浙江大学携手华裔牛人发表表观遗传学新技术
理解染色质修饰在发育和疾病中的调控作用是非常重要的,不过这样的研究往往会受到样本量的限制。基于染色质免疫共沉淀的深度测序(ChIP-seq)近来在这一领域取得了一定进展,但要实现高质量的图谱分析还面临着不少挑战。 浙江大学和卡内基科学研究所的研究人员开发了两项新技术,RP-ChIP-seq(recovery via protection -ChIP-seq)和FARP-ChIP-seq(favored amplification RP-ChIP-seq)。这两项技术只需500个细胞就能进行可靠的表观基因组分析。这一成果发表在十一月五日的Cell Reports杂志上,文章的通讯作者是浙江大学生命科学研究院的贾俊岭教授和卡内基科学研究所的著名华人学者郑诣先( Yixian Zheng)教授。 研究显示,RP-ChIP-seq可以在一个小鼠晶状体中检测衰老相关的表观遗传学改变。而FARP-ChIP-seq能够在小鼠的长期造血......阅读全文
动物性染色体起源新假说,首个鱼类Y染色体整图谱出炉
2021年7月12日,福建省淡水水产研究所薛凌展团队联合福建师范大学、华中农业大学和维也纳大学等单位,在Genome Biology 在线发表题为“ Telomere-to-telomere assembly of a fish Y chromosome reveals the origin o
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化——DNA甲基化
亚硫酸氢盐修饰后测序法主要可用来检测甲基化。基化实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,用PCR扩增(引物设计时尽量避免有CpG,以免受甲基化因素的影响)所需片段,则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序,并且与未经处理的序列比较
贾弟虫病的症状体征介绍
潜伏期为1—3周,主要症状为腹痛、腹泻、腹胀、食欲不振,恶心、呕吐等,大便稀烂有粘液,镜子下面可见脓细胞核红细胞,并可找到包囊及滋养体。重度感染者可有爆发性腹泻,水样便,恶臭味,腹胀明显,病程3—4天,也可持续数月转为慢性。慢性者病程长,间歇性腹泻,稀便恶臭、呃逆、腹痛、腹胀、食欲差、乏力、消瘦
分析贾弟虫病的形成病因
蓝氏见弟鞭毛虫为单细胞原虫,主要寄生在小肠上段,尤其是十二指肠内,有时也寄生在胆囊、胆道和肝胆管内。蓝氏贾弟鞭毛虫及发育分为滋养体和包囊两个阶段。滋养体形如纵切的半个倒置梨子。前端钝圆,后段细尖,背部隆起腹扁而平,腹面前半部向内凹陷形成吸盘,借此吸附于肠壁上,有4对鞭毛,活虫体借助鞭毛摆动作活泼
分析贾第虫病的形成病因
贾第虫滋养体牢固地吸附于十二指肠和近端空肠的黏膜,并二分裂繁殖,释出的虫体很快转化为对外界环境有抵抗力的包囊,包囊随粪排出后经粪-口途径传播,水源性传染是贾第虫病的主要传染源。此外也可经人-人接触直接传染,除人以外,野生动物可成为其保虫宿主。因此山中的溪水和虽经氯化处理但未经严格过滤的城市供水系
异染色质和常染色质的结构差异
染色质可以分为两种类群,异染色质和常染色质。最开始,这两种形式是通过其在染色之后的颜色深浅区分的,常染色质一般着色较浅,而异染色质着色很深,表明其紧密聚集。异染色质通常集中在细胞核的边缘区域。然而,不同于这种早期的二分法,最近的研究表明在动物和植物体内都拥有不止这两种染色体结构,可能会有四到五种,区
常染色质与异染色质的功能差异
常染色质区域的基因可以被转录为信使RNA。常染色质区域非折叠的结构允许基因调控蛋白和RNA聚合酶与其上的DNA序列结合,从而开启转录过程。在转录过程中,并非所有的常染色质都会被转录,但基本上非转录的部分会折叠为异染色质以保护暂时其上不用的基因。因此细胞的活性与细胞核中的常染色质数目有直接关系。常染色
Cell特辑:免疫沉淀
“Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推荐文章集合手册,主要介绍某个生命科学研究领域最新的进展及突出成果。相关特辑内容包括研究论文,评论性文章以及snapshots,涉及了同一领域的方方面面,更为重要的是这些文章由赞助商赞助,可以免费获取。 蛋白与DNA之间
科学家提出深度学习框架用于发现癌症中的新突变
全基因组染色质构象捕获技术(Hi-C技术)已被证明是检测人类基因组中结构变异(SVs)的一种有效方法。然而,目前能够使用Hi-C数据进行全范围检测SVs的算法一直缺乏。目前的方法只能在不太理想的分辨率下,识别染色体间易位和长距离染色体内SVs(>1 Mb)。美国西北大学范伯格医学院研究人员基于深
高通量单细胞ChIPseq确定了乳腺癌染色质状态的异质性
近日,法国巴黎文理研究大学等科研人员在Nature Genetics上发表了题为“High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer”的文章,利用高通
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物,受到紫外光或蓝紫光照射时,可激发成为激发态,当从激发态恢复基态时,发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上,利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染,操
PEG修饰及其修饰GLP1的意义
PEG修饰是一个使多肽或蛋白质在治疗或生物技术方面的效力得以提高的重要过程。当PEG以适当的方式连接在蛋白质或多肽上时,它能改变许多的特征,而主要的生物活性功能,如酶活性或特异结合位点,可以保留下来。PEG修饰通过如下几种途径改善药物的性能。首先,PEG连接在蛋白质或多肽的表面上,提高了它的分子大小
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物,受到紫外光或蓝紫光照射时,可激发成为激发态,当从激发态恢复基态时,发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上,利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染,操
我国科研团队研制成功“量子芯片激光手术刀”
中新社合肥1月3日电 (记者 张俊)记者3日从安徽省量子计算工程研究中心获悉,中国首个专用于量子芯片生产的激光退火仪研制成功,该设备可解决量子芯片位数增加时的工艺不稳定因素,像“手术刀”一样精准剔除量子芯片中的“瑕疵”,增强量子芯片向多比特扩展时的性能,提升量子芯片的良品率。 据安徽省量子计算
金唯智引入Illumina-X10及PacBio测序平台-深化基因组领域业务
近日,金唯智宣布引进全球最高通量的测序平台Illumina HiSeq X-10及最新的单分子基因测序系统PacBio Sequel。这些新平台的加入使得金唯智拥有市场上最先进的高通量测序平台,从而全面加强金唯智在基因组学研究、精准医疗与其它应用领域里的服务范围和能力。 新平台能为客户减低成本
阴和俊调研新疆理化所
8月27日,中国科学院副院长阴和俊和新疆维吾尔自治区人民政府副主席靳诺一行调研新疆理化所。 座谈会上,李晓所长首先汇报了理化所“创新2020”、“十二五规划”以及“科技支疆规划”制订等工作情况。 阴和俊充分肯定了研究所规划的整体思路。他指出,新疆是我国多民族
阴和俊调研过程工程所
3月11日下午,中科院副院长阴和俊调研了中科院过程工程研究所“一三五”战略规划的进展情况。 阴和俊首先考察了多尺度放大调控及重大应用、矿产资源的高效清洁利用技术、生物过程关键技术与装备、离子液体清洁过程与节能技术、高温复合材料与涂层技术等“一三五”代表性平台,听取了科研进展汇报,并就具体问
阴和俊调研长春光机所
参观实验室 9月20日上午,中国科学院副院长阴和俊调研中国科学院长春光学精密机械与物理研究所。 阴和俊一行首先参观了长春光机所某大型光学系统装调现场、特种材料加工工艺研究实验室,实地考察了在建中的应用光学研究及专项光学装备综合研发平台等基建项目和该所投资企业长春
阴和俊调研深圳先进院
8月30日上午,中国科学院副院长阴和俊调研中国科学院深圳先进技术研究院。 阴和俊听取了先进院院长樊建平作的关于先进院整体发展情况的汇报,并听取了先进院二期建设规划和相关项目进展汇报。阴和俊对先进院一期建设成果给予了充分肯定,特别是听到32家先进院孵化的企业本月24日已
阴和俊视察新疆理化所
8月27日,中国科学院副院长阴和俊在新疆维吾尔自治区人民政府副主席靳诺陪同下视察新疆理化所。 新疆理化所所长李晓向阴和俊一行详细汇报了研究所“创新2020”、“十二五规划”以及科技支疆规划制订工作情况。 阴和俊充分肯定了规划的整体思路。他指出,目前新疆的研究所面临新疆
单细胞多组学高通量测序平台(二)
虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出,但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞,早期的技术代表F
赵可吉博士Nature发布重要测序技术
DNase I超敏感位点(DHS)是对DNaseⅠ高度敏感的活性染色质区域。哺乳动物细胞的DHS定位,能够提供转录调控元件和染色质状态的重要信息,一直是科学家们的研究热点。DNase测序(DNase-seq)是进行全基因组DHS分析的常用方法,不过DNase-seq需要数百万细胞,大大限制了该技
RNA加工修饰
中文名RNA加工修饰所属领域生物学定义RNA加工修饰,主要加工方式是切断和碱基修饰,真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。
翻译后修饰
中文名翻译后修饰外文名Post-translational modification定义翻译后修饰是指蛋白质在翻译后的化学修饰。对于大部分的蛋白质来说,这是蛋白质生物合成的较后步骤。
北大汤富酬、乔杰团队Cell-Res表观遗传学新成果
生物通报道:2016年11月8日,国际著名期刊《Cell Research》在线发表了北京大学汤富酬、乔杰团队题为“DNA methylation and chromatin accessibility profiling of mouse and human fetal germ cells”
异染色质的主要类型兼性异染色质
在一定时期的特种细胞的细胞核内, 原来的常染色质可转变成兼性异染色质。如雄性个体的细胞含有一个瘦小的Y染色体和一个大的X染色体, 由于X和Y染色体上很少有共同的基因, 对于雄性来说, X染色体上的基因就只有一个拷贝。虽然雌性细胞有两条X染色体, 也只有一条具有转录活性, 另外一条X染色体像异染色质一
异染色质的主要类型组成性异染色质
组成性异染色质,指除S期以外在整个细胞周期均处于聚缩状态, DNA包装比基本不变,可构成多个染色中心。
普通小麦TaGS2基因表达调控研究获进展
普通小麦是全球重要的粮食作物之一,含有A、B和D三个基因组,不同基因组的同源基因在多倍化过程中会出现功能分化或冗余。解析基因组同源基因表达调控机理有助于加深对功能基因的理解,为小麦新品种设计和培育奠定理论基础。中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心李俊明研究组在表观遗传学及染色质结构参
Scientific Reports:普通小麦TaGS2基因表达调控研究获进展
普通小麦是全球重要的粮食作物之一,含有A、B和D三个基因组,不同基因组的同源基因在多倍化过程中会出现功能分化或冗余。解析基因组同源基因表达调控机理有助于加深对功能基因的理解,为小麦新品种设计和培育奠定理论基础。中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心李俊明研究组在表观遗传学及染色质结构参
广州生物院开发出单细胞测序分析转座元件表达的工具包
3月5日,中国科学院广州生物医药与健康研究员研究院陈捷凯课题组与南方科技大学研究员Andrew Hutchins课题组合作,开发出单细胞测序分析转座元件表达的工具包scTE。相关研究成果以Identifying transposable element expression dynamics a