加拿大开发出DNA条形码融合技术实验效率可提高10倍

据最新一期《分子系统生物学》报道,加拿大研究人员开发出一种新技术,可将DNA(脱氧核糖核酸)条形码拼接在单个细胞内,以同时搜索数以百万计蛋白质对之间的相互作用。 近年来,DNA条形码技术使科学家开展高并行试验(许多不同类型的细胞在同一试管内进行试验)成为可能,而新一代DNA测序技术的发展,进一步提高了对条形码计数和读取结果的效率。 然而,可在同一试管内进行的试验次数,却受限于编码的细胞类型数量。一直以来,DNA条形码都是一维的,也就是一个条形码只能做一次试验。允许条形码在细胞内融合在一起,意味着科学家们现在可以打破这一障碍。新技术可显著提高在单一试管内进行的实验次数,在同等成本条件下能将效率提高10倍。 在广泛使用的酵母双杂交(Y2H)方法中,携带一个“诱饵”蛋白的酵母细胞与携带一个“猎物”蛋白的酵母细胞配对。对Y2H系统进行操纵后,只有“诱饵”与“猎物”蛋白黏在一起的细胞才能存活,从而使科学家可以观察到哪些蛋白间互相......阅读全文

转折性技术横空出世,CryoEM后继有人

  图片到视频,纳米技术不断创造着以DNA为介质的文字或影像记录神话,研究人员不断拓展着破译生物结构空间排布的方法。目前,观察DNA、蛋白质或其他复合物通常需要使用先进的显微镜设备以及相匹配的样品处理方法。你很难只通过一种处理,使用一种设备,同时观察许多分子类型,尤其是有着高密度和高通量,或者动态相

从单个核细胞中分离T细胞(玫瑰花结形成试验、尼龙毛、...

从单个核细胞中分离T细胞一、用玫瑰花结形成试验分离E+细胞1.制备AET-绵羊红细胞1)在刻度离心管中,用无菌的含5%小牛血清的Hanks液洗涤绵羊红细胞3次,每次离心500×g 10分钟。2)吸净上清液,测量红细胞比容。轻击试管分散红细胞,加入4倍红细胞比容量、新鲜制备的AET溶液,混匀。室温中反

单细胞测序新技术:同时分析单个细胞的转录组和甲基...

单细胞测序新技术:同时分析单个细胞的转录组和甲基化组 单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而,由于细胞之间存在较大的差异,又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组,在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。 近日,加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授

单细胞分离和转移最新用法—单个细胞级别的分离和转移

在当代生物学与医学的研究中,对单个细胞的分离一直有着很高的需求。然而传统手段往往需要将大量细胞悬浮后进行分选接种。这类方法不仅费时费力,而且细胞活力也会受到影响。本篇报道中Guillaume使用FluidFM BOT建立了一种非常简易、快速的新手段。 单细胞分离有哪些优势?由于蛋白和基因的随机表达性

Nature人物:寻找“不同世界”的方法,破译单细胞的奥秘

  在Stoeckius获得了他的博士学位之后,他成为了Nikolaus Rajewsky实验室的一名成员,在那里他提出了新问题:“如何能用某种技术解答某个问题?我是否可以“模仿”这个技术?”。在2015年,他加入了纽约基因组中心的新技术创新实验室,在那里他和他的同事们开发了一种高通量的技术,可以同

Nature:新型DNA标签证实血液中细胞发育树的存在

  血液中多种不同的细胞类型是如何发育的?科学家们长期以来一直在研究这个问题。根据经典的模型,不同的发育路线像树一样分枝。树干由干细胞组成,树枝由各种不同的祖细胞组成,这些祖细胞可以产生许多不同的细胞类型。然后,它又进一步分化成特殊的血细胞,即红细胞、血小板和免疫系统的各种白细胞。然而,近年来,人们

渔业生物DNA条形码信息采集与数据库构建工作会议召开

   2014年9月11日至13日,科技基础性工作专项“我国重要渔业生物DNA条形码信息采集及其数据库构建”重点项目在青岛召开项目年度工作会议暨学术研讨会。专家组成员、科技部基础研究司有关同志出席了会议。   “我国重要渔业生物DNA条形码信息采集及其数据库构建”重点项目自2013年6月启动以来,各

版纳植物园在构建木材树种DNA条形码数据库方面获进展

  木材树种是一类与人类息息相关的重要资源植物,对于维持全球生态系统服务功能和生物多样性保护具有重要价值。然而,木材非法活动经常出现在盗砍盗伐、非法加工和出口、虚假申报以规避濒危物种国际贸易公约(CITES)或避税等过程中,因此开发准确、快速的木材树种鉴定工具,对于遏制盗砍盗伐和相关非法贸易、保护生

Dolomite的创新µEncapsulator有利于高通量单个细胞应用

  分析测试百科网讯  2015年12月16日,Dolomite—微流体创新的全球领导者,宣布了突破性的µEncapsulator 1系统,该微流控产品特别设计的来满足研究性生物学家的需求。这种人性化、高通量的系统在高精度、等大小、皮升级液滴中提供简单、明确的包装的单细胞、DNA和/或功能性微珠。 

Ficoll密度梯度离心法分离外周血单个核细胞

测定细胞免疫功能首先要从人或动物外周血或组织中获取有活性的细胞,如淋巴细胞、巨噬细胞、粒细胞等。取得有活性的细胞应根据不同目的,采用不同方法,考虑(1)细胞纯度;(2)细胞获得量;(3)细胞活力;(4)使用方法的简易程度和本室条件等。目前常用Ficoll密度梯度离心法直接分离和纯化外周血单个核细胞。

从全血里纯化单个核细胞(人、大鼠和小鼠)

所需仪器:XL03RH型控温离心机(低速冷冻离心机,可使用24*15ml离心管,水平转子);抽血注射器(大小与抽血体积相一致)试剂:Optiprep;Tricine-缓冲盐溶液(TBS,仅小鼠血)0.85%(质量浓度)NaCl,10mmol/L Tricine-NaOH(ph = 7.4)。 方法:

人骨髓单个核细胞(BM-MNCs)的制备梯度密度离心

                                                                                                          * 仅使用新鲜骨髓。避免冷冻和解冻骨髓细胞,并在无菌条件下进行。1

外周血单个核细胞分离实验的器材和注意事项

  一、试剂与器材  1、聚蔗糖—泛影葡胺分层液,Hank’s液,RPMI-1640培养液,肝素。  2、水平离心机。  二、注意事项  1、在分离外周血单个核细胞过程中,将稀释血液加于分层液上时,要避免冲散分层液面,而要使之形成良好的界面,否则影响分离结果。  2、此法操作得当,单个核细胞得率可达

Ficoll密度梯度离心法分离外周血单个核细胞

测定细胞免疫功能首先要从人或动物外周血或组织中获取有活性的细胞,如淋巴细胞、巨噬细胞、粒细胞等.取得有活性的细胞应根据不同目的,采用不同方法,考虑 (1) 细胞纯度; (2) 细胞获得量; (3) 细胞活力; (4) 使用方法的简易程度和本室条件等.测定细胞免疫功能首先要从人或动物外周血或组织中获取

技术强则药物强单个B细胞抗体制备技术

  如今,单克隆抗体药物以其独特的作用机制及高效性,在肿瘤和自身免疫疾病的治疗中发挥了不可估量的作用,成为全球的研发热点,目前已有2400个单克隆抗体药物处于研发及商业化阶段。   1975年杂交瘤技术问世[1]。1986年鼠源单克隆抗体药物Muromonab的上市拉开了单克隆抗体发展的序幕。

原位进样原理

原位测序技术的原理和应用点击次数:664 发布日期:2022-3-23  来源:苏州阿尔法生物实验器材有限公司原位测序 (ISS) 是一种新方法,通过该方法直接在固定组织或细胞样品的切片中对 mRNA 进行测序。原位测序原理关键是测序信息与其位置之间的联系—在一些情况下,是亚细胞位置。这与传统测序不

钟声教授团队开发高通量蛋白互作检测技术

  通过深入了解基因组产物形成的相互作用网络,人类基因组注释功能得以飞速发展。随着技术的进步,我们已经实现了DNA-DNA、蛋白质 -DNA、RNA-DNA和RNA-RNA相互作用的全基因组映射图谱。但完成人类蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的全基因组映射图谱仍然是一项艰巨任务。  目前,大规模PP

中草药DNA条形码高通量测序一体机HMBI-G30在京发布

  近日,由中国中医科学院中药研究所和华大智造科技有限公司联合开发的中草药DNA条形码高通量基因测序一体机HMBI-G30在北京完成验收评审并发布。HMBI-G30是我国具有完全自主知识产权的全球首创中草药基因测序智能鉴定仪,具有重大的科研和产业价值。  准确鉴定草药基原物种的国际化通用方法,已成为

一种基于CRISPRCas9-的新型诱导谱系示踪技术

  通常情况下,是癌症的转移而非原发病灶导致了癌症患者的死亡。转移不单是由遗传驱动的,这表明其他水平的失调可能也是癌症转移的推手。目前的方法无法同时捕获每个分析细胞的分子表型,这限制了人们对不同转移性克隆的研究。  前瞻性谱系示踪方法,例如慢病毒条形码,它涉及用独特的 DNA 条形码标记细胞。然而,

一种基于CRISPRCas9-的新型诱导谱系示踪技术

  通常情况下,是癌症的转移而非原发病灶导致了癌症患者的死亡。转移不单是由遗传驱动的,这表明其他水平的失调可能也是癌症转移的推手。目前的方法无法同时捕获每个分析细胞的分子表型,这限制了人们对不同转移性克隆的研究。  前瞻性谱系示踪方法,例如慢病毒条形码,它涉及用独特的 DNA 条形码标记细胞。然而,

利用一种新的工具来绘制丰富的细胞和组织功能图谱

  在一项新的研究中,来自美国布罗德研究所的研究人员开发出的一种新的技术让人们对组织中的细胞组成(cellular organization)有了前所未有的了解。这种称为Slide-seq的方法利用基因测序来绘制详细的三维组织图谱,不仅揭示出组织中存在哪些细胞类型,而且还揭示出它们所处的位置和它们正

Cell:新基因条码技术-识别关键癌症免疫基因

西奈山医学研究院的科学家开发了一项可以同时分析数百种基因功能的新技术,分辨率可达单细胞水平。该技术依赖于以一种新蛋白为基础的条形码技术,文章发表在《Cell》杂志。21世纪初,人类基因组计划测序了超过20000个蛋白质编码基因,至今科学家们还没能表征完所有单个基因的许多功能。人类基因组如何工作,如何

基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(四)

 6. 基于CRISPRi的高通量技术快速绘制人类基因的功能图谱2018年7月,Cell刊登了美国加州大学旧金山分校的研究小组的研究成果,开发了一种基于CRISPR的高通量技术快速地绘制人细胞中将近500个基因的功能图谱,其中的许多基因之前从未被详细地研究过。人类目前研究过的基因还不到10%,剩余的

单个电子成像法出现

以色列魏茨曼研究所领导的科学家团队在最新一期《应用物理评论》杂志网站发表论文,展示了一种对单个电子成像的新方法。该方法目前仍处于初始阶段,未来有望为各种不同的分子拍摄“特写”,这可能彻底改变新药研发和量子材料的表征。 几十年来,尽管磁共振成像(MRI)技术在诊断大量疾病方面发挥了重要作用,但仍有

技术强则药物强—单个B细胞抗体制备技术(一)

如今,单克隆抗体药物以其独特的作用机制及高效性,在肿瘤和自身免疫疾病的治疗中发挥了不可估量的作用,成为全球的研发热点,目前已有2400个单克隆抗体药物处于研发及商业化阶段。 1975年杂交瘤技术问世[1]。1986年鼠源单克隆抗体药物Muromonab的上市拉开了单克隆抗体发展的序幕。随后的50年,

脾脏、胸腺和淋巴结中单个核细胞分离和培养

基本方案从小鼠脾脏、胸腺和淋巴结制备单个核细胞分离和培养。实验材料RPMI-5或DMEM-5完全培养基。2.新鲜分离的小鼠器官:≤6周龄的小鼠胸腺;6周至6个月龄的小鼠脾脏和淋巴结。3.60mm×15mm培养皿。4.剪刀和镊子(保存在70%乙醇的烧杯中)。5.装有19G针头的6ml注射器。6.200

利用Ficoll密度梯度离心法分离外周血单个核细胞

实验概要本实验用Ficoll密度梯度离心法直接分离和纯化了外周血单个核细胞。实验原理常用来分离人外周血单个核细胞(PBMC)的分层液比重是  1.077±0.001  的聚蔗糖(Ficoll)-泛影葡胺(Urografin)(F/H)分层液。Ficoll是蔗糖的多聚体,呈中性,犌W水性高,平均分子量

技术强则药物强—单个B细胞抗体制备技术(二)

3)微雕刻和ISAAC方法分选B细胞微雕刻技术原理[7]是基于软光刻微阵列芯片识别、克隆抗原特异性B细胞的方法。通过刺激多克隆B细胞,并将其逐个分布到芯片孔内进行培养产生抗体,然后将改芯片孔内抗体转印至相应的蛋白芯片,通过与目标抗原反应后,再与荧光抗体反应,最后根据荧光抗体染色结果,通过显微操作将分

Science十大科学突破之单细胞水平细胞谱系追踪

  理解任何多细胞生命系统的前提是理解“细胞”,今天,单细胞研究已经不再只是纸上谈兵了,全球已经有许多实验室展开了单细胞研究。  生物通报道:12月21日Science杂志公布了2018年度十大科学突破。今年的Science十大科学突破之首是单细胞水平细胞谱系追踪技术,除此之外,今年的十大科学突破中

基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(下)

  上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。   一、大规模基因功能的筛选   尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基因型-表型关系仍