华盈视角:蛋白质组学——质谱技术

蛋白质作为功能的直接执行者,在生物医学领域中有着重要意义,检测蛋白质表达、修饰、互作等有助于我们理解生命机体的各类机制和活动规律,为疾病的治疗、诊断,药物的开发、优化等提供有力的支持。质谱技术作为检测蛋白质组学的主流技术,有必要了解其核心原理,才能更好的服务于科学问题的解决。1.质谱的原理: 质谱是一种测量分子量与电荷之比(m/z)的原理的分析技术。其基本原理包括样品离子化、离子碎裂、离子检测和数据分析。 图1 质荷比首先,样品经过离子化过程,常用的离子化方法包括MALDI(基质辅助激光解吸电离)、ESI(电喷雾电离)等。离子化后样品中的分子会变成带电离子。然后,离子被引入质谱仪的质量分析器,目前蛋白质谱最常用的质量分析器如Orbitrap(静电场轨道阱)和Quadrupole(四级杆)。这些质量分析器利用内部的磁场或电场对离子进行检测、分离、排序等,通过检测器收集数据信息进行后续的分析。 图2 质谱检测原理......阅读全文

华盈视角:蛋白质组学——质谱技术

蛋白质作为功能的直接执行者,在生物医学领域中有着重要意义,检测蛋白质表达、修饰、互作等有助于我们理解生命机体的各类机制和活动规律,为疾病的治疗、诊断,药物的开发、优化等提供有力的支持。质谱技术作为检测蛋白质组学的主流技术,有必要了解其核心原理,才能更好的服务于科学问题的解决。1.质谱的原理: 质谱是

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(三)

然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同时监测最多10 ~15 个母离子,而SRM 能同时监测上百个离子对,因为高分辨质谱的有效扫描速度通常只有10 ~15 Hz,远慢于SRM 的有效扫描速度。但是这一问题正逐步得到解决,多重累积(Multiplexing, MSX)技术的发展和使用有

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(四)

无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(一)

摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(二)

同步母离子选择(Synchronous precursor selection, SPS)技术的出现彻底解决了MS3 响应弱的问题。SPS 技术利用多频切迹的选择波形电压(MultiNotch) [27] ,在线性离子阱中实现一次选择同时获得多个离子,最多可同时选择15 个(图2A)。利用这一原理,

质谱和蛋白质组学:击中目标

Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008)   作者:Nathan Blow   分析测试百科  译     近年来,质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度,使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面,更从容地面对挑战。     在2008年6月的美国质谱大会(ASMS)

综述:基于质谱技术的糖蛋白质组学与糖组学研究进展

   糖是组成生命体的四大类重要分子之一,糖蛋白质是由糖链与肽链中的特定氨基酸残基以糖苷键共价连接而成的蛋白质。糖蛋白质普遍存在于生物体内,在很多生命过程中起着重要作用,如蛋白质的折叠、细胞之间的相互识别、炎症反应等。同时,糖基化修饰在疾病中,特别是肿瘤的发生、发展和转移过程中也起到重要作用,许多疾

质谱技术帮助科学家发现蛋白质组学重要成果

最近,来自瑞士和荷兰的科学家,对在22种不同生长条件下大肠杆菌表达的蛋白质,进行了定量和定性分析。确定了超过2300个蛋白质,其中一些处于每个细胞一个副本的平均水平。由此产生的数据集描述了细胞中大多数(> 90%)的蛋白质量,对细胞生物学家来说这将是一个宝藏。相关研究结果发表在十二月出版的《Na

AB-SCIEX推出创新的蛋白质组学质谱应用新技术

  将与苏黎世联邦理工学院通力合作,专注发展 TripleTOF 5600 系统上的 SWATH™ 采集方式,来研究全面的系统蛋白质组学  马萨诸塞州弗雷明汉市2011年6月7日电 /美通社亚洲/  --苏黎世联邦理工学院及 AB SCIEX(全球领

质谱组学,引领精准

  8月,上海。炎炎夏日,骄阳似火,正值生机盎然的季节,一场造福行业发展的合作协议今日于上海签订。赛默飞世尔科技(中国)有限公司和上海中科新生命生物科技有限公司在多组学及精准医疗领域,建立战略合作伙伴关系。出席本次签订协议的嘉宾有赛默飞世尔科技(中国)有限公司商务运营副总裁冯时瀚先生、上海中科新生命

《自然》子刊专题:蛋白质组学中的质谱

涉及到蛋白质组学分析的研究人员都知道蛋白质组学研究的技术路线有两条,一条是以双向电泳加生物质谱的方法鉴定生物体系中各种蛋白的表达谱以及各蛋白表达程度的相对变化,另一条路线就是多维色谱与生物质谱相结合的称之为鸟枪法的技术路线。其中质谱分析技术(Mass spectrometry,MS)是蛋白质组学常用

蛋白质组学质谱分析

Proteomics Primer1. Proteomics2. 2-D PAGE3. Immobilised pH gradients (IPGs)4. Mass spectrometry5. Principles of mass spectrometry6. Matrix assisted la

AB-SCIEX三大质谱平台支撑蛋白质组学研究

  2010年10月18~19日,由国家自然科学基金委、中国化学会分析化学委员会主办,复旦大学、上海交通大学承办的2010年微纳尺度分离和分析技术学术会议暨第六届全国微全分析学术会议在上海复旦大学复宣大酒店隆重召开。来自全国高等院校、科研机构、企事业单位的300余名专家学者出席了本次会议。

张丽华:搭建蛋白质组学研究平台

  分析测试百科网讯 自然科学研究,原则上应该是理性思辨能力更强的男性占优;而从屠呦呦获得了诺贝尔奖可以推断,女性从事科学研究同样可以做得出色。在分析化学领域,有这样一位女性。她曾荣获2015年“中国青年女科学家奖”;在和男性同台竞争的舞台上,她2014年入选了中组部“万人计划”; 2017年获得了

第三届质谱论坛:质谱技术在组学研究中的应用

技术讲座 沃特世科技(上海)有限公司技术专家 贾伟博士   来自沃特世科技(上海)有限公司技术专家贾伟博士带来了题为《蛋白质结构质谱分析技术进行》的报告。贾博士在报告中重点介绍了蛋白质修饰分析、蛋白高级结构分析和蛋白差异构象分析这三方面内容。   蛋白质修饰分析   蛋白质

质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法

2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动

生物质谱技术在蛋白质组学中的应用

  一、 前言[1,2]   基因工程已令人难以置信的扩展了我们关于有机体DNA序列的认识。但是仍有许多新识别的基因的功能还不知道,也不知道基因产物是如何相互作用从而产生活的有机体的。功能基因组试图通过大规模实验方法来回答这些问题。但由于仅从DNA序列尚不能回答某基因的表达时间、表达量、蛋白质翻

蛋白质组学研究技术

可以说,蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基(20/ 4), 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰,如磷酸化和糖基化等,给分离和分析蛋白质带来很多困难。此外,

蛋白质组学+AI技术

人们在吞咽的时候,颈部有个器官会随着吞咽动作上下活动,它就是甲状腺。西湖欧米有望实现临床转化的第一个项目,就是基于蛋白质标志物的甲状腺结节的良恶性诊断。甲状腺很小,但它影响到五脏六腑。数据显示,每5个成年人中就可能有1人患有甲状腺结节。其中,约60%的甲状腺结节都是良性的。但有10%的结节是恶性的,

“组学国标”项目结硕果:最精准的mRNA测序与蛋白质组质谱

  二代测序、蛋白质组质谱,这些“高大上”的组学手段早已不是稀罕事,使人们对生命和疾病的理解进入了一个崭新的时代。这些组学技术大量用于科研的同时,在应用领域却陷入了巨大的困境。  蛋白质组质谱技术和RNA测序目前几乎没有任何值得一提的临床应用,即便是在临床应用得相对较多的DNA测序,也饱受重复性差、

岛津携手质谱专家,北京共话组学发展 ——2023北京质谱专家沙龙组学专题会议

2023年8月17日,岛津企业管理(中国)有限公司举办的“2023质谱专家沙龙-组学专题会议”在北京成功召开。会议旨在促进质谱及组学行业专业人士交流、学习与合作。来自于国内各大高校及科研院所的四十余位专家学者参加了本次会议。 会议现场 主持人 岛津企业管理(中国)有限公司,分析计测事业部营业部,北京

ZenoTOF™-7600系统:揭开脂质结构神秘面纱,提供组学新视角

代谢组学和脂质组学已越来越成为生命科学研究的关键手段,然而脂质分子的精准结构阐释、低丰度代谢物的准确定性和定量,依然存在挑战。以花生四烯酸为例,其学名为二十碳四烯酸,属Omega6族长链多元不饱和脂肪酸,这种具有四个双键的20碳脂肪酸于1909年由 Percival Hartley 从哺乳动物组织中

杭州质谱学术大会系列:Astral突破质谱组学新极限

  ——2020-2023杭州质谱学术大会系列报导  6月11日,中国质谱学术大会 “新方法与新技术”专场报告中,来自北京生命科学研究所董梦秋研究员、中科院大连化物所张丽华研究员、南京大学鞠幌先教授、赛默飞应用主管范自全等专家、学者和企业代表带来了关于蛋白质相互作用、结构分析的最新质谱检测方法与应用

质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法介绍

  2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

基于质谱的蛋白质组学,揭示不老分子的抗衰奥秘

  ——清华大学蛋白质化学与组学平台主管邓海腾教授专访  近年来, NAD+的前体NMN作为抗衰老保健品成为京东最畅销的商品,这是因为NAD+可能和每个人的健康寿命都有关系。这激励着更多科学家们开展研究,探索NAD+多靶标抗衰老的功效和机理。基于质谱的蛋白质组学研究方法也在NAD+的研究中发挥重要作

谭敏佳:色谱质谱双翼护航-助力蛋白质组学新突破

  分析测试百科网讯 2021年9月23日,赛默飞双重新品线上直播发布会召开,重磅推出了Thermo Scientific™ TSQ™ Plus 三重四极杆质谱仪和Vanquish Neo UHPLC 系统,为蛋白质组学、精准医学、制药和生物制药、临床研究、转化研究等领域提供了从色谱到质谱的高效、高

蛋白质组学实验技术大全

每一个领域的发展都是基于技术的进步和革新,蛋白质组学亦然。蛋白质的可变性和多样性等特殊性质导致了蛋白质研究技术远远比核酸技术要复杂和困难得多,但正是这些特性参与和影响着整个生命过程。在开始实验之前,先看看这篇技术简介吧。一 蛋白质与DNA相互作用在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与

蛋白质组学鉴定技术流程

蛋白质组(Proteome)的概念,蕞早由澳大利亚Macquarie大学的Wilkins和Williams于1994年首先提出的,是指一个基因组(Genome),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质组学(Proteomics)以细胞、组织或生物体全体蛋白质为研究对象,通过高通量的色谱质谱联用技术