Science最新综述|空间组学技术概览与展望，详解技术原理与优势
导读 几乎所有看似无限复杂的生物学都发生在三维空间中。在生物体内，细胞必须在三维组织中相互作用和组合，每个细胞的位置与其固有性质一样重要，决定着组织的功能或疾病的功能障碍。因此，即使在研究简单生物体或单个组织的结构时，不仅需要破译成千上万个细胞的分子谱，还需要了解空间环境如何以及造成怎样的影响。近年来，随着多重空间分子检测技术的创新爆发，生物学研究开辟了新的篇章，使人们能够进一步了解生命系统的复杂性。 空间组学是继单细胞测序技术之后的又一个生物技术研究热点，其能够弥补单细胞测序技术无法获取细胞空间分布信息的缺陷。空间组学技术主要研究细胞在组织样品中的相对位置关系，用于揭示细胞空间分布关系对疾病的影响，主要检测蛋白质及其修饰或mRNA。虽然空间组学技术存在成本高、耗时长等局限，但目前这一新兴技术已为多个领域提供了大量新见解，包括动物发育和大脑结构以及与患者预后相关的肿瘤微环境（TME）的特征。 近日，英国癌症研究中心（C......阅读全文
空间转录组学研究案例简析
01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1]影响因子：11.878发表时间：2018.06发表期刊：Nat Commun肿瘤内异质性是当今癌症治疗中最大的挑战之一。在这里，研究人员使用空间转录组学（ST）技术研究整个多灶性前列腺癌的全组织基因表达异质性。利用一种新的去卷积方法，分析12个区域的近6
空间组学新技术破解肿瘤细胞早期空间侵袭模式
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516182.shtm近日，上海交通大学医学院分子医学研究院杨朝勇团队和附属仁济医院泌尿科郑军华团队开发了一种空间转录组学测序新技术Decoder-seq，并运用该技术探究了早期肾细胞癌（RCC）两种亚型肿
流式细胞术在血液学中的应用
DNA倍体分析及细胞周期分析 在细胞周期内,DNA含量随细胞内时相发生周期性变化,正常情况下,大多数细胞处于休止期(Go), G1期细胞虽有DNA合成，但DNA含量仍为2N，为二倍体细胞,；处于活跃的DNA合成期(S期)的细胞DNA含量为2N-4N；正经历细胞分裂(G2/M期)的细胞
流式细胞术在免疫学中的应用
流式细胞术（Flow Cytometry，FCM）是二十世纪70年代发展起来的，是一项集激光技术、电子物理技术、光电测量技术、计算机技术以及细胞荧光化学技术、单克隆抗体技术为一体的新型技术，能够对处在快速直线流动状态中的细胞或微球进行多参数的、快速的定量分析和分选，且能保持细胞及细胞器或微粒
流式细胞术
一. 流式细胞术概述流式细胞术(Flow Cytometry, FCM)是七十年代发展起来的高科学技术,它集计算机技术、激光技术、流体力学、细胞化学、细胞免疫学于一体, 同时具有分析和分选细胞功能。它不仅可测量细胞大小、内部颗粒的性状,还可检测细胞表面和细胞浆抗原、细胞内DNA、RNA含量等,可对
前沿：空间转录组学研究案例简析
上一期，我们介绍了空间转录组测序产品，对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品，用起来到底好不好使呢？我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。 01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1] 影响因子：11.878 发表时间：2018.06 发表期刊：Nat
前沿：空间转录组学研究案例简析
上一期，我们介绍了空间转录组测序产品，对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品，用起来到底好不好使呢？我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。 01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1] 影响因子：11.878 发表时间：2018.06 发表期刊：Nat C
2018年新技术：空间转录组学技术
——也许不久的将来，定位组织中的基因表达就会成为一种常规技术了。 对于基因表达研究来说，空间一直都是具有挑战性的前沿研究领域。但是随着越来越多的研究人员获得了技术进展，这已经不再是令人望而生畏的领域了。这些方法的多样性和创造性使其成为一个值得关注的技术方向。 空间基因表达对于理解组织中细胞的
AFADESI空间代谢组学高级研修班
为做好AFADESI空间代谢组学技术服务工作，由中国科学院高能物理研究所测试中心和中国科学院-香港大学金属组学与健康和环境联合实验室共同承办的“AFADESI空间代谢组学高级研修班”将于2023年4月26日-4月27日在京召开。在这里，我们将竭诚为您提供丰富的前沿应用信息和与专家零距离交流的平台
流式细胞术在血液学中的应用（七）
细胞凋亡研究细胞凋亡是细胞在基因控制下的有序死亡，在疾病发生、发展中有重要作用，因而研究细胞凋亡有重要意义。细胞凋亡检测方法很多，应用流式细胞仪技术可根据细胞在凋亡过程中发生一系列形态、生化变化从多个角度对细胞凋亡进行定性和定量的测定。 细胞形态变化：通过流式细胞仪测定细胞光散射的变化来观察细胞凋亡
流式细胞术在血液学中的应用（三）
4．杂合型白血病 真正的双系列表型白血病是伴有t(9;22)或有11q23 MLL（myeloid/lymphoid or mixed lineage leukemia髓/淋系或混合性白血病）基因重排的病人，以往报道的许多杂合型白血病多是由于方法学问题不能排除非白血病细胞的干扰，或将非特异弱表达
关于流式细胞术在肿瘤学应用的内容介绍
这是FCM在临床医学中应用最早的一个领域。首先需要把实体瘤组织解聚、分散制备成单细胞悬液，用荧光染料(碘化吡啶PI)染色后对细胞的DNA含量进行分析，将不易区分的群体细胞分成三个亚群(G1期，S期和G2期)，DNA含量直接代表细胞的倍体状态，非倍体细胞与肿瘤恶性程度有关。 (1)发现癌前病变，
流式细胞术在血液学中的应用（一）
DNA倍体分析及细胞周期分析 在细胞周期内,DNA含量随细胞内时相发生周期性变化,正常情况下,大多数细胞处于休止期(Go), G1期细胞虽有DNA合成，但DNA含量仍为2N，为二倍体细胞,;处于活跃的DNA合成期(S期)的细胞DNA含量为2N-4N;正经历细胞分裂(G2/M期)的细胞含有最
流式细胞术在血液学中的应用（八）
细胞分选流式细胞仪能够分选某一亚群细胞,分选纯度＞95%。目前细胞分选主要用于研究，临床应用较少。血液学应用最多的是造血干细胞的研究，最近随着造血理论的深入研究关于造血干细胞究竟是否都是CD34+细胞出现一些争论,实验研究证明, CD34-造血干细胞较CD34+造血干细胞更具造血潜能,这些实验研究所
流式细胞术在血液学中的应用（四）
淋巴瘤免疫分型 目前淋巴瘤的分类方法已从LSG的形态学分类逐渐转变为REAL分类法, REAL分类法是以肿瘤发生源为基础的分类方法,在原来的形态学基础上加上免疫学分型后再加以分类,这种分类方法不仅能够推断肿瘤的发生源,对治疗也有指导意义。因此淋巴瘤的免疫分型越来越重要。如同白血病免疫分型一样，淋巴瘤
流式细胞术在血液学中的应用（五）
红细胞疾病诊断 （一）网织红细胞测定 计数外周血中网织红细胞数量,对于评价骨髓红系造血及网织红细胞从骨髓到外周血的转送速率有重要意义。有核红细胞在成熟过程中,脱去细胞核后仍有少量RNA残留在细胞浆内,再经过约一天时间残留RNA完全消失,成为成熟红细胞。这种细胞浆内有残留RNA的红细胞称作网织
流式细胞术在血液学中的应用（一）
一、流式细胞术在基础血液学中的应用（一）血细胞的计数和分类研究 1．红细胞的计数、分类及其功能的研究 （1）循环的红细胞总量的测定： 生物素—逆转抗生物素蛋白—FITC系统的特异性和流式细胞 仪（FCM）的敏感性结合起来，建立了FCM测定人红细胞总量的方法，此方法具有标本用量少，无
流式细胞术在血液学中的应用（二）
二、 流式细胞术在血液病学中应用（一）白血病的分类研究 B-cell ALL 1.TdT positive. 2.CD10 positive, except for progenitor B-cell ALL. 3.HLA-DR positive. 4
流式细胞术在血液学中的应用（六）
白细胞吞噬功能测定粒、单核-巨噬细胞是机体免疫反应和免疫调节细胞中的重要成员。它们不仅具有吞噬功能,吞噬外来的微生物、肿瘤细胞等,同时又分泌多种生物因子参于免疫反应,此外单核-巨噬细胞对抗原物质的摄取、修饰、递呈等作用,是淋巴细胞的免疫功能必不可少的。因此检测白细胞吞噬功能对了解机体免疫状况有重要意
流式细胞术在血液学中的应用（二）
白血病免疫分型其临床意义 目前公认的系列特异性指标是:T淋巴细胞系--胞浆CD3（cCD3）,B淋巴细胞系-- cCD22或cCD79，髓系---MPO 或cCD13,一般可先用他们区分细胞系列后再进一步分析某一系列亚型和分化阶段。1. ALL的免疫学分型1986年前分为普通型ALL（cALL）、未
流式细胞术介绍
流式细胞术（flowcytometry，FCM）是一种综合应用光学、机械学、流体力学、电子计算机、细胞生物学、分子免疫学等学科技术，使被测溶液流经测量区域，并逐一检测其中每一个细胞的物理和化学特性，从而对高速流动的细胞或亚细胞进行快速定量测定和分析的方法。 首先，待测细胞经处理或染色后被压人流
流式细胞术简介
流式细胞术是一种细胞分析技术，它在20世纪50年代首次被用于测量细胞体积，可在细胞随快速流动的流体直线通过观察孔时进行检测。从那时起，许多工程师和研究人员不断创新，最终带来了现代流式细胞仪。在流式细胞仪中，溶液中的细胞以每秒10,000个细胞（或更多）的速度通过仪器的激光束，进而对细胞进行检测。如今
流式细胞术原理
流式细胞术公开课会形成鞘液流（鞘液是为了保证细胞在中间形成单个排列的细胞流，因为要保证激光覆盖整个样本中心流）在外周，样本流在中央的层流状态，使得样本仅在轴心激光照射到样本流上，激光60um宽，20um高（宽高有限，只有样本流刚好在中间才能保证激光能覆盖样本流细胞）样本流中的细胞表面的荧光抗体受到激
流式细胞术原理
流式细胞术是一种细胞分析技术。流式细胞术工作原理是在细胞分子水平上通过单克隆抗体对单个细胞或其他生物粒子进行多参数、快速的定量分析。它可以高速分析上万个细胞，并能同时从一个细胞中测得多个参数，具有速度快、精度高、准确性好的优点，是当代最先进的细胞定量分析技术之一。流式细胞术是一种用于细胞计数、细胞分
流式细胞术原理
FSC通道FSC，即前向角散射，它的值代表细胞的 大小 。所以可以利用细胞的FSC值初步比较细胞的大小，利用FSC值对细胞进行分群和分类。SSC通道SSC，即侧向角散射，它的值代表 细胞的颗粒度 （granularity）。细胞越不规则，细胞表面的突起越多，细胞内能够引起激光散射的细胞器或者颗粒性物
读懂流式细胞术
流式细胞术，顾名思义，是研究细胞的一种技术，但是它的研究对象绝对不仅仅局限于真核细胞，还可以研究细菌、病毒以及各种蛋白等等。无论你是基础科研工作者还是临床医生，你都用得上这项技术。自1974年BD公司和斯坦福大学联合研制出世界上第一台商用流式细胞仪以来，作为集N个学科的智慧于一身，将计算机技术、电子
流式细胞术简介
一、流式细胞术发展简史 流式细胞术（Flow Cytometry, FCM）是一种可以对细胞或亚细胞结构进行快速测量的新型分析技术和分选技术。其特点是：①测量速度快，最快可在1秒种内计测数万个细胞；②可进行多参数测量，可以对同一个细胞做有关物理、化学特性的多参数测量，并具有明显的统计学意义；③是一
流式细胞术原理
FSC通道FSC，即前向角散射，它的值代表细胞的 大小 。所以可以利用细胞的FSC值初步比较细胞的大小，利用FSC值对细胞进行分群和分类。SSC通道SSC，即侧向角散射，它的值代表 细胞的颗粒度 （granularity）。细胞越不规则，细胞表面的突起越多，细胞内能够引起激光散射的细胞器或者颗粒性物
单细胞和空间组学技术在肝脏领域应用
近期，中国科学院上海营养与健康研究所李虹研究组在《肝脏病学杂志》（Journal of Hepatology）上，发表了题为Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的综述文章。该文章阐述了前沿的单细胞
高深度空间代谢组学助力肿瘤微环境研究
肿瘤的发展除了与癌细胞自身基因突变导致的恶性增殖有关以外，还与肿瘤微环境息息相关。在癌症中，正常组织中和谐的细胞相互作用关系被破坏，原本保护正常细胞生存的微环境在肿瘤细胞的影响下，逐渐演变成适应肿瘤生长的条件。针对肿瘤微环境的检测和表征研究也可为癌症治疗提供新的思路。目前空间多组学技术已用于研究几种