研究揭示结构变异和新基因在家犬驯化中的作用

近日,中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室、动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心张亚平团队与中国农业科学院农业基因组研究所开展合作,第一次系统地构建了家犬在驯化中的结构变异(Structural Variations)图谱、探讨了新基因在驯化中的作用、并指出了大尺度基因组变异在驯化研究中的重要性。该研究成果发表在国际期刊《国家科学评论》(National Science Review)上。 张亚平团队长期致力于家养动物的起源和驯化研究。因为缺乏家犬的野生近缘种和外群的基因组,前期研究大都集中在单核苷酸多态位点(SNPs)上,而对结构变异这一类大尺度基因组变异研究甚少。结构变异包括大的插入缺失、重复、倒位、易位等,在表型多样性、疾病易感性、环境适应中扮演了重要的作用。该研究通过二代测序和基因组从头组装的方法,获得了灰狼(Canis lupus)和豺狗(Cuonalpinus)的基因组,scaffold N50分......阅读全文

研究揭示结构变异和新基因在家犬驯化中的作用

  近日,中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室、动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心张亚平团队与中国农业科学院农业基因组研究所开展合作,第一次系统地构建了家犬在驯化中的结构变异(Structural Variations)图谱、探讨了新基因在驯化中的作用、并指出了大尺度基因组变异在驯化

免受新冠严重感染基因变异被“揪出”

瑞典卡罗琳斯卡学院主导的一个国际科研团队在最新一期《自然·遗传学》杂志撰文称,他们发现了一个特殊的基因变异,能有效保护个体免于新冠病毒严重感染。研究人员通过研究不同祖先的人群成功查明了这种变异,其具有很重要的临床价值,有助科学家们开发出新冠病毒新疗法。 除年龄和某

免受新冠严重感染基因变异被“揪出”

  瑞典卡罗琳斯卡学院主导的一个国际科研团队在最新一期《自然·遗传学》杂志撰文称,他们发现了一个特殊的基因变异,能有效保护个体免于新冠病毒严重感染。研究人员通过研究不同祖先的人群成功查明了这种变异,其具有很重要的临床价值,有助科学家们开发出新冠病毒新疗法。  除年龄和某些严重疾病外,遗传学也会影响感

长读长测序显优势-基因组复杂结构变异检测实现新突破

  基因组结构变异是很多癌症、遗传病等疾病的重要诱因。目前基于二代测序技术检测基因组结构变异存在很大的局限性,而三代测序存在错误率较高等多种问题,尤其针对复杂结构变异大多软件识别能力较差。针对这一问题,近日,在Nature Methods发表的一项最新研究中,研究人员开发了基因组比对工具NGMLR和

新基因编辑法可成功逆转单个碱基变异

  最近一期英国《自然》杂志刊登一则基因编辑改进方法,可定位和修改DNA单个碱基,并且不在基因组中引入随机插入或缺失的基因。这种新的“碱基编辑”法使用一种修饰过的CRISPR/Cas9蛋白质,使它和另外两种蛋白一同工作,比现有改正单碱基变异的方法更高效。   大多数遗传疾病源于单核苷酸的突变(点突变

基因编辑技术给植物基因结构变异研究带来新机遇

  植物基因组结构变异(Structural variations, SVs)包括基因插入/缺失变异和拷贝数变异,与单核苷酸多态性和表观遗传差异一起构成种内和种间可遗传表型的多样性。了解SVs在植物表型变异中的作用对于植物育种工作者生产改良品种具有重要意义。但早期基因技术的低分辨率和低效的方法限制了

超2.75亿个人类基因新变异发现

  美国科学家在一项最新研究中,对美国国立卫生研究院全民研究计划“我们所有人”中近25万名参与者的基因组数据进行了分析。结果,他们发现了超过2.75亿个以前未报告的基因变异,其中近400万个变异可能会对人类健康产生潜在影响。相关研究论文发表于19日出版的《自然》杂志。  论文通讯作者、范德比尔特大学

Cell-Rep:用CRISPR/Cas诱导基因组结构变异

  2月10日,德国马克斯普朗克分子遗传学研究所的研究人员在《Cell Reports》发表一项最新研究成果,题为“Deletions, Inversions, Duplications: Engineering of Structural Variants using CRISPR/Cas in

基因变异的概念

基因变异是指基因组DNA分子发生的突然的可遗传的变异。从分子水平上看,基因变异是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。基因虽然十分稳定,能在细胞分裂时精确地复制自己,但这种稳定性是相对的。在一定的条件下基因也可以从原来的存在形式突然改变成另一种新的存在形式,就是在一个位点上,突然出现了一个新

基因变异的概念

基因变异是指基因组DNA分子发生的突然的可遗传的变异。从分子水平上看,基因变异是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。基因虽然十分稳定,能在细胞分裂时精确地复制自己,但这种稳定性是相对的。在一定的条件下基因也可以从原来的存在形式突然改变成另一种新的存在形式,就是在一个位点上,突然出现了一个新

新的减肥策略!肥胖的MC4R基因变异

  黑素细胞皮质激素受体4(melanocortin 4 receptor, MC4R)是一种G蛋白偶联受体,它的破坏会导致肥胖。  在一项新的研究中,来自英国剑桥大学的研究人员对在来自英国生物库(UK Biobank)中的50万人中鉴定出的61种MC4R变体进行了功能性描述,并且研究了它们与身体质

研究发现超2.75亿个人类基因新变异

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517788.shtm

新冠变异病毒再变异-“德尔塔+”有多厉害

  近几个月来,新冠变异病毒德尔塔毒株的亚变异株AY.4.2感染病例在多国出现。这种被不少媒体称为“德尔塔+”的毒株到底有多厉害,是否已成为大流行以来传播能力最强的毒株?  “德尔塔+”另有其“毒”  AY.4.2亚变异株,正式名VUI-21OCT-01,被不少媒体称为“德尔塔+”。不过,研究人员指

新冠变异病毒再变异-“德尔塔+”有多厉害

  近几个月来,新冠变异病毒德尔塔毒株的亚变异株AY.4.2感染病例在多国出现。这种被不少媒体称为“德尔塔+”的毒株到底有多厉害,是否已成为大流行以来传播能力最强的毒株?  “德尔塔+”另有其“毒”  AY.4.2亚变异株,正式名VUI-21OCT-01,被不少媒体称为“德尔塔+”。不过,研究人员指

最新研究称每个人的基因都有60个新变异

  据每日科学网6月13日报道,在我们从父母那里获得的基因组中,每个人的基因都有60个新变异。这一惊人的数字,是由英国维尔科姆基金会桑格研究院、加拿大以及美国多家大学合作,通过直接检测人类全基因组变异,并和父母双方比较分析后得出的。  研究人员利用“千人基因组计划”的全基因组测序技术,直接检测了两个

新研究探索DNA变异过程

一项新的研究正在生命的组成部分,并使用高级的单分子方法来探索人类脱氧核糖核酸(DNA)的变异过程。 由英国莱斯特大学的Shriparna Sarbajna博士等开展的这项研究聚焦于在卵子和精子产生时期改组内容的“重组”过程。研究人员指出,“重组”产生的新型组合会传给后代。最后,这些组合经过多年的

染色体结构变异实验

实验方法原理染色体结构变异主要有缺失、重复、倒位、易位四种。其发生过程是由于同源染色体或非同源染色体之间发生断裂,然后发生错误重接的结果。各种结构变异的杂合体,在细胞分裂过程中常常表现不正常的细胞学行为,可以进行细胞学鉴定。在减数分裂过程粗线期,可以观察到缺失杂合体的“缺失环”,重复杂合体的染色体突

染色体结构变异实验

实验方法原理:染色体结构变异主要有缺失、重复、倒位、易位四种。其发生过程是由于同源染色体或非同源染色体之间发生断裂,然后发生错误重接的结果。各种结构变异的杂合体,在细胞分裂过程中常常表现不正常的细胞学行为,可以进行细胞学鉴定。在减数分裂过程粗线期,可以观察到缺失杂合体的“缺失环”,重复杂合体的染色体

染色体结构变异实验

实验方法原理 染色体结构变异主要有缺失、重复、倒位、易位四种。其发生过程是由于同源染色体或非同源染色体之间发生断裂,然后发生错误重接的结果。各种结构变异的杂合体,在细胞分裂过程中常常表现不正常的细胞学行为,可以进行细胞学鉴定。在减数分裂过程粗线期,可以观察到缺失杂合体的“缺失环”,重复杂合体的染色体

Delta变异株——全球主要流行的新冠病毒变异株

  当地时间18日,世卫组织举行新冠肺炎例行发布会,世卫组织首席科学家苏米娅·斯瓦米纳坦表示,由于Delta变异株的传播能力显著增强,这种变异新冠病毒正在成为全球主要流行的新冠病毒变异株。  世卫组织需要更多数据,以了解各种新冠疫苗应对不同新冠病毒变异株的有效性。

北京基因组所构建完成质体基因组结构变异数据库

  多相催化是实现高效定向化学转化的关键技术,其中的一个重要基础科学问题是如何通过精确设计和调控催化活性位结构及所在环境,从而强化其定向催化功能并创造新型高效催化剂。近日,中国科学技术大学熊宇杰教授课题组和江俊教授课题组继在电催化体系中提出表面极化概念后,再次通过与黄伟新教授课题组合作,证实界面极化

分析变异毒株突变-新冠病毒精确完整基因注释图谱完成

  美国麻省理工学院的科学家在11日出版的《自然·通讯》杂志撰文称,在进行了广泛的比较基因组学研究之后,他们绘制出了新冠病毒迄今最精确完整的基因注释图谱,确认了几种蛋白质编码基因,也发现有些基因并不编码任何蛋白质。此外,他们还分析了新冠病毒不同毒株产生的近2000个突变,从而能更好地评估这些突变的重

北京生科院在基因组结构变异识别领域取得新进展

  基因组结构变异是指基因组上由于一段或者多段基因序列因遗传、病变或自然突变等原因在基因组上产生的插入、删除、倒位、移位等变异。从规模上讲,包括小至若干碱基对的变异到大至上万碱基对甚至染色体规模的复杂变异。每一个人的基因组上都存在大量不同规模、不同类型的结构变异,这些结构变异不仅是造成人与人之间表型

英国新研究探索DNA变异过程

有助于了解医药、历史和世系等问题 英国莱斯特大学的Shriparna Sarbajna博士等使用单分子方法来探索人类DNA的变异过程。(图片提供:莱斯特大学)   一项新的研究正在分析生命的组成部分,并使用高级的单分子方法来探索人类脱氧核糖核酸(DNA)的变异过程。   由英国莱斯特大

印度新冠变异株入侵广东

  此轮广东疫情还在持续蔓延。  据广东省卫健委通报,5月30日,省内新增本土确诊病例20例(其中16例为无症状感染者转确诊),广州报告18例,佛山报告2例。新增本土无症状感染者3例,深圳报告2例,佛山报告1例。  在今日下午17时30分的新闻发布会上,广州市人民政府副市长黎明表示,为集中医护力量进

惊!日本出现变异新冠病毒?

  据日本广播协会电视台统计,截至8日20时(北京时间8日19时),日本当日新增新冠确诊病例1565例,连续两天单日新增病例超过1500例。另据日媒当天报道,该国最新研究发现,6月中旬以来日本出现了变异后的、具有新型基因序列的新冠病毒。  统计数据显示,日本累计确诊47464例,累计死亡1042例。

惊!日本出现变异新冠病毒?

  据日本广播协会电视台统计,截至8日20时(北京时间8日19时),日本当日新增新冠确诊病例1565例,连续两天单日新增病例超过1500例。另据日媒当天报道,该国最新研究发现,6月中旬以来日本出现了变异后的、具有新型基因序列的新冠病毒。  统计数据显示,日本累计确诊47464例,累计死亡1042例。

灵长类动物结构变异的机制

  2013年度基因组生物学大会(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美国纽约冷泉港实验室召开。这是基因组学领域最大的会议之一,吸引了多个著名研究所的大牛参加。会议主题包括高通量基因组学和遗传学、复杂性状的遗传学、功能和癌症基因组学、计算基因组学、进化基因组学以

植物诱导染色体结构变异

实验概要了解染色体结构发生变异后,在有丝分裂的细胞中,可以观察到在后期出现染色体桥或染色体断片,在间期的细胞可以观察到微核。实验原理染色体结构变异主要有缺失、重复、倒位、易位四种。其发生过程是由于同源染色体或非同源染色体之间发生断裂,然后发生错误重接的结果。各种结构变异的杂合体,在细胞分裂过程中常常

新研究构建出小麦属全基因组遗传变异图谱

  小麦是人类历史上最成功的作物之一,它起源于新月沃地一个狭小的核心区域,一万年间,从地区性的野生植物迅速转变成为全球种植面积最广的作物之一,在多种多样的环境下为人类提供大量的碳水化合物和蛋白质。然而,小麦对自然环境和人类粮食需求两方面同时适应的遗传机制尚不清楚,理解小麦适应性进化对气候变化条件下小