复旦大学最新综述:基因功能富集分析研究
“核心刊物”迎来了新期刊:科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英国的SA,日本的《科技文献速报》等。目前针对每期的重点内容,生物通将展开详细推荐,欢迎读者共同参与…… 生物通报道:基因功能的富集分析已成为高通量组学数据分析的常规手段, 对于揭示生物医学分子机制具有重要意义. 目前已有上百种基因功能富集分析的方法和工具. 根据所解决的问题和算法的原理, 这些方法可大体分为过代表分析、功能集打分、基于通路拓扑结构和基于网络拓扑结构4大类. 来自复旦大学生命科学学院等处的几位学者对这4大类方法的原理及其中的典型方法进行了综述, 并讨论了基因功能富集分析结果的冗余性问题及建立标准数据集的必要性. 随......阅读全文
基因功能研究策略
随着人类基因组计划的顺利进行,越来越多的新基因被发现,基因功能研究成为生命科学领域中的重大课题,目前基因功能研究方法主要有基因转导、反义技术、转基因和基因剔除、染色体转导、RNA 干涉等。一、 正常情况:DNA→mRNA→蛋白质→功能(遗传效应以及表型)二、 基因功能研究策略:1、 基因功能的获得(
创建荧光鱼研究基因功能
研究人员正在利用作为分子“灯塔”来研究动物的早期发育阶段。研究人员聚焦的Sp2基因可调节其他的表达,他们创建的荧光鱼也可为探究发展成因提供线索。此项研究成果刊登在近期出版的《期刊》(The Journal of Biological Chemistry)上。 Sp2是Sp转录因子家庭的成员之一,
突变按照基因功能改变分类
按照基因功能改变分类功能丧失突变也称失活突变,导致基因产物具有较少或完全没有功能(部分或完全失活)。当等位基因完全丧失功能(无效等位基因)时,它通常被称为无定形突变,与此类突变相关的表型通常是隐性的。功能获得性突变也称为激活突变,改变的基因产物,使其功能变强(增强激活),甚至被不同的异常功能所取代。
关于基因功能分类的介绍
只要是编码基因,则一定在体内发挥某一种功能,如果一群基因或蛋白是样本变化后的主要结果,将基因或蛋白按照功能进行分类,可直观看出样本变化体现出的功能特点。但是,这些功能特点并不一定都是重要的,需要通过统计学分析,找到其中重要的功能。而后,还要对挑选的重要功能分类进行验证,以保证分析的准确性。 对
基因功能鉴定的方法有哪些
基因功能鉴定的方法1、转基因技术2、基因敲出技术3、基因沉默技术转基因技术是将外源基因导入受体细胞,室外源基因随即整合到受体细胞的染色体上,并随者受体细胞的分裂并将外源基因遗传给后代,从而获得携带外源基因的转基因生物方法。基因敲出技术是采用动物胚胎肝细胞介导定向基因转移,使动物体内的特定基因丧失功能
DNA突变按照基因功能改变分类
功能丧失突变也称失活突变,导致基因产物具有较少或完全没有功能(部分或完全失活)。当等位基因完全丧失功能(无效等位基因)时,它通常被称为无定形突变,与此类突变相关的表型通常是隐性的。功能获得性突变也称为激活突变,改变的基因产物,使其功能变强(增强激活),甚至被不同的异常功能所取代。当新等位基因被创建时
RNAi在探索基因功能中的应用
人类基因组计划的完成标志着后基因组时代的来临。阐明人类基因组中功能基因表达产物的生物学作用对医学发展有着深远意义。在RNAi技术出现以前,基因敲除(gene knockout)是主要的反向遗传学(reverse genetics)研究手段,但其技术难度较高、操作复杂、周期长。由于RNAi技术可以利用
RNAi在探索基因功能中的应用
人类基因组计划的完成标志着后基因组时代的来临。阐明人类基因组中功能基因表达产物的生物学作用对医学发展有着深远意义。在RNAi技术出现以前,基因敲除(gene knockout)是主要的反向遗传学(reverse genetics)研究手段,但其技术难度较高、操作复杂、周期长。由于RNAi技术可以利用
RNAi在探索基因功能中的应用
人类基因组计划的完成标志着后基因组时代的来临。阐明人类基因组中功能基因表达产物的生物学作用对医学发展有着深远意义。在RNAi技术出现以前,基因敲除(gene knockout)是主要的反向遗传学(reverse genetics)研究手段,但其技术难度较高、操作复杂、周期长。由于RNAi技术可以利用
RNAi在探索基因功能中的应用
人类基因组计划的完成标志着后基因组时代的来临。阐明人类基因组中功能基因表达产物的生物学作用对医学发展有着深远意义。在RNAi技术出现以前,基因敲除(gene knockout)是主要的反向遗传学(reverse genetics)研究手段,但其技术难度较高、操作复杂、周期长。由于RNAi技术可以利用
RNAi在探索基因功能中的应用
人类基因组计划的完成标志着后基因组时代的来临。阐明人类基因组中功能基因表达产物的生物学作用对医学发展有着深远意义。在RNAi技术出现以前,基因敲除(gene knockout)是主要的反向遗传学(reverse genetics)研究手段,但其技术难度较高、操作复杂、周期长。由于RNAi技术可以利用
RNAi在探索基因功能中的应用
人类基因组计划的完成标志着后基因组时代的来临。阐明人类基因组中功能基因表达产物的生物学作用对医学发展有着深远意义。在RNAi技术出现以前,基因敲除(gene knockout)是主要的反向遗传学(reverse genetics)研究手段,但其技术难度较高、操作复杂、周期长。由于RNAi技术可以利用
双人源化小鼠的基因功能简介
秋天匆匆离去,冬天的脚步近了,但是每周的产品可是必不可少的呦,今天将为大家带来的是B-hPD-1/h4-1BB双人源化小鼠,绝对纯自家生产,工艺精湛,用着放心哦!言归正传,跟着小编一起去看看吧~ 4-1BB基因功能简介 TNFRSF9(TNF receptor superf
双人源化小鼠的基因功能简介
4-1BB基因功能简介TNFRSF9(TNF receptor superfamily member 9)为TNF受体超家族成员,也称为CD137或4-1BB,主要表达在活化的T细胞、NK细胞、单核细胞表面。通过连接其配体CD137L或利用激活型CD137单克隆抗体激活CD137,既能提供共
Nature阐析明星抑癌基因功能
肿瘤抑制基因BRCA1或BRCA2发生遗传突变是迄今为止人类遗传性癌症风险最常见的一个促进因子,往往在年轻的育龄妇女中引起乳腺癌或卵巢癌。尽管科学家们曾尝试在活体哺乳动物中测试BRCA基因,以阐明其在调控与基因组复制相关的一个修复过程中所起的作用,却一直难以做到。 现在来自贝斯以色列女执事
关于基因功能分析的内容介绍
基因功能分析,是指利用生物信息学和不同表达系统对基因的功能进行的预测、鉴定和验证。基因功能是在细胞组成的多层次复杂生命体中实现的,因此对基因功能的研究将极大程度上依赖于对模式生物的研究。基因功能研究的方法有:基因的生物信息学分析,基因的时空表达谱分析(mRNA水平的表达谱分析和蛋白质水平的表达谱
干细胞的研究基因功能的介绍
胚胎干细胞与基因定位整合技术相结合,对于研究基因在胚胎发育中的表达与功能具有十分重要的意义。利用这项技术可以将一些在发育过程中特定的基因敲除,在动物体内进行基因功能缺失的研究,这对于据示以前不能在体内充分证明的分子调控机制也具有重要的作用,此外,还可以在干细胞水平上利用基因功能获得性突变使特定基
关于突变按照基因功能改变分类介绍
1、功能丧失突变 也称失活突变,导致基因产物具有较少或完全没有功能(部分或完全失活)。当等位基因完全丧失功能(无效等位基因)时,它通常被称为无定形突变,与此类突变相关的表型通常是隐性的。 2、功能获得性突变 也称为激活突变,改变的基因产物,使其功能变强(增强激活),甚至被不同的异常功能所取
新基因网络模型可快速确认基因功能
美国得州大学奥斯汀分校研究人员开发出一种强大的新基因网络模型,可更加容易和快速地确认出控制线虫寿命及其肿瘤发展的致病基因。研究人员期冀通过扩展此项技术,未来可鉴别出造成人类疾病与其他身体功能失调症状的相关基因。该研究成果发表在1月27日的英国《自然—遗传学》(Nature Genetics)网络版上
3种常用基因功能验正方法简述
科研人员在分析项目的过程中,碰到这样的问题:通过各种手段(选择清除分析、比较基因组学分析、转录组分析)获得的行驶某种功能的某基因,如果进行实验的验正呢?一般分为:基因上调(基因转染法)、基因下调(基因干扰法)后看蛋白表达水平、细胞功能改变、在体动物模型中相关功能的变化等。 相信大家也有
简述RNAi在探索基因功能中的应用
人类基因组计划的完成标志着后基因组时代的来临。阐明人类基因组中功能基因表达产物的生物学作用对医学发展有着深远意义。在RNAi技术出现以前,基因敲除(gene knockout)是主要的反向遗传学(reverse genetics)研究手段,但其技术难度较高、操作复杂、周期长。由于RNAi技术可以
世界首张小鼠“扰动图谱”解码基因功能
“人类基因组早被测序,但其功能至今深藏不露,这严重妨碍了疾病诊治。”上海科技大学生命学院教授池天说,“21世纪生物医学的重要任务就是解码人类基因组这部‘神秘天书’。”7月22日,池天团队在《细胞》在线发表论文,报道了一种崭新的小鼠基因打靶技术iMAP,并快速鉴定了90个基因在39种组织的基本功能,构
科学家创建“荧光鱼”研究基因功能
可探究动物或人类癌症的早期发展 美国研究人员正在利用荧光鱼作为分子“灯塔”来研究动物的早期发育阶段。研究人员聚焦的Sp2基因可调节其他基因的表达,他们创建的荧光鱼也可为探究肿瘤发展成因提供线索。此项研究成果刊登在近期出版的《生物化学期刊》(The Journal of Biological
3种常用基因功能验正方法简述
科研人员在分析项目的过程中,碰到这样的问题:通过各种手段(选择清除分析、比较基因组学分析、转录组分析)获得的行驶某种功能的某基因,如果进行实验的验正呢?一般分为:基因上调(基因转染法)、基因下调(基因干扰法)后看蛋白表达水平、细胞功能改变、在体动物模型中相关功能的变化等。 相信大家也有
三种常用基因功能验正方法
科研人员在分析项目的过程中,碰到这样的问题:通过各种手段(选择清除分析、比较基因组学分析、转录组分析)获得的行驶某种功能的某基因,如果进行实验的验正呢?一般分为:基因上调(基因转染法)、基因下调(基因干扰法)后看蛋白表达水平、细胞功能改变、在体动物模型中相关功能的变化等。1、 RNA 干扰技术RNA
Nature扩展教科书,基因功能研究的新层面
就像一个管弦乐队中的音乐家们,他们拥有相同的乐谱,却在不同的间隔时间内开始和结束演奏。细胞也拥有相同的基因,却在基因组中的不同位点启动和完成对它们的转录。来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究人员,第一次描述了由于这样的起点和终点变化所导致的信使RNAs (mRNAs)惊人的多样性。他们
CompresstomeTM应用II-基因功能研究:组织学连续切片
关键词:组织学(Histology), 基因功能(Gene Function), 免疫组织化学(Immunohistochemistry), 连续切片(Serial Sections),振动切片机(Vibratome) 在基因功能的研究中,为了研究某种基因的功能或基因调控网络时需要同时在一个动物上对
JakSTAT信号通路相关基因功能介绍AXL基因
酪氨酸蛋白激酶受体UFO是一种人类由AXL基因编码的酶。 该基因最初被命名为UFO,因为这种蛋白质的功能不明。 然而,自其发现以来的几年中,对AXL表达谱和机制的研究使其成为一个越来越有吸引力的目标,特别是对于癌症治疗。 近年来,AXL已成为癌症细胞免疫逃逸和耐药性的关键促进因素,导致侵袭性和转移性
发现不同农作物-基因功能差异新机制
玉米作为一种具有重要经济价值的模式作物,具有丰富的遗传资源,在揭示驯化和植物改良的遗传途径方面具有重要意义。然而,美国加州大学伯克利分校植物和微生物学系的董朝滨(音译)等研究人员,发现驯化玉米和影响其他禾本科作物产量的一些重要途径。在一些情况下,密切相关的禾本科农作物基因之间存在功能差异,似乎不
JakSTAT信号通路相关基因功能介绍mTOR基因
雷帕霉素(mTOR)的哺乳动物靶标,也称为雷帕霉素和FK506结合蛋白12-雷帕霉素相关蛋白1(FRAP1)的机制靶标,是人类中由MTOR基因编码的激酶。 mTOR是蛋白激酶的磷脂酰肌醇3-激酶相关激酶家族的成员。 mTOR与其他蛋白质结合,并作为两种不同蛋白质复合物的核心成分,mTOR复合物1和m