家犬基因组学研究获新进展
科学界对于家犬的起源和驯化一直争议不断。近日，中科院院士张亚平带领团队发现，家犬中亚起源的假说与基于全基因组重测序数据分析的家犬东亚南部起源模式相冲突。相关成果日前在线发表于美国《国家科学院院刊》。 2015年，美国学者Shannon等人通过分析大量的家犬群体全基因组DNA芯片数据，提出了家犬中亚起源假说。然而，张亚平团队通过重新梳理Shannon等人的工作，发现他们把尼泊尔和蒙古都划归到中亚，而这与传统的地理划分相悖。其次，该工作并未包含中国南方这一家犬可能的起源地。通过整合已发表的中国南方家犬群体数据，张亚平团队发现，中国南方的家犬群体拥有最小的连锁不平衡距离。这支持了中国南方而非尼泊尔和蒙古是家犬起源地的结论。 同时，家犬的线粒体DNA（mtDNA）在分子法医学研究中也日益受到重视。2015年，3个研究组分别基于线粒体DNA基因组序列，构建了家犬mtDNA的单倍型类群树。由于采用了不同的参考序列和数据集，3棵单倍型......阅读全文
家犬基因组学研究获新进展
科学界对于家犬的起源和驯化一直争议不断。近日，中科院院士张亚平带领团队发现，家犬中亚起源的假说与基于全基因组重测序数据分析的家犬东亚南部起源模式相冲突。相关成果日前在线发表于美国《国家科学院院刊》。 2015年，美国学者Shannon等人通过分析大量的家犬群体全基因组DNA芯片数据，提出了家犬
基因平衡选择影响家犬毛色
近日从中科院昆明动物研究所获悉，中科院院士张亚平课题组的王国栋博士和公安部昆明警犬基地程鲁光合作，对昆明犬毛色人工选择开展研究，揭示了平衡选择是品种化过程中的一种重要驱动力，为家犬人工选择提供了新的思路和线索。该研究日前在线发表于国际刊物《公共科学图书馆·综合》(PLOS ONE)。
野狮可感染家犬病毒
犬瘟热是一种致命病毒性疾病，主要存在于犬类中，但也会感染其他哺乳动物。该病毒曾在上世纪90年代中期因为首次从家犬转移到坦桑尼亚塞伦盖蒂野生狮子身上而成为新闻，此次事件曾导致该类猫科动物新宿主死亡率达到30%。 为了保护狮子，科学家启动了一项为犬类注射疫苗抵抗该病毒的运动，科技博客网The Ve
昆明动物所揭示非洲家犬复杂的源流历史
近日，《遗传学和基因组学杂志》（Journal of Genetics and Genomics）发表了中国科学院昆明动物研究所张亚平课题组题为A Cryptic Mitochondrial DNA Link between North European and West African Dog
研究揭示从郊狼到北美土著家犬的古老渐渗
犬类生殖器传染性肿瘤（CTVT）是一种可以在犬科动物中传染生存的肿瘤，作为最初患瘤个体（CTVTfounder）的活化石，其基因组记录了一只古代犬科动物的遗传信息。近10年来，科学家们反复讨论了CTVT的起源和肿瘤进化过程。目前，通过对全球范围的现代家犬和部分古代家犬化石的全基因组测序，CTVT
“大灰狼”如何变家犬？“狗狗祖先”DNA来揭秘
作为家犬的唯一野生祖先，灰狼的相关研究对理解家犬起源具有重要的作用。为探究东亚灰狼遗传演化历史及其与家犬的联系，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所联合西北大学等单位开展了中国古代灰狼群体母系遗传研究。5月29日，相关研究成果发表于《整合动物学》。 在这项研究中，研究人员成功获取了来自中国北方的
张亚平等揭示青藏高原家犬低氧适应机制
记者8月27日从中科院昆明动物所获悉，该所张亚平课题组与云南大学、中科院北京基因组所、青海大学等合作发现，藏犬群体表现出与藏族人群非常相似的高原适应性模式。相关成果发表于《基因组生物学与进化》杂志。 据了解，家犬自古以来跟随人类活动迁徙和扩散，即使在海拔超过3500米的青藏高原上，依然表现出与
昆明动物所在家犬行为相关基因研究中取得进展
马里努阿犬是一种高兴奋型工作犬，在局促环境中常表现出转圈行为。其中表现一定转圈行为的个体较无转圈行为个体具有更高的兴奋性和工作欲望，较极度转圈个体具有更好的行为控制力。值得注意的极度转圈行为已经被定义为强迫症，且之前的研究已经发现了一些与之相关的一些基因，神经钙粘蛋白基因（Cadherin 2：
昆明动物所家犬嗅觉受体基因研究取得新进展
家犬作为人类最亲密的朋友，在人类历史上一直扮演者重要的作用。更重要的是，家犬是人类最早驯化的家养动物，由于其经过了驯化和品种培育两个重要的群体历史阶段，并且在家养哺乳动物中形成了最具多样性的品种，因此家犬一直是研究人工选择和自然选择的重要模式生物。中国最为家犬的驯化地，不仅遗传多样
张亚平团队揭示非洲家犬抵御疟原虫侵害遗传机制
中国科学院昆明动物所张亚平院士团队首次揭示家犬在伴随人类的过程中适应非洲炎热自然环境的遗传机制，为今后非洲人群疟疾研究工作提供重要靶点和参考，这是该研究团队在推动万犬基因组计划发展中取得的又一新成果。相关研究结果近日发表在《分子生物学与进化》上。 家犬约在3万多年前从东亚的灰狼驯化而来，并于
昆明动物所等揭示家犬适应欧洲牛奶饮食的遗传机制
家犬大约在1万五千年前到4万年前从欧亚大陆的灰狼驯化而来，现已遍布世界大部分有人类居住的地方。家犬与人类生活在相同的环境中，在很多方面存在趋同进化，家犬对环境的适应性进化遗传机制一直是进化生物学家的研究热点。经历长时间的人工选择和自然选择，欧亚大陆家犬分成欧洲家犬和东南亚两个群体，其背后的遗传机
昆明动物所等家养动物线粒体DNA基因组学研究取得进展
近年来，家养动物线粒体DNA（mtDNA）基因组学得到了迅速发展，积累了大量的mtDNA序列数据。与此同时，一些问题随之浮现出来。除了数据质量存在缺陷（Shi, et al. 2014. Mol Ecol）之外，mtDNA世系划分标准不一，世系命名混乱的问题也已开始干扰家养动物mtDNA的研究工
中国科学家通过基因编辑技术建立孤独症家犬模型
作为儿童和青少年常见的一种精神疾病，孤独症(又称自闭症)致病机理及医疗研究长期以来备受学界和社会广泛关注。 中国科学院遗传与发育生物学研究所(遗传发育所)10月27日在北京举行脑疾病家犬模型成果研讨会宣布，该所张永清团队联合中外多家科研机构长期协力攻关，在国际上首创孤独症家犬模型，基因编辑突变犬
家犬摇尾有何运动特征？研究称对人越熟悉越偏右
中新网北京7月23日电 (记者 孙自法)狗摇尾巴有何运动特征？偏左还是偏右？中国科学院(中科院)合作团队最新完成的一项研究发现，与每个人都有独特的步态相类似，人类最忠实的朋友——家犬也有着独特而稳定的摇尾特征：它们尾巴摇摆的左右偏侧化与其与人的熟悉程度有关，对人越熟悉越偏右。这项研究由中科院遗传与发
家犬基因组联盟发表dog10K计划白皮书
2016年，来自世界各地的20多位科学家成立家犬基因组联盟，全面深度探讨家犬起源与驯化、人工选择、疾病机制、医学模型等重大科学问题。自成立后，科研工作积极有序进行，近期研究联盟在国际刊物National Science Review上发表dog10K计划白皮书。 研究联盟指出，家犬是行为和表型
中国古代家犬线粒体全基因组揭示其种群扩散
1月8日，中科院生物一区杂志《分子生物学与进化》（Molecular Biology and Evolution）在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所古DNA实验室付巧妹研究员团队与中国科学院昆明动物研究所、陕西省考古研究院、浙江省文物考古研究所、兰州大学和四川大学等合作完成的关于中国古
研究揭示结构变异和新基因在家犬驯化中的作用
近日，中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室、动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心张亚平团队与中国农业科学院农业基因组研究所开展合作，第一次系统地构建了家犬在驯化中的结构变异（Structural Variations）图谱、探讨了新基因在驯化中的作用、并指出了大尺度基因组变异在驯化
基因组学分析揭示
英国《自然》杂志18日在线公开的一篇基因组学论文显示，来自西伯利亚阿尔泰山脉东部尼安德特人的祖先，和现代人祖先的相遇与交融繁殖可能比原先认为的更早。已有证据显示，尼安德特人在47000年到65000年前在非洲之外就向现代人贡献了遗传物质。这项新研究还显示，大约在10万年前，现代人和尼安德特人之间
研究揭示家犬同人类近万年来的共迁移历史
家犬是人类第一个驯化的动物，考古证据表明至少一万年前欧亚大陆多处均出现了犬的身影，其起源、扩散以及与人类迁徙的互动关系等科学问题对于理解动物驯化和人类文明传播都至关重要，因此长期受到学界的关注。早期基因组研究表明，家犬早在两万年前就已出现了血统分化并于欧亚大陆广泛扩散，但这些扩散是否与特定人类文化群
我国科学家破解中国古代家犬线粒体全基因组
2020年1月8日，《分子生物学与进化》（Molecular Biology and Evolution）在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所古DNA实验室研究员付巧妹团队与中国科学院昆明动物研究所、陕西省考古研究院、浙江省文物考古研究所、兰州大学和四川大学等合作完成的关于中国古代家犬线
美印药物基因组学与癌症基因组学检测商业化
美国Companiondx实验室拟与健康信息技术服务商Enable Healthcare合作，向医生推广药物基因组学检测；印度癌症医学公司HCG宣布建立一个新的肿瘤基因中心，旨在下代测序技术能够帮助定位肿瘤，从而提高化疗和放疗的效率和响应率 美国药物基因组学检测商业化 Companiondx实验
基因组所与昆明动物所在家犬起源进化研究中取得新进展
5月14日，中科院北京基因组研究所与中科院昆明动物研究所在家犬起源进化合作研究中取得重要进展，相关论文在最新一期《自然·通讯》在线发表。该研究成果从全基因组层面上阐述了狗的起源进化，并首次将其进化历史和人类的近期演化联系了起来。 在昆明动物所张亚平教授和基因组所吴仲义教授的带领下，昆明动物
Science专题：癌症基因组学
在2001年完成人类基因组测序后，许多的研究人员立即将目光放到了利用这些信息来更好地了解遗传学上。最近，越来越多的研究确定了表观遗传学在癌症的发生、形成及发展过程中起效应。从鉴别与遗传性癌症相关的单基因变异的前基因组时代转向，测序技术的进步使得研究人员能够利用全基因组方法来检测基因组间的差异，以
毒理基因组学的定义
毒理基因组学(toxicogenomics)是从多基因、全基因组水平研究毒物作用与基因表达的相互影响。其研究内容主要包括3个方面:促进环境应激原与疾病易感性关系的理解、阐明毒性分子机制、筛选和确认与疾病和毒物暴露相关的生物标志物(biomarkers)。
药物基因组学的定义
药物基因组学(pharmacogenomics),又称基因组药物学或基因组药理学,是药理学的一个分支,定义为在基因组学的基础上,通过将基因表达或单核苷酸的多态性与药物的疗效或毒性联系起来,研究药物如何由于遗传变异而产生不同的作用。
基因组学:－跨越癌症研究国界
1982年11月，在尼日利亚海军医院外足球场上踢球的一名军官，突然摔倒死亡。这名男子被带到急诊室时，当时还是一个新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade医生正在值班。“我们搞不明白为什么他死亡，这让我感到震惊，从那时开始我意识到，我需要做更多的工作来理解和帮助人们。”Ol
－Science：宏基因组学测序技术
宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。 长期以来，对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua
表观基因组学研究指南（一）
今年九月，对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份，因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature，Genome Biology，Genome Research等杂志上公布了三十多份论文，还有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
作物基因组学研究进展
摘要：农作物基因组学研究的发展，对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展，已经实现对重要农作物，如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序，在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了２０１７年度主要农作物基因组
表观基因组学研究指南（三）
今年九月，对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份，因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在 Nature，Genome Biology，Genome Research等杂志上公布了三十多份论文，还有在Science，Cell，以及the Journal