利用一种新的工具来绘制丰富的细胞和组织功能图谱

在一项新的研究中,来自美国布罗德研究所的研究人员开发出的一种新的技术让人们对组织中的细胞组成(cellular organization)有了前所未有的了解。这种称为Slide-seq的方法利用基因测序来绘制详细的三维组织图谱,不仅揭示出组织中存在哪些细胞类型,而且还揭示出它们所处的位置和它们正在做什么。Slide-seq方法是在布罗德研究所研究员Evan Macosko和Fei Chen的实验室中开发出来的。相关研究结果发表在2019年3月29日的Science期刊上,论文标题为“Slide-seq: A scalable technology for measuring genome-wide expression at high spatial resolution”。图片来自Science, 2019, doi:10.1126/science.aaw1219。 鉴于这种技术并不需要专门的成像设备,因此它可被生物学、......阅读全文

全球首个奶牛多组织单细胞表达图谱诞生

中国农业大学动物科学技术学院教授孙东晓团队构建了覆盖奶牛59种组织、179万个细胞的多组织单细胞表达图谱,为解析牛重要性状遗传调控机制、推进精准育种及探索人类疾病的牛模型研究提供了重要资源。9月5日,相关研究成果发表于《自然-遗传》。作为人类最早驯化的家畜之一,奶牛在全球粮食安全与农业生态系统中占据

农科院生物所研究团队绘制水稻根组织单细胞图谱

  近日,中国农业科学院生物技术研究所谷晓峰团队和合作者绘制了单子叶模式植物水稻首个根组织单细胞分辨率转录组图谱,为研究植物细胞类型特化、功能和进化提供了新的途径。相关结果发表在国际学术期刊《分子植物(Molecular Plant)》上。  在植物整个生命过程中,根尖在不断地分化发育,形成的根系从

《自然》发布重要单细胞RNA图谱:首张小肠细胞图谱

  我们肠道上皮是人体内多样性最高,最具活力的组织之一, 作为机体与外界的主要界面之一,组成了一个细胞的生态系统。为了更好地理解这些复杂的组织及其功能,还有影响它的疾病,麻省理工学院、哈佛大学和麻省总医院研究人员领导的一个研究团队通过分析从小鼠肠道或肠道类器官中取样的5.3万多个单独的细胞,完成了一

利用一种新的工具来绘制丰富的细胞和组织功能图谱

  在一项新的研究中,来自美国布罗德研究所的研究人员开发出的一种新的技术让人们对组织中的细胞组成(cellular organization)有了前所未有的了解。这种称为Slide-seq的方法利用基因测序来绘制详细的三维组织图谱,不仅揭示出组织中存在哪些细胞类型,而且还揭示出它们所处的位置和它们正

Nature-|-首次系统性揭示非癌肝组织中的体细胞突变图谱

  由于生物基因组功能性区域的稀疏性、密码子编码的简并性和生物体自身表型的稳健性等因素,发生在体细胞中的基因突变在绝大多数情形下往往不具有对生物体表型产生显著影响的效应【1】。然而,发生在一些关键基因中的突变则具有起始肿瘤的强大驱动力,它们通过各种复杂机制赋予突变型细胞以进化优势(evolution

人体细胞图谱问世

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505110.shtm

肠道细胞综合图谱面世

  肠道是人体重要的消化器官,肠道由不同的解剖区域组成,这些区域发育速度不同,在消化、营养吸收、代谢和免疫调节中也发挥着不同的作用。正确认识肠道细胞的分化过程对于肠道疾病的研究至关重要。  近期,英国桑格研究所的研究团队发布了人体肠道细胞综合图谱。相关研究在《Nature》发表,题为:Cells o

科研人员绘制肝癌组织乳酰化修饰图谱

  乳酸 (lactate) 是哺乳动物糖酵解代谢中的主要产物,在肿瘤、败血症、自身免疫性疾病等病理状态下显著增多。其生物学功能因肿瘤细胞中存在的“瓦伯格效应(Warburg effect)”而得到广泛关注。2019年,芝加哥大学Yingming Zhao教授团队发现哺乳动物细胞内的乳酸可驱动形成一

组织细胞是什么-组织细胞介绍

  1、组织细胞(histiocyte)又称吞噬细胞(phagocyte)。来自血液中的单核细胞,可见于痰液、浆膜腔积液及宫颈涂片等标本中。  2、具有吞噬功能,细胞大小很不一致,一般略大于中性粒细胞。形态为圆形、卵圆形或各种不规则形。核呈圆形、卵圆形、长形或肾形,直径5~7μm。核内染色质颗粒少而

《细胞》:单细胞测序助力基因重组图谱

  来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了来自一个成人男子91个

Science绘制细胞药物反应图谱

  为什么对于同一种药物人们会有不同的反应?研究人员第一次解开了与药物反应相关的遗传和环境因素,使得我们朝着预测出药物将会对我们造成的影响又近了一步。   来自英属哥伦比亚大学的研究人员将6,000种酵母菌株暴露于3,000种药物之中。他们对酵母菌株进行了改造使得能够测量这些酵母的反应。研究人员发

首个肺癌全息细胞图谱问世

  肺癌是发病率和死亡率增长最快、对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一。近年来,肺癌患者有更加年轻化的趋势,治愈较为困难。虽然目前科学家在肺癌治疗方面已取得了巨大进展,但对其细胞层面上的科学认识仍难尽如人意。近日,著名学术期刊《自然—医学》推出史上最完整的肺癌细胞图谱,这将是科学家们在细胞层面深入

首个果蝇细胞衰老图谱公布

  了解身体如何衰老是一个重要的研究领域。美国贝勒医学院、斯坦福大学等机构研究人员在《科学》杂志上发表了首个果蝇细胞衰老图谱(AFCA),详细描述了果蝇中163种不同细胞类型的衰老过程。  分析表明,体内不同细胞的年龄不同,每种细胞类型的衰老过程都遵循特定的模式。AFCA为衰老研究提供了宝贵的资源,

迄今为止最全面的人类肾脏组织图谱

  在一项新的研究中,来自美国华盛顿大学、密歇根大学、加州大学圣地亚哥分校、印第安纳大学医学院和肾脏精准医疗项目(Kidney Precision Medicine Project, KPMP)联盟的研究人员在了解和治疗肾脏疾病方面取得了重大突破,绘制出最全面的人类肾脏组织图谱。来自这种肾脏组织图谱

PNAS:单细胞测序绘制大脑的细胞图谱

  斯坦福大学的著名学者Stephen Quake及其同事本周在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表文章,介绍了人类脑细胞的单细胞转录组测序研究成果。  研究小组对近500个成人或胎儿脑细胞进行了单细胞RNA测序。利用这种方法,他们能够鉴定出大脑中所有主要的细胞类型,并确定神经元的亚型。他们还观察了

组织细胞包括什么细胞?

  构成机体的细胞均可以称之为组织细胞。如表皮细胞、肝脏细胞。朗格汉斯细胞组织细胞增生症(LCH)是原因未明的单克隆CD1a组织细胞增生性疾病。临床特点是:发热,皮疹,齿龈肿胀,咳嗽,喘憋,肝脾淋巴结肿大,或伴有贫血,有的病变侵犯到中枢神经系统,胃肠道系统引起各种症状。

首个千万级免疫细胞图谱发布

免疫细胞是人体免疫系统不可或缺的重要组成部分,在发育、器官形成、疾病发生发展等方面发挥着关键作用。然而,由于技术和成本的限制,长期以来科学家们虽然知道免疫细胞种类繁多,却难以看清每个细胞的具体特征和它们之间的调控关系。北京时间1月9日,由中国科学家组成的研究团队,在《科学》杂志上发布首个了千万级高分

多学科交互,深度绘制细胞图谱

  大多数人类疾病实质上是细胞故障的产物。但要了解细胞的哪些部分出错会导致疾病,科学家首先需要对细胞有完整的了解。美国加州大学圣地亚哥分校医学院的研究人员及其合作者在24日发表于《自然》杂志上的论文中,介绍了尺度集成细胞(MuSIC)技术,这是一种结合了显微镜、生物化学和人工智能的技术,揭示了以前未

脑脊液细胞学分类及图谱

1.免疫活性细胞:均由淋巴细胞(图1)衍生而来,包括小淋巴细胞:为正常人脑脊液中的主要细胞,无特殊的病理意义,占细胞总数75%。①转化型淋巴细胞(图2)和淋巴样细胞:提示局部的体液或细胞介导的免疫反应。临床意义:提示病毒性脑炎、结核性脑膜炎、脑脓肿、多发性硬化等。②浆细胞(图3):亦名抗体细胞,它

樊嘉院士团队等绘制肝癌组织乳酰化修饰图谱

  乳酸(lactate)是哺乳动物糖酵解代谢中的主要产物,在肿瘤、败血症、自身免疫性疾病等病理状态下显著增多,其生物学功能因肿瘤细胞中存在的“瓦伯格效应”(Warburg effect)而得到关注。2019年,美国芝加哥大学教授Yingming Zhao团队发现哺乳动物细胞内的乳酸可驱动形成新型组

科学家绘制正常组织DNA甲基化单体图谱

中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员石建涛,联合上海交通大学医学院附属瑞金医院教授方海,在《基因组研究》(Genome Research)上,在线发表了题为A DNA methylation haplotype block landscape in human tissues and preim

单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就

  今天,《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果,研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法,完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱,揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况,鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系,为肺

单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就

  今天,《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果,研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法,完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱,揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况,鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系,为肺

单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就

  今天,《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果,研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法,完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱,揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况,鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系,为肺

泛癌症T细胞单细胞图谱-相关成果发表

  北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)张泽民课题组联合北京大学肿瘤医院季加孚、步召德课题组以及北京大学第三医院,在国际期刊Science上发表了题为“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-

迄今最大最全人肺细胞图谱公布

  迄今最大、最全面的人类肺细胞图谱8日发表在《自然·医学》杂志上。通过结合近40项研究的数据,一个国际研究团队创建了第一个完整的肺单细胞图谱,揭示了肺部细胞类型的丰富多样性,其突出了健康与患病肺部的关键细胞差异,将成为肺部研究人员的宝贵资源。  研究发现了肺纤维化、癌症和新冠肺炎之间的共同细胞状态

Nature:人类细胞图谱研究先锋Aviv-Regev

  Aviv Regev是一位生物分析专家。现在,她正致力于绘制人体的每一个细胞。  计算生物学家Aviv Regev喜欢做一些看似不可能完成的任务。2011年,她与分子遗传学家Joshua Levin合作,测试了RNA测序的几种方法。科学家们在测试几种技术的极限,以查看哪种方法表现最佳。他们用降解

迄今最全人脑细胞图谱发布

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510144.shtm 科技日报北京10月12日电 (记者张佳欣)12日,同时发表在《科学》《科学进展》和《科学·转化医学》杂志上的21项研究,公布并详细解释了迄今为止最全面的人类脑细胞图谱。这些研究

迄今最大正常乳腺细胞图谱绘成

  美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心、加州大学尔湾分校和贝勒医学院的研究人员,历时7年,绘制出了迄今最大、最全面的正常乳腺细胞的图谱,为乳腺生物学提供了前所未有的见解,有助确定乳腺癌等疾病的治疗靶点。相关报告发表于28日出版的《自然》杂志。  人体包含大约200种不同类型的细胞,其中12种存在于正

Nature重磅成果:人类心脏细胞的图谱

砰……砰……砰”尽管大多数时候我们几乎没有注意到它,但是我们体内稳定的心跳声其实是一种复杂的机理表现,就像是乐团一样,成千上万的细胞必须掌握各自的演奏节奏,并共同努力。近,一组科学家创建了人类心脏细胞的个图谱,这些图集展示了将近50万个心脏细胞,确定了每种细胞在心脏交响乐中的作用!研究人员检查了14