由德林等破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱
记者日前从上海交通大学获悉，该校微生物代谢国家重点实验室由德林研究小组在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破。相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。 DNA是生命的遗传物质，由碳、氢、氧、氮、磷五种元素组成。中科院院士邓子新领衔的团队在前期工作中发现了DNA上存在一种全新的修饰——磷硫酰化修饰。这一现象被国际同行公认为“迄今为止在DNA骨架上发现的第一个天然修饰”，也是目前在DNA骨架上发现的第六种元素。 由德林团队以大肠杆菌Escherichia coli B7A为研究对象，建立了单分子实时测序和碘切割依赖的深度测序等两种前沿技术，测定了基因组水平DNA磷硫酰化修饰位点，首次获得了精确的细菌基因组磷硫酰化修饰位点分布图谱。 据了解，这两种测序方法相互补充，测得修饰位点具有保守的GpsAAC/GpsTTC短序列特征。而大肠杆菌中同样存在一个DNA磷硫酰化修饰—限制系统，并且其基因组中只有部分GAAC/GTTC位点被......阅读全文
研究发现全新DNA单链磷硫酰化修饰系统
DNA单链磷硫酰化修饰-感应修饰限制系统的工作机理 近日，武汉大学药学院教授王连荣课题组在《自然·微生物学》在线发表了细菌DNA磷硫酰化领域的最新研究成果，首次揭示了一套全新的磷硫酰化限制-修饰系统——DNA单链磷硫酰化修饰Ssp系统，并解析了感应基因组修饰抗噬菌体系统的分子机制。 细菌磷硫酰化
由德林等破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱
记者日前从上海交通大学获悉，该校微生物代谢国家重点实验室由德林研究小组在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破。相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。 DNA是生命的遗传物质，由碳、氢、氧、氮、磷五种元素组成。中科院院士邓子新领衔的团队在前期工作中发现了DNA上存在一种全新的修饰——磷硫酰化
上海交大破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱
近日，上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破，《Nature Communications》在线发表了由德林教授研究小组的最新进展《Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modif
揭示了磷硫酰化修饰在全基因组水平上的异质性
DNA是重要的遗传物质，储存着所有蛋白质和RNA的全部遗传信息。DNA上的任何一个微小的变化都有可能改变生命的遗传信息，影响生命活动，如经典的DNA甲基化修饰在生物界具有保护遗传稳定，调控DNA复制、转录以及翻译过程等重要功能。DNA磷硫酰化修饰是由邓子新发现的，DNA骨架上硫原子取代磷原子上
上海交大赵一雷教授Sci Rep解析DNA磷硫酰化修饰新机制
上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室等处的研究人员发表了题为“Mechanistic investigation on ROS resistance of phosphorothioated DNA”的文章，通过体内/体外实验和理论计算相结合的方法，揭示了磷硫酰化修饰DNA抵抗
上海交大研究组揭示细菌DNA新型限制修饰机制
细菌DNA新型限制修饰机制 近日，上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰研究方面取得新进展，由德林教授研究小组与美国麻省理工学院Peter C. Dedon教授课题组合作，以博士生曹博为第一作者，在微生物领域顶级期刊《Molecular Mi
蛋白质乙酰化修饰的精细调控
近期，国际著名学术期刊《美国国家科学院院刊》在线发表了中国科学技术大学生命科学学院施蕴渝教授与姚雪彪教授研究组的合作成果，文章标题为EB1 acetylation by P300/CBP-associated factor (PCAF) ensures accurate kinetochore -m
研究揭示蛋白β-羟基丁酰化修饰关键调控因子
近日，中国科学院上海药物研究所研究员黄河课题组与美国芝加哥大学教授赵英明团队合作，通过全面分析哺乳动物细胞中的Kbhb底物，系统揭示了新型蛋白动态修饰β-羟基丁酰化（Kbhb）的关键调控因子。相关研究成果于2月25日在线发表在Science Advance上。 细胞代谢为生命过程提供能量，同时
科研人员绘制肝癌组织乳酰化修饰图谱
乳酸 (lactate) 是哺乳动物糖酵解代谢中的主要产物，在肿瘤、败血症、自身免疫性疾病等病理状态下显著增多。其生物学功能因肿瘤细胞中存在的“瓦伯格效应(Warburg effect)”而得到广泛关注。2019年，芝加哥大学Yingming Zhao教授团队发现哺乳动物细胞内的乳酸可驱动形成一
PTMab直播预告 | 组蛋白新型酰化修饰ChIP介绍
基因组信息以染色质的形式存储在细胞核中，147bp DNA 缠绕组蛋白八聚体形成染色质最小单元核小体。核心组蛋白的柔性 N 末端以及球状核心结构域存在大量共价修饰，如乙酰化、甲基化和磷酸化等。组蛋白赖氨酸乙酰化中和了赖氨酸的正电荷，削弱了组蛋白和DNA的相互作用，从而形成更开放的染色质状态，更高的D
DNA骨架硫修饰研究又获新成果
上海交通大学、武汉大学与美国麻省理工学院共同合作，以王连荣为第一作者、陈实和彼得·帝丹为共同通讯作者联合完成的论文《DNA磷硫酰化修饰在细菌基因组中广泛分布且量化存在》日前在美国《国家科学院院刊》上发表，这是DNA骨架上硫修饰研究领域又一个新的重大进展，也是邓子新团队与彼得·帝丹合
最新研究揭示蛋白β-羟基丁酰化修饰关键调控因子
近日，中国科学院上海药物研究所研究员黄河课题组与美国芝加哥大学教授赵英明团队合作，通过全面分析哺乳动物细胞中的Kbhb底物，系统揭示了新型蛋白动态修饰β-羟基丁酰化（Kbhb）的关键调控因子。相关研究成果在线发表在Science Advance上。 细胞代谢为生命过程提供能量，同时代谢物可通过
蛋白酰化修饰调控天然产物生物合成研究取得进展
近期，中国科学院上海药物研究所谭敏佳课题组与华东理工大学叶邦策课题组合作研究，揭示了蛋白赖氨酸酰化修饰在天然产物的生物合成代谢通路中的调控新机制，研究工作发表在8月Cell Chemical Biology（25(8): 984-995. doi: 10.1016/j.chembiol.2018
蛋白酰化修饰调控天然产物生物合成研究取得进展
近期,中国科学院上海药物研究所谭敏佳课题组与华东理工大学叶邦策课题组合作研究,揭示了蛋白赖氨酸酰化修饰在天然产物的生物合成代谢通路中的调控新机制,研究工作发表在8月Cell Chemical Biology（25(8)： 984-995. doi： 10.1016/j.chembiol.2018
表观遗传之组蛋白修饰—组蛋白乙酰化
大家好，我又来啦~~今天给大家放送的是表观遗传之组蛋白修饰相关的内容噢，组蛋白修饰也是一个比较复杂的过程，今天呢，我们就给大家讲讲组蛋白乙酰化及相关的产品。 一 组蛋白修饰 真核生物染色质的基本结构单位是核小体，它由约 146 bp DNA 缠绕组蛋白八聚体组成，其中组蛋白八聚体包含 2 (H2
樊嘉院士团队等绘制肝癌组织乳酰化修饰图谱
乳酸（lactate）是哺乳动物糖酵解代谢中的主要产物，在肿瘤、败血症、自身免疫性疾病等病理状态下显著增多，其生物学功能因肿瘤细胞中存在的“瓦伯格效应”（Warburg effect）而得到关注。2019年，美国芝加哥大学教授Yingming Zhao团队发现哺乳动物细胞内的乳酸可驱动形成新型组
邓子新院士团队揭示DNA抗氧化新机制
近日来自上海交通大学生命学院的研究人员在DNA骨架硫修饰科学领域又取得新进展，揭示了DNA抗氧化损伤的新机制。相关论文 “Phosphorothioate DNA as an antioxidant in bacteria”发表在公布在国际知名分子生物学刊物《Nucleic Acids
烟草所首次揭示植物蛋白质的巴豆酰化修饰
近日，中国农业科学院烟草研究所烟草病虫害防控科研团队在烟草蛋白质翻译后修饰研究方面取得新进展，发现烟草蛋白质巴豆酰化参与细胞碳代谢等多种生物学进程。 科研团队利用高质量的巴豆酰化修饰泛抗体，将烟草细胞内发生巴豆酰化的蛋白质组进行富集，通过液相二级质谱（LC-MS/MS）共鉴定到637个发生巴豆
结核杆菌研究新进展：乙酰化修饰图谱公布
近日，发表于杂志Int J Biochem Cell Biol.上的一篇文章中，来自西南大学和杭州景杰生物科技有限公司的研究者公布了结核分歧杆菌的乙酰化修饰谱图。近年来科学家都非常有兴趣致力于病原微生物的蛋白质翻译后修饰研究，本文中作者首次全面鉴定了结核分歧杆菌的乙酰化修饰。这也是继公布首张结合
研究发现全新组蛋白修饰类型——赖氨酸乙酰乙酰化
细胞代谢为生命过程提供能量。同时，代谢物可共价修饰蛋白质来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知，但它们介导细胞信号调控的功能有待探索。酮体（包括丙酮、乙酰乙酸和β-羟基丁酸）为脂质代谢产物。在葡萄糖缺乏的状态下，肝脏产生的酮体可用作多种组织的替代能源，且与多种病理生理状态密
高效的微波辅助氮-硫酰基化和硫酯交换制备硫酯化修饰..
通过高效的微波辅助氮-硫酰基化和硫酯交换制备硫酯化修饰的糖肽Efficient Microwave-Assisted Tandem N- to S-Acyl Transfer and Thioester Exchange for the Preparation of a Glycosylat
二十年磨一剑 打开DNA研究新天地 邓子新院士访谈
中国科学院院士、上海交通大学教授邓子新说：“我们有一百个一千个理由可以放弃：拿不到研究基金、不被人认可……但我们从来没有放弃过，一直做下来了。” 2007年8月，邓子新应邀出席在英国纽卡斯尔召开的第十四届国际放线菌生物学大会，并作了DNA大分子上一种新的硫修饰的研究报告。 2005年9月
马拉硫磷液相分析方法
马拉硫磷液相分析方法：采用反相液相色谱外标法测定马拉硫磷原药中马拉硫磷的含量。马拉硫磷，又名马拉松、杀虫剂4049，学名O,O-二甲基-S-(1,2-二羟乙氧基乙基)二硫代磷酸酯，是一种有机化合物，化学式为C10H19O6PS2，为无色至淡黄色油状液体，为高效低毒虫、杀螨剂。2017年10月27日，
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的...（二）
2. 筛选修饰蛋白进行验证并探究修饰位点功能进一步，作者对6个候选琥珀酰化蛋白进行验证（LuxS、PkG等），先通过Co-IP富集候选的修饰蛋白，随后利用琥珀酰化抗体进行WB，证明了这些蛋白确实发生了琥珀酰化修饰。随后，作者锁定了一个调节群体感应自诱导剂AI-2的合成酶-----LuxS进行深入研究
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的...（一）
琥珀酰化修饰组+代谢组揭示水产动物病原菌的代谢调控机制 随着组学研究步入后基因组时代，蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管，相对于发展迅速的医学等领域，水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚，但目前已有不少高质量文章发表，这为水产科学研究领域打开了
琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制
随着组学研究步入后基因组时代，蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管，相对于发展迅速的医学等领域，水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚，但目前已有不少高质量文章发表，这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。 本期，小编将为大家带来一篇1
α-微管蛋白乙酰化修饰调控神经元轴突分支的分子机制
近日，中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所鲍岚研究组的最新研究成果，以α-Tubulin Acetylation Restricts Axon Overbranching by Dampening Microtubule Plus-End Dynamics in Neurons
琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制
随着组学研究步入后基因组时代，蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管，相对于发展迅速的医学等领域，水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚，但目前已有不少高质量文章发表，这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。 本期，小编将为大家带来一篇
Protein Cell：病毒感染时翻译后修饰乙酰化的动态调控
天然免疫应答是机体应对病原微生物入侵的第一道防线，在杀伤病原微生物、清除感染细胞和维持体内稳态等方面发挥关键作用。蛋白质翻译后修饰（protein post-translational modifications，PTMs）广泛参与调控各种通路中信号分子的激活。非组蛋白乙酰化修饰（non-hi
α-微管蛋白乙酰化修饰调控神经元轴突分支的分子机制
近日，中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所鲍岚研究组的最新研究成果，以α-Tubulin Acetylation Restricts Axon Overbranching by Dampening Microtubule Plus-End Dynamics in Neurons