GenomeBiology：为CRISPR选择最佳向导
细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争，为此它们演化出了多种防御机制，CRISPR-Cas9 适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合，可以在引导RNA的指引下，靶标并切割入侵者的遗传物质。 2012年研究者们利用这一特点，将CRISPR系统发展成了强大的基因组编辑工具。该系统使用简单而且扩展性强，很快便成为了生物学领域的香饽饽。 CRISPR/Cas9基因组编辑的成功取决于向导RNA序列的选择。正因如此，预测向导RNA脱靶和打靶情况的计算工具很受欢迎。不过，人们还不清楚这些算法的准确程度。法国INSERM和美国加州大学的研究人员首次对一些常用算法进行了独立评估，并在此基础上打造了选择向导RNA的网页工具CRISPOR。这项研究于七月五日发表在Genome Biology杂志上。 研究人员收集了八项SpCas9脱靶研究的数据，将其与预测位点进行比较。研究显示，基于序列的脱靶预测是......阅读全文
细菌的核酸抽提
DNA Extraction· DNA Extraction from Bacteria (Julie B. Wolf,UMBC)Phenol/chloroform method· DNA Extraction From Bacteria (Triton Method
研究发现细菌能隐形躲避人类免疫系统
北京时间2月26日消息，据国外媒体报道，英国约克大学的科学家近日称，他们最近在一项研究中发现经菌能够利用硅酸分子制造“隐身衣”，并以此逃避人体内的免疫系统。 在最新一期出版的《生物化学杂志》上，英国约克大学的科学家发表了一篇名为《硅酸变旋的催化》的论文，详细公布了他们的这一最新发现。科学家们称，有
打破肠道平衡，细菌和免疫系统都有责任
德国Charité -Universitätsmedizin Berlin的研究小组发现控制肠道微生物是改善生物免疫反应的关键。这项国际研究发表在Nature Immunology，结果可能有助于开发治疗慢性炎症性疾病的新疗法。 免疫系统既可防范病原菌在肠道肆意传播，又允许有益微生物定植。反
Nature：CRISPR/Cas系统介导细菌躲避宿主免疫系统
CRISPR/Cas（规律成簇的间隔短回文重复）是细菌用来抵御病毒的一个基因系统，该系统在基因工程领域的应用潜力巨大，由此吸引了许多科学家的注意。而埃默里大学（Emory University）的研究人员发现，这一系统还能帮助细菌躲避哺乳动物的免疫系统，相关研究论文刊登在了近期出版的《自然》（N
Nature：巨型病毒也有类似细菌CRISPR的免疫系统
就像细菌，体型较大的病毒也需要保护自己，免受其他微小生物入侵。根据法国科学们的一项新研究，这些巨型病毒有类似于细菌中的CRISPR系统的免疫系统，来保护自己。相关工作发表在近期的《Nature》上。 2003年，法国艾克斯-马赛大学的 Didier Raoult和Bernard La Scol
组装细菌“大杀器”－免疫系统避免“走火”有绝招
紧张有序的备战场景，每天在人体内的免疫系统轮番上演—— 敌人触碰警戒线；警戒巡视系统拉响紧急警报；信号兵就位发出组织防御反击的信号；基地提供物资保障；作战部队全员出动；整装之后，旋即发兵，与敌交火。 近日，《细胞》杂志在线刊登中国工程院院士、南开大学校长曹雪涛团队的重要发现，阐述了“基地
新发现！Cell：噬菌体抱团抑制细菌CRISPR免疫系统
在2018年7月19日同时在线发表在Cell期刊上的两篇论文中，来自两个研究团队的研究人员提供了当入侵含有CRISPR的细菌时，噬菌体彼此间进行合作的证据。他们发现为了压制CRISPR的破坏，噬菌体通过联合起来快速地感染细菌来加以适应，而且有时一个噬菌体还会为此作为引火噬菌体（primer p
科学家首次发现超级细菌会抑制免疫系统功能
自抗生素被发明以来，细菌们为了存活，产生出强大的耐药性。它们不仅通过变异衍生出“超级细菌”，更可怕的是，科学家们发现这些超级细菌竟然还会“劫持”我们的神 自抗生素被发明以来，细菌们为了存活，产生出强大的耐药性。它们不仅通过变异衍生出“超级细菌”，更可怕的是，科学家们发现这些超级细菌竟然还会
细菌免疫系统中的Cas10如何区分敌军和友军
当外来异物对我们发起攻击时，免疫系统中的民兵分子就会火速应战。不过，在一片混战之中，这些民兵分子必须很小心，以免对自己的战友开火。从细菌到人类，各种生物体已经进化出特殊的机制来避免这种混淆。 在洛克菲勒大学的一项新研究中，研究人员介绍了一种策略，细菌可以通过这种策略来区分自己的部队和恶意入侵者
科学家发现细菌后天免疫系统可修改DNA片段
据美国媒体报道，近年来，科学家发现细菌的免疫系统“Crispr”可用来修改DNA，这个发现可能让科学家拥有修改生命密码的空前力量。 据报道，Crispr这个名词是“间隔的短回文重复序列”(clustered regularly interspaced short palindromic
细菌感染性疾病的直接核酸诊断试验（一）
细菌感染性疾病的直接核酸诊断试验 Florence Paillard, PhD, and Craig S. Hill, PhD准确和快速的诊断是及时采取治疗措施和防止感染性疾病扩散的关键。理想的感染性疾病的诊断试剂应该能够给临床医生提供快速、灵敏度高和特异性强的实验结
细菌感染性疾病的直接核酸诊断试验（三）
A群链球菌性咽炎：检测咽炎病人A群链球菌（GAS）的金标准是采用咽拭子标本进行培养，但培养需要24—48小时。目前所开发的快速抗原检测试剂（RADT）虽然可以进行快速检测，而且使用也较方便，但其灵敏度一般比培养低。许多专家建议当病人为儿童或青少年、或医生在他的实际工作中不能确定所使用的RADT的灵敏
细菌感染性疾病的直接核酸诊断试验（二）
3．TMA：TMA是在恒温过程中特异性扩增RNA或DNA分子，反应过程需引物和两种酶：逆转录酶（RT）和RNA聚合酶。逆转录酶用来合成DNA，合成的DNA再被RNA聚合酶用来复制更多的RNA，这一过程可以循环进行。采用自动化扩增仪，TMA可以在15到30分钟内使目标序列扩增100亿倍。检测采用HPA
细菌感染性疾病的直接核酸诊断试验（四）
2．NAATs：Roche公司的AMPLICOR试剂是第一代基于PCR的NAAT；而BD公司的BDProbe Tec是第一代基于SDA的NAAT。这些试剂扩增的目标序列通常位于染色体DNA或质粒中。BDProbe Tec目前有两种：一是检测CT的BDProbe Tec CT，另一种是可以在一份标本中
全新双重荧光定量PCR方法助力细菌污染核酸检测
目前，核酸筛检系统（Nucleic Acids Testing，NAT）已广泛用于血制品常规病原体（乙肝、丙肝、艾滋、梅毒）的核酸检测，极大降低了相关疾病的输血传播。但是，在输血感染性风险中，血小板的细菌污染及相关败血症性输血反应仍是棘手的问题。将核酸筛检技术用于细菌污染检测还有不少困难，包括：
发现激活记忆T细胞的活细菌，助力胎儿培养免疫系统
研究人员在胎儿的肠道、皮肤、肺和胎盘中发现了激活记忆T细胞的活细菌，这表明早期接触微生物有助于培养免疫系统。 14周大的人类胎儿中肠的典型扫描电镜显示有细菌的粘膜区域(红色箭头) 在过去的十年里，科学家们已经证明了胎儿的免疫系统比最初认为的发育的快得多，但是哪种抗原训练新生的免疫细胞以及它如
免疫系统中的维和部队被发现－可阻止攻击有益细菌
美国物理学家组织网10月17日报道，生活在人类皮肤和肠道的细菌比我们自身的细胞还要多，它们大多是人体需要的益生菌。但免疫系统是怎样识别这些“非自体”细菌而不伤害它们呢？澳大利亚悉尼大学世纪学院的科学家发现，在皮肤外层的免疫细胞中有一群“维和部队”，它们阻止了免疫系统攻
肠道细菌产生的脂肪酸可增强机体免疫系统的功能
近日，来自日本理化研究所的研究人员通过研究揭示了肠道细菌对机体免疫系统成熟的作用，相关研究刊登于国际著名杂志Nature上，该研究也为揭示丁酸可以作为治疗炎性肠病比如克罗恩病的有效疗法。 丁酸是肠道细菌消化膳食纤维后的一种副产品，其可以扮演表观遗传开关的作用，来通过诱导肠道中调节T细胞的产
免疫系统功能缺陷的儿童或更易遭受严重的细菌性感染
近日，一项刊登在国际杂志JAMA Pediatrics上的研究报告中，来自默多克儿童研究所的科学家们通过研究发现，引发肺炎和脑膜炎的细菌性感染或与儿童机体免疫系统功能下降有关。研究者指出，侵袭性肺炎球菌病（尤其是发病一次以上）可能是儿童免疫功能缺陷的重要标志，但诊断延误或会严重影响医生的及时诊断
果蝇免疫系统产生抗菌肽来防御食物和环境中常见细菌
以前的理论认为抗菌肽（antimicrobial peptide）---一类天然抗生素---在杀死一系列细菌方面具有普遍作用。然而，在一项新的研究中，来自瑞士联邦理工学院和英国埃克塞特大学的研究人员考察了果蝇的免疫系统如何受它们的食物和环境中的细菌影响。他们在果蝇的免疫系统中发现了两种抗菌肽：D
细菌阿尔古蛋白在沉默外来核酸中的作用
在真核细胞中，阿尔古蛋白在由小RNA调节的基因沉默中扮演了一个重要角色。在最近一期的《分子细胞》中，Alexei Aravin和同事证明了一种细菌阿尔古蛋白在沉默外来核酸中的作用。 阿尔古蛋白被发现存在于一系列的细菌和古生菌中。尽管已经有几种晶体结构可用，并且对于一些细菌阿尔古蛋白的基
黏膜免疫系统的体液免疫系统的介绍
体液免疫是粘膜免疫效应的主要过程，即产生分泌型免疫球蛋白A（sIgA）。据研究，人体每天分泌sIgA的量约为30～60mg/kg，超过其它免疫球蛋白的量。 IgA在浆细胞产生后，由J-链(含胱氨酸较多的酸性蛋白)连接成双聚体分泌出来。当IgA通过粘膜或浆膜上皮细胞向外分泌时，与上皮细胞产生的分
cell：细菌的脂多糖是如何进入胞浆激活天然免疫系统的
在天然免疫反应过程中，宿主的免疫细胞可以通过多种机制识别外源微生物信号，其中包括位于细胞膜表面的Toll样受体，这类受体能够识别胞外的微生物组分，比如LPS。另外还有一些存在于胞浆中的受体，它们能够特异性识别入侵细胞内部的微生物成分。此前研究发现LPS如果进入胞浆中，则能够引发caspase-1
免疫系统组成
免疫器官 种类：扁桃体、淋巴结、胸腺、脾、骨髓等。 作用：免疫细胞生成、成熟或集中分配的场所。 免疫细胞 发挥免疫作用的细胞。分为淋巴细胞、吞噬细胞等。 淋巴细胞位于淋巴结、血液和淋巴液中，分为T细胞（在胸腺中成熟）和B细胞（在骨髓中成熟）。 免疫活性物质 免疫活性物质是由免疫细胞
抗菌肽如何发挥作用？
破坏细胞膜：抗菌肽可以与细菌和真菌的细胞膜结合，并通过插入、破裂等方式破坏其结构。这会导致细胞内容物泄漏出来，最终导致细胞死亡。 干扰蛋白质合成：抗菌肽可以与细菌和真菌的核糖体结合，从而干扰其蛋白质合成过程。这会阻止细菌和真菌生长和繁殖，最终导致其死亡。 抑制核酸合成：抗菌肽可以与细菌和真菌
抗菌肽是如何杀死或抑制细菌和真菌的？
破坏细胞膜：抗菌肽可以与细菌和真菌的细胞膜结合，并通过插入、破裂等方式破坏其结构。这会导致细胞内容物泄漏出来，最终导致细胞死亡。 干扰蛋白质合成：抗菌肽可以与细菌和真菌的核糖体结合，从而干扰其蛋白质合成过程。这会阻止细菌和真菌生长和繁殖，最终导致其死亡。 抑制核酸合成：抗菌肽可以与细菌和真菌
免疫系统“返老还童”了
在研究人员减少了老年老鼠体内异常的干细胞后，其发展出了更年轻的免疫系统。这项技术加强了老年啮齿类动物对病毒感染的反应，并降低了炎症迹象。相关研究结果发表于3月27日《自然》。血液干细胞(人工着色)。图片来源：Science Photo Library研究人员通过用抗体处理老年老鼠，以减少能够产生多种
免疫系统不能“娇生惯养”
俗语说：“不干不净，吃了没病”。这并非没有一点科学道理。 免疫是人体的一种生理功能，人体依靠这种功能识别“敌我”，从而破坏和排斥进入体内的病原微生物和异物，及人体本身所产生的损伤衰老细胞和肿瘤细胞等，以维持人体的稳态和健康。 免疫分为先天性免疫和适应性免疫两种。先天性免疫是一种无选择性排斥、清除
免疫系统的构造
免疫系统的构造： 免疫系统是一个由免疫细胞和有机器官构成的网状系统，能自动对抗外来的有害物质，清除坏死细胞，并毁灭可能致癌的突变细胞。免疫系统的结构是繁多而复杂的，其主要的免疫器官有骨髓、胸腺、脾脏、扁桃体、淋巴结、淋巴管、盲肠。这些关卡都是用来防堵入侵的毒素及微生物。 1、骨髓 为白血球
Nature：以彼之道，还施彼身！揭开病毒对抗细菌CRISPR免疫系统的全新方式
噬菌体（Phage）和其他可移动遗传元件（MGE）对细菌施加了巨大的选择压力，作为回应，细菌也发展出了广泛的防御机制。其中最我们熟知的就是——CRISPR-Cas系统，这是一组在细菌中广泛存在的RNA引导的适应性免疫系统。 CRISPR-Cas系统的特异性和可编程性导致了基因组编辑、分子诊断等