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定量蛋白质组学质谱采集技术进展(一)

摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋白质组学在相对定量和绝对定量分析方面的局限提供了有效途径。本文对定量蛋白质组学目前遇到的瓶颈问题进行了分析,总结了质谱定量采集技术的最新进展,并评述了这些新技术的特点以及在定量蛋白质组学应用中的优势。 关键词 定量蛋白质组学; 同步母离子选择; 平行反应监测; 数据非依赖性采集; 综述 1引言 当今蛋白质组学的关注焦点和研究趋势已经逐渐从定性分析转向定量分析。定量蛋白质组学是对细胞、组织乃至完整生物体的蛋白质表达进行定量分析,对生物过程机理的探索和临床诊断标志物的发现与验证具有重要意义[1,2] 。定......阅读全文

质谱检测法与蛋白质分析(二)

传统的和最新的蛋白质组学研究策略虽然到目前为止,还没有一种蛋白质组学研究策略能够对某个蛋白质组进行常规的、完整的分析,但是现在的技术已经非常强大,我们相信,很快就能进行全蛋白质组学研究了。而且,对某个亚蛋白质组(比如某个细胞器或亚细胞结构的蛋白质组)进行研究早就已经不是什么难题了,这已经成为了一种常

质谱仪

最近又有几项有关质谱仪的最新进展问世,这些新成果的出现又给我们的生物大分子研究工作补充了“弹药”。在蛋白质测序方面,基于碰撞诱导裂解技术(CID),又新出现了可变裂解技术(Alternate fragmentation technique),该新技术是基于处在碰撞池中的离子具有的电子传递特性开发出来

全国质谱分析学术研讨会:组学及生命分析分会

  2014年4月27日下午,中国化学会首届全国质谱分析学术研讨会组学及生命分析分会在北京西郊宾馆召开。在此次的组学及生命分析分会报告中邀请了清华大学化学系/分析中心的梁琼麟教授; 中国科学院大连化学物理研究所的张丽华教授;中国科学院北京基因组研究所的刘斯奇教授; 复旦大学的陆豪杰

赛默飞世尔科技:为蛋白质组学提供深层次解决方案

  【导语】 毫不夸张地说,蛋白质组学的兴起推动了整个质谱的研发和应用,使质谱产品层出不穷,并应用于更多的组学、更多的复杂体系研究中。蛋白质组学面临的挑战也促使质谱的研发者们不断推出创新的技术,比如第6种质量分析器Orbitrap的出现,以及随之出现的一系列新的研究流程和方法。在第六届AO

质谱检测法如何进行蛋白质分析?

  MS/MS操作模式  串联质谱仪通常使用的都是离子模式来鉴定蛋白质的氨基酸序列。目前所有的MS/MS质谱仪都具有该功能。不过其它特殊的质谱仪也具有MS/MS功能。如果要发现蛋白质中的某个功能基团则需要用到母离子扫描功能或者中性丢失扫描功能,而这就必须用到三重四级杆质谱仪,如Q-Q-Q质谱仪,或四

蛋白质组技术的研究进展

  大规模基因组测序计划的实施已改变生命科学的重心,在相当短的时期内,一些原核生物和某些低等真核生物的基因组序列已被测定. 1995年,流感嗜血杆菌基因组序列首次被破译,在此后不到两年的时间,近50个细菌的基因组序列已被完成. 然而,这仅仅是理解有机物功能的一个起点. 在基因组时代,许多DNA序列信

聚焦药物和蛋白 质谱技术创新开发临床应用研讨会落幕

  分析测试百科网讯 2018年7月6日,由上海市徐汇区中心医院/复旦大学附属中山医院徐汇医院,中国科学院上海临床研究中心,上海市徐汇区医学会共同主办,分析测试百科网承办的“质谱技术的创新开发及临床应用研讨会”在上海市徐汇区中心医院召开(相关链接:聚焦质谱技术创新开发与应用 拓展临床质谱方法学研究)

2017年暑假生物医学大型仪器理论与实验技术培训班

(二轮通知 2017年7月10~19日,北京)  中国医学科学院基础医学研究所∕北京协和医学院基础学院在医学领域具有国内一流的影响力和知名度,以尖端的医学研究及出色的理论和实验教学成为著名的医学科学研究与教育基地。为了培养生物医学领域创新人才,现推出一年一度的,以尖端仪器和实战训练为特色的“大型仪器

郭天南:全景式组学研究为新冠重症早诊断提供决策依据

  分析测试百科网讯 在新冠肺炎COVID-19疫情肆虐全球之际,PCR技术在快速筛查中已大显神威,但进入临床后如何更早地区分轻症和重症患者,从而更准确地治疗和用药?5月27日中国研究人员在《Cell》发表文章,利用蛋白质组学和代谢组学的全景式分析,发现了重症患者体内应对病毒进攻特征性的分子改变,并

“空间定位组学”和“4D组学”建起科学研究与疾病治疗的桥梁

  分析测试百科网讯 布鲁克一直以MALDI技术闻名全球,并已在成像领域占据领导地位;自去年推出timsTOF Pro创新组学系统后,在深度覆盖和高通量蛋白质组学分析中取得了突破性的进展,并且迅速和国内院校和企业开展了一系列深度的合作。比如timsTOF系列,已和北京大学、清华大学、复旦大学、厦门大

蛋白质组最新研究进展

  蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物,蛋白质组中蛋

质谱MRM技术定量分析与应用

质谱多反应监测(multiple reaction monitoring, MRM)技术作为一种质谱检测的分析方法,具有特异性强、灵敏度高、准确度高、重现性好、线性动态范围宽、自动化高通量的突出优点,这些特质能够满足今天很多研究领域的迫切需要。通过MRM技术进行实时的定量监测可以进行药代动

1100学者齐聚杭州 第二届质谱大会开幕

  分析测试百科网讯 2015年10月17日,第二届全国质谱分析学术报告会(质谱大会)在浙江大学紫荆港校区体育馆盛大开幕,本次大会由中国化学会、国家自然科学基金委员会主办,中国化学会质谱分析专业委员会、浙江大学化学系承办。浙江大学副校长罗建红教授、南京大学陈洪渊院士、中

布鲁克总裁专访:科学大咖灵感加磅 timsTOF创新广泛开花

  分析测试百科网讯 东方人的思维更偏向于实用主义,比如大家常认为创新来自于应用驱动;世界上还有一种创新首先来自于技术或理论的突破,然后再去寻找应用的方向,布鲁克的timsTOF便是后者。2016年发布Trapped Ion Mobility捕集离子淌度质谱后,引起了组学和临床领域科学大咖们的广泛兴

2012中国质谱学会第32届学术年会大会报告(二)

  2012年8月13日,由中国质谱学会主办,中国工程物理研究院核物理与化学研究所承办的2012中国质谱学会第32届学术年会暨第九届全国质谱代表大会在“彩云之南云之端”的“春城”昆明盛大召开(http://www.antpedia.com/news/88/n-231788.html)。来自

张玉奎院士等专家在2012年北京色谱年会上作大会报告

  2012年12月07日,北京,2012年北京色谱年会热烈召开。促进了北京地区色谱以及色谱相关领域的技术应用与交流。围绕“色谱新技术及其应用”的主题,展开多场报告,内容包括蛋白质组学、色谱技术、色谱与质谱、色谱与核磁共振、金属组学、代谢组学、生物气味研究、环境分析等。中国科学院大连化学物理研究所张

华东色谱质谱会学术报告荟萃

  第四届华东地区色谱、质谱学术报告会暨仪器展示会上,二十余位学术专家和仪器公司的技术专家做了精彩的学术报告,内容包括近两年来色谱、质谱技术研究、分析测试方法等在食品安全、环境、化工、生物医药(包括体内药物分析)、农药、农残、药残等领域的分离、分析和质量控制等方面的发展

质谱沙龙第三十三期活动报道

  2011年9月25日,第三十三期质谱沙龙活动在北京大学分析测试中心成功举行。来自第二炮兵总医院、北京大学、中科院微生物研究所、中国医学科学院基础医学研究所、空军总医院、AB SCIEX公司、北京艾米诺医学研究有限公司等,近四十位专家、学者、技术工程师参加了本次沙龙活动,本次沙龙以大分子为主题,共

蛋白质组技术的研究进展

大规模基因组测序计划的实施已改变生命科学的重心,在相当短的时期内,一些原核生物和某些低等真核生物的基因组序列已被测定. 1995年,流感嗜血杆菌基因组序列首次被破译,在此后不到两年的时间,近50个细菌的基因组序列已被完成. 然而,这仅仅是理解有机物功能的一个起点. 在基因组时代,许多DNA序列信息仅

CNCP-2018在京开幕 计算蛋白质组学——小人物的学术盛会

  分析测试百科网讯 2018年08月22日,“第五届中国计算蛋白质组学研讨会(CNCP-2018)”在中国科学院计算技术研究所举行。CNCP-2018由中国科学院计算技术研究所、中国人类蛋白质组学会(CNHUPO)、北京蛋白质组研究中心徐平实验室、北京生命科学研究所董梦秋实验室、中国科学院大连化学

质谱技术在临床诊断领域的应用趋势

  质谱技术是过去几十年中受到临床实验室认可并快速发展的最新技术, 近十年来影响了医学及临床实践的诸多领域。气相色谱质谱(gas chromatography/mass spectrometry, GC/MS)技术最早被应用于各类临床检测, 此后各类型质谱技术被不同应用领域所接受, 包括毒理学、微生

第六届AOHUPO大会报告集锦(二)

  第六届亚太人类蛋白质组组织(AOHUPO)大会于2012年5月5日下午在北京国家会议中心开幕。这是亚太地区规模最大、影响最广、学术水平最高的蛋白质组学学术峰会。有20多个国家和地区的1000多名专家学者参会,提交相关领域学术论文近400篇。5月6日,大会继续进行,各

中国人类蛋白质组计划:精准解密中国人的健康密码

  中国科学院院士贺福初有一个比喻:基因组和蛋白质组的关系就像词典与文章、元素表与化工厂。基因组学中微小的差异,在蛋白质组学中可以被千倍甚至近万倍地放大。因此,要真正阐释生命,必须从蛋白质组中寻找答案。  北京市昌平区中关村生命科学园的主入口处,一栋由南北双楼组成的银白色建筑呈一字型展开。这里是国家

中国人类蛋白质组计划:精准解密中国人的健康密码

  中国科学院院士贺福初有一个比喻:基因组和蛋白质组的关系就像词典与文章、元素表与化工厂。基因组学中微小的差异,在蛋白质组学中可以被千倍甚至近万倍地放大。因此,要真正阐释生命,必须从蛋白质组中寻找答案。  北京市昌平区中关村生命科学园的主入口处,一栋由南北双楼组成的银白色建筑呈一字型展开。这里是国家

2016年寒假生物医学大型仪器理论与实验技术培训班二轮通知

2016年寒假生物医学大型仪器理论与实验技术培训班二轮通知(2016年1月20~28日)   中国医学科学院基础医学研究所∕北京协和医学院基础学院在医学领域具有国内一流的影响力和知名度,以尖端的医学研究及出色的理论和实验教学成为著名的医 学科学研究与教育基地。为了培

质谱检测法与蛋白质分析(一)

质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高,希望检测技术的灵敏度也越来越高,同时能够对更为复杂的样品进行分析处理,因此推动了质谱检测技术的发展,出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。本文将对近几年质谱技术的发展以及质谱技术在蛋白质

北京色谱年会十周年 浓墨重彩话色谱

中科院大连化学物理研究所 张玉奎院士   来自中科院大连化学物理研究所的张玉奎院士与大家分享的报告题为《色谱进展—机遇和挑战》。   从1990年至2010年,中国色谱论文的总量达28324篇,占全球总数的22%;GC、HPLC、CE研究呈明显增长。近20年来,中国的色谱研究在全球

质谱检测法与蛋白质分析

在生命科学研究工作中有一个重要问题,就是发现、鉴定蛋白质并弄清楚它们的一级结构。知道了蛋白质的氨基酸序列信息,我们就可以通过遗传密码将其与编码序列对应起来,从原则上来说,也就将细胞的生理学与遗传学联系起来了。发现、鉴定出了一个蛋白质就好像给我们打开了一扇窗,透过这个窗口,我们就能够对复杂的细胞调控网

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(四)

无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决

首届尿液生物标志物研讨会 Urimarker 2015 在京举办

  分析测试百科网讯 2015年4月25日,首届尿液生物标志物研讨会在北京师范大学举办,会议旨在建立一个平等、自由、高效的学术交流与合作的平台,促进基础研究团队和临床医师合作,促进新的尿液标志物的产生和研究成果转化。会议由高友鹤教授发起,赛默飞世尔科技赞助,邀请了具有临床生物标志