中大绘出广东食管鳞状细胞癌遗传变异图谱

由中山大学肿瘤防治中心贾卫华教授领衔,中山大学、美国NIH等多家机构的科研人员组成的国际合作团队,基于新一代测序技术、基因的表达谱分析、体内外实验以及大量临床数据,对食管鳞状细胞癌的全基因组变异进行了历时五年的研究,绘制出广东食管鳞状细胞遗传变异图谱。 广东是食管癌高发大省,人群具有独特的遗传背景及生活习惯。从全基因组水平,全面、系统揭示广东食管鳞癌特有的体细胞遗传变异图谱,进而发现影响预后及靶向治疗的遗传变异,无疑对解析食管癌的发病机理、推动临床治疗方法的研究具有极大价值。由贾卫华教授领衔的该项研究系统地揭示了广东食管鳞癌的癌症基因组学特征,尤其是发现了一系列新的影响癌症转归和生存的基因突变(如VANGL1)、基因异常表达(如miR-4707-5p)和特征性的染色体结构变异,并进行了深入的体内外实验研究和癌症信号通路研究。贾卫华教授团队通过对67个广东食管鳞癌患者的肿瘤及癌旁正常组织进行全基因组或外显子组测序发现,同中国......阅读全文

关于单分子测序技术—第三代测序技术的特点介绍

  1、第三代测序技术实现了DNA聚合酶内在自身的反应速度,一秒可以测10个碱基,测序速度是化学法测序的2万倍。  2、第三代测序技术实现了DNA聚合酶内在自身的延续性,一个反应就可以测非常长的序列。二代测序可以测到上百个碱基,但是三代测序就可以测几千个碱基。  3、第三代测序技术的精度非常高,达到

关于单分子测序技术—第三代测序技术的原理介绍

  第三代测序技术原理主要分为两大技术阵营:  第一大阵营是单分子荧光测序,代表性的技术为美国螺旋生物(Helicos)的SMS技术和美国太平洋生物(Pacific Bioscience)的SMRT技术。脱氧核苷酸用荧光标记,显微镜可以实时记录荧光的强度变化。当荧光标记的脱氧核苷酸被掺入DNA链的时

全新一代测序技术:没有光的测序

  至今,新一代测序技术已经遍布全球上百个基因组测序中心   ――明斯特大学Dag Harmsen   在去年召开的美国微生物学会上,来自明斯特大学的医学微生物学家Dag Harmsen开始听到了有关德国大肠杆菌疫情爆发的传言,这场疫情首先在德国北部地区爆发,感染了至少4000人,夺去了超过

关于DNA测序技术的测序凝胶的银染介绍

  染色过程要求凝胶浸在塑料盘中。因而至少使用两个盘子,大小与玻璃板类似。在盘中加入新鲜溶液之前须用高质量的水洗涤盘子。  1.电泳完毕后用一个塑料片子小心地分开两板,凝胶应该牢固地附着在短玻璃板上。  2. 固定凝胶:将凝胶(连玻璃板)放入塑料盘,用固定/停止溶液浸没,充分振荡20分钟或直至样品中

2018年《国家先进污染防治技术目录(大气污染防治领域)》

  分析测试百科网讯 近日,生态环境部印发《2018年》。此次发布的2018年《国家先进污染防治技术目录(大气污染防治领域)》中,共有35项涉及除尘技术、烟气脱硫、中低温脱硝技术、VOCs治理等技术,现附全文如下:关于发布2018年《国家先进污染防治技术目录(大气污染防治领域)》的公告  为贯彻《中

甲状腺肿瘤临床路径

   一、甲状腺肿瘤临床路径标准住院流程     (一)适用对象。     第一诊断为甲状腺肿瘤(ICD-10:C73/D09.302/D34/D44.0)。     行甲状腺肿瘤切除术(ICD-9-CM-3:06.2-06.4)。     (二)诊断依据。     根据《临床诊疗指南-耳鼻

黄芪生物防治技术获突破

日前,天津大学药学院教授高文远团队针对黄芪根腐病研发新型生物抑菌剂。该抑菌剂不仅能抑制根腐病,还能促进黄芪生长代谢。相关成果已发表于国际期刊《化学工程杂志》。黄芪素有“补药之长”美誉,被《本草纲目》誉为药材上品。现代医学研究表明,黄芪含有三萜皂苷、黄酮等有效成分,还含有多种氨基酸、叶酸等微量元素,有

《废电池污染防治技术政策》解读

  ●锂离子电池逐年增多,含汞电池已退出民用市场,废电池的种类、数量相比十几年前都发生了巨大的变化,带来的环境风险不可忽视。  ●焚烧已成为特大城市主流的垃圾处理方式,生活垃圾如混入废电池,可能产生环境风险。应避免废电池进入生活垃圾焚烧装置或堆肥发酵装置。  ◆中国环境报记者郭薇  环境保护部于去年

临床生化数据简要分析

 1.检验前质量控制 :取样中的错误:采血时不顺利可导致溶血;标本量不足,取材时间不当,标本容器不适当,取样位置不当,标本储存不当,体位的影响,口服药物的影响等。溶血会影响很多项目: 影响比较明显的有ALT,AST,CKMB,LDH,GGT,血钾,铁, 使某些结果假性偏高或假性降低,无法准确测定;

临床生化数据简要分析

 1.检验前质量控制 :取样中的错误:采血时不顺利可导致溶血;标本量不足,取材时间不当,标本容器不适当,取样位置不当,标本储存不当,体位的影响,口服药物的影响等。溶血会影响很多项目: 影响比较明显的有ALT,AST,CKMB,LDH,GGT,血钾,铁, 使某些结果假性偏高或假性降低,无法准确测定;

数据增强在单细胞测序数据分析中的应用案例有哪些?

以下是一些数据增强在单细胞测序数据分析中的可能应用案例:  1. 增加细胞样本数量    - 假设初始研究只有少量特定疾病状态下的单细胞样本,通过对现有样本的数据进行随机采样、翻转、添加微小噪声等操作,生成更多的“虚拟”样本,从而增加训练数据量,提高模型对该疾病状态下细胞特征的学习能力。  2.

赫捷院士:我国肿瘤大数据刚刚起步

  “恶性肿瘤已成为严重危害我国人们健康的重大疾病。但我国却尚未建立以医院为基础的癌症监查网络,缺乏全国肿瘤诊疗状况的权威数据,这就会导致肿瘤防治、临床研究、指南制定、政府决策等带有一定盲目性。”  7月29日,在中国卫生信息学会健康医疗大数据肿瘤专业委员会暨慢病防治联盟指导委员会成立大会上,中国科

测序技术如何助推精准医学?

主要应用领域基因测序的一个重要应用是测出生缺陷,包括单基因病、遗传病、无创产前、基因检测,这是目前应用的最多、最成熟的产业。整个肿瘤基因组结构非常复杂,一个肿瘤基因组数据量大约有几十个G,要完整地测一个肿瘤单细胞,则需要更多工具,数据量也更大。移植配型白血病、骨髓配型,包括基因身份证和整个的器官移植

Illumina宣布测序技术大创新

  生物通报道 Illumina公司近日宣布了一系列产品和技术上的创新,从样品制备到系统改进再到数据分析,这有望带来基因组研究上的新突破。随着平台的不断改进,测序速度、准确性、产量和流程都有望改善。   样品制备新品   简化和加速样品制备的过程对改善测序流程和降低周转时间至关重要,这也是测

概述DNA测序技术的操作

  成功地使用银染测序系统需要对提供的操作方法进行仔细考虑。银染不如放射性检测法灵敏,而需要更多的模板量,此外,也不可能通过延长X-光胶片曝光时间的方法增加信号强度。因此,请使用推荐的DNA模板量, 每次均使用所提供的对照检查系统的可靠性,并且注意如下几点:  (1) DNA的浓度和纯度必须经过琼脂

关于DNA测序技术的概述

  人类基因组这部由A、T、G、C四个字母组成的卷帙浩繁的生命天书如同一座宝库,保藏着几千年来人们迫切想知道的秘密,DNA测序技术就好似“芝麻开门”这样的咒语,是我们打开宝库的金钥匙。世界上第一个测定DNA序列的方法是由英国生化学家弗雷德里克·桑格尔发明的。自此DNA测序的速度就一直呈加速态势。20

基因测序技术的应用介绍

英国伦敦大学学院和美国罗格斯大学的联合研究团队,将基因测序技术和超级计算机技术相结合,试图探索解决这一命题。研究人员把艾滋病(HIV)蛋白酶分子作为对象,酶在不同人体中形状略有不同,尤其是在蛋白质活动区,在那里酶完成切片并构成了下一个病毒,进而形成特定的病毒基因序列。如果知道了酶的形状,就可以找到相

NGS基因测序技术是什么

美国第三代试管婴儿的NGS基因测序技术是新一代的PGS基因筛查技术的升级技术,整体来说,NGS技术具有通量大、时间短、精确度高和信息量丰富等优点,使麦沃海外试管婴儿专家可以在短时间内对基因进行精确定位,对于临床诊断和保障麦沃试管成功率起到事半功倍的作用。NGS基因测序技术需要7~14天的时间才能出具

基因测序技术发展论坛

  由科技部批准,中国分析测试协会主办的第十六届北京分析测试学术报告会暨展览会(BCEIA 2015)将于2015年10月27—30日,在北京国家会议中心举办。除大会报告和分会报告之外,以“生命科学”和“科学仪器应用及检测技术发展”为主题的学术论坛也将如期举行。  “生命科学”学术论坛中“基因测序技

基因测序技术的主要应用

英国伦敦大学学院和美国罗格斯大学的联合研究团队,将基因测序技术和超级计算机技术相结合,试图探索解决这一命题。研究人员把艾滋病(HIV)蛋白酶分子作为对象,酶在不同人体中形状略有不同,尤其是在蛋白质活动区,在那里酶完成切片并构成了下一个病毒,进而形成特定的病毒基因序列。如果知道了酶的形状,就可以找到相

NGS基因测序技术是什么

美国第三代试管婴儿的NGS基因测序技术是新一代的PGS基因筛查技术的升级技术,整体来说,NGS技术具有通量大、时间短、精确度高和信息量丰富等优点,使麦沃海外试管婴儿专家可以在短时间内对基因进行精确定位,对于临床诊断和保障麦沃试管成功率起到事半功倍的作用。NGS基因测序技术需要7~14天的时间才能出具

DNA测序技术的分类介绍

  高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。  根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同

DNA测序技术的发展历史

70年代末,WalterGilbert发明化学法、FrederickSanger发明双脱氧终止法手动测序,同位素标记80年代中期,出现自动测序仪(应用双脱氧终止法原理)、荧光代替同位素,计算机图象识别90年代中期,测序仪重大改进、集束化的毛细管电泳代替凝胶电泳2001年完成人类基因组框架图

AFDIL:DNA测序技术鉴定

  1972年,美国空军中尉Michael Joseph Blassie在越南战争中牺牲。因无法确认身份,Blassie的遗体被埋葬在无名烈士墓中,供人们瞻仰。直至1998年,经过线粒体DNA检测, Blassie中尉的遗体才得以确认,并运回家乡。从此,DNA测序开始在鉴定美国士兵残骸中发挥

浅议基因测序技术的代际

相对于较早出现的Sanger双脱氧核苷酸测序技术(简称Sanger测序),2005年后出现的NGS测序技术,使得基因组研究进入高通量时代,促进了基因组学科学研究及技术转化应用。在基因组学领域,NGS通常是next-generation sequencing的缩写,意为下一代或者新一代测序技术,亦

PCR技术(十六):PCR产物测序

PCR技术代替了为测序而反复进行的分子克隆和模板制备步骤。PCR技术与自动测 序技术相结合后,它将成为一种最快、最有效的测定核苷权序列的方法。本章主要综 述各种测模板的制备以及如何完成PCR产物的直接测序。与传统的将PCR片段克隆入质 粒或病毒基因组相比,直接序列分析有两个主要的优点:1)由于它是一

NGS基因测序技术是什么

美国第三代试管婴儿的NGS基因测序技术是新一代的PGS基因筛查技术的升级技术,整体来说,NGS技术具有通量大、时间短、精确度高和信息量丰富等优点,使麦沃海外试管婴儿专家可以在短时间内对基因进行精确定位,对于临床诊断和保障麦沃试管成功率起到事半功倍的作用。NGS基因测序技术需要7~14天的时间才能出具

基因测序技术引发ZL官司

  两家企业围绕英国牛津纳米孔技术公司研发的紧凑型纳米孔测序设备大动干戈。图片来源:nanoprotech.com  一种价格低廉、方便携带的DNA测序方法,即纳米孔测序正待起飞,但该技术已经引发一家产业巨头和一家备受瞩目的创业公司之间的法律战争。近日,控制着基因测序产业的亿明达公司对牛津纳米孔技术

高通量测序技术SOLiD简介

目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligat

高通量测序技术及原理

高通量测序技术及原理介绍如下:1.什么是高通量测序高通量测序技术也被称作二代测序技术(Next Generation Sequencing, NGS),这是相对一代测序技术(Sanger Sequencing)而言的,同时由于高通量测序的出现使得我们能对一个物种的基因组和转录组进行全面、细致的分析成