加拿大开发出DNA条形码融合技术实验效率可提高10倍
据最新一期《分子系统生物学》报道,加拿大研究人员开发出一种新技术,可将DNA(脱氧核糖核酸)条形码拼接在单个细胞内,以同时搜索数以百万计蛋白质对之间的相互作用。 近年来,DNA条形码技术使科学家开展高并行试验(许多不同类型的细胞在同一试管内进行试验)成为可能,而新一代DNA测序技术的发展,进一步提高了对条形码计数和读取结果的效率。 然而,可在同一试管内进行的试验次数,却受限于编码的细胞类型数量。一直以来,DNA条形码都是一维的,也就是一个条形码只能做一次试验。允许条形码在细胞内融合在一起,意味着科学家们现在可以打破这一障碍。新技术可显著提高在单一试管内进行的实验次数,在同等成本条件下能将效率提高10倍。 在广泛使用的酵母双杂交(Y2H)方法中,携带一个“诱饵”蛋白的酵母细胞与携带一个“猎物”蛋白的酵母细胞配对。对Y2H系统进行操纵后,只有“诱饵”与“猎物”蛋白黏在一起的细胞才能存活,从而使科学家可以观察到哪些蛋白间互相......阅读全文
细胞化学词汇DNA噬菌体
中文名称:DNA噬菌体英文名称:DNA phage定 义:能感染细菌并在细菌内复制自身的DNA病毒。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
植物细胞线粒体DNA的提取
实验方法原理 分离线粒体DNA和叶绿体DNA的原理是基本一致的。本方法首先是分离完整的细胞器,然后从细胞器中提取DNA。要获得高纯度的细胞器DNA,关键是要把所要的细胞器与其他亚细胞结构分离开来,这可以通过差速离心或梯度离心来完成。完整的细胞器经裂解后,可以通过CsCl离心或酚-氯仿抽提获得DNA。
DNA-ladder法检测细胞凋亡
发生细胞凋亡时,内源性核酸酶被激活,染色体DNA链在核小体之间被切割,形成180~200个碱基或其整数倍的DNA片段,将这些DNA片段抽提出来进行电泳,可得到DNA梯状条带(DNA ladder)。一、材料与试剂凋亡细胞;蛋白酶K(500μg/ml)8mol/L 醋酸钾白细胞裂解液:pH8.0,10
细胞化学基础B-型-DNA
中文名称:B 型 DNA英文名称:B-form DNA定 义:一种右手双螺旋构型的DNA。螺旋每一圈为11个核苷酸,核苷酸对的平面与双螺旋轴倾斜20°角。应用学科:细胞生物学(一级学科),细胞化学(二级学科)
10x-Genomics独创短读序列技术-两年收入增涨20倍
近日,基因检测初创公司10x Genomics又筹集了3500万美元。本次融资是该公司D轮融资的延续,10x Genomics将用这笔资金继续推进研发工作和扩大产品营销。 在2018年4月,10x Genomics就已筹集了5000万美元的D轮融资,由Meritech Capital领投,Fi
单细胞RNA性能分析新方法
人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成,每个细胞都有其独特的分子“指纹”,即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学(LMU)分子生物学家Wolfgang Enard教
单细胞RNA性能分析新方法
人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成,每个细胞都有其独特的分子“指纹”,即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学(LMU)分子生物学家Wolfgang Enard教
基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(五)
二、DNA标记与细胞谱系示踪发育生物学的重点包括构成器官或生物体的细胞类型的多样性以及这些细胞的发育谱系历史。这些方面通常作为一个方向被单独研究,但最近的四篇新论文报道了一种将单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术与基于CRISPR的谱系示踪技术相结合来同时解剖转录组细胞表型和谱系历史的方法。近
细胞系的多位点DNA指纹检测——细胞系-Southern-印迹-DNA-制备
实验方法原理细胞中提取的 DNA 经限制性酶消化,利用 Southern 印迹技术将消化产物固定在尼龙膜上 [ Ausubel et al.,1996,2002 ],与来自 M 13 噬菌体的标记 DNA 进行杂交。实验材料D-PBSHinfI酶及其缓冲液琼脂糖凝胶5×TBE储存液EDTA二钠盐6×
原位质谱分析方法实现对单个神经细胞活体的实时研究
中国科学技术大学黄光明、熊伟教授联合研究团队近日在神经细胞研究中取得重要进展,他们使用自行开发的检测平台,对小鼠大脑的单个神经元细胞开展了多种化学成分的快速分子监测,并且可以做到同步采集电生理信号,从而完成对神经元功能、代谢物组成及其代谢通路的研究。 脑神经细胞种类繁多,不同细胞的化学分子组成
测量单个细胞染色质可接近性,从而揭示胚胎发育路径
在一项新的研究中,美国华盛顿大学和位于德国海德堡市的欧洲分子生物学实验室的研究人员证实细胞类型和发育阶段能够从数千个单细胞的染色质可接近性(chromatin accessibility, 也译作染色质开放性)测量中推导出来。他们利用这种方法发现正在发育的胚胎中的细胞如何调节它们的身份,从而决定
利用SCICPMS-法测定单个细菌细胞中的铁含量
优势:ICP-MS 法可以分析成批培养的细菌细胞中的总金属含量,然后根据测得的细胞总数平均算出单个细菌细胞的铁含量。由于平板计数法无法计算死亡细胞或未被培养的完整细胞,导致计数出现误差。然而,由于仪器的限制,目前还未见有方法可直接分析单个细菌细胞中的铁含量。基于单细胞ICP-MS (SC-ICP-M
利用SCICPMS-法测定单个细菌细胞中的铁含量
优势ICP-MS 法可以分析成批培养的细菌细胞中的总金属含量,然后根据测得的细胞总数平均算出单个细菌细胞的铁含量。由于平板计数法无法计算死亡细胞或未被培养的完整细胞,导致计数出现误差。然而,由于仪器的限制,目前还未见有方法可直接分析单个细菌细胞中的铁含量。基于单细胞ICP-MS (SC-ICP-MS
提升声学报告基因灵敏度,可深入观察研究单个细胞
加州理工学院研究人员在《自然·方法》上发表研究介绍,其研制的声学报告基因(acoustic reporter genes)灵敏度提升,能够对单个细胞进行成像研究。 报告基因是一段特殊的DNA片段,通常编码荧光蛋白,可插入基因组内用于检测特定基因表达情况。比如,将报告基因插在神经元发育基因旁边,
哈佛尹鹏组开发组织中多蛋白同时成像的新技术
为了更好地理解组织和器官是如何发育、功能衰竭以及随着时间的推移而再生的,研究人员想要在三维空间中可视化它们的组成细胞的分子库。"人类生物分子图谱计划"、"人类细胞图谱计划"和几个大脑图谱计划等雄心勃勃的计划正在进行中,这些计划旨在绘制出许多蛋白质(基因表达的产物)在人体器官和组织中单细胞水平上的
大大简化药物发现过程的新方法
最近在《Nature Biotechnology》发表的一篇论文,来自麻省理工学院-哈佛大学布罗德研究所和Dana-Farber癌症研究所的研究人员描述了一种新的方法,大大简化了早期药物发现中一个费力的实验过程。他们的方法称为PRISM,采用一种分子条形码系统,以前所未有的规模和速度,在癌症和其
商业条形码检测仪常用款型
CCD扫描器,激光手持式扫描器和全角度激光扫描器二种。 一、HHP QC条形码检测仪是利用光电藕合(HHP)原理,对条形码印刷图案进行成像,然后再译码。它的优势是:无转轴,马达,使用寿命长;价格便宜。HHP因战略原因,从2012年停产全线所有检测仪相关产品,专注于条码扫描枪的业务。 选择C
条形码8字开头是转基因食品?
近日,一篇“8开头的条形码是转基因食品”的帖子又在网上流转开来。信息时报记者多方求证了解到,该说法并不准确,条形码开头数字代表的是区域而非产品,而目前国内对于商品条形码并没有强制标准。此外,转基因食品必须在外包装文字说明,消费者通过外包装便可以辨别商品是否转基因。 “8”字开头不特指产品只代
我国最大热带雨林永久样地将开展树木条形码合作研究
准确的物种鉴定是人类认知自然和可持续发展的必要前提。基于形态学特征鉴定物种难以满足科学发展的巨大需求,DNA条形码提供了可信息化的分类学标准和有效的分类学手段,成为进展最迅速的学科前沿之一。鉴于目前对热带雨林树种条形码研究的共同需求,来自中国科学院西双版纳热带植物园的5个不同研究组
病毒-DNA-的提取实验——培养细胞中病毒-DNA-的提取
实验材料细胞试剂、试剂盒裂解液TE 缓冲液仪器、耗材培养瓶EP管真空泵实验步骤1. 贴壁培养细胞倾去培养液,加 PBS 洗 2次,加胰蛋白酶消化 (37℃, 5~10 min)后移入Ep管中,2000 r/min 离心 10 min, 弃上清液,用 PBS 悬浮细胞,离心洗涤 2~3次,用 PBS
Science里程碑!哈佛大牛有望还原生物所有细胞的发育过程
每个多细胞生命的诞生之初,都是一个单细胞。这个细胞会一变二,二变四,四变八,最终变成一个天文数字。据估计,新生儿体内约有260亿个细胞,这一数字在成年后还会继续增加。 从1到260亿,生命的发育过程让人叹为观止。这些细胞是怎么形成的?哪些细胞在先?哪些细胞在后?人们顺理成章地提出了疑问。但由于
我国将对最大热带雨林永久样地开展树木条形码合作研究
准确的物种鉴定是人类认知自然和可持续发展的必要前提。由于形态学特征鉴定物种难以满足科学发展的巨大需求,DNA条形码提供了可信息化的分类学标准和有效的分类学手段,成为进展最迅速的学科前沿之一。 针对热带雨林树种条形码研究的共同需求,近日,来自中国科学院西双版纳热带植物园5个不同研究组的科技人员在
光合作用始于单个光子
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503105.shtm
ald-工艺-怎么保证-单个原子沉积
原子层沉积(Atomic layer deposition)是一种可以将物质以单原子膜形式一层一层的镀在基底表面的方法。原子层沉积与普通的化学沉积有相似之处。但在原子层沉积过程中,新一层原子膜的化学反应是直接与之前一层相关联的,这种方式使每次反应只沉积一层原子。单原子层沉积(atomic layer
Science最新综述-|-空间组学技术概览与展望,详解技术原理与优势
导读 几乎所有看似无限复杂的生物学都发生在三维空间中。在生物体内,细胞必须在三维组织中相互作用和组合,每个细胞的位置与其固有性质一样重要,决定着组织的功能或疾病的功能障碍。因此,即使在研究简单生物体或单个组织的结构时,不仅需要破译成千上万个细胞的分子谱,还需要了解空间环境如何以及造成怎样的影响
外周血和脐带血中分离单个核细胞—FicollHypaque梯度离心法
外周血单个核细胞可应用于: (1)免疫学(包括自身免疫性疾病),传染病,血液系统恶性肿瘤,疫苗开发,移植免疫学研究; (2)预测药物和异生素免疫抑制作用; (3)高通量筛选本实验来自「精编免疫学实验指南」作者:J.E.科利根等,译者:曹雪涛等,实验方法原理FicoH-Hypaque(又称淋巴细胞分层
细胞化学基础卫星DNA的用途
体细胞克隆卫星DNA可以把某一个体的遗传物质完整地传递下去,因而它对于保存并传播优良个体和珍稀濒危动物的基因组具有重大意义。确定异种重构胚的核是否来自于供体的核就显得异常关键。中国科学院昆明动物研究所丁波、张亚平等人建立了一种从早期囊胚中提取DNA以进行核内和核外DNA分析的方法。用这种方法从异种克
细胞化学词汇DNA突变子
一个顺反子内任何一突变位点,发生变化产生突变表型,即一个基因内产生突变表型的最小单位。
细胞化学词汇DNA限制性
中文名称:DNA限制性英文名称:DNA restriction定 义:宿主菌利用其本身具有的限制-修饰系统对进入细胞内的外源DNA的一种控制作用,即宿主菌产生的限制性酶(有三类)可以对未与载体重组的外源DNA进行切割,使其不能在细胞内进行繁殖。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因