中大绘出广东食管鳞状细胞癌遗传变异图谱
由中山大学肿瘤防治中心贾卫华教授领衔，中山大学、美国NIH等多家机构的科研人员组成的国际合作团队，基于新一代测序技术、基因的表达谱分析、体内外实验以及大量临床数据，对食管鳞状细胞癌的全基因组变异进行了历时五年的研究，绘制出广东食管鳞状细胞遗传变异图谱。 广东是食管癌高发大省，人群具有独特的遗传背景及生活习惯。从全基因组水平，全面、系统揭示广东食管鳞癌特有的体细胞遗传变异图谱，进而发现影响预后及靶向治疗的遗传变异，无疑对解析食管癌的发病机理、推动临床治疗方法的研究具有极大价值。由贾卫华教授领衔的该项研究系统地揭示了广东食管鳞癌的癌症基因组学特征，尤其是发现了一系列新的影响癌症转归和生存的基因突变（如VANGL1）、基因异常表达（如miR-4707-5p）和特征性的染色体结构变异，并进行了深入的体内外实验研究和癌症信号通路研究。贾卫华教授团队通过对67个广东食管鳞癌患者的肿瘤及癌旁正常组织进行全基因组或外显子组测序发现，同中国......阅读全文
多项血液肿瘤研究数据亮相ASH年会
近日，多项血液肿瘤管线最新数据在第65届美国血液学协会（ASH）年会上公布。其中奥布替尼联合方案治疗初治套细胞淋巴瘤（MCL）患者研究入选口头报告。 一项由天津医科大学肿瘤医院张会来教授作为第一作者和通讯作者的奥布替尼+来那度胺+利妥昔单抗联合方案治疗初治MCL患者的前瞻多中心II期研究（PO
曹雪涛委员：推进精准医学发展－助力健康中国建设
科技日报：今年1月30日，美国总统奥巴马在白宫正式宣布美国启动“精准医学”研究计划，什么是精准医学？美国启动的精准医学研究计划的主要内容是什么？ 曹雪涛：精准医学是以个体化医疗为基础、随着基因组测序技术快速进步以及生物信息与大数据科学的交叉应用而发展起来的新型医学概念与医疗模式，本质上是通过基
关于DNA测序技术的测序凝胶板的制备
一、玻璃板的处理 银染测序的玻璃板一定要非常清洁，一般先用温水和去污剂洗涤，再用去离子水冲洗玻璃板，除去残留的去污剂，最后用乙醇清洗玻璃板。玻璃板上遗留的去污剂微膜可能导致凝胶染色时背景偏高(棕色)。短玻璃板经粘合溶液处理可将凝胶化学交联于玻璃板上。这一步对于在银染操作过程中防止凝胶撕裂至关重
影响DNA测序技术测序产物银染的因素
1. 水的质量对于染色的成功极其重要。超纯水(NANOpureR 或Milli-QR 的水)或双蒸水可获得较好的效果, 如果水中有杂质, 则低分子量条带可能无法出现。 2. 碳酸钠也非常重要。使用新鲜的，美国化学学会级碳酸钠较好，如Fisher和Kodak ACS试剂级碳酸钠(Fisher C
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术的区别
时空分辨单细胞测序技术和传统单细胞测序技术主要有以下区别：空间信息获取传统单细胞测序：通常无法获取细胞在组织中的空间位置信息，只是对分离出的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序：能够在测定单细胞基因表达等信息的同时，明确细胞在原始组织中的具体空间位置。细胞互作研究传统单细胞测序：难以直观地揭示基于
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术的差异
时空分辨单细胞测序技术与其他单细胞测序技术主要在以下方面存在区别：空间信息获取普通单细胞测序技术：通常不提供细胞在原始组织中的空间位置信息。时空分辨单细胞测序技术：能够同时获取细胞的基因表达等信息以及它们在组织内的空间位置。细胞间相互作用分析普通单细胞测序技术：难以直接推断细胞间基于空间位置的相互作
相比一代测序技术，二代测序技术具有哪些优点
第一代指双脱氧末端终止法，扩增后通过毛细管电泳读取序列，每次获取数据量少第二代为高通量测序，采用微珠或高密度芯片边合成边测序，代表有454，solexa，solid，高通量，可一次获得数G数据，相对与第三代，都仍然需要扩增的方法放大信号，扩增后再检测。第三代特点是单分子测序，多基于纳米科技，无需扩增
相比一代测序技术，二代测序技术具有哪些优点
相比一代测序技术，二代测序技术优点如下：1、Illumina 原理：桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像优势：Illumina的这种测序技术每次只添加一个dNTP的特点能够很好的地解决同聚物长度的准确测量问题，它的主要测序错误来源是碱基的替换。而读长短（200bp-500bp）也让其应用有所局
第二代测序技术：高速发展的高通量测序技术
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测
16种常见癌症可做预测性基因检测
研究人员正在进行肿瘤组织基因组提取。 随着癌症发病率逐年上升，癌症基因检测愈发流行。基于自身健康的考虑，一些高危人群开始主动进行癌症基因检测。目前，癌症基因检测还处于发展阶段，多数用于肿瘤的靶向治疗以及临床疾病的药物治疗，不过我国现在已有16种常见癌症变异基因被破译，可做预测性基因检测。 精
我国叫停基因测序临床应用
国家食品药品监督管理总局、国家卫生计生委日前联合发出通知，任何医疗机构不得开展基因测序临床应用，已经开展的要立即停止，仍继续开展的，卫生行政部门要依法依规予以查处。 据介绍，包括产前基因检测在内的基因测序相关产品和技术，属于当代前沿产品和技术研究范畴，涉及伦理、隐私和人类遗传资源保护、生物
单细胞测序的临床应用
近期精准医学的进展集中在发展基于基因组学的诊断和治疗。这些方法通常包括从患者的组织样本中生成DNA或RNA序列信息，并分析它以确定可用于诊断、预后或通知临床管理的特定特征。‘bulk’一词指的是从大量细胞中集体生成基因组数据的方法，或者在无细胞DNA的情况下，来自许多细胞的基因组材料。因此，这些基因
肿瘤二代测序都能干什么？
基因检测包括：PCR，FISH，芯片技术，基因测序。基因测序技术是基因检测的一种。基因测序目前主要有一代测序（Sanger测序）、二代测序（illumina/Life Tech）、三代测序（单分子测序）等。PCR、FISH和芯片技术，主要是通过已知序列去调查特定确定的片段序列或位点的有或无，
如何选择合适的数据增强方法来处理单细胞测序数据？
选择合适的数据增强方法来处理单细胞测序数据可以考虑以下几个方面：了解数据特点分析单细胞测序数据的特征，包括基因数量、细胞类型分布、数据的方差和均值等。这有助于确定哪种数据增强方法可能更适合数据的固有模式。考虑生物学合理性确保所选择的数据增强方法在生物学上是合理的。例如，对于基因表达数据，增强操作不应
第29届全国肿瘤防治宣传周在京启动
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498545.shtm4月14日，第29届全国肿瘤防治宣传周启动仪式在北京举行。今年宣传周主题是"癌症防治、全面行动——全人群、全周期、全社会"，倡导每个人践行健康文明的生活方式，宣传落实癌症三级预防理念，
测序技术再现新进展，已开发基于单分子测序平台的单细胞多组学测序技术
单细胞多组学测序技术是指对一个单细胞同时检测多个组学层面（例如基因组、表观基因组和转录组）的测序技术。这类技术可以更系统、全面地探索细胞异质性以及同一个细胞内的不同组学层面之间的互动关系，有利于更深入地解析复杂的生理、病理过程中细胞类型特异性的分子调控机制1, 2。2019年，Nature Me
Cancer－Cell：基因测序发现治疗儿童肿瘤的药物
横纹肌肉瘤(Rhabdomyosarcoma)，是起源于横纹肌细胞或向横纹肌细胞分化的间叶细胞的一种恶性肿瘤，是儿童软组织肉瘤中最常见的一种，少发生于成人。胚胎型横纹肌肉瘤，多发于8岁前儿童(平均年龄为6岁)，肺泡型横纹肌肉瘤见于青春期男性(平均年龄为12岁)，多型性横纹肌瘤最常见于成人，也可见
单细胞测序技术的技术优势
单细胞测序技术具有许多优势：揭示细胞异质性：能够发现不同细胞之间基因表达和遗传变异的差异。研究细胞发育和分化：追踪细胞在发育过程中的动态变化和谱系关系。解析复杂组织：剖析组织中各种细胞类型的组成和功能。助力疾病研究：在肿瘤学中，有助于了解肿瘤细胞的进化、异质性和耐药机制。
基因测序：数据深度挖掘和解读难题待解
作为一种新型基因检测技术，基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性，个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因，提前预防和治疗。正因如此，今年华大基因的上市，就引发了资本市场的热烈追捧。 在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上，与会的众多专
白血病最大测序项目研究数据已公开！
近日，美国圣裘德儿童医院的科学家与合作者一同对数百名T细胞急性淋巴细胞性白血病（T-ALL）患者进行了前所未有的基因组测序分析。该研究展现了白血病患者最为宏观细致的基因组图景，为白血病临床治疗策略的制定和靶向药物的开发提供了重要的信息。同时，大量的基因组信息也为白血病小鼠模型的设计打下了坚实的基
单细胞测序数据的分析有什么意义
单细胞测序可以分析一个细胞里面的基因组序列这个主要适用于受精卵的试管婴儿
基因测序：数据深度挖掘和解读难题待解
作为一种新型基因检测技术，基因测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性，个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因，提前预防和治疗。正因如此，今年华大基因的上市，就引发了资本市场的热烈追捧。 在日前在京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上，与会的众多
－英公开埃博拉病毒基因测序数据
一个英国科研团队成功完成了对埃博拉病毒的基因测序，并已将数据在网上公开发布，免费提供给全球科研人员使用。这有助于各国研发更高效的治疗药物和疫苗。 剑桥大学３日发布公告称，２０１４年埃博拉疫情在西非暴发后，来自该校及英国多个科研机构的研究人员开始在塞拉利昂采集病毒样本，并利用美国一家公司开发的新
百度与协和合作开展食管癌基因测序领域研究
“百度-协和医学院食管癌研究项目”在北京协和医学院举办签约仪式。双方将充分发挥北京协和医学院的医学研究优势和百度大数据与人工智能等技术优势，发现与中国人密切相关的食管癌早期诊断的标志物，为食管癌的早期筛查和诊断提供科学依据,并为食管癌药物的研发提供靶标。据悉，此次合作中，百度CEO李彦宏将个人捐
徐瑞华教授Gut发表重要成果：监测癌症药物耐药性
HER2阳性胃癌是胃癌的一种亚型，该类患者预后差，接受单纯化疗方案后疾病控制时间不超过6个月。既往研究表明在单纯化疗基础上联合曲妥珠单抗这一靶向药物可显著延长HER2阳性晚期胃癌患者的总生存期。但是，曲妥珠单抗用于胃癌治疗存在疗效有限和快速耐药的问题，且胃癌具有高度复杂的异质性。因此，监测HER
因美纳亮相2024年CSCO学术年会，基因组学点亮肿瘤精准医学未来
中国厦门，2024年9月26日——全球基因测序和芯片技术的领导者因美纳以“基因组学点亮肿瘤精准医学未来”为主题，亮相第27届全国临床肿瘤学大会暨2024年中国临床肿瘤学会（CSCO）学术年会，全方位展示其在基因组学领域最新进展和应用，并将组织多场专题研讨会，同与会各方一道深入探讨基因组学在精准诊
全基因组测序用于临床之前，技术性挑战仍然存在
据3月12日发表在《美国医学会杂志》上的一则研究报告披露，在一项有12名成年人参与的探索性研究中，应用全基因组测序(WGS)与不完整的遗传性疾病基因的覆盖、检测具有最高潜在临床影响的基因变异的低复验性，以及临床报告发现的不确定性有关，尽管在某些案例中，WGS会发现基因变异株从而引入早期的医疗干预
测序技术在临床医学领域及大健康领域的应用何去何从？
2018年9月8日至9日，由苏州生物医药产业园（BioBAY）携手中国医疗器械行业协会主办的第八届中国医疗器械高峰论坛（DeviceChina2018）在苏州金鸡湖畔拉开帷幕。在现场，行业大咖围绕“基因测序技术在临床医学领域及大健康领域的应用何去何从”的主题展开了热烈讨论。
关于加强临床使用基因测序相关产品和技术管理的通知
各省、自治区、直辖市食品药品监督管理局、卫生计生委，新疆生产建设兵团食品药品监督管理局、卫生局： 包括产前基因检测在内的基因测序相关产品和技术属于当代前沿产品和技术研究范畴，涉及伦理、隐私和人类遗传资源保护、生物安全以及医疗机构开展基因诊断服务技术管理、价格、质量监管等问题。目前，基因测序
时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术有何不同？
时空分辨单细胞测序技术与传统单细胞测序技术主要有以下几个方面的不同：空间信息获取传统单细胞测序技术通常无法提供细胞在组织中的空间位置信息，只是对分离的单细胞进行独立分析。时空分辨单细胞测序技术能够在获取单个细胞基因表达等信息的同时，明确细胞在组织中的具体位置。细胞间相互作用研究传统技术难以直接揭示细