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单细胞RNA测序发现新的免疫细胞

最近在《Nature Immunology》发表的一项新研究,详细检测了一组新发现的免疫细胞(被称为ILC)。通过对单个扁桃体细胞的基因表达进行分析,瑞典卡罗林斯卡学院的科学家们,发现了三个以前未知的ILC子群,并揭示了关于“这些细胞在人体中如何发挥功能”的更多信息。 先天淋巴细胞(ILC)是一组免疫细胞,只在最近才在人类中被发现。目前关于ILCs的知识,来源于胃肠道炎症或感染的动物研究。因此,迫切需要在人类中更多地了解这些细胞。 以前的研究表明,ILCs对于维持粘膜的屏障功能非常重要,粘膜作为肺部、肠道和其他部位抵御微生物的第一道防线。然而,尽管有越来越多的证据表明,ILCs与一些疾病有关,如炎症性肠道疾病、哮喘和肠癌,但是,仍然需要进行基础研究,查明它们到底起了什么作用。 由Rickard Sandberg和Jenny Mjösberg带领的两个研究小组,对来自人类扁桃体的ILCs进行了一项合作研究。迄今为止,人类......阅读全文

单个脑细胞的基因表达谱

  科研人员报告了一种根据基因表达谱为人类大脑的单个细胞分类的方法。人类大脑含有许多种类的细胞,它们的基因表达模式有差别。此前为这些细胞类型分类的方法一直限于使用几个基因或蛋白质标记物以及分析整个细胞群。Stephen Quake及其同事使用单细胞RNA测序分析了来自人类大脑组织的466个个体细胞的

单细胞基因表达谱揭示小脑细胞分化机制

  尽管小脑(Cerebellum)体积仅为全脑的十分之一左右, 但其神经元数量大约占全脑的一半以上。近来研究表明,小脑不仅对运动的调节和维持有着重要作用,而且影响情绪、认知等高级功能。小脑发育异常和功能障碍与许多神经和精神疾病有关,例如共济失调,震颤,自闭症障碍和精神分裂症等。了解疾病相关基因在小

表达谱基因芯片实验

表达谱基因芯片可应用于:(1)疾病诊断;(2)新药开发;(3)环境保护。实验方法原理按照预定位置固定在固相载体上很小面积内的千万个核酸分子所组成的微点阵阵列。在一定条件下,载体上的核酸分子可以与来自样品的序列互补的核酸片段杂交。如果把样品中的核酸片段进行标记,在专用的芯片阅读仪上就可以检测到杂交信号

Cell重大成果:首张干细胞发育基因表达谱

  来自哈佛大学医学院,圣朱迪儿童研究医院等处的研究人员完成了造血干细胞发育不同阶段的基因表达谱,这将有助于识别指引胚胎干细胞向造血干细胞分化的关键因子,为未来干细胞工程研究提出了重要基础信息。这项研究公布在Cell Stem Cell杂志上,并被作为封面文章推荐。      (吸血

表达谱基因芯片实验操作流程

一、试剂1. TRIzol2. 异丙醇3. 氯仿4. 75%乙醇(RNase-free)5. Milli-Q水(RNase-free)6. 无水乙醇7. dNTPs8. Cy5-dCTP和Cy3-dCTP9. 杂交试剂110. 标记试剂I11. 杂交试剂212. 标记试剂II13. 反转录酶14. 

免疫细胞的基因表达或能帮助预测机体对流感的易感性

  近日,一项刊登在国际杂志Genome Medicine上的研究报告中,来自斯坦福大学医学院的研究人员通过研究发现,免疫细胞的基因表达或许能够有效预测机体对流感的易感性,文章中,研究者表示,表达KLRD1的自然杀伤细胞或许能作为机体对流感易感性的特殊生物标志物。   研究者Erika Bo

基因表达谱数据聚类分析相关内容

DNA微阵列基因表达数据分析 对于基因表达谱数据的分析是生物信息学 的研究热点和难点。转化为数学问题,分析任务是从数据矩阵 M 中找出显著性结构,结构类型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。对基因表达谱数据的分析是数据挖掘问题,所采用的方法包括通过可视化进行探索性数据分析

汉族和日本人之间的基因表达谱差异

  6月4日,《医学遗传学杂志》在线发表了上海生科院计算生物学研究所徐书华研究组的研究成果“Identification of well-differentiated gene expressions between Han Chinese and Japanese using genome

大型衰老相关基因表达谱数据库建成

  英国《自然·通讯》杂志30日发表的一项研究称,包括人类在内的4个物种的大型衰老相关基因表达谱数据库建成。德国科学家团队分析数据后发现,衰老相关基因的表达变化与退行性慢性病相关基因的表达变化轨迹一致,但与癌症的相反。  对衰老及衰老相关疾病的研究,一直是人类医学的难题。但随着“衰老基因”的确定,衰

Science:新型单细胞基因表达检测技术

  发表在最新一期《科学》(Science)杂志上的一篇研究论文,证实了一种新型的大规模平行测序技术可借助于新一代测序(NGS)在单细胞水平上检测基因表达。  论文作者、来自Cellular Research, Inc公司的Christina Fan博士、Glenn Fu博士以及Stephen Fo