黄海所:发现刺参免疫通路基因
灿烂弧菌(Vibrio splendidus)是刺参(Apostichopus japonicus)腐皮综合症的主要致病因素之一,严重危害刺参养殖产业的发展。 为筛选涉及灿烂弧菌侵染的刺参免疫基因,并探索这一过程的分子机制,中国水科院黄海水产研究所王印庚研究员领衔的课题组对灿烂弧菌侵染的抗性型和敏感型刺参的相关转录组和基因表达谱进行了系统分析。 研究人员使用转录组测序共获取319,455,942个Reads,组装成186,658个contigs。之后,对89,891个代表性的contigs(无异构体)进行聚类分析。接着采用DGE测序对基因表达谱进行分析(转录组测序和DGE测序项目均由联川生物承担完成)。相比于对照组,在细菌抗性组中鉴定出358个差异表达基因(DEGs),在细菌敏感组中鉴定出102个DGEs。参照文献报道和来自BLAST,GO和KEGG的注释信息,研究人员从DEGs中鉴定出30个假定的细菌抗性基因和19个假......阅读全文
联川生物遇难基因测序”红海“,DNA合成技术或为破局关键
时隔四个月,杭州联川生物技术股份有限公司(下称“联川生物”)自撤单后再度启动IPO上市工作。日前,联川生物在浙江证监局进行上市辅导备案登记,辅导机构为国金证券。 联川生物成立于2006年,一直以来专注于基因治疗领域,建立了翻译转录组学、表观调控组学、微生物与基因组学及蛋白与代谢组学四大服务条线
-安科生物拟斥资4.5亿揽入中德美联-推进基因测序
安科生物11月23日晚间公告,拟以人民币4.5亿元现金收购核酸检测法医领域的领军型高新技术企业——无锡中德美联生物技术有限公司(简称“中德美联”)100%股权,推进基因测序技术的研发及产业化,促进主营业务扩展至标的公司的精准医疗领域。双方已签订《框架协议》,安科生物股票将从24日起复牌。 资料
生物芯片用于基因测序
基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列,这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列,准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异,
-布局基因测序!安科生物拟≤1.13亿购中德美联25%股权
7月13日,安科生物发布公告称,公司10 日与无锡中德美联生物技术有限公司(以下简称“中德美联”)股东代表签署《合作意向书》,公司拟支付现金不超过人民币1.125亿元,收购中德美联25%股权。昨日复牌后涨停。 公告显示,中德美联是目前经营涉及生物基因测序、DNA 检测等业务,拥有具有良好发展潜
生物芯片技术用于基因测序
基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列,这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列,准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异,
生物芯片技术用于基因测序
基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列,这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列,准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异,
生物芯片技术应用与基因测序
基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列,这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列,准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异,
英生物银行启动大规模基因测序计划
英国生物银行日前宣布,它将与葛兰素史克制药公司(GSK)和美国再生元制药公司(RGC)合作,对该银行拥有的50万名志愿参与者样本进行基因测序;首批5万个样本的基因测序将于今年年底完成。 基因证据能够提供各种基因和疾病之间的清晰联系,因而近年来为科学发现和药物开发带来了革命性变化。目前进入临
英生物银行启动大规模基因测序计划
英国生物银行日前宣布,它将与葛兰素史克制药公司(GSK)和美国再生元制药公司(RGC)合作,对该银行拥有的50万名志愿参与者样本进行基因测序;首批5万个样本的基因测序将于今年年底完成。 基因证据能够提供各种基因和疾病之间的清晰联系,因而近年来为科学发现和药物开发带来了革命性变化。目前进入临床试
基因测序找出肠道核心微生物群
人类肠道中有数以万亿计的微生物,也称为肠道菌群,与多种疾病如肠炎、肥胖、糖尿病等都有关系。最近,比利时鲁汶大学和荷兰格林宁根大学两个团队分别在《科学》杂志发表论文,通过两项大型研究计划找出了肠道核心微生物群,为进一步建立生物标记体系,评估肠道菌群是否正常提供了线索。 肠道微生物组能产生维生素
中美倡议启动“地球生物基因组计划”-对所有真核生物测序
在美国斯密森尼生物多样性基因组学项目组与中国华大基因公司近日联合主办的生物基因组学会议(BioGenomics2017)闭幕论坛上,加州大学戴维斯分校基因组学家哈瑞斯·莱文等人和华大基因生物学家张国捷等组成的科研团队联合倡议,全球科学家合作开启另一项与人类基因组计划(HGP)类似的项目——地球生
人类基因组测序先驱欲进军生物医疗测序领域
J. Craig Venter(中)希望通过利用基因组学实现对抗衰老的目标 美国人类基因组测序先驱J. Craig Venter将和其新创立的公司Human Longevity Inc.(HLI)进军生物医疗测序领域。HLI是“基因组学和细胞的诊断与治疗公司”,计划于今年夏季启动,终极目标
人类基因组测序先驱欲进军生物医疗测序领域
J. Craig Venter(中)希望通过利用基因组学实现对抗衰老的目标。 美国人类基因组测序先驱J. Craig Venter将和其新创立的公司Human Longevity Inc.(HLI)进军生物医疗测序领域。HLI是“基因组学和细胞的诊断与治疗公司”,计划于今年夏季启动,终极目
单分子测序改善微生物基因组组装
美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员近日在《Genome Biology》上发表文章,介绍了SMRT技术在微生物基因组组装上的应用。他们认为,单分子测序数据能降低测序费用,并带来更多完整的基因组,改善微生物基因组数据库的质量。 随着测序费用的不断下降,测序项目的数量也在不断上升。G
基因组测序揭示多细胞生物进化之谜
最近,研究人员通过对各种绿藻进行基因组测序,已经接近于解开了“引起多细胞生物的遗传变化”的谜团。 从单细胞生物到多细胞生物的过渡,是地球上生命进化的关键进步;在不同的系统发育谱系中,这种改变已经独立地发生了多次。了解“有多少基因以及有哪些基因,对单细胞祖先成为多细胞来说是必要的”,是一个有趣的
全基因组重测序的生物信息分析内容
1.数据量产出总碱基数量、Totally mapped reads、Uniquely mapped reads统计,测序深度分析。2.一致性序列组装与参考基因组序列(Reference genome sequence)的比对分析,利用贝叶斯统计模型检测出每个碱基位点的最大可能性基因型,并组装出该个体
黄海所:发现刺参免疫通路基因
灿烂弧菌(Vibrio splendidus)是刺参(Apostichopus japonicus)腐皮综合症的主要致病因素之一,严重危害刺参养殖产业的发展。 为筛选涉及灿烂弧菌侵染的刺参免疫基因,并探索这一过程的分子机制,中国水科院黄海水产研究所王印庚研究员领衔的课题组对灿烂弧菌侵染的抗性型
联川生物与布鲁克深入交流,共同推进蛋白质组学和代谢组学快速发展
2025年8月14日杭州,杭州联川生物技术股份有限公司(以下简称“联川生物”)与布鲁克公司(以下简称“布鲁克”)在联川生物进行交流和洽谈深入合作。 联川生物作为多组学科研服务行的领军企业,近年来以其高质量的组学数据为发展的驱动力,在组学科研服务业务快速增长。布鲁克以持续开发领先的分析技术为使命
《PLoS生物学》:老鼠全基因组测序图公布
最新一期的开放存取的《公共科学图书馆·生物学》(PLoS Biology)杂志上,美国、英国和瑞典的研究人员公布了老鼠的全基因组测序图。老鼠成为继人类之后第二个完成全基因组测序的哺乳动物。 在对人类和老鼠的基因测序图进行综合性比较后,研究人员发现两者之间的遗传差异要比人们预想的大得多。老鼠
全球微生物模式基因组测序计划获进展
近日,《核酸研究》(Nucleic AcidsResearch)在线发表了国家微生物科学数据中心(中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心)关于全球模式微生物基因组数据库gcType的论文。gcType是由我国牵头的全球模式微生物基因组测序计划的重要成果。 模式菌株(t
攻克基因组测序难题-探究茶树生物学奥秘
我国现存最早的中医医药典籍《本草经》记载:“神农尝百草,日遇七十二毒,得荼(茶)而解之。”这说明了茶的神奇功效。茶树起源于我国的云南、四川等地,在从中国向世界各地数千年漫长传播历程里,与全球多元文化邂逅交融,发展形成了今天地球上复杂而美妙的茶文化。茶之所以广受欢迎,除了有迷人的香气和令人愉悦的滋
江苏农科院:miRNA调控茄科抗盐胁迫
茄科包括许多重要的蔬菜作物,它们经常遭受盐胁迫。microRNA(miRNA)已被发现参与调控植物的基因表达来应答盐胁迫。然而,几乎没有关于茄科植物miRNA参与此类应答的报道。由江苏省农业科学院蔬菜研究所庄勇副研究员领衔的课题组采用小RNA测序技术对此展开了深入分析,研究成果发表在近期的Int
中科院海洋研究所:看迟钝爱德华氏菌如何抑制细胞凋亡
细胞凋亡是多细胞生物中一种细胞程序性死亡,研究表明细菌性病原体可以抑制细胞凋亡。迟钝爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)是一种革兰氏阴性病原菌,在淡、海水鱼类中感染极其广泛,其显著特征是可以在不同的宿主细胞中生存和繁殖。据报道,E. tarda能够躲避细胞内吞作用,在细胞质中复制,
微生物宏基因组测序可以解释地球氮循环?
微生物(细菌和古细等)是全球生物地球化学循环的重要驱动者。阐明微生物生物地理分布及其驱动过程对于预测环境变化将如何影响生物地球化学循环非常重要。以往微生物生物地理学的研究常常聚焦在物种的层面。然而,越来越多的研究表明,由于微生物群落固有的功能冗余性,微生物群落的功能变化通常与其物种组成变化是解耦
JVI:昆虫利用siRNA而非miRNA抵御病毒侵染
棉铃虫(Helicoverpa armigera),是夜蛾科昆虫的一种,寄主植物有20多科200余种,其中大部分为重要栽培作物,是棉花的主要害虫之一。棉铃虫单核衣壳核多角体病毒(HaSNPV)是一种杆状病毒,能专一性地感染棉铃虫,作为生物杀虫剂已得到广泛应用。 近日澳大
《基因组生物学》:一种超级细菌的基因组测序完成
最近,英国桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)和布里斯托尔大学的研究者们共同完成了一种名为Steno的超级细菌的基因测序工作,研究结果显示,这是一种具有显著抗药性的生物体。对这种细菌基因组的了解将有助于研究者们发现如何应对这种具有独特抗药性的生物体。这一研究论
马里兰大学完成蜘蛛胶基因测序,将会生物材料突破
马里兰大学巴尔的摩郡分校UMBC博士后Sarah Stellwagen和美国陆军研讨实验室(Army Research Lab)的Rebecca Renberg最新刊登在《Genes, Genomes, Genetics》研讨,初次发表了两种基因的完好序列,这两种基因能够让蜘蛛发生胶水---一种
成都生物所完成脱落酸高产菌株全基因组测序
3月8日,从中科院成都生物研究所科技处获悉,在上海人类基因组研究中心的协作下,该所完成了脱落酸高产菌株灰葡萄孢霉(Botrytis cinerea) TBC-A的全基因组测序及分析工作。 B. cinereaTBC-A是成都生物所经过多年改良筛选及系统研发的、具有自主知识产权
超高通量基因测序仪首发!真迈生物在新区创新启航
10月15日,真迈生物南京公司启用揭牌仪式暨新品发布会在新区生物医药谷举行。中国科学院院士陈润生,市委常委、江北新区党工委书记陆卫东,江苏省药品监督管理局副局长陈和平,南京市科学技术局局长赵成军,江北新区党工委委员、管委会副主任王伟、陈文斌,真迈生物董事长颜钦出席活动。 真迈生物成立于2012
中国完成海带等7种海洋生物全基因组测序
中国科学家10月30日在青岛首次披露了海带、栉孔扇贝和南美白对虾全基因组测序的部分成果,至此中国已完成7种大型海洋生物的全基因组测序,为改良这些海洋生物品质、提高产量奠定了科学基础。 中国的海洋生物基因组学研究虽然起步较晚,但现在一些研究成果已达到国际前沿水准。目前,人类完成全基因组测序的