何川教授Nature,Cell子刊解析表观遗传学

早年毕业于中国科技大学的何川教授现任芝加哥大学生物物理动态研究所主任,以及北京大学合成与功能生物分子中心主任。何川教授研究组主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究,近期在Nature Biotechnology,Molecular Cell杂志上发表新研究成果,解析基因组及转录组中新发现的突变,以及RNA甲基化表观遗传等方面的新发现。 核苷酸变异(Nucleotide variants),特别是那些与表观遗传功能有关的变体,并不仅仅是简单的基因组序列变化,还为我们提供了关于调控的重要信息,而且这些变化也定义了高等生物中的细胞状态,比如DNA中发现的5-甲基胞嘧啶(5-mC),就是真核生物表观遗传修饰中近期才解析的核苷酸变异。 但是研究表示,5-mC只是DNA表观遗传动态调控网络的一个小成员,这一调控网络还包括5-羟甲基胞嘧啶(5hmC),5-甲酰胞嘧啶(5- formylcytosi......阅读全文

核苷酸的生物学功能

核苷酸类化合物具有重要的生物学功能,它们参与了生物体内几乎所有的生物化学反应过程。现概括为以下五个方面:① 核苷酸是合成生物大分子核糖核酸 (RNA)及脱氧核糖核酸(DNA)的前身物,RNA中主要有四种类型的核苷酸:AMP、GMP、CMP和UMP,这四种类型的核苷酸从头合成前身物是磷酸核糖、氨基酸、

核苷酸的生物学功能

核苷酸类化合物具有重要的生物学功能,它们参与了生物体内几乎所有的生物化学反应过程。现概括为以下五个方面:① 核苷酸是合成生物大分子核糖核酸 (RNA)及脱氧核糖核酸(DNA)的前身物,RNA中主要有四种类型的核苷酸:AMP、GMP、CMP和UMP,这四种类型的核苷酸从头合成前身物是磷酸核糖、氨基酸、

GenomeResearch发表基因组研究新发现基因组

多伦多大学的科学家们发现,作为基因组看门人的C2H2-锌指蛋白(C2H2-ZF)实际上肩负着更加多样化的职责。这项发表在Genome Research杂志上的研究,有助于我们更准确地解读个人基因组。C2H2-ZF有大约七百个成员,是规模最大的一种人类蛋白。然而,人们对这些蛋白一直知之甚少。C2H2-

细胞生物学名词核苷酸

核苷酸是一类由嘌呤碱或嘧啶碱、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物,又称核甙酸。戊糖与有机碱合成核苷,核苷与磷酸合成核苷酸,8种核苷酸组成核酸。核苷酸主要参与构成核酸,许多单核苷酸也具有多种重要的生物学功能,如与能量代谢有关的三磷酸腺苷(ATP)、脱氢辅酶等。

核苷酸的主要生物学功能

一类由嘌呤碱或嘧啶碱基、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物,又称核甙酸。五碳糖与有机碱合成核苷,核苷与磷酸合成核苷酸,4种核苷酸组成核酸。核苷酸主要参与构成核酸,许多单核苷酸也具有多种重要的生物学功能,如与能量代谢有关的三磷酸腺苷(ATP)、脱氢辅酶等。某些核苷酸的类似物能干扰核苷酸代谢,可

细胞生物学名词嘌呤核苷酸

嘌呤核苷酸是一种嘌呤碱的核苷酸,五碳糖与有机碱合成核苷,核苷与磷酸合成核苷酸。

细胞生物学名词环核苷酸

中文名称:环核苷酸英文名称:cyclic nucleotide定  义:核苷酸分子内的磷酸酯。视连接部位不同,有2′,3′-环核苷酸、2′,5′-环核苷酸和3′,5′-环核苷酸。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞生物学名词嘧啶核苷酸

嘧啶核苷酸的分解代谢是先去除磷酸和核糖生成嘧啶碱,嘧啶碱在肝内降解。降解产物易溶于水,这点与嘌呤碱不同,嘌呤碱的代谢产物尿酸仅微溶于水。嘧啶环中的脲基碳以形式从呼吸排出,并产生β-丙氨酸(有生理意义,为鹅肌肽、肌肽及泛酸的成分)及β-氨基异丁酸(经代谢进入三羧酸循环)。

细胞生物学名词脱氧核苷酸

脱氧核苷酸(deoxynucleotide)是脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleic acid,简称DNA)的基本单位  ,是一类由嘌呤或嘧啶碱基 、脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的小分子化合物 ,是构成生物体遗传物质DNA的物质基础 。决定生物的多样性的就是脱氧核苷酸中四种碱基腺嘌呤 (ad

Nature新发现改写细胞生物学教科书

  来自丹麦的一项突破性的研究表明,需要修改当前对人类细胞周期的科学描述。研究结果还有可能促使开发出一些新的治疗方法来靶向不同类型癌症的致命弱点。相关研究论文发表在《自然》(Nature)杂志上。  所有理工科学生都知道人类细胞分裂是如何发生的。直到现在,人们都认为基因组的复制只发生在细胞周期的S期

核苷酸类化合物的生物学功能

核苷酸类化合物具有重要的生物学功能,它们参与了生物体内几乎所有的生物化学反应过程。现概括为以下五个方面:① 核苷酸是合成生物大分子核糖核酸 (RNA)及脱氧核糖核酸(DNA)的前身物,RNA中主要有四种类型的核苷酸:AMP、GMP、CMP和UMP,这四种类型的核苷酸从头合成前身物是磷酸核糖、氨基酸、

何川教授Nature,Cell子刊解析表观遗传学

  早年毕业于中国科技大学的何川教授现任芝加哥大学生物物理动态研究所主任,以及北京大学合成与功能生物分子中心主任。何川教授研究组主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究,近期在Nature Biotechnology,Molecular Cell杂志上发表新研究成果,解析基因组及

生物学术语基因组当量的概念

基因组当量是基因组文库容量的度量单位。基因组文库容量的度量单位,指文库中所有载体的插入片段总长度相当于基因组的总长度。

生物学术语基因组扫描的概念

中文名称基因组扫描英文名称genome scanning定  义从全基因组的遗传标记中寻找与特定性状或基因紧密连锁的标记,并在染色体上定位相关基因的方法。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

海洋所贝类发育生物学研究取得新发现

  中科院海洋研究所研究人员以长牡蛎为研究对象,从蛋白质组学的角度解析了在贝类幼虫早期发育过程中的关键蛋白质分子,取得了若干重要发现。   通过分析长牡蛎两个发育阶段幼虫蛋白质组学的差异,科研人员发现了与贝类幼虫神经、肌肉系统发育和分化相关的重要分子,首次提出“质控蛋白”系统在贝类发

复旦大学PNAS发表全基因组测序新发现

  复旦大学上海医学院高谦(Qian Gao)教授课题组的研究人员与来自中国、西班牙、瑞士等国的科学家们展开合作,在新研究中采用全基因组测序结合大规模基因分型揭示出了结核分枝杆菌北京家族菌株的起源、进化及其与现代人类迁移的联系。这项研究发布在6月15日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。  

北京基因组所发表RNA甲基化新发现

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA最后流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以在不改变DNA序列的基础上调控基因的表达,并由此决定细胞的分化和发育情况。实际上,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。  N6-methyladenosine(m

推进后基因组时代物理生物学探索

  5月7日~8日,科学与技术前沿论坛在中科院学术会堂召开,此次论坛的主题为“后基因组时代的物理生物学”。欧阳钟灿、郝柏林、陈润生、欧阳颀等多名来自全国各大高校和科研院所的院士和学者出席了此次论坛,并发表了主题演讲。  本次论坛召集人中科院院士杨玉良表示,上世纪末以来,生命科学获得了飞速发展,积累了

于军:从基因组生物学到精准医学

  今年是“人类基因组计划”宣布完成10周年。选择2003年结束这个计划是为了纪念美国沃森和英国克里克两位生物学家发现DNA双螺旋结构50周年,而沃森博士正是这个宏大计划早期的实际推动者之一。   科学界往往以重要人物和他们的重要科学发现及技术发明为里程碑。基因组学应属于分子生物学范畴,其学科的真

于军:从基因组生物学到精准医学

  今年是“人类基因组计划”宣布完成10周年。选择2003年结束这个计划是为了纪念美国沃森和英国克里克两位生物学家发现DNA双螺旋结构50周年,而沃森博士正是这个宏大计划早期的实际推动者之一。   科学界往往以重要人物和他们的重要科学发现及技术发明为里程碑。基因组学应属于分子生物学范畴,其学科的真

《基因组生物学》:一种超级细菌的基因组测序完成

最近,英国桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)和布里斯托尔大学的研究者们共同完成了一种名为Steno的超级细菌的基因测序工作,研究结果显示,这是一种具有显著抗药性的生物体。对这种细菌基因组的了解将有助于研究者们发现如何应对这种具有独特抗药性的生物体。这一研究论

美国宇航局称将公布天体生物学新发现

  据美国国家航空航天局(NASA)官网11月29日发布的新闻稿,NASA将于当地时间12月2日下午2点(北京时间3日凌晨3点左右)在其华盛顿总部演播大厅召开新闻发布会,内容将涉及NASA在天体生物学方面的一些新发现。  据美宇航局网站发布的消息,此次新闻发布会将按照惯例,以电视和网络两种

单核苷酸多态性在基因组内的形式

一是遍布于基因组的大量单碱基变异;二是分布在基因编码区(coding region) , 称其为cSNP,属功能性突变。SNP在单个基因或整个基因组的分布是不均匀的:(1)非转录序列要多于转录序列(2)在转录区非同义突变的频率, 比其他方式突变的频率低得多。

单核苷酸多态性在基因组内的形式

一是遍布于基因组的大量单碱基变异;二是分布在基因编码区(coding region) , 称其为cSNP,属功能性突变。SNP在单个基因或整个基因组的分布是不均匀的:(1)非转录序列要多于转录序列(2)在转录区非同义突变的频率, 比其他方式突变的频率低得多。

PNAS打开基因组生物学的黑盒子

  最近,美国佛罗里达州立大学、贝勒医学院和哈佛大学-麻省理工学院Broad研究所的科学家们,开辟了人类遗传学中一个鲜为人知的领域。相关研究结果发表在7月18日的《PNAS》杂志。  在这项研究中,研究人员表明,一条不活跃的X染色体上的一段不寻常的DNA重复序列,实际上对于这种女性特有的遗传现象的整

《PLoS生物学》:老鼠全基因组测序图公布

  最新一期的开放存取的《公共科学图书馆·生物学》(PLoS Biology)杂志上,美国、英国和瑞典的研究人员公布了老鼠的全基因组测序图。老鼠成为继人类之后第二个完成全基因组测序的哺乳动物。   在对人类和老鼠的基因测序图进行综合性比较后,研究人员发现两者之间的遗传差异要比人们预想的大得多。老鼠

生物学术语基因组复杂度的概念

中文名称基因组复杂度英文名称genome complexity定  义衡量基因组所含信息量的参数,由单一序列的核苷酸数目表示。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

《基因组生物学》:孤独是一个分子

已经知道一个人的社交环境能够影响他的健康。与社会隔离的人往往死亡率较高。在最新一期的《Genome Biology》杂志上发表的首项此类研究中,来自美国加州大学洛杉矶分校的研究人员从慢性、严重孤独者的免疫细胞中发现了一种不同的基因表达模式。 这些发现揭示出社会孤立感与驱动炎症的基因活性改变有关。

攻克基因组测序难题-探究茶树生物学奥秘

  我国现存最早的中医医药典籍《本草经》记载:“神农尝百草,日遇七十二毒,得荼(茶)而解之。”这说明了茶的神奇功效。茶树起源于我国的云南、四川等地,在从中国向世界各地数千年漫长传播历程里,与全球多元文化邂逅交融,发展形成了今天地球上复杂而美妙的茶文化。茶之所以广受欢迎,除了有迷人的香气和令人愉悦的滋

《PLoS生物学》:乳齿象线粒体基因组测定完成

这的确有些不可思议。德国科学家利用一颗远古牙齿化石,成功确定了乳齿象完整的线粒体基因组,这也是迄今为止科学家得到的最古老的线粒体基因组。该研究成果有望加深科学家对于象类分化的理解。相关论文发表在的7月24日的《PLoS生物学》上。 2800万年前出现的乳齿象是现代大象的近亲,它们大约有3米高,有和猛