建立茎尖细胞特异基因表达图谱

基因差异表达是细胞分化和不同细胞类型形式特异功能的基础。细胞特征的转录图谱对于了解不同类型细胞如何生长发育、响应环境至关重要。但植物细胞由细胞壁固着,不易分离,很难获得细胞类型特异的转录数据。 中国科学院遗传与发育生物学研究所焦雨铃研究组在之前的工作中建立了器官边界区的细胞特异表达图谱 (Tian et al., 2014, Molecular Systems Biology)。在此基础上,该研究组利用翻译核糖体亲和纯化技术进一步获得了茎顶端和叶片不同区域特异的基因表达图谱。研究发现了许多区域特异的未知细胞功能,并发现相似性很低的细胞类型可以利用共同的调控模块。研究还进一步鉴定了新的侧生分生组织起始调控基因。该图谱为研究植物生长发育及环境响应提供了重要参考数据。通过该研究搭建的数据库,每个基因的细胞特异表达数据均可检索并可视化展示。 该研究结果于2019年1月11日发表于《自然-通讯》(Nature Communicat......阅读全文

建立茎尖细胞特异基因表达图谱

  基因差异表达是细胞分化和不同细胞类型形式特异功能的基础。细胞特征的转录图谱对于了解不同类型细胞如何生长发育、响应环境至关重要。但植物细胞由细胞壁固着,不易分离,很难获得细胞类型特异的转录数据。  中国科学院遗传与发育生物学研究所焦雨铃研究组在之前的工作中建立了器官边界区的细胞特异表达图谱 (Ti

遗传发育所等建立茎尖细胞特异基因表达图谱

  基因差异表达是细胞分化和不同细胞类型形式特异功能的基础。细胞特征的转录图谱对于了解不同类型细胞如何生长发育、响应环境至关重要。但植物细胞由细胞壁固着,不易分离,很难获得细胞类型特异的转录数据。  中国科学院遗传与发育生物学研究所焦雨铃研究组在之前的工作中建立了器官边界区的细胞特异表达图谱 (Ti

花生茎秆单细胞基因表达图谱构建成功

  广东省农业科学院作物研究所花生遗传育种团队在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助下,成功攻克了花生茎秆单细胞基因表达图谱构建的技术难题。近日,相关成果在线发表于《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)。花生茎秆单细胞基因表达图谱构建。研究团队供图 

植物茎尖培养

(一)实践目的通过实践学习和练习,掌握植物茎尖培养基本技术。(二)实践用具与材料超净工作台、18cm手术弯剪、16cm镊子、接种盘、毛刷、纱布、培养瓶。培养基250瓶、洗衣粉1袋、2%新洁尔灭500mL、75%酒精4L、0.1%升汞1L、无菌水。带嫩芽的植物枝条(三)实践时间与场地4学时、植物组培室

茎尖培养的定义

把茎尖的分生组织或包括有此分生组织的茎尖分离进行无菌培养的方法。

植物的茎尖培养

植物茎尖培养 (一)实践目的 通过实践学习和练习,掌握植物茎尖培养基本技术。 (二)实践用具与材料 超净工作台、18cm手术弯剪、16cm镊子、接种盘、毛刷、纱布、培养瓶。培养基250瓶、洗衣粉1袋、2%新洁尔灭500mL、75%酒精4L、0.1%升汞1L、无菌水。带嫩芽的植物枝条

Nature重要论文:大型基因表达图谱

来自艾伦脑科学研究所的科学家们在最新出版的《自然》(Nature)杂志上报告称证实人类大脑具有一致的遗传蓝图,且拥有巨大的生物化学复杂性。这些研究结果来自于对“艾伦人脑图谱库”(Allen Human Brain Atlas)公开提供的大量数据集的首次深入大规模分析。 这项研究的结果是基于对“艾

中国髓母细胞瘤基因表达图谱研究新成果发布

  中华医学会第七届全国小儿神经外科学术大会暨第十一届中国小儿神经外科论坛(CPNF)于2019年6月21至23日在广州隆重召开。本次会议由中华医学会、中华医学会神经外科学分会小儿神经外科学组主办,广东三九脑科医院、上海交通大学医学院附属新华医院承办。  复旦大学附属华山医院神经外科姚瑜教授课题组、

科学家破解大豆发育“基因密码”助力精准分子育种

大豆是人类与家畜植物性蛋白质和油的重要来源。目前,利用分子设计育种策略加速大豆育种颇为重要,而揭示关键基因和大豆器官发育的调控网络则对分子设计育种至关重要。中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜研究团队与合作者,开创性地构建了宏观-单细胞-空间三级转录解析体系。研究基于314份全器官样本的Bulk

基因的组织特异性表达的定义

克隆载体中加入一些与表达调控有关的元件即成为表达载体.组织特异性就是多细胞生物个体,每个组织具有与其它组织相区别的特征,组织特异性的存在是取决于构成该组织主要成分的细胞性质.而组织特异性表达克隆载体就是带有某种组织特殊的启动子,在该组织中才能表达

大脑完整基因表达图谱和神经元联系图谱绘制完成

  继美国总统奥巴马宣布“推进创新神经技术脑研究计划”(简称BRAIN计划或脑计划)一年后,美国科学家成功给“整个大脑”做了图谱。4月3日出版的英国《自然》杂志发表两项相关研究,介绍了哺乳动物大脑中完整的基因表达图谱和神经元联系图谱。此次的图谱对于研究人类大脑发育和神经回路,从而理解人类的行为和认知

Nature:大脑基因表达图谱和神经元联系图谱绘制完成

2013年4月2日奥巴马政府公布“脑计划”,现在一年过去,脑计划出了两项突破性成果:科学家绘制出哺乳动物大脑中完整的基因表达图谱和神经元联系图谱        在美国总统巴拉克·奥巴马宣布了“使用先进革新型神经技术的人脑研究”(BRAIN)计划 1 年后,《自然》杂志于4月3日发表了两项研究,介

基因表达过程中哪些因素与基因表达组织特异性有关

基因表达(geneexpression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中遗传信息经过转录和翻译,转变成具有生物活性的蛋白质分子。生物体内的各种功能蛋白质和酶都是同相应的结构基因编码的。差别基因表达(differentialgeneexpression)指细胞分化过程中,奢侈基因按一定顺序表

茎尖培养的定义和脱毒的原理

茎的生长点培养,实际就是茎尖培养。在植物组织的培养中,曾是很早以来就被应用的一种方法,茎尖培养除研究枝条的发育和花的形态形成外,也应用于无病毒植物的培养和兰花等园艺作物的营养繁殖等方面。此外,用这种方法进行营养繁殖的个体称为分体无性繁殖(mericlone)。茎尖培养脱毒的原理是茎尖几乎不含病毒,采

北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM

近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance

北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM

  近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can

上海生科院提出植物芽从头再生的分子框架图

  在合适培养环境条件下,植物离体组织或器官(也称为外植体)能够从头再生出新的分生组织。六十多年前,Skoog和Miller发现细胞分裂素和生长素是诱导外植体从头建立茎尖或根尖分生组织的关键要素,但其中蕴含的分子机制尚不清晰。4月7日,《植物细胞》(The Plant Cell)杂志在线发表了中国科

全球首个奶牛多组织单细胞表达图谱诞生

中国农业大学动物科学技术学院教授孙东晓团队构建了覆盖奶牛59种组织、179万个细胞的多组织单细胞表达图谱,为解析牛重要性状遗传调控机制、推进精准育种及探索人类疾病的牛模型研究提供了重要资源。9月5日,相关研究成果发表于《自然-遗传》。作为人类最早驯化的家畜之一,奶牛在全球粮食安全与农业生态系统中占据

组织特异性基因的表达是如何调控的

这个问题如果搞得特别明白足够发一篇CNS了,不同组织的转录组在不同时期表达是不同的,这也是为什么人要研究转录组的原因,但是有一点的是 housekeeping gene在不同组织不同时空还是要表达的,只是差异表达基因会不同而已,你可以参照中科院基因组所 zhu jiang 发表在genome res

《细胞》:单细胞测序助力基因重组图谱

  来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了来自一个成人男子91个

我国学者在大豆时空组学领域取得新进展

图 大豆器官发育的时空图谱  在国家自然科学基金项目(批准号:32388201)等资助下,中国科学院遗传发育所/崖州湾国家实验室田志喜团队在大豆时空组学研究方面取得新进展,成功构建并发布了第一个国产大豆(中黄13)时空转录图谱。研究成果以“大豆器官发育的大规模整合转录组图谱(A large-scal

细胞的分化与基因表达

细胞分化是个体发育过程中细胞之间产生稳定差异的过程。所以,细胞分化是指同源细胞通过分裂,发生形态、结构与功能特征稳定差异的过程。细胞分化的实质是基因选择性表达的结果,在个体发育过程中基因按照一定程序相继激活的现象,称为基因的差次表达(differential expression)或顺序表达(Seq

苔藓物种多样性评估中常用的鉴定方法有哪些?

苔藓物种多样性评估中常用的鉴定方法如下:形态学鉴定:观察外部形态特征:苔藓植物的茎、叶、假根等形态结构各有特点。例如,藓类植物的茎多为直立,叶的形状、排列方式多样;苔类植物的叶通常较简单。通过观察这些特征并与专业资料进行对比来鉴定物种。如葫芦藓,其茎直立,叶片呈卵形或舌形,先端渐尖,这是其重要的形态

猪等位基因特异性表达的时空特异性首获系统研究

近日,我国学者首次系统研究了猪等位基因特异性表达(ASE)的时空特异性,揭示了在不同发育时期、不同组织中的亲本决定型和等位基因型决定型两种ASE类型。相关成果在线发表于《自然-通讯》杂志。现代养猪产业普遍采用专门化品系选育和配套系杂交,其目的是充分利用杂种优势。基因表达调控是将基因型转化为表型的关键

单个脑细胞的基因表达谱

  科研人员报告了一种根据基因表达谱为人类大脑的单个细胞分类的方法。人类大脑含有许多种类的细胞,它们的基因表达模式有差别。此前为这些细胞类型分类的方法一直限于使用几个基因或蛋白质标记物以及分析整个细胞群。Stephen Quake及其同事使用单细胞RNA测序分析了来自人类大脑组织的466个个体细胞的

首个豆科植物根尖单细胞表达图谱绘制成功

 百脉根单细胞图谱细胞类型。中国农科院供图 近日,中国农业科学院生物技术研究所作物生物技术育种创新团队与国内其他科研单位合作,共同绘制完成首个豆科植物百脉根的根尖单细胞表达图谱,鉴定出根尖的主要细胞类型,发现了新的细胞类型特异基因,并分析了各个细胞类型的潜在功能,对研究豆科植物根系发育、结瘤固氮

北京生科院建立单细胞环形RNA分析技术及表达图谱

  环形RNA是一类在真核细胞中广泛存在的内源性非编码RNA分子,在生物体发育过程中发挥重要作用。之前研究已在不同物种中鉴定出数百万个环形RNA分子,并产生了大量用于揭示生物体组织表达模式的环形RNA数据资源。然而,由于大多数环形RNA表达量较低,传统的转录组测序方法无法表征单个细胞环形RNA表达谱

关于位点特异性重组的基因的表达调控介绍

  如果一个DNA分子上两个特异位点之间发生重组,其后果有两种可能性:两个位点之间的节段或被丢失,或被颠倒。有些生物能够利用这种重组倒置来控制基因的表达。因为DNA的一正一倒两种排列法可以相应地表达两种不同的蛋白质,细胞就可根据需要作出选择。奇怪的是,利用这种机制所调节的蛋白质往往都位于生物的体表。

重测序构建芝麻超高密度图谱以及花序基因的定位

连锁分析寻找QTL位点,是最经典的性状定位方法。而遗传图谱的密度是限制定位精度的其中一个方面。目前,构建图谱的方法已从基于传统的SSR、AFLP等基于片段长度多态性的分子标记,过渡到了基于SNP芯片或NGS测序的SNP分子标记。NGS测序最常用的是简化基因组测序和全基因组重测序,区别在于标记数量的多

3篇Science文章:大规模人类基因表达差异图谱

  在美国国立卫生研究院基因型-组织表达(GTEx)项目的资金资助下,研究人员构建出了一个万众期待的新数据资源,它可以帮助确立个体基因组构成之间的差异对于基因活性的影响以及对疾病的贡献。借助于这一新资源,科学家们可以同时探究许多不同人类组织和细胞的潜在基因组学,并有望为研究和了解人类生物学开辟新途径