北大汤富酬发表表观基因组新成果
表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性。基因表达在时间和空间上的表观遗传学调控,对于人类发育是至关重要的。近年来,表观基因组已经成为了生物医学领域的一大研究热点。 北京大学的研究团队对早期人类胚胎进行深入研究,获得了胎儿大脑、心脏和肝脏的表观基因组景观。这一成果发表在十二月三十日的Journal of Biological Chemistry杂志上,文章的通讯作者是北京大学的汤富酬研究员。 ChIP-seq将染色质免疫共沉淀与新一代测序结合起来,是研究表观基因组的强大工具。研究人员在早期人类胚胎中对大脑、心脏和肝脏的多种组蛋白标签进行了ChIP-seq分析,鉴定了40,181个活跃的增强子。这些增强子大多存在组织特异性和发育阶段特异性,说明它们可以在早期人类胚胎中控制发育基因的有序时空表达。 研究人员通过sequential ChIP-seq发现,这三个器官都拥有大量H3K4me3和H3K27me3......阅读全文
关节炎中的表观遗传学基因开关
一项新研究发现DNA甲基化是控制MMP13酶基因的开关,而MMP13酶具有重要的软骨破坏作用。文章发表在FASEB Journal杂志的网站上。 骨关节炎是一种退行性关节疾病,该疾病的典型症状是患者关节软骨持续不可逆的损失,这主要是由于基质金属蛋白酶MMP13破坏基质中的II型胶原引起
不可忽视的表观遗传学:运动可改变DNA
瑞典德隆大学的科研人员发现运动可以从基因角度改变脂肪存储的方式。脂肪组织不仅可以被动地存储能量,还能够产生一些具有生物活性的化学物质作用于身体的其他部位。这项研究表明,运动可以使人体的脂肪细胞更高效地进行脂肪代谢,从而使脂肪存储在正确的部位。这项研究发表在Public Library of
Aging:雷帕霉素可以延缓表观遗传学衰老
正如我们所知,年龄显然是一个不恰当的测量,因为它完全是基于时间的流逝,而不考虑我们身体的生物变化。2013年,加州大学洛杉矶分校(UCLA)的Steve Horvath描述了DNA上的化学修饰(称为甲基化)随着年龄的增长而发生变化的惊人数学精度。利用这些甲基化图谱,他推导出了一种高度精确的年龄预
何川教授Nature发布表观遗传学重要发现
几十年前研究人员就已经知道,对遗传信息流动至关重要的信使核糖核酸(mRNA)上存在着一种化学修饰。然而直到最近,芝加哥大学的研究人员才通过实验证实,这种修饰的一个主要功能是控制RNA的寿命和降解,这一过程对于健康细胞发育极为重要。相关研究成果发表在2014年1月2日纸质版的《自然》(Nature
35岁助理教授追逐表观遗传学的奥秘
当黄云(Yun “Nancy” Huang,音译)还是一名大学生时,她一直希望成为一名医生,但在浙江大学医学院获得学士学位后,她的想法改变了,“我意识到,要治愈疾病,我还需要了解更多疾病的基础生物学知识。” 2005年,黄云来到了美国,在乔治亚州立大学的Jenny Yang实验室开始攻读生物化
华人女院士发表表观遗传学重要成果
MECP2的突变会引起神经发育性疾病Rett综合征(RTT)。RTT是一种常发生在女童身上的神经系统疾病,属于严重的自闭症谱系障碍。患者会出现类似自闭症的行为、丧失运动控制能力、呼吸不规律以及骨骼问题。 RTT中的错义突变MECP2R306C可以阻止MeCP2与NCoR/HDAC3复合物互作。
“小时吃好,长大不胖”的表观遗传学基础
“再苦不能苦孩子”——数十年来,人们已经对儿童早期发育时期的营养良好供给的重要性达成共识。 确实,早期营养供给“烙印”对人的一生具有深刻且持久影响。例如妊娠期和/或哺乳期营养不良记录可作为表观遗传记忆储存在孩子的基因组上,持续到成年期,从而增加个体对肥胖等代谢疾病的易感性。 表观遗传学与成年
北大教授最新文章解析癌症表观遗传学
来自北京市肿瘤防治研究所,北京大学肿瘤医院病因研究室的研究人员在之前研究的基础上,展开了胃癌发生发展相关DNA甲基化组扫描,进行了所获90余个基因的DHPLC大规模研究,在中日韩三国验证队列中证明了了GFRA1的去甲基化激活,SRF和ZNF382的甲基化失活可用作胃癌等恶性肿瘤的转移标志物。就此
朱健康院士Nature子刊表观遗传学成果
拟南芥5-甲基胞嘧啶(5mC)DNA糖基化酶的ROS1/DEMETER家族,是真核生物中第一个遗传表征的DNA去甲基化酶。然而,ROS1靶基因位点的特征还没有得到很好的理解。10月31日在《Nature Plants》发表的一项研究中,来自中科院上海植物逆境生物学中心和普渡大学的研究人员,对拟南芥C
复旦大学发表Nature表观遗传学新文章
来自复旦大学、中国科学院等机构的研究人员在新研究中揭示出了,从头甲基化转移酶DNMT3A自抑制以及组蛋白H3诱导DNMT3A激活的机制。研究结果发表在11月10日的《自然》(Nature)杂志上。 领导这一研究的是复旦大学上海医学院,生科院的徐彦辉(Yanhui Xu)教授,其早年毕业于清华大
染色质,解锁癌症表观遗传学的钥匙
表观遗传学指基因序列不变化的前提下,基因表达发生了可遗传的变化,包括DNA甲基化、染色质改型、基因沉默、RNA编辑、组蛋白修饰(甲基化、乙酰化、磷酸化等)等。其中,染色质改型调控基因表达的过程,涉及多种导致DNA和组蛋白组成变化、染色质构象变化的蛋白质。 众多研究已经证明,染色体畸变和染色质异
北大两位教授合作发表Cell子刊:生殖细胞研究新进展
北京大学第三医院乔杰教授团队与北京大学生命科学学院汤富酬研究员团队合作,对人类胚胎生殖细胞及其微环境细胞在妊娠4周到26周的长达五个月的发育关键期的转录组进行了全面、系统、深入的解析与阐释,并通过后续的功能实验对性腺中生殖细胞的分布与定位、以及细胞亚群的精确比例关系等关键特征进行了系统的分析。
北大两位教授合作发表Cell子刊:生殖细胞研究新进展
北京大学第三医院乔杰教授团队与北京大学生命科学学院汤富酬研究员团队合作,对人类胚胎生殖细胞及其微环境细胞在妊娠4周到26周的长达五个月的发育关键期的转录组进行了全面、系统、深入的解析与阐释,并通过后续的功能实验对性腺中生殖细胞的分布与定位、以及细胞亚群的精确比例关系等关键特征进行了系统的分析。
《细胞》:世界首个女性个人遗传图谱绘制完成
对人类卵子的两个极体进行高通量测序 第一个人类女性个人遗传图谱 极体基因组测序结果指导异常胚胎筛选 2013年12月20日,著名学术期刊《细胞》杂志发布世界上首个人类女性个人遗传谱图。 在这篇题为“Genome Analyses of single human oocytes”
相聚2019国际遗传与表观遗传精准医疗论坛-聚焦重大疾病
2019国际遗传与表观遗传精准医疗论坛会议 中国•温州 2019.4.19-21 2019国际遗传与表观遗传精准医疗论坛会议将于2019年4月19日至21日在温州医科大学附属眼视光医院育英学术馆举办。 “国际遗传与表观遗传精准医疗论坛(International Forum of Genet
世界首例MALBAC胚胎全基因组扩增测序试管婴儿诞生
世界首例MALBAC胚胎全基因组扩增测序试管婴儿诞生 2014年9月19日,世界首例经MALBAC基因组扩增高通量测序进行单基因遗传病筛查的试管婴儿在北京大学第三医院诞生,这标志着我国胚胎植入前遗传诊断技术已处于世界领先水平。 婴儿的父母,男方为单基因显性遗传病患者,经历了多次手术治疗
北京大学汤富酬等团队发布单细胞测序技术最新研究成果
基于第三代测序(TGS)平台的单细胞RNA-seq技术的进步加速了生物学研究。自2016年以来,已经开发了几种基于TGS平台的单细胞RNA-seq方法。由于受到低准确度和灵敏度的限制,它们要么结合基于NGS平台的方法降低错误率,要么通过牺牲通量来提高检测率。 2023年1月11日,北京大学汤富
我国揭示H3K27me3修饰和DNA甲基化对胚胎命运决定过程作用
近日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组,与北京大学汤富酬研究组的合作论文,以Silencing of developmental genes by H3K27me3 and DNA methylation reflects the discrepant plas
清华团队Nature、Cell子刊连发多项表观遗传学成果
表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性,对于人类发育和人类疾病有深远的意义。组蛋白修饰是一种重要的表观遗传学修饰,包括甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化、ADP-核糖基化等等。 组蛋白修饰可以调控许多关键的细胞过程。不过,人们一直不清楚组蛋白的这些标签是否能从哺乳动物生殖细胞传
新型纳米孔器件有望用于表观遗传学快捷测序
新华社布鲁塞尔5月9日电(记者潘革平)比利时校际微电子中心(IMEC)9日发表公报说,该中心成功开发出一种能直接读取单分子DNA(脱氧核糖核酸)碱基的新型光学纳米孔器件,有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍,新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术,能以超高分辨率,实现无标记检测DN
中科院参与发表Nature表观遗传学新成果
在动植物的发育过程中,配子和胚胎会发生表观遗传学状态的重编程,这是正确发育必不可少的一步。 植物的生殖细胞来自于花的体细胞组织,需要消除植物发育或应答外界刺激时积累的染色质修饰。如果这一过程不能有效进行,那么上一代的表观遗传学状态就会错误的遗传下去。不过在绝大多数情况下,上述表观遗传学修饰都能
何川教授Nature,Cell子刊解析表观遗传学
早年毕业于中国科技大学的何川教授现任芝加哥大学生物物理动态研究所主任,以及北京大学合成与功能生物分子中心主任。何川教授研究组主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究,近期在Nature Biotechnology,Molecular Cell杂志上发表新研究成果,解析基因组及
Nature子刊发布大脑表观遗传学重要图谱
表观遗传修饰的重要性越来越被人们所认识,但在人类大脑中的作用并不是很清楚,实际上在胚胎和成人大脑中,神经干细胞增殖并通过一些受到高度调控的过程生成神经元和神经胶质,包括DNA和组蛋白修饰以及非编码RNAs调控在内的表观遗传学机制在神经发生的不同阶段发挥至关重要的作用。另一方面异常的表观遗传调控也
甲基化芯片在表观遗传学中的应用
表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活;组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变;组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。 CpG岛的异常甲基化是导致基
新型纳米孔器件有望用于表观遗传学快捷测序
比利时校际微电子中心(IMEC)9日发表公报说,该中心成功开发出一种能直接读取单分子DNA(脱氧核糖核酸)碱基的新型光学纳米孔器件,有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍,新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术,能以超高分辨率,实现无标记检测DNA中的遗传编码以及表观遗传变异。研究近期发
全国首个医学表观遗传学协同创新中心成立
6月17日,由天津医科大学联合南开大学、瑞典卡罗林斯卡分子医学中心组建的天津医学表观遗传学协同创新中心揭牌成立。这是全国首个医学表观遗传学协同创新中心。 据介绍,表观遗传是生物学和基础医学研究的重要领域之一,被定义为“在基因组序列不变的情况下,可以决定基因表达与否并可稳定遗
Nature特别关注:争议中前行的表观遗传学
人们居住的地区和他们的价值观,都会对后代产生影响。那么抽烟、经历饥荒或者在战争中服役,这些经历是否会给后代留下独特的印记呢? Emory大学的Brian Dias在小鼠中对这类问题进行了研究。他发现,与特殊气味关联的恐惧可以影响小鼠后代的大脑。他将雄性小鼠暴露在苯乙酮中,同时给予一定的
表观遗传学研究揭示植物器官大小的奥秘
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517290.shtm
甲基化芯片在表观遗传学中的应用
表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活;组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变;组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。CpG岛的异常甲基化是导致基因沉默和过度表
两篇Nature论文挑战流行表观遗传学观点
Friedrich Miescher生物医学研究所(FMI)的Dirk Schübeler和他的研究团队,确定了沿着基因组设置表观遗传学标记的决定因素。这项发表在《自然》(Nature)杂志上的新研究表明,基因活性和DNA序列在对表观遗传标记的调控中发挥了比以往认为更大的作用。这对流行的观点:外