常兴研究组发现RNA剪接基因编辑的新方法
2018年10月5日,国际知名学术期刊《分子细胞》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康研究院)常兴研究组题为“Genetic modulation of RNA splicing with a CRISPR-guided cytidine deaminase”的最新研究成果。证明可以利用TAM (Targeted-AID induced mutagenesis)基因编辑,靶向DNA上的RNA剪接顺式元件,高效调控RNA剪接,用于研究RNA可变剪接的功能,以及用于人类遗传疾病的治疗。 真核细胞中, RNA剪接是基因的表达的重要环节。据估计,超过75%的人类基因具有一种以上的mRNA剪接方式 (可变剪接),其中大部分可以翻译为功能性蛋白质。但相对于基因功能而言,对于可变剪接的生理功能,认识还非常有限,原因主要在于调控内源RNA剪接的实验手段非常有限。RNA剪接的异常也是许多疾病的直接诱因,估计35~50%的人类疾......阅读全文
RNA-剪接
中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定 义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子,连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必需的
简述RNA剪接和基因沉默之间的联系
为了识别在RNA干涉(RNAi)和微RNA介导的基因表达调控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事对86种真核生物进行了系统发生分析,所得到的候选物再用转录和蛋白组相互作用数据进行Bayesian分析,来估计它们参与小RNA调控的概率。所识别出的小RNA辅因子中大约一半是RNAi沉默所必
关于RNA剪接的简介
大多数脊椎动物基因的编码序列,无论是编码多肽的基因还是编码除mRNA以外的RNA分子的基因,都是由非编码的间隔序列(内含子)分隔为各个外显子部分。这些基因的外显子和内含子都转录在一条初级RNA转录分子中,接下来,此初级RNA转录分子要经过RNA剪接,此过程包括一系列的加工反应:RNA的内含子部分
概述RNA剪接的类型
RNA剪接及其机制的研究,不仅解决了不连续基因“连续”转录产物的问题,而且对于了解不连续基因的起源乃至整个生命起源与进化等问题,均产生极大的推动作用,另外,由此发现了核酸分子的催化功能,进一步拓宽了对于酶的认识。不连续基因中的介入序列称为内含子;被内含子隔开的基因序列称为外显子(exon)。一个
RNA剪接为什么会出错
“这项研究不仅提出了用小分子药物治疗维斯科特-奥尔德里奇综合征的新目标,而且为RNA剪切的基础生物学提供了新的线索,这是一个重要的但尚未完全被理解的过程,”共同通信作者Juan Carlos Izpisua Belmonte说,他是Salk基因表达实验室的教授和Roger Guillemin主席。患
关于RNA剪接的基本介绍
RNA剪接 (RNA splicing)是指从DNA模板链转录出的最初转录产物中除去内含子,并将外显子连接起来形成一个连续的RNA分子的过程。RNA剪接机制的研究,是80年代生物化学和分子生物学领域中最有生机的研究课题之一,它不仅解决不连续基因转录产物的剪接问题,而且对于了解不连续基因的起源乃至
关于RNA剪接的定义介绍
RNA剪接是真核细胞基因表达中非常重要的一个生物过程,通过RNA剪接,可以产生许多具有功能的,带有编码信息的mRNA,它对生物的发育及进化至关重要。所以RNA剪接识别是正确理解基因表达过程的重要一步,而剪接的识别的关键是依赖于剪接位点的判定。真核细胞pre-mRNA的剪接位点处存在一定的序列保守
关于RNA剪接第Ⅱ类内含子的自我剪接介绍
第Ⅱ类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列多为…外显子…↓GUGCG…内含子…嘧啶碱AU↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,在离3’剪接点上游6-12bp有一段比较保守的序列,一致序列为CUCAC,在这一保守序列A的两侧各有一段3~5核苷酸的短序列能与上游方向的核苷酸互补,而A总是不包含在这
北京基因组所揭示RNA甲基化调控基因剪接机制
中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂课题组在研究m6A甲基化修饰调节mRNA选择性剪接规律过程中,发现了读码器YTHDC1通过招募前体mRNA剪接因子SRSF3同时抑制剪接因子SRSF10与RNA的结合,促进外显子被保留的分子机制。该研究结果于2016
常兴研究组发现RNA剪接基因编辑的新方法
2018年10月5日,国际知名学术期刊《分子细胞》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康研究院)常兴研究组题为“Genetic modulation of RNA splicing with a CRISPR-guided cytidine deaminase”的最新研究成果。证明可
环形RNA可变反向剪接和可变剪接表达图谱被系统绘制
6月30日,国际学术期刊Genome Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所杨力研究组和生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于环形RNA研究的最新进展:Diverse alternative back-splicing and alternative spl
关于基因剪接的简介
基因组中或基因组间发生遗传信息的重新组合,被称为DNA重组(DNA recombination),其中发生在基因组中的DNA重组又称DNA重排。包括同源重组、特异位点重组和转座重组等类型,广泛存在于各类生物。体外通过人工DNA重组可获得重组体DNA,是基因工程中的关键步骤。
Nature:针对RNA转录和剪接的新观点!
细胞通常产生区室来控制重要的生物功能。细胞核就是一个很好的例子;它被核膜包围着,容纳着基因组。然而,细胞还含有未被膜包围的较为短暂存在的封闭室,就像水中的油滴。在过去两年中,这些称为液滴状“凝聚物(condensates)”的封闭室已越来越多地被认为是控制基因的主要参与者。如今,在一项新的研究中
PNAS:RNA剪接调控研究方面新的进展
近日,PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展。该研究揭示了RNA二级结构在剪接调控中的新机制,并首次证明了MYC调控蛋白FUBP1同样具有剪接调控活性。 RNA剪接是连接转录与翻译的重要桥梁,也是生物体蛋白质多样性的重要保证。在真核生物中,mRNA前体被剪
关于基因剪接的意义介绍
①参与DNA复制。 ②参与DNA修复。 ③参与基因表达调控。 ④在真核细胞分裂时促进染色体正确分离。 ⑤维持遗传多样性。 ⑥在胚胎发育过程中实现程序性基因重排 。
关于基因剪接的基本介绍
基因剪接是通过一些酶学操作使一条DNA分子与另一条DNA分子相连。即在mRNA成熟期,切除基因的内含子,连接基因的外显子的过程,称为基因剪接。而天然基因的某些片段被合成的DNA链所取代或连成整体的过程称为基因剪辑。一个基因为它的等位基因所替换,而其他基因则保持不变称为基因置换。
关于基因剪接的历史发现介绍
1972年,加州大学旧金山分校的微生物学家赫伯特·伯耶(Herbert Boyer)、斯坦福大学的研究员史坦利·科恩(Stanley Cohen)在火奴鲁鲁参加学术会议时在一家现成食品店里遇到了对方。他们一边吃着熏牛肉三明治,一边构思除了一个开创了现代生物技术产业的实验。回到加州后,这两个人成功
分子遗传学词汇基因剪接
中文名称:基因剪接外文名称:Gene splicing别 名:重组DNA定 义:基因剪接是通过一些酶学操作使一条DNA分子与另一条DNA分子相连。即在mRNA成熟期,切除基因的内含子,连接基因的外显子的过程,称为基因剪接。而天然基因的某些片段被合成的DNA链所取代或连成整体的过程称为基因
发现重复基因剪接信号演化特点
近日,中科院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所孔祥银课题组张振国等人发现基因重复后基因剪接信号演化特点,以及这些变化对基因新结构形成的影响,该成果在线发表在《基因组生物学》(Genome Biology)杂志上。 在物种进化过程中,基因重复是经常发生的。那么基因重复后,基
营养所在RNA剪接调控研究中取得新进展
近日,PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展:Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing rep
上海生科院揭示反向剪接RNA成环与RNA转录的偶联机制
4月19日,国际学术期刊Cell Reports 发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组与计算生物学研究所杨力研究组最新合作研究论文。此工作深入研究了环形RNA生成与RNA转录的偶联机制,揭示了环形RNA在神经分化过程中表达上调原理。 环形RNA是一类通过反向
METTL16介导通过阻碍对剪接位点的识别从而抑制RNA剪接
RNA m6A修饰是目前RNA表观遗传领域研究的热点,对于m6A的甲基化酶和去甲基化酶,相信大家也是耳熟能详。事实上,大名鼎鼎的METTL3仅能结合约22%的m6A位点,这提示还有其他m6A甲基化酶。确实,在METTL3之后,METTL16也被鉴定为m6A甲基化酶,但是它的底物远不如METTL3
Nature:首次发现RNA剪接与衰老之间存在因果关系
生物通报道:衰老是各种破坏性慢性疾病的一个重要危险因素,但是,随着时间推移生物学因素如何影响“细胞何时以及多快的衰老”,在很大程度上仍然是未知的。现在,由哈佛大学T.H. Chan公共卫生学院带领的一个研究小组,将细胞机器——其在一个称为“RNA剪接”的过程中切割和重新连接RNA分子——的一个核
研究揭示甘蔗花叶病毒干扰RNA剪接促进侵染
近日,中国农业大学植物保护学院教授周涛课题组在甘蔗花叶病毒(SCMV)相关研究上获得了新进展。研究发现,SCMV侵染改变了玉米八氢番茄红素合成酶基因(ZmPSY1)的转录本可变剪接模式,因此促进病毒侵染。相关成果发表于《植物生理学报》。 SCMV是我国和非洲玉米生产上的一种主要病原,广泛分布于世
Cell-Systems:构建RNA结合蛋白的剪接调控作用预测模型
基因组研究结果显示,人体内超过90%的基因存在选择性剪接(alternative splicing)。该过程在不同组织以及不同生理阶段受到严格的调控,其失调会导致多种疾病的发生。选择性剪接的体内调控主要由前体mRNA中的顺式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子(trans-a
GUT揭示癌症治疗靶点调控RNA可变剪接的分子机制
来自浙江大学基础医学院,中国药科大学等处的研究人员发表了题为“SRSF6-Regulated Alternative Splicing that Promotes Tumor Progression Offers a Therapy Target for Colorectal Cancer”的文
异常剪接
中文名异常剪接定 义指对序列库中异常剪接mRNA的鉴定和分析隶属领域生物领域主要功能处理多顺反子性转录单元,调控转录效率和mRNA的稳定性,同时可以增加产物蛋白的多样性