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生物学家借助数据科学破解生命奥秘

自2000年人类基因组图谱绘制后,生物学研究迈入全新的“组学”时代,科学家们争先恐后地测序各种有机生物的基因组或蛋白质组。 现在,即使一些简单的实验都会产生大量数据,而从“背景噪音”中获得想要的结果则成为了一大挑战。美国趣味科学网站近日报道指出,计算机技术正帮助科学家们征服这些数据大山,甚至提出科学假设并对新生物学进程进行解释。包括机器学习、计算机模拟等数据科学将革新前沿生物学研究。 机器学习变革生物学研究 尽管科学家通过基因和蛋白质测序让我们知晓它们的名字和所处方位,但这些并不能告知它们的功能以及工作原理,我们需要理解这些基因、蛋白质以及中间成分在不同生物过程中的相互作用,从而最终征服癌症、心脏病、阿尔茨海默氏症等多种顽疾,但这会涉及到海量数据。 例如,科学家希望借用DNA测序等“组学”工具,弄清楚人类哪些基因会受到病毒性流感的影响,但人体包含数万个基因,常见的流感研究也会牵涉多达数千个基因。 计算机在处理海量数......阅读全文

漫谈个性化诊断与治疗

  2013年9月底,致力于癌症个性化诊断与治疗的Foundation Medicine公司在美国纳斯达克交易所上市。公司提供的是癌症全基因组测序服务,医生能够参照测序结果为患者提供针对性的治疗方案。史蒂夫•乔布斯曾使用过这项技术,使得该公司名声大噪,可惜的是,这项技术终究还是不够成熟,未能挽救

研究解开冬瓜“保守”的秘密

  几千年前,我们的祖先吃的蔬菜水果可没有现在这么丰富多样。  葫芦科作物的千变万化更是印证了这一点。很难想象,冬瓜、黄瓜、甜瓜、西瓜、葫芦、南瓜、丝瓜等葫芦科作物有着一个共同的祖先,是什么导致他们在历史长河里发展成不同形态大小和风味的?科学家们对此产生了浓厚的兴趣。  探究葫芦科作物“变异”的脉络

华大基因背后的技术武器

  斥巨资采购128台基因测序仪,一举成为全球最大的基因测序中心,全额收购美国纳斯达克上市公司Complete Genomics(下称CG),改变中国生物科技企业被跨国企业单向并购的格局。华大基因向来不按套路出牌。看似有些疯狂的举动,实际是华大基因建立技术优势的精心布局。华大基因的服务规模和测序团队

颜宁研究团队成功背后的故事:有梦想才有辉煌

         葡萄糖,地球生物最重要的能量来源。它,究竟如何进入细胞?100多年来,多少科学家为之着迷。  6月5日,英国《自然》杂志揭开了这个源自生命内部的奥秘:由37岁的中国科学家、清华大学医学院教授颜宁率领的8

生物芯片北京国家工程研究中心:十年磨砺 用“芯”创造

  2010年5月6日,中共中央总书记、国家主席胡锦涛陪同朝鲜劳动党总书记、国防委员会委员长金正日参观博奥生物有限公司。新华社供图  2008年12月27日,中共中央政治局常委、国务院总理温家宝来到北京中关村科技园区,看望广大科技工作者,就园区的创新发展问题进行专题调研。这

科学家用表型变异重建单个细胞生命史 追溯到受精卵

  英国威尔克姆基金会桑格研究所科学家近日利用基因组测序技术,通过观察健康细胞基因组的变异过程,能把一个细胞的生命历史追溯到最初的受精卵。它们构建了多种组织细胞的发展历程,从早期胚胎开始,直到它们变成成熟器官中的“一员”。相关论文发表在最近出版的《自然》杂志上。   在多细胞生物的生命历程中,身体的

邵峰:坚持自己独立的思考和判断

   邵峰简介▶▶▶  1973年生,1996年毕业于北京大学技术物理系应用化学专业,1999年获得中科院生物物理所硕士学位,2003年获得美国密歇根大学医学院博士学位,2005年在哈佛大学医学院完成博士后训练后回国,在北京生命科学研究所建立实验室,开始独立研究生涯。  邵峰实验

最年轻的院士邵峰:成功的原因就是不要跟风

  邵峰简介   1973年生,1996年毕业于北京大学技术物理系应用化学专业,1999年获得中科院生物物理所硕士学位,2003年获得美国密歇根大学医学院博士学位,2005年在哈佛大学医学院完成博士后训练后回国,在北京生命科学研究所建立实验室,开始独立研究生涯。   邵峰实验室主要致力于研究病原

华大基因的3万多“铁粉”,能否等到股价的再次起飞?

自2017年7月打开IPO涨停板,到2017年11月股价涨到巅峰的261.39元,再到2018年9月3日股价降到73.39元,华大基因的股东户数一直在3万多;而截止2018年上半年股东户数,为33,283户。这3万多“铁粉”,能否等到华大基因的再次腾飞?我翻越了它不少资料,试图从公司披露的中报,谈谈

中美科学家解密男性输出小管转运精子的功能

  一个健康男性的双侧睾丸大约每天要产生上亿的精子,而这些精子在睾丸曲细精管中生成之后是不具备运动能力的,它们需要转运到附睾中继续成熟发育,直到最后形成具备运动能力和受精功能的成熟精子。而连接睾丸和附睾之间的唯一桥梁是几根输出小管,输出小管非常纤细,直径大约只有60-110微米,比精子的长度还要小(

基因测序未来将走向哪里?

  在这一年,Sanger发明双脱氧链终止法,即Sanger测序法;Maxam和Gilbert发明化学降解测序技术,即Maxam-Gilbert化学降解测序法。40年来,基因测序领域已经发生了天翻地覆的变化,新技术、新平台以及新需求层出不穷。那么接下来呢,基因测序将走向哪里?   首先,我们先简单

基因检测过去、未来与问题

  10月11日,美国国立卫生研究院美国国家人类基因组研究所所长Eric D. Green,美国加州首席科学官Edward M. Rubin以及美国华盛顿华盛顿华盛顿大学华盛顿大学医学与基因组科学荣誉教授Maynard V. Olson在Nature联合发表了一篇预测性文章,题为The future

中国人类蛋白质组计划(CNHPP)正式启动

“中国人类蛋白质组计划(CNHPP)”正式启动  今天上午,“中国人类蛋白质组计划(CNHPP)”在军事医学科学院召开第一次工作部署会,国家科技部、总后勤部相关领导、重点专项管理委员会成员及全国40多个科研单位的70余名院士、专家出席,这标志着CNHPP全面启动实施,这是我国科学界乃至世界

细胞出版社2016中国年度论文/机构揭晓

   5月8日,由中国科学报社与美国细胞出版社共同主办、中国科学院生物物理研究所联合主办的2017“中国科学家与Cell Press”系列活动——细胞出版社2016中国年度论文、年度机构颁奖典礼暨前沿论坛在中国科学院生物物理研究所举行。会场  这是继中国科学报社与美国细胞出版社合作出版2014和20

中国人类蛋白质组计划在京启动

  “中国人类蛋白质组计划(CNHPP)”第一次工作部署会日前在北京举行,来自科技部、总后勤部的部分相关负责人和全国40多家科研单位的70余名院士、专家出席会议。  中国科学院院士、人类蛋白质组计划国际执委、亚太蛋白质组组织主席、CNHPP首席科学家贺福初在接受记者采访时介绍说,CNHPP是在系统总

“国之重器”高速前行

   散裂中子源、强磁场装置、同步辐射光源、大型天文望远镜……近年来,一项项神秘的大科学装置陆续建成并投入使用,它们或隐世于高山峡谷,或藏身在喧嚣城市的地下,虽然不被世人所熟悉,却自带耀眼的光环。它们作为重大科技基础设施,伴随着一项项大科学计划,缔造着中国乃至世界科学的未来。   这些大科学装置何以

AB SCIEX隆重推出两款质谱系统 助力5th AOMSC暨33rd CMSS

  2014年7月17日,“第5届亚洲与大洋洲质谱会议(AOMSC)暨第33届中国质谱学会学术年会”召开之际,AB SCIEX公司在北京大学召开新品发布会,隆重推出Triple Quad™3500和TripleTOF® 6600两款质谱系统。并于同期举行媒体见面会,200余质谱专家学者共聚

micro RNA(miRNA)综述-3

未来要解决的问题miRNAs在多个物种中广泛被发现,而且在进化上高度保守。这些“小玩意儿”留给我们一大堆谜团:miRNA的确切功能是什么?它的目标靶是什么?作用机制是什么?也许需要对植物或者线虫的基因组进行miRNAs突变株的筛选,在果蝇中可以用targeted- disruption缺失miR

微流控芯片在生命科学研究中的应用

分析技术的进步极大地推动了生命科学的发展,同时也提出了许多新的问题。随着多种生物基因组测序的完成,特别是人类基因组计划(HGP)的完成将我们带入了后基因组时代,分子生物学已经进入蛋白质组学的研究阶段。仅仅从DNA水平上测定基因组序列只是揭示生命奥秘的第一步,更重要的是去发现、鉴定和测量每个基因所编码

医学科技发展“十二五”规划发布

  关于印发医学科技发展“十二五”规划的通知各省、自治区、直辖市、计划单列市有关部门,各有关单位:   为了贯彻落实《国家中长期科学和技术发展规划纲要(2006—2020年)》,指导医学科技工作发展,科学技术部、卫生部、国家食品药品监督管理局、国家中医药管理局、教育部、国家人口和计划生育

Nature:哈佛/斯坦福在“迷你脑”领域获重大突破

  过去几年中,通过干细胞三维培养物来生成“迷你人脑”组织的实验方法已经允许科学家们对大脑发育这一生命奥秘进一步深度分析:了解进化过程中其发育如何发生变化,及其研究大脑是如何受疾病影响的。然而,一大批问题目前尚不明了,诸如这些“脑体(brain organoids)”组织中会准确出现哪些细胞类型?“

基因测序仪成人类“解密神器”

定制型基因诊断         神器,网络热词之一,形容特别好用的工具。目前,基因测序仪可谓生命科学的神器,帮助人们越来越快速准确地解开生命的奥秘,并影响着人们的生活。  拉登被击毙后,如何确定死者就是其

虚位以待——西湖大学启动成立以来最大规模招聘!

  3月18日,西湖大学官网对外发布2019年招聘公告,面向海内外招聘学术人才、行政服务、平台支持和科研团队人员,总计约200个岗位。这是西湖大学成立以来最大规模的招聘,包括施一公实验室在内的54个前沿实验室,都打开大门广纳贤才。  2018年2月,西湖大学获教育部批准设立。这是一所“高起点、小而精

刘伯宁:后基因组时代10年间生命科学的发展与挑战

  8月2日,我国科学家利用“全基因组关联分析”的方法,在人类1号染色体上发现了肝癌的易感基因区域。这将为肝癌的风险预测、早期预防和个体化治疗提供理论依据。  事实上,自2000年人类基因组草图绘制完成迄今,科学家已经相继发现70余种疾病的易感基因,基于此的基因诊断产业已经初现端倪,但10

牛津大学:4个基因主导人类胚胎早期变化

  据物理学家组织网近日报道,14年前牛津大学的研究人员测定和命名了4个基因,但这些基因的功能却始终没有破解。最近他们发现,这些基因主导着人类胚胎早期的变化,离解开谜团更近了一步。  2002年,在人类基因组计划中,进化生物学家彼得?霍兰教授和研究生安妮?布斯测定了4个基因,分别命名为Argfx,L

加强科学普及 服务创新发展

  ■ 在科学普及中,“公众”包括各方面社会群体,除科研机构和部门外,政府和企业中的决策及管理者、媒体工作者、量大面广的创业者、作为科技最终用户的消费者等都在其中,任何一个群体的科学素质相对落后,都将成为创新驱动发展的“短板”。  ■ 科学形成于认知和利用自然界的长期实践。它是系统化的知识,也是掌握

基因领域:最重要的是读懂“天书”

  左手技术,右手资本,毫无疑问,基因科技已经成为生命科学领域最热门的宠儿。  从最近十几年的发展来看,人类基因测序技术的发展已经超越了“摩尔定律”:上世纪启动的“人类基因组计划”项目计划花费30亿美元,用十三年时间完成一个人类全基因组的测序,绘制出人类基因组图谱。但到了今天,使用最新一代高通量测序

牛津大学研究人员4个基因主导人类胚胎早期变化

  据物理学家组织网30日报道,14年前牛津大学的研究人员测定和命名了4个基因,但这些基因的功能却始终没有破解。最近他们发现,这些基因主导着人类胚胎早期的变化,离解开谜团更近了一步。  2002年,在人类基因组计划中,进化生物学家彼得·霍兰教授和研究生安妮·布斯测定了4个基因,分别命名为Argfx,

抽个血,就能知晓前世今生?

  自1975年英国生化学家弗雷德里克·桑格发明末端终止法DNA(脱氧核糖核酸,其中具有遗传效应的片段叫做基因)测序技术之后,基因测序被视为打开生命奥秘之门的金钥匙。如今在一些发达国家,基因测序已从实验室走入临床应用;特别是一些名人利用基因测序提前预防癌症等疾病,更让这一技术炙手可热。  基因测序到

小分子RNA——microRNA综述(2)

未来要解决的问题miRNAs在多个物种中广泛被发现,而且在进化上高度保守。这些“小玩意儿”留给我们一大堆谜团:miRNA的确切功能是什么?它的目标靶是什么?作用机制是什么?也许需要对植物或者线虫的基因组进行miRNAs突变株的筛选,在果蝇中可以用targeted-disruption缺失miRNA序