基因组分析揭示等位基因特异RNA编辑现象

核糖核酸(RNA)编辑是RNA水平一种常见的修饰,是增加基因转录和功能多样性的重要形式。17日,来自中科院昆明动物研究所的消息,由张亚平院士领导的、多个研究机构加盟的团队,在等位基因特异的RNA编辑研究上取得了重要进展。 中科院昆明动物研究所周中银博士介绍,对二倍体生物来说,虽然两个等位基因的表达调控对发育至关重要并与一些疾病相关,但现有的研究表明,诸多基因表现为单等位基因高表达。其中,等位基因特异的甲基化是产生等位基因特异表达产生的重要原因之一,但现有的研究主要集中于DNA层面。由于RNA在转录和翻译过程中发挥了承前启后的作用,各种各样的RNA修饰相继被发现报道,但是生物体内在RNA层面的修饰是否表现为等位基因特异的修饰,还没有相关研究。 由张亚平院士领导的团队研究了人类和小鼠各种组织中等位基因特异的RNA编辑情况。他们在人体中鉴定出315个等位基因特异的RNA编辑位点,且这些位点在不同组织中有相当比例的重叠。同......阅读全文

中科院Science公布最新基因组

  继2012年中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院等单位合作完成了首个山羊全基因组图谱之后,6月昆明动物研究所,华大基因等处的研究人员又公布了绵羊基因组序列,并且将这一基因组与其它哺乳动物基因组进行了比对,构建了相关的系统发育树。这一研究成果公布在6月6日Science杂志上。  参与这项

中科院基因组测序平台联盟成立

  2月12日上午,在中国科学院条件保障与财务局的支持和推动下,中科院基因组测序平台联盟成立大会暨签约仪式在中科院北京基因组研究所召开。条财局副局长曹凝及中科院广州、武汉、上海、昆明及北京各区域中心专家代表和部分研究所代表共计20余人出席会议。   会上,北京基因组所副所长、党委

中科院海洋所破译海参基因组

  记者从中科院海洋所获悉,国际学术期刊PLoS Biology13日在线刊发了由中国科学院海洋研究所杨红生研究员课题组和相建海、李富花研究员课题组主导,天津生物芯片技术公司、加拿大纽芬兰纪念大学等单位合作,由张晓军、孙丽娜、袁剑波等青年科研人员为共同第一作者,协力完成的研究论文“The sea c

中科院等完成橡胶草基因组序列解析

   中国科学院遗传与发育生物学研究所李家洋研究组与中国农业科学院、中国热带农业科学院等合作,在橡胶草基因组序列解析方面取得重要进展,标志着以橡胶草作为模式植物进行天然橡胶合成研究进入后基因组时代。研究成果近日在线发表在权威学术期刊《国家科学评论》(National Science Review)杂

中科院天津工生所构建高效基因组编辑方法

  近日,中科院天津工业生物技术所研究员张学礼带领的微生物代谢工程研究团队和研究员毕昌昊带领的代谢工程与合成生物技术研究团队,在大肠杆菌中首次利用CRISPR/Cas9技术实现了四基因的同时高效编辑,两个基因、三个基因、四个基因同时编辑效率分别达到100%、90%、40%。相关成果发表于《生物技术期

中科院免去杨焕明北京基因组所所长职务

日前,中国科学院经研究,决定:杨卫平同志任北京基因组研究所常务副所长(法定代表人,任期至本届班子届满);免去杨焕明同志北京基因组研究所所长职务。在其官方网页上显示,于军仍为北京基因组研究所副所长。 姓 名 杨卫平 性 别 男 出生日期

中科院利用CRISPR及TALEN技术获基因组编辑新突破

  来自中科院遗传与发育生物学研究所、中科院微生物研究所的研究人员利用TALEN和CRISPR-Cas9技术,在六倍体面包小麦中成功实现了同时编辑3个同源等位基因(homoeoallele) ,并由此赋予了小麦对白粉菌(powdery mildew)的遗传性抵抗力。这一突破性的成果发表在7月20日的

中科院海洋所破译首个深海甲壳动物基因组

  近日,中科院海洋所李富花研究员课题组和李新正研究员课题组合作破译了国际上首个深海甲壳动物——深海水虱(Bathynomus jamesi)的基因组,并揭示了深海水虱体型巨大化和深海寡营养环境适应的独特分子遗传机制。  据悉,此研究是继深海软体动物和深海管虫等深海物种之后,首次报道深海甲壳动物基因

中科院遗传发育所在黍子的基因组研究中取得进展

  多倍化在植物进化过程中反复发生,呈现出多倍体化-二倍体化的循环模式,所有被子植物至少经历了一次多倍化事件。多倍体形成之后,通常会迅速进入二倍体化的过程,最终演变成二倍体。多倍化后的基因组休克和二倍化可能导致亚基因组优势,即显性基因组保留更多的祖先基因并显示更高的同源基因表达。然而,二倍体化的分子

牡蛎基因组测序项目在中科院海洋所正式启动

牡蛎基因组测序项目(OGP)日前在中科院海洋所正式启动。 中国科学院海洋研究所介绍,开展牡蛎全基因组测序和组学研究,揭示牡蛎各种特异性状的基因组学基础,可以提升贝类和海洋基因组学研究水平,促进发展贝类养殖产业健康和可持续发展。 中国是牡蛎的故乡,分布有近20种牡蛎。牡蛎是一种重要的海洋生物资源,

谁在先?“鸡基因组”和“鸡蛋基因组”

是先有鸡还是先有鸡蛋?这个问题相当恼人,恐怕很难说清楚。现在,研究人员回答了与这个问题一样恼人的问题:是人类基因组中的成千上万的长重复DNA片段中,那个是第一个产生的?那些被复制了? 这个答案发表在10月7日的《自然·遗传学》杂志上。该研究给出了人类基因组中DNA重复片段复制的第一个进化证据,这种

叶绿体基因组

叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能的重要细胞器,叶绿体中进行的光合作用是严格地受到遗传控制的。早在20世纪初,人们就已知叶绿体的某些性状是呈非孟德尔式遗传的,但直到60年代才发现了叶绿体DNA(chloroplast DNA,ctDNA)。叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子,其大小在1

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

中科院任命吴仲义为北京基因组研究所所长

2008年6月20日,中国科学院北京基因组研究所所长聘任、任命仪式在基因组所2楼报告厅举行。会议由中科院北京分院党组副书记刘松林主持,中科院副秘书长何岩,人事教育局局长李和风,基因组所党委书记杨卫平,副所长于军,所长助理胡松年研究员、王彩平研究员以及所党委、纪委委员,中层管理干部,副研以上科研人员等

中科院“细菌全基因组测序及分析”取得阶段性成果

中科院北京基因组研究所的胡松年研究员和浙江大学医学院附属二院的胡讯教授合作研究的项目“细菌Phenylobacterium zucineum全基因组测序及分析”取得阶段性成果,相关论文发表在今年第9期的BMC Genomics上。 P.zucineum是合作方从K562细胞系中分离到的兼性细菌。系

全基因组的比较基因组杂交技术介绍

Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a

GenomeResearch发表基因组研究新发现基因组

多伦多大学的科学家们发现,作为基因组看门人的C2H2-锌指蛋白(C2H2-ZF)实际上肩负着更加多样化的职责。这项发表在Genome Research杂志上的研究,有助于我们更准确地解读个人基因组。C2H2-ZF有大约七百个成员,是规模最大的一种人类蛋白。然而,人们对这些蛋白一直知之甚少。C2H2-

中国新生儿基因组、胚胎基因组计划启动

  为从根本上实现新生儿遗传病的早发现、早诊断、早干预,7日,中国遗传学会遗传咨询分会联合复旦大学附属儿科医院在上海发起中国新生儿基因组计划。  中国新生儿基因组计划将在未来的5年内开展10万例样本的新生儿基因检测,旨在构建中国新生儿基因组数据库,建立新生儿遗传病基因检测标准,促进新生儿遗传病基因检

《基因组研究》:首张猫基因组草图绘就

猫是研究人类失明和艾滋病模型之一,因此测序结果大有用处 一只名为“肉桂”(Cinnamon)的4岁雌性阿比西尼亚猫有幸成为第一只完成基因组测序草图的猫。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在内的基因组“俱乐部”。相关论文11月1日在线发表于《基因组研究》(Genome Research)杂

中科院开发基于内源CRISPR系统植物病原菌基因组编辑方法

高效便捷的基因组操纵技术可推动病原菌致病机理的研究。水稻是世界上主要的粮食作物,由水稻白叶枯菌(Xanthomonas oryzae pv. oryzae,Xoo)引起的水稻白叶枯病是威胁水稻生产的主要病害之一。近日,中国科学院微生物研究所邱金龙团队利用水稻白叶枯菌内源CRISPR-Cas系统,建立

中科院遗传发育所水稻基因组编辑研究取得重要新进展

  水稻突变体是进行水稻功能基因组学基础研究和水稻分子设计育种的重要材料。常规的水稻突变体来源于自发突变或化学、物理及生物的诱变,具有很大的随机性和局限性,不能满足大规模的水稻功能基因组学研究和水稻分子设计育种的需求。利用高效便捷的CRISPR/Cas9基因组编辑技术和高通量的寡核苷酸芯片合成技术可

中科院微生物所在细菌耐药基因组学研究获进展

   中科院微生物所朱宝利课题组在细菌耐药基因组学研究中的最新进展,研究首次以基因组学大数据为依托,深入解析了耐药基因在细菌间的传播网络和规律,对深入认识细菌耐药性的进化、细菌耐药的形成机制等具有重要意义。成果近日在线发表于《应用与环境微生物学》,并将于第82卷22期以“封面故事”形式发表。副研究员

中科院深圳先进院开发出人工基因组高效简化策略

最小真核基因组的构建是基因组学中的重要议题,被称为该领域的“圣杯”。通过基因组的精简,去除冗余基因,可为认识生命的起源和进化提供重要线索,有助于深化对基因组功能组成和运转方式的认识。2016年,最小原核基因组已由J. Craig Venter团队构建出来。面对更为复杂的真核生物基因组,如何构建其最小

中科院植物所等揭秘构树基因组组成及根系菌群

  大约3100万年前,构树与桑树分开,进化出了独特的纤维内皮。构树低木质素、高纤维素的独特比例,使其营养丰富,易被牲畜消化吸收,这也可能是它可以与土壤微生物共生的原因。中国植物学家首次破译了构树的基因组,通过对基因组的解析发现了这种联系,并于2月27日在《分子植物》上发表了该成果。构树用于造纸、饲

基因组文库法

基因组文库法一)基因组DNA分离、纯化和加工[Mbo I酶检测]1.准备1.5ml小试管4个;每管内含有:基因组DNA(在TE或水中)             10.0μg10×Mbo I缓冲液                         2.5μlH2O                    

基因组构的定义

中文名称基因组构英文名称gene organization定  义(1)单个基因的组成结构。一般包含启动子、增强子、非翻译序列、编码序列等。真核生物和原核生物的一个显著区别是前者具有内含子。(2)广义指一个完整的生物个体内基因的组织排列方式。原核和真核生物的一个显著区别是原核生物的结构基因成串分布,

基因组的分类

病毒基因组病毒基因组可以由RNA或DNA组成。 RNA病毒的基因组包含单链或双链RNA,也包含一种或多种单独的RNA分子。 DNA病毒基因组可以是单链或双链DNA。大多数DNA病毒基因组由单个线性DNA分子组成,但有些由DNA病毒基因组由环状DNA分子组成  。原核基因组原核生物和真核生物基因组由D

烟草基因组计划

生物技术和生命科学将成为21世纪引发新科技革命的重要推动力量。实施基因组计划可以获得一批具有自主知识产权的烟草重要性状功能基因,全面揭示种质资源的遗传背景,确立我国在烟草基因组研究上的核心优势,对提升烟草育种工作整体水平、实现烟草品种的根本性突破、培育烟草新兴产业、更好地发挥烟草模式作物的基础研究作

基因组构的定义

中文名称基因组构英文名称gene organization定  义(1)单个基因的组成结构。一般包含启动子、增强子、非翻译序列、编码序列等。真核生物和原核生物的一个显著区别是前者具有内含子。(2)广义指一个完整的生物个体内基因的组织排列方式。原核和真核生物的一个显著区别是原核生物的结构基因成串分布,

基因组的定义

在分子生物学和遗传学领域,基因组是指生物体所有遗传物质的总和。这些遗传物质包括DNA或RNA(病毒RNA)。基因组包括编码DNA和非编码DNA、线粒体DNA和叶绿体DNA。研究基因组的科学称为基因组学。