任兵教授利用CRISPR发现新型增强子
人类基因组只有不到2%编码蛋白质，因此解析非编码DNA的功能是一个很大的挑战。科学家们已经通过分析DNA甲基化、染色质修饰、核酸酶敏感性、转录因子结合，在人类基因组中预测了数百万个调控序列，但只有少数序列在天然条件下得到证实。 加州大学的研究团队为此开发了基于CRISPR/Cas9的高通量筛选策略，并由此发现了一类新型增强子。这项研究发表在一月二十六日的Genome Research杂志上，文章的通讯作者是加州大学的任兵（Bing Ren）教授。 研究人员用自己开发的CRISPR/Cas9方法，在人胚胎干细胞（hESC）中研究了1Mbp POU5F1位点的174个候选调控序列。他们鉴定了POU5F1转录所必需的两个经典调控元件，一个启动子和一个近端增强子。 此外，研究人员还还意外发现了一类新型增强子。研究显示，这种增强子以一种独特的方式促进POU5F1转录。干扰增强子序列会导致暂时的POU5F1转录损失，但POU5F1......阅读全文
简述顺式作用元件结构增强子的作用原理
增强子的作用原理：一种观点认为，增强子为转录因子提供进入启动子区的位点。另一种认为，增强子能改变染色质的构象。因为增强子区域容易发生从B—DNA到Z—DNA的构象变化。
Nature子刊：用CRISPR操控表观基因组
杜克大学的研究人员开发出了一种新方法，可以精确地控制基因开启及激活的时间。借助这一新技术研究人员可通过化学操控包装DNA的蛋白，来开启特异的基因启动子和增强子——控制基因活性的基因组片段。 研究人员说，拥有操控表观基因组的能力将有助于他们探究特殊启动子和增强子在细胞命运或遗传病风险中所起的作用
拟南芥超级增强子鉴定与功能验证研究获进展
近日，东北地理所农田有害生物控制学科组孟凡立研究员团队与美国密歇根州立大学（Michigan State University）Jiming Jiang团队和英国约翰英纳斯中心（John Innes Centre）Anne Osbourn团队合作，在国际权威SCI期刊PROCEEDINGS OF
Nat－Genet：新方法揭示基因“增强子”的工作机理
来自日本理化研究所（RIKEN）综合医学科学中心和肿瘤分子研究所(IFOM)的研究人员与京都大学、卡罗林斯卡研究所和DNAFORM的合作者一起开发出了一种被称为NET-CAGE的新技术，揭示了基因组中被称为增强子的非编码基因的结构，增强子可以激活特定基因的功能。基因组的这些部分曾经被认为是不重要
AAVTBGCre/GOI在小鼠肝脏特异性基因表达或敲除中的应用...
AAV-TBG-Cre/GOI在小鼠肝脏特异性基因表达或敲除中的应用与优势分析AAV-TBG-Cre/GOI系统简介：l AAV-TBG-Cre系统是整合了肝脏特异性TBG启动子和Cre重组酶的腺相关病毒载体。Ø TBG启动子是一种基于人甲状腺结合球蛋白(TBG)启动子和微球蛋白增强子的混合型启动子
AVTBGCre/GOI在小鼠肝脏特异性基因表达敲除应用与分析
AAV-TBG-Cre/GOI系统简介： l AAV-TBG-Cre系统是整合了肝脏特异性TBG启动子和Cre重组酶的腺相关病毒载体。 Ø TBG启动子是一种基于人甲状腺结合球蛋白(TBG)启动子和微球蛋白增强子的混合型启动子，用于肝脏特异性转外源基因表达。 Ø Cre重组酶是
上海生科院揭示DNA修饰在人胚胎干细胞神经分化中的功能
7月28日，Cell Discovery 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组的研究论文AF9 Promotes hESC Neural Differentiation through Recruiting TET2 to Neurodevelopment
Nature子刊：鉴定增强子全新方法
增强子是能够加强特定基因表达的DNA序列。日期，劳伦斯伯克利国家实验室(Berkeley Lab)的研究团队，开发了一个能在人类和其他哺乳动物基因组中鉴定基因增强子的新技术。文章于三月二十三日发表在Nature Methods杂志的网站上。 这一技术被称为SIF-seq(site-sp
启动子封堵的定义
中文名称启动子封堵英文名称promoter occlusion定 义上游启动子对下游启动子的阻碍作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
启动子阻抑的定义
中文名称启动子阻抑英文名称promoter suppression定 义由于转录抑制因子的作用或甲基化修饰等使启动子活性减弱或丧失。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
启动子清除的定义
聚合酶转录时,首先结合到启动子上,找到特异结合位点,激活后起始转录。 特异性结合的聚合酶-启动子复合物连接紧密,如果转录要延长需要聚合酶的前进,只有脱离结合的启动子才可以。聚合酶离开结合的启动子以延伸转录产物的过程就叫启动子清除。
启动子阻抑的定义
中文名称启动子阻抑英文名称promoter suppression定 义由于转录抑制因子的作用或甲基化修饰等使启动子活性减弱或丧失。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
启动子解脱的定义
中文名称启动子解脱英文名称promoter escape定 义发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象,即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离,此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录,但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二
启动子元件的功能
中文名称启动子元件英文名称promoter element定 义启动子中的一些顺式作用序列,可以位于启动子的任何方向和任何位置(上游或下游)。可以被一些转录因子所识别,从而调节启动子的活性。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
克隆启动子的方法
随着基因工程的发展，常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大，是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法，对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。迄今为止，国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道，国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、克隆
克隆启动子的方法
随着基因工程的发展，常常需要构建一种能高水平表达异源蛋白质的表达载体。启动子对外源基因的表达水平影响很大，是基因工程表达载体的重要元件。因此研究启动子的克隆方法，对研究基因表达调控和构建表达载体至关重要。迄今为止，国外尚未见到有关启动子克隆方法的综述性报道，国内仅孙晓红等曾就启动子的结构、分类、克隆
双向启动子的定义
双向启动子( bidirectional promoter)位于两个相邻且转录方向相反的基因之间 的一段DNA序列。
翻滚启动子的定义
中文名称翻滚启动子英文名称flip-flop promoter定 义可颠倒的启动子。最早见于沙门氏菌的两种鞭毛蛋白基因的交替表达。这些基因都受一个可以颠倒的DNA片段控制,在一个顺式作用因子的调节下,这个片段从不同的方向驱动不同基因的表达,后来发现奇异变形杆菌的氯霉素抗性基因和珠蛋白基因等基因的表
启动子解脱的定义
中文名称启动子解脱英文名称promoter escape定 义发生在真核生物基因转录起始过程后期的一个现象，即转录起始复合体形成后RNA聚合酶从启动子上脱离，此后RNA聚合酶不再依赖启动子就能继续完成转录，但是转录的速度也因此而受到限制。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二
启动子封堵的概念
中文名称启动子封堵英文名称promoter occlusion定 义上游启动子对下游启动子的阻碍作用。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
杂合启动子的定义
中文名称杂合启动子英文名称hybrid promoter定 义由两种或两种以上不同启动子元件融合构成的一个新的启动子。如tac启动子就是将色氨酸启动子Ptrp-35区域与突变的乳糖启动子PlacUV5的-10区域融合构成的杂合启动子，兼具Ptac强启动能力和乳糖启动子可操控特性(受lacI产物的阻
启动子的基本结构
启动子是一段位于结构基因5'端上游区的DNA序列，能活化RNA聚合酶，使之与模板DNA准确地相结合并具有转录起始的特异性。因为基因的特异性转录取决于酶与启动子能否有效地形成二元复合物，故RNA聚合酶如何有效地找到启动子并与之相结合是转录起始过程中首先要解决的问题。有实验表明，对许多启动子来说
启动子清除的概念
聚合酶转录时，首先结合到启动子上，找到特异结合位点，激活后起始转录。 特异性结合的聚合酶－启动子复合物连接紧密，如果转录要延长需要聚合酶的前进，只有脱离结合的启动子才可以。聚合酶离开结合的启动子以延伸转录产物的过程就叫启动子清除。
启动子的功能介绍
一个启动子是一组DNA序列能使一个基因进行转录。启动子是由RNA聚合酶所确认，并且引发转录。在RNA的合成中，启动子是一种方法区分哪一个基因用作制造mRNA，及进而控制细胞制造哪一种蛋白质。
启动子—基因表达的发动机
众所周知，一段基因从转录开始，最终形成蛋白质执行功能，离不开一个高效、匹配的启动子。启动子的一般结构包括核心启动子元件和上游调控元件。核心启动子元件又包括转录起始点和TATA框，主要作为RNA聚合酶结合并起始转录的位点，上游调控元件能够通过与对应的反式作用因子相结合改变转录的效率，如图1。
分子遗传学词汇增强子
中文名称：增强子外文名称：enhancer定义：增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域，与蛋白质结合之后，基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游，也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因，这是因为染色质的缠绕结构，使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
华人科学家发现DNA甲基化关键调节因子
《科学》基因表达调控新突破： DNA甲基化对哺乳动物发育至关重要。本研究利用DNA甲基化报告子敲入技术，对人类胚胎干细胞进行全基因组CRISPR-Cas9筛选。发现QSER1基因是发育相关基因二价启动子和准备状态增强子的关键保护因子，尤其是位于DNA甲基化峡谷内的基因。研究确定了QSER1和T
胚胎干细胞
胚胎干细胞当受精卵分裂发育成囊胚时，内层细胞团（Inner Cell Mass）的细胞即为胚胎干细胞。胚胎干细胞具有 全能性，可以自我更新并具有分化为体内所有组织的能力。早在1970年Martin Evans已从小鼠中分离出胚胎干细胞并在体外进行培养。而人的胚胎干细胞的体外培养才获得成功。 进
揭秘胚胎发育奥秘！为何发育中胚胎细胞彼此并不相同？
近日，一项刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中，来自纽约大学的科学家们通过研究阐明了在胚胎发育（embryogenesis）过程中细胞变得彼此不同的分子机制，相关研究结果或能帮助阐明胚胎发育的遗传规律，同时也能帮助理解疾病发生和出生缺陷的原因。图片来源：commons.wik
新研究揭示猪肌纤维类型分化及转化机制
7月1日，华南农业大学教授吴珍芳团队首次揭示了不同代谢类型猪骨骼肌的染色质空间构象及其介导的调控差异，通过整合表观基因组学与三维基因组学分析并结合分子实验，阐明了超级增强子调控肌纤维类型分化与转化的分子机制。相关成果发表于《自然-通讯》（Nature Communications）。研究对象及高通量