测序污染有多危险，如何防范与去除？
一些研究表明，目前已经公布的基因组存在多种污染，随着这个问题越来越突出，我们需要找出方法来应对 Supratim Mukherjee在进行数据分析的时候，发现数以百计的微生物基因组中会重复出现同一种噬菌体序列，这令他感到很惊讶。这位来自劳伦斯伯克利国家实验室的生物信息学家最开始是为了比对这些微生物的代谢途径，但后来他发现了几乎无处不在的序列，“我以为我们发现了一些新的东西，”他回忆道，“在这些不同的微生物中，这整个噬菌体基因组是完整地保留下来的。” 但当Mukherjee一开始分析这个噬菌体序列时，他就知道这就是 PhiX 序列，一种Illumina公司测序试剂盒中用做标准品的噬菌体。PhiX 本来是作为一种质控检测指标，用于追踪每个测序过程中出现的错误率的，但在上百个案例中，Mukherjee发现研究人员都没有从其公布的基因组序列中剔除Phi X的序列。 并不是只有Mukherjee一人发现此种情况，最近大量的报告表......阅读全文
台湾首例猴痘病人病情严重，基因序列出炉
据台湾“中央社”报道，台湾6月底出现首例境外移入的猴痘病例，台“疾病管制署”7日公布此个案病毒全基因序列，确认为死亡率较低的B.1西非株基因型。 台“疾病管制署”6月24日公布台湾地区出现首例猴痘境外移入病例，为20多岁台湾男性，自德国返台后出现发烧、喉咙痛、肌肉酸痛、身体出现红疹及鼠蹊部淋巴肿
－克雷格·文特尔：组建基因序列公司改善人类寿命
本月，基因组学创业家克雷格·文特尔(Craig Venter，见上图)宣布了他的最新冒险：组建一家公司，来创造出关于人类健康的所谓最全面的数据集，以应对衰老带来的疾病。 这家位于美国圣迭戈的“人类寿命”(Human Longevity)公司表示，将使用Illumina公司新的高通量
益生乳酸菌全基因组序列测定完成
内蒙古农业大学正式公布,益生乳酸菌的全基因组序列测定分析全部完成,这是我国第一个完成的乳酸菌基因全序列测定。 由内蒙古农业大学“乳品生物技术与工程”教育部重点实验室主持进行的益生乳酸菌的全基因组序列测定Lb.casei Zhang科技项目是经过6年分离、筛选,并进行系统研究开发的具有完全自主知识产
我国完成世界首张－西瓜基因组序列图谱
由北京市农林科学院蔬菜平台牵头，联合了中国农业科学院、深圳华大基因科技有限公司、美国康奈尔大学、荷兰瑞克斯旺等优势单位，共同完成了世界首张西瓜基因组序列图谱绘制与破译，获得了高质量的西瓜基因组序列图谱，成为由中国主导完成的世界第一张西瓜基因组序列
我国首次完成寨卡病毒全基因组序列测定
2月22日，记者从军事医学科学院获悉，该院与广州市第八人民医院、出入境检验检疫系统相关单位密切合作，在获得从委内瑞拉归国患者临床标本后，采用高通量测序技术，于2月21日直接从尿液中获得病毒全基因组序列。 寨卡病毒属黄病毒科，是一种主要由伊蚊传播的虫媒病毒。1947年首次在乌干达寨卡丛林中的恒河
蚂蚁基因组序列被破译－有助探究人类衰老根源
美国科学家8月30日表示，他们首次绘制出了两种蚂蚁的全基因组序列图。此举可为科学家更好地了解人类衰老以及行为表现提供帮助。 该研究项目的负责人、纽约大学兰贡医疗中心的生化学教授丹尼·赖因伯格说：“蚂蚁是绝对的社会动物，蚂蚁个体的生存要依靠蚂蚁群体，这与我们人类非常相似。无论是工蚁、兵
关于H7N9禽流感的基因序列介绍
科学家们说，一种此前从未在人体内发现的致命禽流感病毒的基因序列数据显示，这一病毒已经发生某些可能使之更易在人类中大流行的变异。 2013年4月3日，迄今没有证据显示，H7N9禽流感病毒正在人际间传播，也存在以下可能性：这种病毒可能会逐渐销声匿迹，不会完全变异为一种人流感。就在中国宣布已确诊多例
我国科学家开发高效基因组序列分析工具
类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异，往往由DNA序列变化造成，这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究（Genome-Wide Association Study，GWAS）是通过比对大量人群的遗传信息，利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学的
美研究称基因序列预测长寿准确率高达77％
美国研究人员宣布，他们发现基因序列可以预测人能否长寿，预测准确率高达77%。研究论文7月1日由《科学》（Science）杂志发表。长寿老人多有长寿基因 波士顿大学一个研究小组调查1000多名百岁老人，根据收集数据开发出一个基因分析系统。使用这个系统，可以预测人们是否有相当大机会“格外
新算法TRFill解决生物基因组重复序列组装难题
近日，中国农业科学院农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队开发出了一种新算法——TRFill，解决了现有工具无法完全填补基因组间隙的难题，显著提升了基因组质量。相关研究成果发表在《基因组生物学》（Genome Biology）上。 动植物基因组的许多区域存在大量高度重复的DNA片段
我国首获濒危物种白头叶猴全基因组序列
广西林业局11日提供的信息显示，中国首次获得濒危物种白头叶猴全基因组序列，揭示了白头叶猴能够在富含矿物离子的高碱性喀斯特山地长久生存的基因组遗传特征秘密。 白头叶猴是中国特有的生物物种，其体毛以黑色为主，与黑叶猴不同的是头部高耸着一撮直立的白毛。白头叶猴仅分布在广西崇左左江和明江间不足200平
蛋白质数据+基因序列精准构建进化树
西班牙基因组调控研究中心的科学家们在最新一期《自然·通讯》上发表了一项创新研究，展示了如何利用蛋白质三维形状，解开生命中古老的“历史密码”，揭示了生命之树中最古老的进化关系。这项研究首次将蛋白质的形状数据与基因序列数据结合，提高了进化树的准确性。蛋白质结构解决“饱和问题”（艺术概念图）。图片来源：《
我国完成世界首张西瓜基因组序列图谱
我国主导完成世界首张西瓜基因组序列图谱的绘制与破译，相关研究成果于北京时间11月26日凌晨在国际学术顶级刊物《自然·遗传学》上在线发表。 西瓜是全球重要的经济作物和夏季消暑水果，但就是这样一种常见的水果，人们却始终未能从内到外了解它。过去，各国科学家虽然知道栽培西瓜遗传多样性狭窄是制约西瓜
关于真核基因组的高度重复序列的介绍
1、真核基因组的高度重复序列— 简介 高度重复序列在基因组中重复频率高，可达10^3以上，因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异，约占10-60%，在人基因组中约占20%。高度重复顺序又按其结构特点分为三种。 2、真核基因组的高度重复序列—倒位重复序列 这种重复顺序复性速度极快，即
基因污染的大致现状介绍
与此同时，转基因的生物及生物制品也在悄然走进中国。作为农业大国，中国富有丰富的基因资源，更是水稻，大豆等农作物的故乡，各种各样的野生，人工选育的品种，构成了天然的庞大基因库。这些天然的基因资源一旦受到转基因的污染其损失将无可限量。 对于突如其来的基因污染问题中国已积极面对，出台了一系列应对方案
关于基因污染的形成介绍
20世纪70年代基因工程技术兴起时，基因重组实验必须在“负压”实验室进行。为了防止基因重组的生物当时主要是微生物不致进入人体或逃逸到外界，实验室设立了各种等级的物理屏障和生物屏障。虽然以后对非病原体基因工程实验的规定有所放宽，但有关生物安全的原则不变。各国政府对于基因重组实验颁布有相应的操作规程
深圳华大基因研究院完成大熊猫基因组序列图谱
揭开大熊猫黑眼圈的奥秘 深圳华大基因研究院十月十一日在深圳第十届“高交会”上宣布，大熊猫“晶晶”基因组框架图绘制完成，这是世界首例用短序列进行新物种测序与组装新技术完成的大型基因组序列图。 据深圳华大基因研究员王俊博士介绍，大熊猫有二十一对染色体，基因组大小与人相似，约为三十亿个碱基对，包含二到
核酸序列分析
【实验目的】1、 掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤；2、 掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基本分析；3、 熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析（内含子/外显子分析）；4、 了解基因的电子表达谱分析。【实验原理】针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因，找出基因的位置和
设计引物用cds序列和cdna序列的区别
cDNA和mRNA的序列是互补的，如果用两个引物，最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向从5‘至3’，所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可。
冲激序列信号与阶跃序列信号各有什么特性
单位脉冲序列只在n=0 处有一个单位值1，其余点上皆为0；单位阶跃序列只有在n>=0时，才取非零值1，当n
基因序列仪在感染性疾病诊断上的应用
测序技术可以精确的分析碱基序列，通过序列比对，对各种病原体直接进行鉴定、分型和溯源，明确某一感染性疾病对应病原体的基因序列，可以有针对性地用药和预防，提高用药的有效性和安全性。同时基因测序可以用于发现新型病原体，能更好地做好预防工作。
新技术90分钟完成全基因组序列分析
美国国家儿童医院（Nationwide Children's Hospital）的研发人员最近在Genome Biology上发布了一个自主开发的分析软件，表示这个软件使寻找全基因组致病变异从几周缩短到按几十个小时。 第一个人类基因组测序完成耗时大约13年，耗费30亿美元，而现在技术测序技术的
BZ010－水稻Cry1Ac－基因序列定性PCR－检测
BZ010 -水稻Cry1Ac 基因序列定性PCR 检测试剂盒 包括100 个扩增反应所需的试剂 【试剂盒组成】 2 x 275 μl Cry1Ac 反应试剂 (Cry1Ac mastermix； -20oC 保存) 1 x 50 μl 阳性对照 (Positive co
我国完成首部高原濒危物种全基因组序列图谱
12月25日，由青海大学和深圳华大基因研究院共同发起并承担的藏羚羊基因组序列图谱在青海大学医学院宣告绘制完成，这是世界上第一部绘制完成的高原濒危物种全基因组序列图谱，也是中国科学家对全球基因组科学的又一重大贡献。 藏羚羊是我国青藏高原特有的物种，其生存环境高寒、缺氧，自然条件极为严酷。在喜
蝴蝶兰光周期相关基因序列及其应用获发明ZL
由中科院华南植物园张建霞、段俊等完成的“蝴蝶兰光周期相关基因PhalCOL的序列及其应用”于6月29日获国家发明ZL授权(ZL号：ZL 200910042303.9)。 蝴蝶兰是兰科植物中栽培最广泛、最受欢迎的种类之一，花形似蝴蝶，别致美丽、色彩艳丽，花期长达数月之久，观赏价
更改小白菜基因序列亩产可提高2000公斤
“目前我们已经发现了小白菜中的分蘖基因，如果更改普通小白菜中的基因序列，让它们拥有分蘖基因的功能，亩产可达6000公斤，提高近2000公斤。”昨天，在南京农业大学召开的“百家名企进南农”活动中，该校园艺学院院长、博士生导师侯喜林向记者表示。 不结球白菜俗称青菜、小白菜，原产中国。2009年
科学家发现奇异基因序列或来自全新生物域
沃斯的“三域说”是目前生物分类界的主流学说。 “科学坏小子”文特尔（左）参与了这次的研究项目。 在过去的近300年中，生物分类法从两界、三界一直被扩充到六界三域，分类系统不断被改写。然而，演化树的改写可能还会继续下去。美国加州大学基因中心和文特尔研究所对海洋水样本中的DNA序列分
英国拟为癌症病人绘基因序列图以研发新药
据英国路透社12月10日报道，英国拟为近10万癌症或其它罕见疾病的患者绘制基因序列图，以研发新的药物。 英国首相卡梅伦10日表示，他希望英国能够成为第一个将基因排序引入健康服务的国家。 据报道，卡梅伦政府计划在未来3至5年内投入1亿英镑(约合人民币10亿元)用于基因排序项目。绘制病人
首个亚洲人源基因检测序列标准物质完成研制
6月，中国计量科学研究院和深圳华大基因研究院共同发布首个亚洲人源(炎黄一号)DNA序列标准物质(BW-5201)和大肠杆菌O157基因组DNA序列标准物质(BW-5202)。这是全球首次发布亚洲人源DNA和微生物基因组DNA序列标准物质，为基因检测产业评估测序和数据分析的准确性提供了参考标准。
Science：新研究揭示短串联重复序列如何影响基因表达
几十年来，科学家们已经知道，“垃圾 DNA（junk DNA）”实际上起着至关重要的作用：尽管基因组中的蛋白编码基因提供了构建蛋白的蓝图，但是基因组中的一些非编码部分，包括以前被认为是 “垃圾DNA”的基因组区域，似乎可以提高或降低这些基因的表达。但人们一直不清楚某些非编码区域如何影响基因表达水