著名学者解析如何利用质谱确定蛋白复合物的结构
质谱技术已经成为了蛋白质组学研究的主力。这种技术方法能精确的检测多肽,从而帮助研究人员识别并测序多肽分子,分析它们的特征,了解它们如何进行化学修饰的。 但大多数蛋白质并不是单独行动的,一些关键的生物学过程,如DNA 复制、转录、翻译、细胞分裂和能量生成都依赖于大型蛋白复合物的行为,这些蛋白复合物常常涉及几十个亚基,十分复杂,传统的质谱方法难以进行研究。为此研究人员不断改进质谱技术,希望能通过技术改进来解决这个问题: 解析蛋白复合物的构架 研究员:俄亥俄州立大学著名学者,化学和生物化学教授Vicki Wysocki 研究项目:整个复合物分析的仪器研发 解决方案: 借助于其在化学分析方面的经验,Vicki Wysocki致力于蛋白复合物的仪器分析。她的实验室研发了一种称为表面诱导解离技术 (surface-induced dissociation,SID,生物通译)。 这种方法与其它许多种片段化方法一样,都是利用质......阅读全文
新质谱技术可获取完整蛋白复合物重要结构信息
本周的《自然―方法学》介绍了一种提高质谱仪分辨率和可用性的改进方法,科研人员可利用该方法获得完整蛋白复合物的重要结构信息。 关于大型蛋白复合物的详细结构信息包括可与之结合的分子有哪些、该复合物是如何组成的等,是可以通过使用能检测高分子量离子的质谱技术来获得的。迄今为止,这项技术的实现需要采用特殊定
蛋白鉴定方法之质谱相关技术
质谱已成为连接蛋白质与基因的重要技术,开启了大规模自动化的蛋白质鉴定之门。 用来分析蛋白质或多肽的质谱有两个主要的部分,1)样品入机的离子源,2)测量被介入离子的分子量的装置。 首先是基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOF)为一脉冲式的离子化技术。 它从固相标本中产生离子,并在飞
著名学者解析如何利用质谱确定蛋白复合物的结构
质谱技术已经成为了蛋白质组学研究的主力。这种技术方法能精确的检测多肽,从而帮助研究人员识别并测序多肽分子,分析它们的特征,了解它们如何进行化学修饰的。 但大多数蛋白质并不是单独行动的,一些关键的生物学过程,如DNA 复制、转录、翻译、细胞分裂和能量生成都依赖于大型蛋白复合物的行为,这些蛋白复合
质谱流式技术——蛋白水平的单细胞技术
摘要:在蛋白质水平,流式一直是最为常用的单细胞分析手段。但是由于串色等问题的困扰,流式通常只能进行6~10种蛋白的同时检测。质谱流式技术的出现给研究者带来了惊喜。利用分辨力超强的质谱技术以及独特的金属标记抗体,CyTOF2质谱流式细胞仪在检测通道数量和信号质量两方面都有了质的提升。单细胞技术在近年来
促进质谱新技术,传承质谱文化
——第六届中国仪器仪表学会分析仪器分会质谱专业委员会诞生2022年8月26日,由中国仪器仪表学会分析仪器分会质谱仪器专家组和分析测试百科网主办的《第五届质谱仪器研发论坛》在北京市怀柔区举办。本次大会旨在进一步加强我国质谱新技术研发、应用、产业化及投资等方面的交流、促进我国质谱行业健康快速发展。质谱研
质谱联用技术
质谱仪是一种很好的定性鉴定用仪器,对混合物的分析无能为力。色谱仪是一种很好的分离用仪器,但定性能力很差,二者结合起来,则能发挥各自专长,使分离和鉴定同时进行。因此,早在20世纪60年代就开始了气相色谱-质谱联用技术的研究,并出现了早期的气相色谱-质谱联用仪。在70年代末,这种联用仪器已经达到很高的水
飞行质谱技术
工作原理早期的飞行质谱为基质辅助激光解吸离子飞行质谱(maldi-tofms),基质使被分析蛋白质离子化,再由质谱测定。seldi把基质改为以色谱原理设计的蛋白芯片,增强了分离能力。芯片技术最初应用于DNA分析,称基因芯片。由于芯片整合了多种高技术:高度集成、超微化、计算机化、自动化,具有多样、快速
飞行质谱技术
飞行质谱的全称是表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF或SELDI)。质谱技术-飞行质谱是由2002年诺贝尔化学奖得主田中(Tanaka)发明,赛弗吉(Ciphergen)系统生物公司制造的特殊芯片,诞生伊始便引起学术界的重视,成为最引人注目的亮点。 工作原理 早期的飞行质谱为基
华盈视角:蛋白质组学——质谱技术
蛋白质作为功能的直接执行者,在生物医学领域中有着重要意义,检测蛋白质表达、修饰、互作等有助于我们理解生命机体的各类机制和活动规律,为疾病的治疗、诊断,药物的开发、优化等提供有力的支持。质谱技术作为检测蛋白质组学的主流技术,有必要了解其核心原理,才能更好的服务于科学问题的解决。1.质谱的原理: 质谱是
细胞质谱技术
细胞质谱技术(CytoMS)是指直接对细胞进行分析的质谱技术,可追朔到15年以前,当时采用的是激光捕获微切割(LCM)从目标细胞上采集生物分子,然后在线或离线结合质谱进行分析,主要是蛋白质组学中采用此策略。单细胞免疫质谱技术(Single Cell ImmunoMS)是当前质谱新应用之一,采用多种不
质谱技术及其应用
21世纪的最前沿科学之一,随着人类第一张基因序列草图的完成和发展,生命科学的研究也将进入一个崭新的后基因组学,即蛋白质组学时代。正如基因草图的提前绘制得益于大规模全自动毛细管测序技术一样,后基因组研究也将会借助于现代生物质谱技术等得到迅猛发展。本文拟简述生物质谱技术及其在生命科学领域研究中的应用。1
质谱及其联用技术
(一)质谱(MS)法常用的离子化方式:基本原理是将供试物分子经一定离子化方式,如电子轰击或其它离子化方式,一般是把分子中的电子打掉一个成为M+,继之裂解成一系列碎片离子,再通过磁场使不同质荷比(m/z)的正离子分离并记录其相对强度,绘出MS图。即可进行元素分析、分子量测定、分子式确定和分子结构的解析
质谱技术优缺点
优点高特异性、高灵敏度、单次分析的快速性、检测信息的丰富性,以及对复杂生物基质分析的高耐受性不足:1、所需的标准物质、试剂、耗材和仪器的维修服务等成本高;质谱实验室的仪器设备昂贵,技术人才匮乏,临床应用的门槛高。 2.自动化程度较低,对人依赖性较大;同时在数据处理和报告发放环节,仍未实现自动化;3.
色谱质谱联用技术
色谱质谱联用技术 一、联用技术的必要性 每种分析方法都有其特长和局限性。在线联用不仅能取长补短,而且还具有协同作用,获得两种技术单独使用时所不具备的某些功能。 色谱用于分离,而光谱用于结构鉴定,两者联用,不仅可以对混合物中的各未知组分进行定性,也可用于定量分析。 二、气相色谱-质谱联用(
蛋白质质谱测序
蛋白质谱一般来讲是用来对某个蛋白质进行鉴定的方法而蛋白质测序实际上就是检测蛋白质的多肽链数目,不一定要用到质谱技术简单说,蛋白质测序的方法有很多,一般是在构建完成后,通过测序来对比之前的预测的序列是否正确。而质谱检测一般是用在蛋白质表达纯化完成后,用来鉴定是否是最初设计的那个蛋白。
我所发表功能蛋白质复合物发现和结构表征质谱策略综述
近日,我所生物技术研究部生物分子结构表征新方法研究组(1822组)王方军研究员团队与南方科技大学田瑞军教授团队合作,发表了功能蛋白质复合物发现和结构表征质谱策略的综述文章。 功能蛋白复合物的发现和结构—功能表征研究在理解和干预生物学过程中发挥着至关重要的作用。亲和纯化质谱(AP-MS)是发现功
蛋白质质谱测序技术和仪器国产化
2015年10月17日,第二届全国质谱分析学术报告会在浙江大学紫荆港校区体育馆盛大开幕,在5位院士的精彩报告后,多位学者做了高水平的大会报告。 复旦大学杨芃原教授:蛋白质质谱测序技术和仪器国产化 复旦大学教授杨芃原教授做题为《蛋白质质谱测序技术和仪器国产化》的报告。蛋白质质谱测
赛默飞世尔质谱技术发现蛋白标记物
摘要: 赛默飞世尔科技今日宣布将与乔治梅森大学(GMU)的研究者们合作,来验证GMU利用赛默飞世尔的质谱技术而发现的蛋白标记物(biomaker)。 GMU应用蛋白质组和分子医药中心(CAPMM)的科学家们将会利用赛默飞世尔的中TSQ Quantum Ultra三重四极杆质谱仪来发现癌症标记物,
质谱技术在蛋白组研究中的应用(一)
[摘要] 质谱对于现代蛋白质化学研究是一项重要的技术。也可用于蛋白组分析,在同一时间监控上千种蛋白的表达情况。首先蛋白质混合物可以用双向凝胶电泳分开,再用质谱及随后的蛋白质数据库检索对单个蛋白进行鉴定和分析。最近几年,质谱领域取得了令人鼓舞的进展,使得全自动、高通量的蛋白检测成为可能。质谱也
定量蛋白质组学质谱采集技术进展(四)
无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决
定量蛋白质组学质谱采集技术进展(三)
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同时监测最多10 ~15 个母离子,而SRM 能同时监测上百个离子对,因为高分辨质谱的有效扫描速度通常只有10 ~15 Hz,远慢于SRM 的有效扫描速度。但是这一问题正逐步得到解决,多重累积(Multiplexing, MSX)技术的发展和使用有
蛋白质质谱鉴定技术概述及常见问题
蛋白质(Protein)是生物体中含量最高,功能最重要的生物大分子,存在于所有生物细胞,作为生命的物质基础之一,蛋白质在催化生命体内各种反应进行、调节代谢、抵御外来物质入侵及控制遗传信息等方面都起着至关重要的作用,因此蛋白质也是生命科学中极为重要的研究对象。现代研究结果发现越来越多的多肽同蛋白质一样
定量蛋白质组学质谱采集技术进展(二)
同步母离子选择(Synchronous precursor selection, SPS)技术的出现彻底解决了MS3 响应弱的问题。SPS 技术利用多频切迹的选择波形电压(MultiNotch) [27] ,在线性离子阱中实现一次选择同时获得多个离子,最多可同时选择15 个(图2A)。利用这一原理,
定量蛋白质组学质谱采集技术进展(一)
摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋
质谱技术在蛋白组研究中的应用(二)
6 质谱仪的最新进展 用质谱检测蛋白,首先考虑到用PMF与 MALDI-TOF联用,如果无法检测,下一步就用ESI-MS/MS创建序列标签。在PMF分析中,MALDI的平板中只需一小部分样本就足以检测,剩下的样本就可以用来创建序列标签。并且,在MALDI-TOF仪器上,用一种叫做“源后延迟”
深度揭秘氦质谱检漏技术——氦质谱检漏技术历史及原理
一、氦质谱检漏技术的发展历史第二次世界大战中期,美国为了制造原子弹,在田纳西州的橡树岭(Oak Ridge)建立的大规模分离铀-235的工厂。为了探测电磁分离器真空系统中的漏孔,1943年由明尼苏达州大学的A.O.C.Nier设计了世界上第一台具有简易气体分析器的玻璃外壳的质谱检测仪。它使用一个热灯
基于糖苷键质谱可碎裂交联剂的蛋白质复合物原位解析
近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员张丽华团队,研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂,显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度,同时具有良好的两亲性和生物兼容性,实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者,蛋白质通过相
临床质谱技术在中国
质谱技术这一长期流连于科研院所的检测技术,因其巨大的潜在临床应用前景,正逐渐被检验医学领域所关注。目前国内质谱技术在临床医学的应用尚处于起步阶段,国内许多三甲医院与第三方独立医学实验室都纷纷布局临床质谱技术。质谱技术对于中国的临床检验发展究竟有着什么样的作用?质谱是怎样的一种技术?
质谱技术有哪些应用?
近年来质谱技术发展很快。随着质谱技术的发展,质谱技术的应用领域也越来越广。由于质谱分析具有灵敏度高,分析速度快,样品用量少,分离和鉴定同时进行等优点,因此,质谱技术广泛的应用于化学、能源、运动医学、刑侦科学、医药、化工、环境、生命科学、材料科学等各个领域。 质谱仪种类繁多,不同仪器应用特点也不
MassARRAY核酸质谱技术特点
多重反应,检测成本低单个反应达10~60重检测,且只需简单的PCR及延伸试剂,无需荧光探针,无需高成本人员投入,检测成本极低高准确度和灵敏度分型准确性>99.7%,是SNP检测的金标准;灵敏度可达0.1%的低频等位基因或稀有突变进行检测;检测周期短检测流程和数据分析简单-从DNA到结果输出仅需8小时