中科院PLOS发表RNA编辑新成果

7月28日,来自中科院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组、上海巴斯德研究所郝沛研究组以及密歇根州立大学王红兵教授,在国际著名遗传学期刊《PLOS Genetics》发表一项合作研究,题为“The Landscape of A-to-I RNA Editome Is Shaped by Both Positive and Purifying Selection”。这项研究通过对多生物物种RNA编辑事件的系统发现和分析,首次揭示了RNA编辑表观遗传学位点的系统进化规律,以及其在动物神经功能和神经发育中发挥的主要作用。 自从20年前第一次被发现以来,RNA编辑已经成为多种生命形式的遗传编码变异的重要来源。RNA编辑的一个突出机制是,前体mRNA分子中腺苷的去氨基。脱氨基的事件,即A-to-I编辑,将特殊的腺苷(A)转换为肌苷(I)。在翻译中,肌苷被解码为鸟苷(G),从而导致密码子的变化,往往会引起蛋白质产物中的氨基酸......阅读全文

RNA编辑:肿瘤和遗传疾病治疗的新选择

  2018年,美国FDA和欧洲EMA批准了来自RNA药物制造两大巨头Ionis Pharmaceuticals公司的反义寡核苷酸疗法药物Tegesedi(Inotersen)和Alnylam Pharmaceuticals公司的siRNA疗法药物Onpattro(Patisiran),用于治疗遗传

DNA碱基编辑器或能诱导大量脱靶RNA突变!

  DNA碱基编辑方法能够直接在基因组DNA中进行点突变的校正,同时并不会产生任何双链的断裂(DSBs,double-strand breaks),但潜在的脱靶效应常常限制了这些方法的应用,腺相关病毒(AAV)是DNA编辑基因疗法中最常用的传递系统,由于这些病毒能够在体内持续维持基因表达的功能,因此

《自然》子刊:升级版RNA编辑技术效率变高

  近日,北京大学教授、博雅辑因科学创始人魏文胜实验室在Nature Biotechnology 发文,报道了RNA单碱基编辑技术“LEAPER”的升级版本,升级后该技术可大幅提升体外和体内编辑的效率和精准性。  LEAPER(Leveraging endogenous ADAR for progr

基因组分析揭示等位基因特异RNA编辑现象

  核糖核酸(RNA)编辑是RNA水平一种常见的修饰,是增加基因转录和功能多样性的重要形式。17日,来自中科院昆明动物研究所的消息,由张亚平院士领导的、多个研究机构加盟的团队,在等位基因特异的RNA编辑研究上取得了重要进展。  中科院昆明动物研究所周中银博士介绍,对二倍体生物来说,虽然两个等位基因的

张锋连发Science,Nature文章:CRISPR下个技术趋势—RNA编辑

  10月25日Science发表了CRISPR技术先驱张锋研究组的最新成果:RNA editing with CRISPR-Cas13,咋一看这个标题还以为是张锋一稿多投,因为实在是与本月初他们研究组发表在Nature的论文标题太像了(Nature论文:RNA targeting with CRI

Nature子刊:最大、最精确的RNA编辑位点列表

  由布朗大学领导的一个研究小组编译出了一份最大型、经最严格验证的果蝇RNA编辑位点列表。该研究生成了关于这一模式生物基础生物学的一些新见解,研究结果发表在9月29日的《自然结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。   这一“主列

基因组分析揭示等位基因特异RNA编辑现象

核糖核酸(RNA)编辑是RNA水平一种常见的修饰,是增加基因转录和功能多样性的重要形式。17日,来自中科院昆明动物研究所的消息,由张亚平院士领导的、多个研究机构加盟的团队,在等位基因特异的RNA编辑研究上取得了重要进展。 中科院昆明动物研究所周中银博士介绍,对二倍体生物来说,虽然两个等位基

Science:从结构上揭示布氏锥虫RNA编辑机制

  作为美国波士顿大学的分子生物学家和夫妻,Ruslan Afasizhev和Inna Afasizheva已经合作了几十年。他们共同发表了数十篇关于单细胞致病寄生虫---布氏锥虫(Trypanosoma brucei)---线粒体DNA和RNA机制的论文。如今,在一项新的研究中,他们详细介绍了一种

我国科学家开发出一种新型RNA编辑系统

  使用工程核酸酶的基因组编辑技术,比如锌指核酸酶(ZFN)、转录激活因子样效应物核酸酶(TALEN)和CRISPR系统中的Cas蛋白已被用于操纵许多有机体的基因组。最近,科学家们已将胞苷脱氨酶或腺苷脱氨酶与CRISPR-Cas9融合在一起,构建出可编程的DNA碱基编辑器,从而为校正致病性突变提供新

常兴研究组发现RNA剪接基因编辑的新方法

  2018年10月5日,国际知名学术期刊《分子细胞》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康研究院)常兴研究组题为“Genetic modulation of RNA splicing with a CRISPR-guided cytidine deaminase”的最新研究成果。证明可

殷平教授Nature子刊解析植物RNA编辑的分子机制

  早在1989年研究人员就在植物中发现了RNA编辑的现象。2005年,第一个参与RNA编辑的蛋白因子被鉴定出来,发现它是一个PLS-type的PPR蛋白。近期来自华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室的研究人员报道了RNA编辑关键因子MORF蛋白可以和PLS-type PPR蛋白相互作用形成复报道

Nature发布CRISPR重大突破:可编程的RNA编辑工具

  一种用来编辑基因组中DNA指令的强大科学工具现在也可以应用于RNA。来自加州大学伯克利分校和劳伦斯伯克利国家实验室的一个研究人员小组,证实借助于一种方法可以编程CRISPR/Cas9蛋白复合物在序列特异性的靶位点识别并切割RNA。这一研究发现有可能改变RNA功能研究的模式,为检测、分析和操控RN

免费开源给学术研究,升级版CRISPR拓展RNA功能编辑

  近日,张锋团队再次升级CRISPR基因编辑系统,升级版的CRISPR通过靶向特定的RNA能够将致病蛋白扼杀在萌芽状态。该研究发表于Science。DOI: 10.1126/science.aax7063  基因编辑新品发布  张锋教授像极了基因编辑技术领域的“乔布斯”。张峰团队在基因编辑从无到有

基因编辑:经编程后杀死人细胞中RNA病毒的新技术

  世界上许多最常见或致命的人类病原体都是RNA病毒,比如埃博拉病毒、寨卡病毒和流感病毒,并且大多数都没有美国食品药品管理局(FDA)批准的治疗方法。在一项新的研究中,来自美国麻省理工学院、哈佛大学和布罗德研究所等研究机构的研究人员将一种CRISPR RNA切割酶转变为一种经编程后检测和破坏人细胞中

植物所发现四吡咯合成酶参与RNA编辑新机制

  四吡咯代谢途径广泛存在于动物、植物和微生物中,如人体内的血红素以及植物的叶绿素都经该途径合成,对包括呼吸作用和光合作用在内的生命活动具有不可缺少的作用。RNA编辑是真核生物的一种重要调控方式,可在基因序列不变的情况下产生蛋白质的多样性。之前,人们尚不清楚四吡咯代谢途径与RNA编辑两个迥然不同的过

上海生科院等揭示RNA编辑表观遗传位点的系统进化规律

  7月28日,PLOS Genetics 杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组题为The landscape of A-to-I RNA editome is shaped by both positive and purifying selection 的研究论文。

上海生科院等揭示RNA编辑表观遗传位点的系统进化规律

  7月28日,PLOS Genetics 杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组题为The landscape of A-to-I RNA editome is shaped by both positive and purifying selection 的研究论文。

美研究人员利用可编辑RNA疫苗技术发明寨卡病毒候选疫苗

  利用可编辑RNA疫苗技术,美国麻省理工学院的研究人员发明出一种寨卡病毒候选疫苗。这种疫苗由信使RNA簇构成,信使RNA簇被封装到一种纳米微粒中,一旦进入细胞,RNA将转译为蛋白质并引发宿主免疫反应。研究人员认为,这种疫苗效果如同合成病毒,但不是病原体、不会传染,人类可以控制疫苗表达的时间。因为它

进化分析揭示编码区和非编码区RNA编辑的功能调控效应

  2017年3月,国际知名学术期刊PLOS Genetics在线发表了斯坦福大学Jin Billy Li课题组和中山大学生命科学学院张锐课题组共同研究的题为“Evolutionary analysis reveals regulatory and functional landscape of c

华人科学家Nature子刊发文--或将突破诺奖RNA编辑技术

  一周多前,顶尖学术期刊《Science》杂志才刚刚报道著名学者张锋教授在基因疗法领域做出的潜在颠覆性变革。不到半个月,张锋教授团队又在《Nature》子刊《Nature·Biotechnology》发表一篇关于RNA编辑的重要论文。一些医药行业的知名媒体表示,这可能是RNA编辑的一大突破!   

营养所研究发现RNA编辑酶在细胞分泌过程中的调控功能

  最近,美国《实验生物学联合会会刊》 (The FASEB Journal)发表了中科院上海生命科学研究院营养所刘勇研究组在RNA编辑与细胞分泌功能研究方面所取得的最新进展——Deficiency in RNA editing enzyme ADAR2 impairs regula

根据RNA编辑位点定义与预后相关化疗敏感的LUAD患者亚型

    图像:LUAD患者RNA编辑亚型的鉴定。  肺腺癌(LUAD)的发病率呈逐年上升趋势,死亡率仍居高不下。LUAD基因组研究的最新进展已经确定了一些特定基因的驱动改变,从而实现了分子分类和相应的靶向治疗。然而,只有一小部分携带驱动突变的LUAD患者能从靶向治疗中获益,而剩余的大量患者未进行分类

我国学者研制CRISPRCas13a介导的精确定点RNA编辑人工机器

   国际学术期刊《Nucleic Acids Research》在线发表了中科院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所李轩研究组合作完成的题为“Implementation of the CRISPR-Cas13a system in fission yeast and its repurp

基因编辑技术可以编辑所有基因吗

即便当前不能,以后会能的。基因编辑技术指能够让人类对目标基因进行“编辑”,实现对特定DNA片段的敲除、加入等。在过去几年中, 以ZFN (zinc-finger nucleases)和TALEN (transcription activator-like effector nucleases)为代表

章鱼藐视遗传“中心法则”-头足类动物RNA编辑程度令人吃惊

  章鱼、鱿鱼和乌贼经常并不严格地遵循其DNA中的遗传指令,相反,它们利用酶清除RNA中的特定碱基A(腺苷),并且利用一种不同的碱基I(肌苷)替代它们。大多数动物很少使用这种被称作RNA编辑的过程重新编码蛋白,但章鱼等头足类动物在超过半数的转录基因中编辑RNA。在一项新研究中,当研究人员定量和描述头

科学家完成CRISPRCas13a介导的精确定点RNA编辑的人工机器

  5月31日,国际学术期刊Nucleic Acids Research 在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所李轩研究组合作完成的题为Implementation of the CRISPR-Cas13a system in fission yeast and its r

我国研究院揭示m6A修饰对AtoI-类RNA编辑的调控作用

  A-to-I类型的RNA编辑是一种基本的生物学现象,广泛存在于哺乳动物中,目前被认为是一种能够产生分子多样性的转录后修饰机制,通过重新编码来调节蛋白质翻译,大大丰富了遗传信息。A-to-I类型的RNA编辑不仅对基因表达调控具有重要影响,而且还与很多疾病的发生发展过程密切相关。m6A 修饰对 A-

DNA碱基编辑:基因编辑工具“升级版”

  美国哈佛大学14日宣布,将授予光束疗法(Beam Therapeutics,下称BT)公司全球专利许可,对可用于治疗人类疾病的一套革命性DNA碱基编辑技术进行开发和商业化。  BT公司同日宣布,已经筹集了高达8700万美元由F-Prime资本和ARCH风投牵头的A轮融资。BT公司由基因编辑技术领

DNA碱基编辑:基因编辑工具“升级版”

  美国哈佛大学14日宣布,将授予光束疗法(Beam Therapeutics,下称BT)公司全球专利许可,对可用于治疗人类疾病的一套革命性DNA碱基编辑技术进行开发和商业化。   BT公司同日宣布,已经筹集了高达8700万美元由F-Prime资本和ARCH风投牵头的A轮融资。BT公司由基因编辑技

选对学术编辑和责任编辑多么重要

   公开评审的期刊都会为每个稿件指定一个学术编辑或者责任编辑来评估稿件质量,通过了学术编辑的初审然后就是外审同行专家进一步评估,等返回了规定的有效审稿意见(一般至少2份)后学术编辑会评估审稿人的审稿意见是否可靠,然后再做出推荐和裁决。   很多时候不少作者只关注审稿人提出的意见而忽略了责任编辑提出