北大汤富酬发表表观基因组新成果
表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性。基因表达在时间和空间上的表观遗传学调控,对于人类发育是至关重要的。近年来,表观基因组已经成为了生物医学领域的一大研究热点。 北京大学的研究团队对早期人类胚胎进行深入研究,获得了胎儿大脑、心脏和肝脏的表观基因组景观。这一成果发表在十二月三十日的Journal of Biological Chemistry杂志上,文章的通讯作者是北京大学的汤富酬研究员。 ChIP-seq将染色质免疫共沉淀与新一代测序结合起来,是研究表观基因组的强大工具。研究人员在早期人类胚胎中对大脑、心脏和肝脏的多种组蛋白标签进行了ChIP-seq分析,鉴定了40,181个活跃的增强子。这些增强子大多存在组织特异性和发育阶段特异性,说明它们可以在早期人类胚胎中控制发育基因的有序时空表达。 研究人员通过sequential ChIP-seq发现,这三个器官都拥有大量H3K4me3和H3K27me3......阅读全文
表观遗传学有助解释妊娠高血压
弗吉尼亚联邦大学(VCU)医学院的研究者发现,一种关键酶的基因表达变化可能会导致有先兆子痫的孕妇出现高血压,并使她们形成血栓的易感性增加。这些结果可为孕妇高血压和血栓形成的最佳治疗方法提供线索,高血压和血栓形成可能会阻断孕妇内脏器官的血流,并且导致器官衰竭。 研究者一直致力于从分子层面
人类胚胎着床过程首次被解析
一枚受精卵长成一个婴儿,需在发育的第7天左右着床才能存活,这期间的人胚胎细胞无法获取,难以解析。22日,《自然》杂志登载了我国北京大学汤富酬与北医三院乔杰联合团队研究的最新突破,他们利用体外模拟人类着床策略和高精度单细胞测序技术,展现了“黑盒子”中的乾坤。 “临床上,着床失败是导致早期流产的重
Nature发表:-阐述人类围着床期胚胎发育分子调控规律
2019年8月22日,北京大学第三医院乔杰课题组和汤富酬课题组合作,在国际权威学术期刊《自然》(Nature,IF:43.07)在线发表研究成果“Reconstituting the transcriptome and DNA methylome landscapes of human imp
中科院新成果揭示癌症干细胞中的表观遗传学调控
癌症干细胞能够通过自我更新和分化,启动并维持癌症的发生和发展。人们已经在越来越多的肿瘤中分离和鉴定到了癌症干细胞,比如结肠癌、肝癌、乳腺癌和胰腺癌。 Metadherin (MTDH)广泛参与了肿瘤生长、药物抗性、肿瘤复发和转移,但此前人们并不了解其分子机制。中科院的研究团队通过深入研究,揭示
动物所减数分裂的表观遗传学调控机制研究取得进展
减数分裂是配子发生过程中最为重要的一环,减数分裂的异常不仅可以导致后代的致死或遗传病的发生,还可影响正常单倍体配子的形成,导致男性不育或女性不孕。表观遗传学修饰尤其是组蛋白的翻译后修饰在减数分裂过程中发挥了重要的作用。而H2B的泛素化修饰是从酵母到人都非常保守的一种表观遗传学调控机制,其在减数分
科学家揭示植物叶片衰老表观遗传学调控新机制
叶片衰老受到严苛的调控过程,是叶片发育的最后阶段。叶片衰老时,叶绿素、核酸、脂类、蛋白质及其它高分子物质会被分解成营养物质,并会重新分配到生长旺盛的器官或贮存器官中。伴随着叶片年龄的增长,大量叶片衰老相关基因会被诱导表达。研究发现很多叶片衰老相关基因的诱导表达与组蛋白第三亚基四号赖氨酸的三甲基化
免疫系统和表观遗传学调控:一个新的前沿领域
表观遗传学(epigenetics)研究转录前基因在染色质水平的结构修饰对基因功能的影响,这种修饰可通过细胞分裂和增值周期进行传递。表观遗传学已成为生命科学中普遍关注的前沿,在功能基因组时代尤其如此。免疫系统被认为是一个解析表观遗传学调控机制的良好模型,而且免疫细胞伯分化及功能表达和表观遗
Nature:北大绘就首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱
近日,北京大学交叉研究取得重要研究成果:绘就出世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱。此项研究工作为人们提供了一个全面的人类早期胚胎DNA甲基化调控网络的研究框架,对于人类认识自身早期胚胎发育过程中表观遗传调控机制、辅助生殖技术的安全性评估与改善,以及临床上疑难病例的诊治均具有非常重要的意义
世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱
记者25日从北京大学第三医院获悉,该院生殖医学中心乔杰研究组与北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组合作,绘就了世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱。这一成果日前已在线发表于《自然》,影响因子达38.597。 据介绍,哺乳动物的胚胎发育起始于单个受精卵细胞,父母的表观遗传记
如何读懂胚胎植入前遗传学诊断?
随着多种生物学工具的飞速发展,胚胎植入前遗传学诊断(Preimplantation Genetic Diagnosis,PGD)可以说迎来了一个新时代,同时由于现代社会接近11%的不孕不育比率,PGD的需求也越来越多,如何读懂这一辅助生育技术,了解试管婴儿操作过程中最为关键的一步,不再只
北大汤富酬、乔杰、付卫Science发表结直肠癌新成果
结直肠癌是胃肠道中常见的恶性肿瘤。基因组不稳定性、表观遗传异常以及基因表达失调是结直肠癌的典型分子特征。以往的单细胞研究只能分别检测基因组、甲基化组或转录组,而不能以单细胞分辨率同时开展多组学研究。 为了更好地了解结直肠癌的发展,北京大学的研究团队开发出一种单细胞测序方法,不仅能够分析单细胞的
世界最大表观遗传学研究项目正式启动
表观遗传学:主要探索细胞内随时发生的化学变化如何影响基因的活动。这些化学变化有些可能是随机的,有些可能与生活方式或者饮食有关,而这种影响可能持续多代。 记者从华大基因研究院获悉,作为人类基因组学研究中最具潜力的项目之一,全球最大的表观遗传学研究项目将于9月6日正式启动。 该项目将对
表观遗传学变异或可解释慢性肾病
由宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院肾电解质和高血压部门的医学副教授、临床科学家Katalin Susztak博士带领的一项研究,试图阐明慢性肾病的分子根源和遗传素质,其研究成果发表在最近的Genome Biology杂志上。 在这项研究中,Susztak和她的共同通讯作者、来自阿尔伯特爱因
Cell:朊蛋白,表观遗传学的新层面
朊蛋白prion总是与疯牛病和克-雅氏病等联系在一起,不过人们正逐渐意识到,朊蛋白在生物中也能够发挥正常的有益功能。 日前科学家们发现,朊蛋白能够使酵母从常规单细胞形态转变为多细胞协作形式,并由此在不利环境条件下增大酵母的生存几率。这种可遗传的改变不会影响酵母基因组,是一种表观遗传学现象。
饮食改变衰老过程的表观遗传学修饰
表观遗传学修饰可以不改变基因编码,而影响基因的开启或关闭。研究人员对185位志愿者(84位男性和101位女性)的直肠组织切片进行了研究,发现人体内基因的表观遗传学修饰主要受衰老的驱动,不过日常饮食也会对表观遗传学修饰产生重要影响。该研究发表在十二月六日的Aging Cell杂志上。 研
表观遗传学开关控制基因节律性转录
当夜晚降临,我们就会慢慢入睡,这是受昼夜节律circadian cycle影响的结果,我们的每个器官甚至基因中都存在这样的节律。 Salk研究所的科学家发现,表观遗传学修饰是使肝脏活性与昼夜节律同步的遗传学开关。这一发现能够帮助人们进一步了解高血糖、高胆固醇等健康威胁背后的机制,文章于近期
Science新闻:表观遗传学印记让基因“窒息”
吸烟留下的可不仅仅是衣服和手指上的烟味,现在一项新研究提出了强有力的证据指出,吸烟能够通过表观遗传学修饰影响增加癌症发病风险的基因活性。这一发现,为研究者们提供了一个评估吸烟人群癌症风险的新工具。 我们DNA上的化学修饰可以影响基因的功能,决定基因的开启和关闭,这些化学修饰被称为表观遗传学
厦门大学PNAS表观遗传学新文章
来自厦门大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员证实,热休克蛋白HSP70精氨酸甲基化调控了维甲酸介导的RARβ2基因激活。这项研究发布在6月16日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。 厦门大学药学院的刘文(Wen Liu)教授和加州大学圣地亚哥分校的Michael G. Rosenfeld教
厦门大学PNAS表观遗传学新文章
来自厦门大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员证实,热休克蛋白HSP70精氨酸甲基化调控了维甲酸介导的RARβ2基因激活。这项研究发布在6月16日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。 厦门大学药学院的刘文(Wen Liu)教授和加州大学圣地亚哥分校的Michael G. Rosenfeld教
表观遗传学药物有望解决癌症治疗难题
表观遗传学是一种调控基因表达的可逆途径,通过DNA和组蛋白的化学修饰,决定特定基因是否能得以表达。在癌症中,表观遗传学修饰的添加或删除,与肿瘤抑制基因的沉默或者癌基因的过表达有关。有研究显示,在标准的化疗流程之前先用表观遗传学药物处理癌细胞,可以增强这些细胞对抗癌药物的敏感性。这样的措施将大大有
美国女院士表观遗传学新成果
TET(ten-eleven translocation)蛋白是生物体内存在的一种α-酮戊二酸(α-KG)和Fe2+依赖的双加氧酶,是DNA去甲基化过程中的一种重要的酶,对于维持干细胞的多能性有重要作用。多年来,科学家了解到,TET蛋白家族有肿瘤抑制因子的作用,但是,它们是如何抑制失控的癌细胞增
何川教授eLife最新表观遗传学成果
7月2日,国际著名学术期刊《eLife》在线刊登了芝加哥大学何川教授(Chuan He)和俄亥俄州立大学Li Wu带领的一项研究成果,题为“N6-methyladenosine of HIV-1 RNA regulates viral infection and HIV-1 Gag protei
表观遗传学研究揭示拉美人长寿之谜
加州大学洛杉矶分校UCLA的研究人员首次证实,拉美人(Latinos)的衰老速度的确比其他民族的慢。这项研究发表在本期的Genome Biology杂志上,有望帮助科学家们找到适合所有人的抗衰老途径。 “尽管拉美人患糖尿病和其他疾病的比例较高,但他们的寿命比高加索人长。这被科学家们视为一种难以
神经精神疾病的表观遗传学关联
根据加州大学欧文分校的科学家报道,多巴胺信号的功能障碍,可深刻地改变大脑前额叶皮层中大约2000个基因的活性水平,可能是某些复杂神经精神疾病(如精神分裂症)的一个根本原因。 接收这种神经递质的脑细胞中基因活性的这种表观遗传学改变,首次表明多巴胺不足会影响前额叶皮层中调控的各种行为和生理功能。
朱冰:表观遗传学过去,现在,未来
由北京生命科学研究所朱冰研究组领衔完成的Science研究论文,揭示出染色质的紧密程度能调节组蛋白H3K27甲基化酶复合体PRC2的催化活性,从而影响基因转录,这有助于解析基因转录调控以及基因沉默的重要机制。为了更深入追踪这项研究的具体内容,生物通特联系了朱冰研究员,就几个方面请教了他。
Science:表观遗传学实现行为重编程
在佛罗里达木蚁中,大工蚁(majors)和小工蚁(minors)属于两个完全不同的阶级,它们的社会性行为存在很大差异。宾夕法尼亚大学领导的研究团队发现, 这些阶级特异性的社会行为并非一成不变,可以人为地进行表观遗传学重编程。这一重要成果发表在本期的Science杂志上。 表观遗传学修饰可以在不
科学家建立植入前胚胎遗传学诊断新方法
北京大学谢晓亮、乔杰、汤富酬团队在国际上首次建立了一种全新的植入前胚胎遗传学诊断方法MARSALA(高通量测序同时检测突变位点、染色体异常以及连锁分析),可以在早期胚胎阶段对各种单基因遗传疾病和染色体疾病同时进行精确诊断,以避免严重遗传病患儿的出生。相关成果日前发表于美国《国家科学院院刊》。
表观遗传学研究揭示维生素B12调控罕见疾病的机制
一些罕见的疾病的发生往往属于不幸的偶然,即当父母携带突变基因的情况下,子代有可能会出现病变的表型。然而,最近由来自法国Lorraine大学以及加拿大McGill大学的研究者们发现一类罕见的,叫做"epi-cblC"的疾病,改变了以往的认知。他们发现该疾病的患者不能产生维生素B12,进而导致严重的
Nature-Methods-:北大汤富酬团队揭示单个细胞内高阶染色质结构
调控基因组元件的高阶三维(3D)组织为基因调控提供了拓扑基础,但尚不清楚哺乳动物基因组中的多个调控元件如何在单个细胞内相互作用。 2023年8月28日,北京大学汤富酬团队在Nature Methods (IF=48)在线发表题为“scNanoHi-C: a single-cell long-r
习近平视察北大:了解遗传病及癌症早期诊断技术研究进展
5月4日上午,在纪念五四运动95周年、庆祝北大建校116周年之际,习近平总书记莅临北京大学,视察指导工作。 在北大生物动态光学成像中心,习近平观看多媒体演示,了解胎儿遗传疾病筛查、癌症早期诊断等新技术研究应用的情况,并通过显微镜观看动物卵细胞受精和极体细胞提取过程。北京大学第三医院