中大绘出广东食管鳞状细胞癌遗传变异图谱

由中山大学肿瘤防治中心贾卫华教授领衔,中山大学、美国NIH等多家机构的科研人员组成的国际合作团队,基于新一代测序技术、基因的表达谱分析、体内外实验以及大量临床数据,对食管鳞状细胞癌的全基因组变异进行了历时五年的研究,绘制出广东食管鳞状细胞遗传变异图谱。 广东是食管癌高发大省,人群具有独特的遗传背景及生活习惯。从全基因组水平,全面、系统揭示广东食管鳞癌特有的体细胞遗传变异图谱,进而发现影响预后及靶向治疗的遗传变异,无疑对解析食管癌的发病机理、推动临床治疗方法的研究具有极大价值。由贾卫华教授领衔的该项研究系统地揭示了广东食管鳞癌的癌症基因组学特征,尤其是发现了一系列新的影响癌症转归和生存的基因突变(如VANGL1)、基因异常表达(如miR-4707-5p)和特征性的染色体结构变异,并进行了深入的体内外实验研究和癌症信号通路研究。贾卫华教授团队通过对67个广东食管鳞癌患者的肿瘤及癌旁正常组织进行全基因组或外显子组测序发现,同中国......阅读全文

如何读懂空间转录组测序数据结果

  空间转录组学研究是很多老师非常感兴趣的一种最新组学研究技术。做完空间转录组测序后,能拿到哪些结果,是不是存在买家秀和卖家秀的差距?本期,生物芯片生物信息团队利用已发表数据的实操分析,为大家展示空间转录组测序数据结果。   我们分析了来自10x Genomics 的Visium技术生成的某肿瘤生

如何读懂空间转录组测序数据结果

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数据增强会对单细胞测序数据的质量产生什么影响?

数据增强可能对单细胞测序数据的质量产生以下几方面的影响:引入噪声数据增强过程中添加的随机噪声或对数据的随机变换可能会在一定程度上干扰原始的基因表达信号,从而影响数据的准确性。潜在的生物学失真如果数据增强的方法不合理,可能会导致生成的数据偏离真实的生物学过程和细胞状态,从而使分析结果产生偏差。数据分布

时空分辨单细胞测序技术的临床应用存在哪些挑战?

时空分辨单细胞测序技术的临床应用面临以下一些挑战:技术复杂性和成本该技术的操作流程较为复杂,需要专业的设备和技术人员,这增加了临床应用的难度和成本。高昂的费用可能限制其在大规模临床实践中的普及。样本采集和处理获得高质量、能准确反映体内真实情况的样本存在一定难度,尤其是在保持细胞的空间结构和生物活性方

时空分辨单细胞测序技术在临床应用中的实际案例

时空分辨单细胞测序技术在临床应用中的实际案例:肿瘤研究在肺癌研究中,通过时空分辨单细胞测序技术,发现了肿瘤组织中不同区域的癌细胞具有独特的基因表达模式和免疫细胞浸润情况。这有助于深入了解肿瘤的异质性,为制定更精准的治疗策略提供依据,例如针对特定区域的癌细胞选择更有效的靶向药物。神经系统疾病对于脑胶质

中国医学界专家欢迎基因测序技术走入临床

  来自中华医学会北京分会、北京同仁医院、江苏省中医院、Life Technologies等医疗和技术机构的专家,在近日召开的"北京同仁医院基因测序技术临床应用学术研讨会"上纷纷表示欢迎基因测序技术进入临床。本次研讨会由中华医学会北京分会检验分会主办,首都医科大学附属北京同仁医院承办,Life Te

创新ctDNA高通量测序技术让临床不再“盲人摸象”

  安可济(AccuraGen)公司联合创始人兼科研总监赵奇志(Grace Zhao)博士  在3月6日-11日举行的旧金山分子医学三方会议(The Molecular Medicine Tri-Conference)上,安可济(AccuraGen)公司的联合创始人兼科研总监赵奇志(Grace Zh

时空分辨单细胞测序技术在临床上的应用前景如何?

时空分辨单细胞测序技术在临床上具有广阔的应用前景:肿瘤诊断和治疗早期诊断:可以检测到肿瘤发生早期的少量异常细胞,提高诊断的敏感性。精确分型:确定肿瘤的分子亚型和异质性,为个性化治疗方案提供依据。治疗监测:实时跟踪肿瘤细胞在治疗过程中的变化,评估治疗效果,及时调整治疗策略。免疫治疗评估分析免疫细胞在肿

肿瘤愈后监控:一个可能被忽略的基因测序刚需市场

  2015年被业内称为基因测序临床应用的元年。  4月8日,浙江迪安诊断技术股份有限公司(下称“迪安诊断”)发布公告称,其全资子公司杭州迪安医学检验中心有限公司取得了第一批“肿瘤诊断与治疗项目高通量基因测序技术临床应用试点”资格。  “公司将积极研究肿瘤筛查与靶向药物伴随诊断技术等,为肿瘤病人设计

DNA的测序技术1

DNA序列的正确测定,是进行基因结构和功能分析,绘制基因图谱、转基因检测等方面工作的重要前提。同时DNA测序技术为快速、简捷分析蛋白序列及结构提供了工具。DNA序列测定技术是在DNA内切酶、合成酶的应用,基因克隆及亚克隆技术,高分辨率聚丙烯酰胺变性胶电泳技术等基础上建立起来的。这些技术主要有三部分组

基因测序的技术原理

  基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。[2]  自上世纪90年代初,学界开始涉足“人类基因组计划”。而传统的测序方式是利用光学测序技术。用不同颜色的荧光标记四种不同的碱基,然后用激光光源去捕捉荧光信号从而获得待测基因的序列信息。[2]  虽然这种方法检测可靠,但是价格不菲也是有目共睹的

二代测序技术

人们常说“事后诸葛亮”,可见“料事如神”是一个让人艳羡的能力。现代科技的发展让人们无限接近这种能力,天气预报就是现代人诸多“料事如神”本领中的一种,不断进步中切实提高了生活品质与舒适度。个人体会进步主要体现在两个方面:1.越来越说人话。印象里小时候听天气预报感觉听的是中文,但是这些中国话想表达什么听

什么是DNA测序技术?

DNA测序技术系指分析DNA碱基构成和碱基顺序的技术,即用于确定DNA片段中腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)的构成和排列方式。一般采用双脱氧链终止法进行DNA测序。其原理是利用2',3'-双脱氧核苷三磷酸(2',3'-ddNTP)作为链终止试剂

DNA的测序技术3

(二):测序胶的制备1:玻璃板的处理A,长板(不带凹槽、反硅化处理,粘胶板) a,2N NaOH浸泡1小时以上,自来水冲洗,海绵或软布蘸洗涤剂将板清洗干净,自来水冲洗掉全部洗涤剂,无离子水中过三遍,晾干。b, 在1ml95%乙醇,0.5%冰乙酸中加入5μl粘合硅烷。c, 用b中所配溶液浸

高通量测序技术包括

高通量测序技术及原理介绍如下:高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(“Next-generation” sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。测序技术推进科学研

基因测序的技术原理

  基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。[2]  自上世纪90年代初,学界开始涉足“人类基因组计划”。而传统的测序方式是利用光学测序技术。用不同颜色的荧光标记四种不同的碱基,然后用激光光源去捕捉荧光信号从而获得待测基因的序列信息。[2]  虽然这种方法检测可靠,但是价格不菲也是有目共睹的

DNA测序技术的简介

DNA测序技术,又叫基因测序技术。人类基因组这部由A、T、G、C四个字母组成的卷帙浩繁的生命天书如同一座宝库,保藏着几千年来人们迫切想知道的秘密,DNA测序技术就好似“芝麻开门”这样的咒语,是我们打开宝库的金钥匙世界上第一个测定DNA序列的方法是由英国生化学家弗雷德里克·桑格尔发明的。自此DNA测序

DNA的测序技术4

3,染色,将胶板移至染色液中,摇床震荡30分钟。 4,凝胶洗涤,将染色后的胶板,放入超纯水中2-3秒后,迅速取出并竖起控水,随后把胶板放入预冷的显影液中(用量为总量的1/2),充分震荡,当第一批条带后,把胶板移入预冷的另一半显影液中,震荡,直至全部条带出现。 注意:从放入水到放入

基因测序技术大升级

  DNA就像是漆黑的夜里萤火虫发的光,第二代测序技术无法辨别每一只萤火虫,所以就把上千只萤火虫放在同一个袋子里,才能收集到它们的光。但第三代技术却可以辨别每一只萤火虫,而且可以同时测量很多个DNA片断。 日前,南方科技大学生物系副教授贺建奎与另外几名中美科学家联合在生物医学杂志BioRxiv上

DNA测序技术的介绍

  DNA测序技术,又叫基因测序技术。  人类基因组这部由A、T、G、C四个字母组成的卷帙浩繁的生命天书如同一座宝库,保藏着几千年来人们迫切想知道的秘密,DNA测序技术就好似“芝麻开门”这样的咒语,是我们打开宝库的金钥匙。世界上第一个测定DNA序列的方法是由英国生化学家弗雷德里克·桑格尔发明的。自此

PCR测序技术的应用

PCR测序是对生物遗传信息的最终判定。随着各种基因组计划的开展,PCR测序工作在不断加强和完善,特别是全自动DNA测序仪的开发,为提前完成人类基因组计划奠定了基础。此外,在临床遗传病、传染性疾病和癌症的基因诊断、农业畜牧业的动植物育种、法医鉴定等领域上有广泛的应用前景。过去由于全自动DNA测序的仪器

【技术】基因测序那些事

  最早的时候,基因测序只能应用于科研之上,是遗传学及分子生物学一个重要的科研工具。随着测序技术的发展,测序价格大大降低及测序仪的能力越来越高,测序技术应该不仅仅局限于科研市场,越来越多的人想要将测序这种分子生物学技术应用到面向大众的普通消费市场,特别是医疗市场和临床市场,一旦测序技术在这些市场进行

Illumina-测序技术原理概述

基因的变异类型有多种(点击查看),对应的分子检测方法亦有多种,针对不同的需求,都有对应的理想检测方法,每个检测平台都有着自己的优势,比如:操作简单:PCR,ARMS-PCR,HRM等时间快速:ARMS-PCR,HRM等成本低:PCR,PCR-RFLP,MassARRAY等准确:Sanger等通量高:

DNA测序技术的介绍

  DNA测序(DNA sequencing,或译DNA定序)是指分析特定DNA片段的碱基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)与鸟嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA测序方法的出现极大地推动了生物学和医学的研究和发现。  在基础生物学研究中,和在众多的应用领域,如诊断,生物技术,法医

DNA的测序技术2

一:仪器:离心机,PCR仪,高压电泳仪, 测序槽 ,摇床 ,染色,脱色缸易生物仪器库:http://www.ebioe.com/yp/product-list-42.html易生物试剂库:http://www.ebioe.com/yp/product-list-43.html二:试剂:测序反应试剂

基因测序的技术原理

基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。  自上世纪90年代初,学界开始涉足“人类基因组计划”。而传统的测序方式是利用光学测序技术。用不同颜色的荧光标记四种不同的基因,然后用激光光源去捕捉荧光信号从而获得待测基因的序列信息。  虽然这种方法检测可靠,但是价格不菲也是有目共睹的,一台仪器的价格

基因测序的技术原理

基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。  自上世纪90年代初,学界开始涉足“人类基因组计划”。而传统的测序方式是利用光学测序技术。用不同颜色的荧光标记四种不同的基因,然后用激光光源去捕捉荧光信号从而获得待测基因的序列信息。  虽然这种方法检测可靠,但是价格不菲也是有目共睹的,一台仪器的价格

测序新技术速览

454技术 样品制备  将基因组打成较短的DNA片段,再将片段与接头相连,以便使其更容易与磁珠结合在一起(一个DNA片段结合于一个磁珠)。将PCR产物包被于“油包水”的乳化剂中,每一滴乳化剂内除PCR产物外,还含有一个结合了一个DNA片段的磁珠,这样,PCR扩增过程就可以在每一滴乳化剂内独立进行,而

基因测序技术的原理

基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。自上世纪90年代初,学界开始涉足“人类基因组计划”。而传统的测序方式是利用光学测序技术。用不同颜色的荧光标记四种不同的碱基,然后用激光光源去捕捉荧光信号从而获得待测基因的序列信息。 最新的基因测序仪中,芯片代替了传统激光镜头、荧光染色剂等,芯片就是测序

基于高通量测序技术(NGS)的肿瘤基因变异检测伴随诊断试剂的检测范围

  基于高通量测序技术(NGS)的肿瘤基因变异检测伴随诊断试剂的检测范围可以包括哪些基因及位点?  基于高通量测序技术(NGS)检测人福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本的肿瘤基因变异检测伴随诊断试剂,针对特定的适应证,其检测范围基于方法学特点一般包括多个变异基因及变异位点。  上述变异基因及位