浙江大学携手华裔牛人发表表观遗传学新技术

理解染色质修饰在发育和疾病中的调控作用是非常重要的,不过这样的研究往往会受到样本量的限制。基于染色质免疫共沉淀的深度测序(ChIP-seq)近来在这一领域取得了一定进展,但要实现高质量的图谱分析还面临着不少挑战。 浙江大学和卡内基科学研究所的研究人员开发了两项新技术,RP-ChIP-seq(recovery via protection -ChIP-seq)和FARP-ChIP-seq(favored amplification RP-ChIP-seq)。这两项技术只需500个细胞就能进行可靠的表观基因组分析。这一成果发表在十一月五日的Cell Reports杂志上,文章的通讯作者是浙江大学生命科学研究院的贾俊岭教授和卡内基科学研究所的著名华人学者郑诣先( Yixian Zheng)教授。 研究显示,RP-ChIP-seq可以在一个小鼠晶状体中检测衰老相关的表观遗传学改变。而FARP-ChIP-seq能够在小鼠的长期造血......阅读全文

染色质的分类

间期染色质按其形态特征、活性状态和染色性能区分为两种类型:常染色质和异染色质。按功能状态的不同可将染色质分为活性染色质和非活性染色质。

性染色质检测

实验方法原理 在间期细胞核中,女性X染色质和男性Y染色质均可用特殊染色法显示出来。女性的两个X染色体中的一个,在间期时的染色质呈异固缩(Heteropyconosis),呈深染的小体称Barr氏体。Barr氏体位于间期细胞核内面,呈三角形或半月形小体,易为碳酸复红或硫堇等染料着色。正常女性Barr氏

染色质的定义

  染色体在细胞周期的间期时DNA的螺旋结构松散,呈网状或斑块状不定形物,即染色质。以浓集状态存在者,称异染色质(1~eterochromatin);以分散状态存在者,称常染色质(euchromatin)。常染色质染色较浅且均匀,异染色质染色深。性染色质与性染色体(x染色体和Y染色体)有关,称x染色

单细胞测序数据分析中深度学习方法的稳定性如何提高?

提高单细胞测序数据分析中深度学习方法稳定性的策略:  1. 数据增强    - 采用数据扩充技术,如随机旋转、翻转、添加噪声等,增加数据的多样性,从而使模型对数据的变化更具鲁棒性。  2. 正则化    - 应用正则化方法,如 L1 和 L2 正则化、Dropout 等,防止模型过拟合,提高

我国科学家发现新冠患者T细胞变化机制

   上海市公共卫生临床中心教授卢洪洲、周晓辉传染病医学科研团队,应用国际先进的单细胞转录组测序技术和单细胞染色质可及性分析技术,揭密了新冠患者体内T细胞特性和变化规律,他们剖析了入组的新冠重症、危重患者,普通型患者和健康志愿者(共3组)的外周血T细胞的表观遗传特征和免疫转录图谱,并对数据进行分析后

我国科研团队研制成功“量子芯片激光手术刀”

  中新社合肥1月3日电 (记者 张俊)记者3日从安徽省量子计算工程研究中心获悉,中国首个专用于量子芯片生产的激光退火仪研制成功,该设备可解决量子芯片位数增加时的工艺不稳定因素,像“手术刀”一样精准剔除量子芯片中的“瑕疵”,增强量子芯片向多比特扩展时的性能,提升量子芯片的良品率。  据安徽省量子计算

Science:梳理患儿肿瘤细胞的基因组寻求答案

  组蛋白翻译后修饰方式出现异常,以及组蛋白修饰位置出现异常都会导致肿瘤发生。   高通量DNA测序技术的快速扩张让我们能够以前所未有的速度和精细度对人体疾病展开遗传学分析,尤其是对罕见的小儿疾病进行全基因组测序(whole-genome sequencing)更是有助于我们对儿童发育,以及多

多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰(二)

(2)在整条肽中的某个Lys侧链接入FITC,Lys侧链为末端为-NH2的四碳直链烷基,直接起到了降低空间位阻的作用。这种修饰方式能够灵活的在整条肽中任何位置进行FITC修饰,而不仅仅局限于末端。我们所采用的FITC修饰多肽的两种形式,都具有操作简便,成功率高,容易分离纯化等优点。2.AMC修饰7-

多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰(一)

荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物,受到紫外光或蓝紫光照射时,可激发成为激发态,当从激发态恢复基态时,发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上,利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染,操作简

金唯智引入Illumina-X10及PacBio测序平台-深化基因组领域业务

  近日,金唯智宣布引进全球最高通量的测序平台Illumina HiSeq X-10及最新的单分子基因测序系统PacBio Sequel。这些新平台的加入使得金唯智拥有市场上最先进的高通量测序平台,从而全面加强金唯智在基因组学研究、精准医疗与其它应用领域里的服务范围和能力。  新平台能为客户减低成本

Scientific Reports:普通小麦TaGS2基因表达调控研究获进展

  普通小麦是全球重要的粮食作物之一,含有A、B和D三个基因组,不同基因组的同源基因在多倍化过程中会出现功能分化或冗余。解析基因组同源基因表达调控机理有助于加深对功能基因的理解,为小麦新品种设计和培育奠定理论基础。中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心李俊明研究组在表观遗传学及染色质结构参

普通小麦TaGS2基因表达调控研究获进展

  普通小麦是全球重要的粮食作物之一,含有A、B和D三个基因组,不同基因组的同源基因在多倍化过程中会出现功能分化或冗余。解析基因组同源基因表达调控机理有助于加深对功能基因的理解,为小麦新品种设计和培育奠定理论基础。中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心李俊明研究组在表观遗传学及染色质结构参

在纤毛虫鉴定了DNA6mA甲基转移酶复合物及阐明生物学功能

  DNA甲基化是表观遗传调控的重要组成部分,在调控基因组印记,X染色体失活,转座子抑制,基因表达,胚胎发育等方面发挥重要作用。真核生物中最主要的DNA甲基化修饰是5-甲基胞嘧啶(5mC)。由于其在真核生物中的丰富性和重要性,以前的研究集中表征5mC。相反,N6-甲基腺嘌呤DNA(6mA)修饰是原核

陆俊:“沙里淘金”十余载

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/481767.shtm 陆俊在做实验 中科院物理研究所供图   不让重要的信号“埋葬”在噪音里,哪怕它极其微弱,这就是锁相放大器的使命。 随着科研和工业领域精细测量微弱信号的需求不断增多,锁

阴和俊调研深圳先进院

  8月30日上午,中国科学院副院长阴和俊调研中国科学院深圳先进技术研究院。  阴和俊听取了先进院院长樊建平作的关于先进院整体发展情况的汇报,并听取了先进院二期建设规划和相关项目进展汇报。阴和俊对先进院一期建设成果给予了充分肯定,特别是听到32家先进院孵化的企业本月24日已

阴和俊视察新疆理化所

  8月27日,中国科学院副院长阴和俊在新疆维吾尔自治区人民政府副主席靳诺陪同下视察新疆理化所。   新疆理化所所长李晓向阴和俊一行详细汇报了研究所“创新2020”、“十二五规划”以及科技支疆规划制订工作情况。   阴和俊充分肯定了规划的整体思路。他指出,目前新疆的研究所面临新疆

阴和俊调研新疆理化所

  8月27日,中国科学院副院长阴和俊和新疆维吾尔自治区人民政府副主席靳诺一行调研新疆理化所。   座谈会上,李晓所长首先汇报了理化所“创新2020”、“十二五规划”以及“科技支疆规划”制订等工作情况。   阴和俊充分肯定了研究所规划的整体思路。他指出,新疆是我国多民族地区,是国

阴和俊调研过程工程所

  3月11日下午,中科院副院长阴和俊调研了中科院过程工程研究所“一三五”战略规划的进展情况。   阴和俊首先考察了多尺度放大调控及重大应用、矿产资源的高效清洁利用技术、生物过程关键技术与装备、离子液体清洁过程与节能技术、高温复合材料与涂层技术等“一三五”代表性平台,听取了科研进展汇报,并就具体问

阴和俊调研长春光机所

     参观实验室   9月20日上午,中国科学院副院长阴和俊调研中国科学院长春光学精密机械与物理研究所。   阴和俊一行首先参观了长春光机所某大型光学系统装调现场、特种材料加工工艺研究实验室,实地考察了在建中的应用光学研究及专项光学装备综合研发平台等基建项目和该所投资企业长春

《自然》两篇文章介绍生物新方法

生物学研究方法日新月异,在8月2日的《Nature》杂志上,来自麻省理工学院和哈佛大学的两个研究小组介绍了两种新颖的技术,为生物学研究提出了新的思路。 原文检索:Nature 448, 553-560 (2 August 2007) | doi:10.1038/nature06008; Rece

由德林等破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱

  记者日前从上海交通大学获悉,该校微生物代谢国家重点实验室由德林研究小组在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破。相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。  DNA是生命的遗传物质,由碳、氢、氧、氮、磷五种元素组成。中科院院士邓子新领衔的团队在前期工作中发现了DNA上存在一种全新的修饰——磷硫酰化

简述贾第虫病的临床表现

  潜伏期一般1~3周,平均9~15天,临床表现以胃肠道症状为主。急性期典型症状为暴发性腹泻,水样大便并有恶臭,可有少量黏液,但多无脓血,患者常伴有恶心、呕吐、腹胀、嗳气,腹痛常见,多在中上腹、绞痛,部分患者有低热、发冷、头痛,乏力、食欲减退等全身症状。  急性期持续数天,如治疗不及时,即可能转为亚

关于贾第鞭毛虫病的简介

  蓝氏贾第鞭毛虫病是由于感染虫体对机体产生的机械和化学作用,导致机体产生非特异性和特异性宿主反应。分布呈世界性,在前苏联特别严重,美国也接近于流行,发展中国家感染人数约为2.5亿。中国分布也很广泛,各地感染率0.48%~10%之间,儿童高于成人,夏秋季节发病率较高。   人体感染后出现以腹泻为主

贾伟:医者仁心-不悔来时路

  热爱加持,使命感油然,认真对待每一个病人筑成贾伟二十年从医路。想来不悔,除了医者仁心,大抵还有对这份工作的深深认同。病人愈后发自内心的微笑于他而言是人生最大的嘉奖。  作为一名致力于血管外科工作的医者,随着人们饮食习惯的改变,高血压、高血脂、糖尿病等引发的血管疾病发病率提高,贾伟一直攻坚克难,砥

贾文毓:保守是学术创新之基

  ■ 保守的前提是拥有。不曾拥有,保守于何?  “保守”一词,声誉不佳,人们往往归之于贬义词之列。《现代汉语词典》释曰:“维持原状,不求进取;跟不上形势的发展(多指思想)。”《汉语大词典》:“谓维持旧状态,不求改变或改进。”如果从字义学的角度分析“保守”一词,或可获得些许

贾弟虫病的基本信息介绍

  贾弟虫病由贾弟氏原虫引起的轻微的肠道病。感染动物(犬、猫、水癞、啮齿类)的粪便可发现此原虫。若饮用未经消毒的地表水(池塘、湖泊、溪流)将增加感染的危险。整个感染期间均有传染性。会再感染。无证据表明患者对再感染有免疫力。一般不需隔离,但食品从业人员、幼儿园雇员、医务人员患腹泻应离任,直至症状消失。

贾宝余:让教改特区真正“特”起来

  7月15日,教育部召开新闻发布会并透露,将在26所高校内部选择一些学院设立“教育教学改革特别试验区”,实行教授治学,创新人才培养模式。  据介绍,改革内容主要涉及四个方面:一是创新高等学校管理体制机制,扩大学院在教学、科研、管理方面的自主权,实行教授治学;二是改革教师聘任、考核和评价制

关于贾第虫病的检查方式介绍

  1.病原体检查  新鲜腹泻便中可发现滋养体,糊状便和成形便中多为包囊,粪便直接生理盐水涂片即可找到滋养体;以碘液染色后可使包囊易于识别,硫酸锌漂浮法等浓缩法可提高包囊检出率,粪便检查应三送三检,三检阳性率可提高到97%,十二指肠引流物,小肠黏液或活检组织均可查到虫体。  2.免疫学试验  可分为

简述贾弟虫病的诊断检查介绍

  凡小儿长期腹泻、腹痛、一般治疗难于根治者,应考虑本病,做下列检查以协诊断。  粪便检查  在于粪便中找到滋养体和包囊可确诊,光镜下新鲜稀薄便中可找到滋养体。在成形便中须用碘液染色才能找到包囊。由于包囊的形成具有间歇性,应隔日检查粪便,连续3次以上。  十二指肠引流液检查  如多次检查粪便均为阴性

蓝氏贾第鞭毛虫-Giardia-lamblia

蓝氏贾第鞭毛虫(Giardia lamblia Stiles,1915)简称贾第虫。寄生人体小肠、胆囊,主要在十二指肠,可引起腹痛、腹泻和吸收不良等症状,致贾第虫病(giardiasis),本病世界性分布,由于在旅游者中发病率较高,故又称旅游者腹泻。 一、形态滋养体附着于小肠柱状细胞表面(透射电镜照