检测稀有突变的两大工具比拼
物以稀为贵，突变检测也是如此。如今，稀有突变（rare mutation）已成了热门的研究对象，并推动了PCR仪器和检测的发展。尽管定量PCR（qPCR）在相当一段时间内仍将占据优势，但数字PCR（dPCR）并不会让它专美。 什么是稀有突变？ “稀有突变”这个词代表什么意思？你询问不同的人，可能会得到不同的答案。一些人认为，这是指群体中的频率。一个人可能只携带了突变的等位基因，之所以说稀有，是因为人群中携带这个突变的人非常少。 稀有的另一层意思是突变的序列在特定生物中以相对低水平存在。不过，许多个体可能都有相同的突变。例如， “一些引起癌症的热点突变，”赛默飞世尔数字PCR系统的产品经理Lance Wakida解释道。“对于乳腺癌，一小部分突变 – 如EGFR的特定外显子 – 就以一定的规律存在。” 这个术语也有不同的定量解释。对于测序人员来说，鉴于错误率在1%-1.5%的范围内，那么低于5%的突变 都是稀有的。如果......阅读全文
数字PCR技术的优势
1.绝对的定量：不依赖于标准曲线和参照样本，直接检测目标序列的拷贝数。 2.高灵敏度检测：灵敏度高达0.01%，可以检测含量极低的核酸序列（如CTDNA）。 3.区分浓度差异微小的样品：可以精准测定靶基因相对表达，基因拷贝数变异等。
前列腺癌患者选择哪种靶向治疗，验一下血便知晓
近年来，晚期前列腺癌的治疗手段迅速发展，每年都有新的治疗药物上市。特别是去势抵抗性前列腺癌（CRPC），多种疗法都获得了不同程度的成功。如今通过abiraterone或enzalutamide来抑制雄激素受体已是CRPC的标准治疗方法，但是哪些患者将从中受益，目前还不清楚。 近日，英国癌症研究
数字PCR技术的应用领域
从上世纪90年代以来qPCR技术的爆发式发展使得现代核酸检测技术具有全新的面貌，而进入二十一世纪之后，速度更快、通量更高。成本更低的DNA测序技术正在迅速发展，也是目前竞争最为激烈的研究领域之一，即使在这种情况下，dPCR技术仍然以其高度的灵敏性和特异性在诸多科学领域争取到属于自己的一席之地。即使在
关于乙肝病毒DNA检测的优点介绍
DNA检测方法由于其特异性好、灵敏度高、操作简便等原因已成为物种鉴定的主要检测方法。首先，DNA在细胞中含量相对稳定，比蛋白质耐热，在产品的加工过程中也相对不容易被破坏，从加工产品中仍能提取出足够可供分析的小片段DNA；其次，DNA信息量大，物种的差异直接反映在DNA序列的差异上。可以根据DNA
研究在尿路上皮癌诊断和动态监测液体活检技术获进展
泌尿生殖系统肿瘤是严重危害人类健康的一类疾病，当前对于泌尿生殖系统肿瘤的诊断和监测方法通常是侵入性的，且缺乏敏感性和特异性，存在假阳性率。 近日，中国科学院北京基因组研究所慈维敏团队与北京大学第一医院泌尿外科周利群、李学松团队合作，对315例尿液样本（检测队列含泌尿上皮癌、肾癌、前列腺癌，非肿
单细胞基因组扩增法的定量评估
近日， Nature出版集团旗下刊物Scientific Reports刊发南方科技大学副教授贺建奎课题组最新研究成果《单细胞基因组扩增法的定量评估及其在检测单个海马神经元基因拷贝数变异的应用》，从多个角度评估了三种最常用的单细胞基因组扩增方法。经过细致比较发现，MALBAC和GenomePle
科学家发现藏族进化遗传关键因素
近日，中科院上海生科院计算生物学研究所徐书华研究组与国内外科学家合作，检测到一段藏族特异的拷贝数缺失区域，有可能解决困扰科学家多年的高原极端环境生物学适应机制问题。相关研究已在线发表于《美国人类遗传学杂志》。 在该研究中，徐书华等发展了一种搜寻人群特异拷贝数变异的新方法，在DNA微阵列芯片的原
乙型肝炎病毒DNA定量检测临床应用的若干问题与思考
HBV DNA 检测技术目前已经在临床中普遍应用。但在实际工作中，不少临床医师对如何认识、评价和使用 HBV DNA 检测结果仍存在着一些困惑，甚至可能因认识不足、应用不当导致了错误的诊断和治疗。现就 HBV DNA 定量检测临床应用的基因诊断和临床治疗研究阐述如下。一、如何正确认识和评价 HBV
无创产前诊断在亚染色体异常检测上或会限制临床应用
近日，来自英国的研究人员通过研究表示，无创产前诊断（NIPT）因亚染色体异常（sub-chromosomal abnormalities）会限制临床应用。随着对胎儿三染色体（21，18，13）检测的无创产前诊断知晓率的增加，如今很多商业供应商都相应扩大了公司的服务范围，包括复发性的微小缺失和微小
安捷伦科技创造出一款独具特色的细胞遗传学工具
安捷伦科技将 CGH 和 SNP 分析结合到同一芯片上创造出一款独具特色的细胞遗传学工具 2010 年 10 月 11 日，北京——安捷伦科技公司（纽约证交所：A）今日推出 SurePrint G3 Human CGH+SNP 芯片平台，这一创新型的系统能够同时分析染色体拷贝数改变和不改变的染色
PCR技术的临床应用的介绍
一、感染性疾病 PCR在医学检验学中最有价值的应用领域就是对感染性疾病的诊断。理论上，只要样本有一个病原体存在，PCR就可以检测到。一般实验室也能检出10~100基因拷贝，而目前病原体抗原检测方法一般需要105-7个病原体才可检测到。PCR对病原体的检测解决了免疫学检测的“窗口期”问题，可判断
尖锐湿疣的病原学诊断试验
[摘要]目的探讨荧光定量聚合酶链反应（FQ－PCR）在尖锐湿疣诊断方面的作用。方法：第一阶段用FQ－PCR检测病理确诊的CA组15份标本和健康对照组35份标本；第二阶段用FQ－PCR及病理诊断同期检测临床送检病例53份标本，并做诊断性试验评价。结果第一阶段15例病理确诊的尖锐湿疣患者HPV611DN
SYBR－实时荧光定量PCR技术
优博生物技术有限公司开发的SYBR实时荧光定量PCR（Real-time PCR）就是在PCR反应体系中加入荧光染料与DNA双链的结合的原理，实时监测整个PCR进程，判定即时测定特异性产物的量和推断出初始基因的量，可快速、灵敏的检测样本的RNA和DNA，在动物病原体基因的检测，畜禽产品的检验检疫，生
谢晓亮院士Science单细胞测序新技术
人类、草莓、蜜蜂、鸡和大鼠等许多生物体都已经进行过DNA测序。如果说测序个别物种具有挑战性，那么测序单个细胞的DNA无疑更难。 为了获得足够的DNA进行测序，通常需要数以千计或甚至数以百万计的细胞。而找出哪种突变存在于哪种细胞中几乎是不可能的，只存在于少数细胞(如早期癌细胞)中的突变也基本
谢晓亮院士研发出单细胞测序新技术
人类、草莓、蜜蜂、鸡和大鼠等许多生物体都已经进行过DNA测序。如果说测序个别物种具有挑战性，那么测序单个细胞的DNA无疑更难。 谢晓亮院士研发出单细胞测序新技术 为了获得足够的DNA进行测序，通常需要数以千计或甚至数以百万计的细胞。而找出哪种突变存在于哪种细胞中几乎是不可能的，
dPCRvs.qPCR我该如何选择？
数字PCR(dPCR)是PCR领域的新浪潮。它的与众不同之处在于样品分液。通过微流体芯片、通道或液滴实现分液，而每个都作为单独的PCR反应，带来了出色的灵敏度。同时，也无需建立标准曲线。然而，我们究竟应不应该追赶这个新浪潮?这在很大程度上取决于你的应用和所需的灵敏度水平。何时应该选择d
各类癌症基因检测技术优劣势大对比
提到基因检测，前几年，临床医生在向患者推荐时还心存疑虑，而近两年，基因检测已成为癌症诊疗的标准动作，基本上每一个癌症患者都有一套自己的基因检测报告。 不得不说，一个患者一套方案的个体化诊疗时代已经到来。比如，一位患者患了癌症，不仅要做病理诊断还要做全基因检测，发现突变位点，进而为患者制定包括化疗
PCR检查是查什么的
PCR是现在实验室常用的技术手段之一。一般用于病原的检测，分子机制中各基因的检测以及遗传相关的检测。感染性疾病PCR在医学检验学中最有价值的应用领域就是对感染性疾病的诊断。理论上，只要样本有一个病原体存在，PCR就可以检测到。一般实验室也能检出10~100基因拷贝，而目前病原体抗原检测方法一般需要1
数字PCR技术发现，癌细胞正在偷工减料
美国Stowers医学研究所的研究人员近日在《PLoS Genetics》上发文称，癌细胞可能正在简化它们的基因组。它们减少了核糖体DNA（rDNA）的拷贝数，从而更容易增殖。 “尽管核糖体DNA对细胞功能很重要，但由于定位和分析的挑战，我们几乎不知道是什么在控制其拷贝数的稳定性，”研究人员称
PCR反应绝对定量和相对定量的差别？
绝对定量目的是测定目的基因在样本中的分子数目，即通常所说的拷贝数，应用于taqman探针法检测。相对定量的目的是测定目的基因在两个或多个样本中的含量的相对比例，而不需要知道它们在每个样本中的拷贝数，应用于sybr green染料法检测。
聚合酶链反应的常规应用介绍
用于治疗感染性疾病，肿瘤及遗传病。感染性疾病PCR在医学检验学中最有价值的应用领域就是对感染性疾病的诊断。理论上，只要样本有一个病原体存在，PCR就可以检测到。一般实验室也能检出10~100基因拷贝，而目前病原体抗原检测方法一般需要105-7个病原体才可检测到。PCR对病原体的检测解决了免疫学检测的
HIV核酸检测：定性与定量检测方法及程序的区别
随着生物技术的发展,核酸检测得到了人们越来越多的重视,它可直接检查HIV RNA,可在发现血清学变化之前检测HIV感染,而且比P24抗原检测方法更灵敏。简单的说就是病毒感染人体后，一般情况下可通过一系列检测被发现，而最早能被检测到的是病毒核酸。现有的酶联免疫等血清学检测方法检测的是抗原或抗体，而
冷泉港推出两个精选新方法－分别用于分析基因组和植物细胞
基因组分析法： 2008年6月冷泉港报：人类基因组计划后时代推动了其他个体基因组拷贝序列测定的发展，令人惊讶的是大量的基因拷贝数和DNA系列在个体之间存在很大的差异。这些拷贝数变异(CNV)是产生生物多样性的主要原因，也是导致诸多遗传疾病的元凶。本月的冷泉港期刊Cold Spring Habor
实时荧光定量PCR基本原理
• Taqman 技术：该技术以美国 ABI 公司为代表。 PCR 扩增时，在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针。该探针为一直线型的寡核苷酸，两端分别标记一个荧光报告基团和一个荧光淬灭基团，探针完整时，报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收， PCR 仪检测不到荧光信号； PCR
比较基因组杂交方法介绍
比较基因组杂交是将消减杂交、荧光原位杂交相结合，用于检测DNA序列的拷贝数变异并将其定位在染色体上的方法。CGH 只能检测不平衡的染色体改变。结构染色体变异，例如：平衡的相互易位或倒位不能被检测出来，因为拷贝数没有变化。CGH最初设计是用来检测单一副本缺失的，所以它的的区带长度至少5～10Mbarr
qPCR仪的主要性能指标有哪些？
qPCR仪最重要也是最基本的要求是检测的准确性，因此，在选择时，最关键的一点就是衡量仪器的检测灵敏度、准确性和稳定性。 检测灵敏度：也就是能检测到的最低量，一款好的荧光定量PCR仪是可以达到单拷贝检测灵敏度的。 仪器准确性和稳定性：就是指结果能够准确反应目标基因的量，并且重复多次实验能够
转基因植物的分子检测与鉴定方法（二）
1.1.2.2 降落PCRTD-PCR是一种在一个反应管或少数几个反应管中通过一系列退火温度逐渐降低的反应循环来达到最佳扩增目的基因的PCR方案。它通过体系自身的代偿功能弥补以反应体系和并非完美的循环参数所造成的不足。此策略保证了最初形成的引物模板杂交体具最强的特异性。尽管最后一些循环采用的退火温
关于HBVDNA的正确解读介绍
HBV-DNA定量为4×10的5次方copies/ml，不能解释为血液中每亳升含有乙肝病毒40万个，拷贝数是利用DNA信号扩增技术，由计算机算出血液中乙肝病毒核酸的含量，拷贝数是一个分子生物定量单位，不是简单的数量单位。拷贝数高，说明病毒核酸含量高。 由于肝脏组织中的乙肝病毒每时每刻释放到血液
实时荧光定量pcr仪技术原理
所谓real-time Q-PCR技术，是指在PCR反应体系中加入荧光基因，利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。在 real-time 技术的发展过程中，两个重要的发现起着关键的作用：（1）在90年代早期，TaqDNA多聚酶的5′核酸外切酶活性的
实时荧光定量PCR仪的技术原理
所谓real-time Q-PCR技术，是指在PCR反应体系中加入荧光基因，利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。在 real-time 技术的发展过程中，两个重要的发现起着关键的作用：（1）在90年代早期，TaqDNA多聚酶的5′核酸外切酶活性的