Nature子刊:鉴定增强子全新方法
增强子是能够加强特定基因表达的DNA序列。日期,劳伦斯伯克利国家实验室(Berkeley Lab)的研究团队,开发了一个能在人类和其他哺乳动物基因组中鉴定基因增强子的新技术。文章于三月二十三日发表在Nature Methods杂志的网站上。 这一技术被称为SIF-seq(site-specific integration fluorescence-activated cell sorting followed by sequencing),是一个无偏好的,中等通量的功能分析工具,可鉴定远距离作用的增强子。据研究人员介绍,SIF-seq弥补了ChIP-seq等现有基因组工具的不足。 “虽然ChIP-seq是鉴定增强子的有力工具,但它有时会遗漏真正的增强子,或者将其他位点错认为是增强子,”文章的第一作者Diane Dickel说。“尽管SIF-seq目前一次只能测试数百个位点的增强子活性,但它比ChI......阅读全文
科学家尝试破解基因增强子之谜
基因可能是细胞核中的主角,但如果没有强有力的配角阵容,它们也将永远无法发光。随着DNA调控剂(增强子)的延展,将帮助基因在正确的时间和位置启动。尽管研究人员像狗仔队追踪好莱坞明星一样详细调查了基因,增强子依然身处幕后,其工作原理仍然成谜。不过,近日举行的遗传学会议可能将改变现状:研究人员描述了
增强子的增强子的特点作用
① 具有远距离效应。② 无方向性。③ 顺式调节。④ 无物种和基因的特异性。⑤ 具有组织特异性。⑥ 有相位性。⑦ 有的增强子可以对外部信号产生反应。增强子能大大增强启动子的活性。增强子有别于启动子处有两点:[1]增强子对于启动子的位置不固定,而能有很大的变动;[2]它能在两个方向产生相互作用。一个增强
增强子的定义
增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域,与蛋白质结合之后,基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游,也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因,这是因为染色质的缠绕结构,使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
增强子的分类
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类:①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性,只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下,才能发挥其功能。②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如,金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录,又可受类固醇激素、锌、镉
Nat-Genet:新方法揭示基因“增强子”的工作机理
来自日本理化研究所(RIKEN)综合医学科学中心和肿瘤分子研究所(IFOM)的研究人员与京都大学、卡罗林斯卡研究所和DNAFORM的合作者一起开发出了一种被称为NET-CAGE的新技术,揭示了基因组中被称为增强子的非编码基因的结构,增强子可以激活特定基因的功能。基因组的这些部分曾经被认为是不重要
“超级增强子”调控关键基因-科学家为其编目录
据物理学家组织网10月10日报道,最近,美国怀特黑德生物医学研究所科学家发现了一套称为“超级增强子”的基因调控器,能控制、影响人类和小鼠的大量细胞型。研究人员指出,超级增强子富集在基因组的变异区,而这些变异区与多种疾病谱系密切相关,所以它们最终可能在疾病诊断与治疗方面发挥重要作用。相关论文在线发
增强子转录在小麦基因表达调控中的作用获揭示
广州大学分子遗传与进化创新研究中心董志诚团队与复旦大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧团队合作,首次报道了植物中的增强子转录,初步阐释了增强子转录在小麦基因表达调控中的作用。相关研究近日发表于《基因组生物学》(Genome Biology)。 增强子是一种40
基因组精确注释新方法:增强子鉴定新技术
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所动物功能基因组学创新团队研发出增强子鉴定新技术。该技术与传统技术相比,平均分辨率提高了约10倍,为基因组的精确注释提供了新方法。相关研究成果发表在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上。 增强子是一种基因组非编码区的顺式调控元件,
增强子转录在小麦基因表达调控中的作用获揭示
广州大学分子遗传与进化创新研究中心董志诚团队与复旦大学、中国科学院分子植物科学卓越创新中心张一婧团队合作,首次报道了植物中的增强子转录,初步阐释了增强子转录在小麦基因表达调控中的作用。相关研究近日发表于《基因组生物学》(Genome Biology)。 增强子是一种40
简述增强子的发现
1981年Benerji在SV40DNA中发现一个140bp的序列,它能大大提高SV40DNA/兔β—血红蛋白融合基因的表达水平,这是发现的第一个增强子。它位于SV40早期基因的上游,由两个正向重复序列组成,每个长72 bp。发现的增强子多半是重复序列,一般长50bp,通常有一个8—12bp组成
增强子的基本结构
增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域,与蛋白质结合之后,基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游,也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因,这是因为染色质的缠绕结构,使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
增强子元件的定义
中文名称增强子元件英文名称enhancer element定 义存在于高等真核生物和各种病毒的基因组中的一种DNA序列。通常位于基因转录起始位点的上游,在与专一的转录因子结合后能提高该基因的转录水平。与启动子不同,单独的增强子元件不足以使基因表达。它们在两个方向和与启动子的任何距离处都能发挥作用。
增强子元件的定义
中文名称增强子元件英文名称enhancer element定 义存在于高等真核生物和各种病毒的基因组中的一种DNA序列。通常位于基因转录起始位点的上游,在与专一的转录因子结合后能提高该基因的转录水平。与启动子不同,单独的增强子元件不足以使基因表达。它们在两个方向和与启动子的任何距离处都能发挥作用。
增强子的特点作用
① 具有远距离效应。② 无方向性。③ 顺式调节。④ 无物种和基因的特异性。⑤ 具有组织特异性。⑥ 有相位性。⑦ 某些增强子可以应答外部信号。
增强子的特点作用
① 具有远距离效应。② 无方向性。③ 顺式调节。④ 无物种和基因的特异性。⑤ 具有组织特异性。⑥ 有相位性。⑦ 某些增强子可以应答外部信号。
概述增强子的特点作用
① 具有远距离效应。 ② 无方向性。 ③ 顺式调节。 ④ 无物种和基因的特异性。 ⑤ 具有组织特异性。 ⑥ 有相位性。 ⑦ 某些增强子可以应答外部信号。 增强子能大大增强启动子的活性。增强子有别于启动子处有两点:[1]增强子对于启动子的位置不固定,而能有很大的变动;[2]它能在两个
关于增强子的分类介绍
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类: ①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性,只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下,才能发挥其功能。 ②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如,金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录,又可受类固醇
增强子的基本分类
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类:①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性,只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下,才能发挥其功能。②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如,金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录,又可受类固醇激素、锌、镉
增强子捕获的方法特点
中文名称增强子捕获英文名称enhancer trapping定 义用于确定DNA序列中是否包含增强子功能的一项技术。用做检测的载体含有启动子和报道基因可作表达的标记,但缺乏增强子,将拟检测的DNA序列克隆入这种载体的适当位置,导入细胞或个体,从报道基因表达的程度可分析出增强子的存在与否及其强弱。应
关于增强子的特点介绍
① 具有远距离效应。 ② 无方向性。 ③ 顺式调节。 ④ 无物种和基因的特异性。 ⑤ 具有组织特异性。 ⑥ 有相位性。 ⑦ 某些增强子可以应答外部信号。 增强子能大大增强启动子的活性。增强子有别于启动子处有两点:[1]增强子对于启动子的位置不固定,而能有很大的变动;[2]它能在两个
关于增强子的作用介绍
增强子具有组织特异性,例如免疫球蛋白基因的增强子只有在B淋巴胞内,活性才最高。除此以外,在胰岛素基因和胰凝乳蛋白酶基因的增强子中都发现了有很强的组织特异性。此外,所有的增强子中均有一段由交替的嘧啶-嘌呤残基组成的DNA,这种DNA极易形成Z-DNA型;故有人认为在形成一小段Z-DNA后,增强子才
关于增强子的分类介绍
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类: ①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性,只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下,才能发挥其功能。 ②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如,金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录,又可受类固醇
关于增强子序列的简介
增强子是指能使和它连锁的基因转录频率明显增加的DNA序列。作为基因表达的重要调节元件,增强子序列大多为重复序列,一般长约50bp,适合与某些蛋白因子结合。其内部常含有一个核心序列:(G)TGGA/TA/TA/T(G),是产生增强效应时所必需的。 1981年Benerji在SV40DNA中发现一
科学家发现功能增强子导致染色体外致癌基因扩增
近日,美国克利夫兰凯斯综合癌症中心等科研机构的科研人员在Cell上发表了题为“Functional Enhancers Shape Extrachromosomal Oncogene Amplifications”的文章,发现功能增强子导致染色体外致癌基因扩增 跨越致癌基因边界的非编码区扩增一
Cell:两项研究聚焦“超级增强子”
近日,麻省理工白头研究所和哈佛丹娜法伯癌症研究所以及冷泉港实验室这三家知名的研究机构的科学家惊讶地发现,一组称作“超级增强子”( super-enhancer)的强有力基因调控子,它们控制了细胞的状态和特性。相关两个研究论文刊登在了近期出版的《细胞》(Cell)杂志上。 研究发现,健康
Nature子刊:鉴定增强子全新方法
增强子是能够加强特定基因表达的DNA序列。日期,劳伦斯伯克利国家实验室(Berkeley Lab)的研究团队,开发了一个能在人类和其他哺乳动物基因组中鉴定基因增强子的新技术。文章于三月二十三日发表在Nature Methods杂志的网站上。 这一技术被称为SIF-seq(site-sp
eLife:癌基因总闸与超强抗癌小鼠
将一个与不同类型癌症相关的调节区域移除,小鼠对肿瘤的形成产生了巨大的抵抗力! 我们每个细胞内都有接近2万个基因,这些基因是维系我们身体和生存的说明书。在细胞生命周期的某个时间点上,只有部分基因需要保持活跃,每个基因的活性一直处于动态的调节状态,使细胞响应环境变化。 增强子是控制基因活性的分子
分子遗传学词汇增强子
中文名称:增强子外文名称:enhancer定义:增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域,与蛋白质结合之后,基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游,也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因,这是因为染色质的缠绕结构,使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
顺式作用元件的结构增强子的特点介绍
(1)增强子可提高同一条DNA链上基因转录效率,可以远距离作用,通常距离l~4kb,个别情况下离开所调控的基因30kb仍能发挥作用,而且在基因的上游或下游都能起作用。 (2)增强子作用与其序列的正反方向无关,将增强子方向倒置依然能起作用。而将启动子倒置就不能起作用,可见增强子与启动子是很不相同
为什么增强子对启动子没有专一性
(1)增强子可提高同一条DNA链上基因转录效率,可以远距离作用,通常距离l~4kb,个别情况下离开所调控的基因30kb仍能发挥作用,而且在基因的上游或下游都能起作用。 (2)增强子作用与其序列的正反方向无关,将增强子方向倒置依然能起作用。而将启动子倒置就不能起作用,可见增强子与启动子是很不相同