科学家发现奇异基因序列或来自全新生物域

沃斯的“三域说”是目前生物分类界的主流学说。 “科学坏小子”文特尔(左)参与了这次的研究项目。 在过去的近300年中,生物分类法从两界、三界一直被扩充到六界三域,分类系统不断被改写。然而,演化树的改写可能还会继续下去。美国加州大学基因中心和文特尔研究所对海洋水样本中的DNA序列分析的合作研究发现,地球上可能存在着三个域之外的生物。外环境入手测DNA序列 这个发现十分惊人,其可能改写从上世纪90年代以来延续的主流生物分类学法。研究是加州大学戴维斯分校基因中心的艾森(Jonathan Eisen)领头所做。他与同事们提取了一部分海洋水样本中的DNA进行分析,发现这些样本基因序列十分不同寻常,和人们平时所知的细胞生物似乎关系非常疏远,完全像是来自另外一个全新的生物域。 基因分析是目前用来进行生物分类和判断的好工具。我们星球上大部分的物种并非日常所见的动植物,而是看上去像是一个个单一细胞的低等生物体,如果要判断它......阅读全文

缺觉如何影响肥胖Science子刊给出解释

  导读:睡眠不足容易引发肥胖。这是为什么呢?2018年8月22日,《Science Advances》期刊刊载的一篇研究揭示:一次睡眠不足就会对人体的基因表达、代谢产生特定的影响。这或许可以解释为什么轮班工作、长期睡眠不足会损伤新陈代谢,并对身体造成负面影响。   缺觉如何影响肥胖?Scienc

Science发布蛋白质组研究重大成果

  学家们在新研究中揭示了人类巨细胞病毒(HCMV)令人惊讶的、复杂蛋白质编码能力,该发现是朝着了解感染过程中这一病毒操控人类细胞的机制所迈出的重要的第一步。20多年前研究人员首次对HCMV基因组进行了测序,现在他们又对这一常见病原体的蛋白质组(proteome,整套的表达蛋白)进行了研究。   

新发现蓝菌对氮气情有独钟

据11月14日的《科学》(Science)杂志报道说,海洋中的蓝菌通常被认作是能够完成多种任务的细菌,它通过光合作用产生了大量的氧气,它能“固定”碳和氮,将这2种元素转化为在生物学上有用的形式。研究人员报告说,一组新近发现的蓝菌则反其道而行之,它只专注于固氮,而无需生产氧气和固定碳所需的遗传学机器。

科学家呼吁关注全球基因组数据库污染

样品处理有可能是导致DNA数据库广泛污染的最主要原因  2月16日发表在《公共科学图书馆·综合》(PLoS ONE)期刊上的一份研究报告称康涅狄格大学的遗传学家Mark Longo及同事发现由顶级公共测序机构提供的测序结果构建的基因组数据库中的大约1/5的细菌、植物和非灵长类动物基因

重叠基因的调控序列

①在5′端转录起始点上游约20~30个核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。TATA框是一个短的核苷酸序列,其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序,它是RNA聚合酶的重要的接触点,它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时,mRN

父亲的“垃圾DNA”也作怪,突变或导致后代患自闭症

  过去的十年里,科学家们鉴定出了数百个似乎能影响大脑发育,增加患自闭症风险的基因变异。而这些基因变异主要是发生在DNA中能直接编码蛋白质的区域(即编码区)。现在,一项调查所谓非编码DNA的新研究发现,调节基因活性的DNA区域(即非编码区)的改变也可能会导致自闭症,且令人惊讶的是,这些变异倾向于遗传

研究揭示海洋玫瑰杆菌有机硫二甲基巯基丙酸代谢的调控机制

  近日,山东大学教授张玉忠团队与英国东英吉利大学教授Jonathan D Todd合作,阐明海洋玫瑰杆菌中二甲基巯基丙酸两条竞争代谢途径的协同调控机制,揭示为海洋细菌响应二甲基巯基丙酸浓度变化、平衡抗逆与代谢利用的分子机制,填补了海洋二甲基巯基丙酸代谢调控机制空白,为解析海洋硫循环与全球气候变化的

特殊基因突变或与人类机体多种复杂特性直接相关

  最近,一项刊登在国际杂志Nature Genetics上的研究报告中,来自加利福尼亚大学等机构的科学家们通过研究发现,人类基因组中难以研究的突变—短串联重复序列(short tandem repeats, STRs或微卫星)或能参与与机体复杂性状相关的基因的表达过程,这些性状包括精神分裂症、炎性

人类携带的其他生物100种以上的基因简介

人类体细胞中的DNA,并不完全是由亲代遗传得到的,还含有其他生物100种以上的基因。从细胞内的遗传物质来说,人类已经不是完全的人类了。每个人都可能含有细菌、单细胞生物、病毒等多达145个基因。这是一项新研究得出的结论,它提供了进化史中其他生物的基因成为动物细胞一部分的一些证据。“这意味着生命之树不是

DNA碱基序列决定其光敏性

DNA分子在所有生命形态中扮演着遗传信息载体的角色,对紫外光的修改具有高度的抵抗性,但要理解其光稳定性的机制还存在一些令人费解的问题,一个重要方面是构成DNA分子的4种碱基之间的相互作用。德国基尔大学的研究人员成功地证明,DNA链因其碱基序列而有不同的光敏感性。相关研究结果刊登在最近出版的《科学》(

细菌DNA序列可作信息“存储器”

  阿根廷科学家近日成功将该国国歌旋律以人工基因编码形式植入某种细菌染色体中。这一方法不仅可以用来存储音乐旋律,还可能发展为一种拥有巨大应用潜力的信息存储方式。   据阿根廷媒体报道,主持研究的阿根廷信息生物学家费德里克·普拉达介绍说,生物的DNA(脱氧核糖核酸)由四种脱氧核苷酸组成,即腺嘌呤、胸

双脱氧链终止法测定DNA序列

[目的] 掌握双脱氧链终止法测定DNA序列的原理与方法[原理]DNA聚合酶催化的DNA链延伸是在3’-OH末端上进行的。由于2’,3’-双脱氧三磷酸核苷酸(ddNTP)的3’-位脱氧而失去游离-OH,当它参入到DNA链后,3’-OH末端消失,使DNA链的延伸终止。本实验根据此原理,将待测DNA片段插

细胞化学基础着丝粒DNA序列

着丝粒DNA 序列(centromere DNA sequence,CEN):着丝粒确保复制了的染色体能够平均分配到子细胞中。它在间期及分裂期具有多种功能。着丝粒参与细胞周期的关卡调控并在间期能与核仁蛋白发生互作。着丝粒是动粒形成的位点,它位于染色体表面,在有丝分裂时结合微管并调控染色体运动。

核酸序列分析实验

实验方法原理针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因,找出基因的位置和功能位点的位置,以及标记已知的序列模式等过程。在此过程中,确认一段 DNA 序列是一个基因需要有多个证据的支持。一般而言,在重复片段频繁出现的区域里,基因编码区和调控区不太可能出现;如果某段 DNA 片段的假想产物与某个已知的蛋

SLAS-2013分会:美国年会创新计划奖项的侯选者及获得者

  2013年6月6日,实验室自动化与筛选协会2013亚洲会展在上海金茂君悦大酒店盛大开幕,国内外知名药企、生物医学研究专家、学者等应邀参会。“美国年会创新计划奖项的候选者及获得者”报告分论坛于6月7日下午举行,由RainDance科技研发副总裁Darren R.Link博士、百时美施贵宝公司高级研

九大测序平台对比(四)

5.Helicos企业: Helicos Biosciences推出时间: 2008年主流型号: HeliScope™ Single Molecule Sequencer(2008年推出)样品要求: 1-3 μg,起始DNA体积不超过100 μL.测序原理: 边合成边测序,可逆阻断测序待测DNA被随

Science特刊:人体遗传学

  DNA用其严谨的精确性,决定了每个人的分子结构,生理性状和健康功能,这也令遗传学成为了最重要的科学之一。9月28日Science杂志以“Human Genetics”为题,探讨了最近几年间人体遗传学领域的最新进展,并介绍了要想真正了解人类本性和疾病,我们所面临的挑战。  在特刊综述中,Jay S

第二代测序技术:高速发展的高通量测序技术

高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测

Science:成功构建秀丽隐杆线虫发育的分子图谱

  在一项新的研究中,来自美国宾夕法尼亚大学等研究机构的研究人员首次详细描述了动物胚胎发育过程中每个细胞是如何变化的。他们使用了新兴的单细胞生物学领域的最新技术来分析秀丽隐杆线虫胚胎中的细胞。相关研究结果于2019年9月5日在线发表在Science期刊上,论文标题为“A lineage-resolv

揭秘阿尔兹海默病患者如何失去对基因活性的控制?

  阐明大脑中控制基因活性的分子机制或能帮助理解阿尔兹海默病的发病机理,近日,一项刊登在国际杂志Nature Neuroscience上的研究报告中,来自英国埃克塞特大学的科学家们通过研究揭开了基因活性指示器和阿尔兹海默病的发病关联,相关研究或为后期科学家们开发治疗阿尔兹海默病的新型疗法提供新的思路

NatureGenetics:最大规模精神分裂症全基因组扫描

――超过41,000位患者的全基因组扫描,揭示了携带精神疾病极大风险的“拷贝数变异”目前发现的许多增加精神分裂症患病风险的遗传变异都是罕见突变,因此很难分析其在疾病中的作用。为了解决这一问题,加州大学圣地亚哥分校的医学院Jonathan Sebat博士研究组完成了目前为止最大的全基因组研究,分析了超

基因组所开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT

  中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员,带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT(Parallel Alignment and back-Translation)”。该研究成果发表在Biochemical and Biop

蚜虫核基因EF1-alpha基因序列测定及系统发育分析

实验概要核基因含有更加丰富的遗传信息,生物的性状基本上是由核基因决定的,用适当的核基因研究昆虫的系统发育,结果更有可能真实地反映昆虫的进化历史。本研究采用DNA序列分析法,对三种蚜虫的核基因EF-1 alpha进行比较,通过系统发育树分析了它们的系统进化。这一结果结合三种蚜虫的mtDNA的C

基因序列仪的分类介绍

根据电泳类型分为平板型电泳和毛细管电泳两类:1. 平板型电泳:平板型电泳的凝胶灌制在两块玻璃板中,聚合后厚度一般小于0.4mm或更薄,因此又称为超薄片层凝胶电泳。是经典的电泳技术,具有样品判读序列长(600-900bp)、一块凝胶板上可同时进行多个样品测序的优点。2. 毛细管电泳:将凝胶高分子聚合物

什么是基因的核心序列?

中文名称核心序列英文名称core sequence定  义重复序列共有的核苷酸序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

科学家发现奇异基因序列或来自全新生物域

沃斯的“三域说”是目前生物分类界的主流学说。  “科学坏小子”文特尔(左)参与了这次的研究项目。  在过去的近300年中,生物分类法从两界、三界一直被扩充到六界三域,分类系统不断被改写。然而,演化树的改写可能还会继续下去。美国加州大学基因中心和文特尔研究所对海洋水样本中的DNA序列分

两篇Cell文章:发布CRISPR研究重大突破

  发表于10月9日《细胞》(Cell)杂志上的两篇研究论文中,来自加州大学旧金山分校的科学家报告称他们应用一种新型的、精确的方法开启和关闭了细胞内的基因。这一成果有可能促成更好地了解疾病以及开发出新的治疗方法。  这一研究进展的核心是一个叫做SunTag的新发明。SunTag实质上是一套分子挂钩,

遗传学大牛Science发现基因组新奥秘

  来自斯坦福大学,霍德华休斯医学院的一组研究人员发现,当基因组中相似的基因不断“弹出来”的时候,通常这些基因会丢失,但如果能被留下来(也就成为了多余基因),就会由于一个基因发生一次表达消减这一理论,而在哺乳动物中受到保护。  这一研究成果公布在5月20日的Science杂志上。文章的通讯作者是斯坦

我国科学家开发高效基因组序列分析工具

  人类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异,往往由DNA序列变化造成,这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通过比对大量人群的遗传信息,利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学

我国科学家开发高效基因组序列分析工具

  类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异,往往由DNA序列变化造成,这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通过比对大量人群的遗传信息,利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学的