两篇NatureMethods发布突破性测序技术

澳大利亚基因组研究者开发了一种人工合成的“镜像”DNA序列——Sequins。这一突破性技术能帮助人们更好地进行基因组分析,有望成为将基因组测序推向临床的一大助力。 人类基因组是包含六十多亿DNA碱基的复杂序列。现在测序一个人的基因组已经比较方便了,但随之而来的基因组分析问 题依然令人头疼。为了提高基因组分析的质量,澳大利亚Garvan医学研究所的团队开发了Sequins技术。他们在八月八日的Nature Methods杂志上连发两篇文章对这个技术进行了详细的介绍。 “随着基因组测序越来越多地用于疾病诊断,准确理解基因组数据的含义变得更加重要了,”这项研究的领导 者,Garvan医学研究所的Dr Tim Mercer表示。Dr Mercer及其同事想到,可以在测序过程中给患者DNA添加小的合成DNA(Sequins)。这些Sequins可以作为内参,帮助人们分析基因组测 序生成的庞大数据。 据介绍,Sequins技术基......阅读全文

DNA-序列分析技术

DNA序列分析技术可用于:(1)分析物种的遗传多样性;(2)鉴定新的物种;(3)用于比较基因组学。实验方法原理本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDe

DNA-序列分析技术

            实验方法原理 本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDeoy TM Terminator

DNA序列测定技术

DNA序列测定技术序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam-Gilbert DNA化学降解法测序策略目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干

DNA微序列技术

·         Protocols for Making Drosophila Arrays (Stanford U.)Detailed protocol for making arrays including PCR Amplification of cDNAs for Printing, 

DNA-序列分析技术

试剂、试剂盒 琼脂糖TE 水饱和酚无水乙醇70%乙醇TEMED测序酶溴化乙锭仪器、耗材 电泳仪离心管离心机冰浴箱恒温板DNA 测序仪

DNA序列测定技术

DNA序列测定技术序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam-Gilbert DNA化学降解法测序策略  目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定2

目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法(双脱氧链终止法)和Maxam(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组核苷酸都有共同的起点,却随机终止于一种(或多种)特定的残基,形成一系列以某一特定核苷酸

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定3

2.利用末端转移酶和α-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下,末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端,如果作为底物的核苷酸经过修饰(如ddNTP),则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段,亦存在DNA的两侧均被标记问题,可通过上述同

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定1

㈣ DNA聚合酶 如前所述,选用合适的DNA聚合酶进行测序反应也是保证测序质量的重要因素之一。常用于双脱氧末端终止法测序的有几种不同的酶: 1.大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow片段) 此酶是最早用于建立Sanger测序的酶。但通常会有两个问题:①Klenow片段的持续合成能力较

DNA序列分析技术1

物种的遗传多样性在本质上是DNA 一级序列的多样性。近年来,随着DNA 测序技术的迅速发展和日益普及,DNA 测序在遗传多样性的研究中正在起着越来越大的作用。本章将介绍目前在遗传多样性研究中常用的一种手动和一种全自动双链DNA 测序方法。1.DNA 模板的制备在遗传多样性的研究中,由于样本量一般都较

DNA序列家族的概念

中文名称DNA序列家族英文名称DNA sequence family;sequence family定  义DNA分子变性后可复性形成稳定的碱基配对双链分子的一组序列。序列之间有很高的同源性。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

端粒DNA-序列的概念

端粒DNA 序列(telomere DNA sequence,TEL)端粒的功能是与端粒酶结合,完成染色体末端复制。端粒酶以其自身的RNA 为模板,在染色体端部添加上端粒的重复序列。作为模板的RNA 比较短,含有1.5 个端粒重复单元。端粒结构还能防止染色体融合及降解。端粒是保护DNA分子中的基因的

重复[DNA]序列的概念

中文名称重复[DNA]序列英文名称repetitive [DNA] sequence定  义DNA分子中重复出现的核苷酸序列。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

DNA序列分析技术2

3)电泳电极缓冲液 1 倍TBE(pH 值8.0)预电泳 30 分钟至1 小时恒温方式 测序胶板上夹盖铝恒温板电泳温度 50℃左右电泳条件 恒功率 90~110W电泳时间 2.5 小时至5 小时4)干胶制备和压片电泳结束后取下胶板,用工具撬开玻璃板,使胶留在其中一块板上。将裁剪好的新华3 号滤纸在胶

DNA自动序列测定试验

[实验原理]DNA 测序(DNA sequencing)是对DNA 分子的一级结构的分析。其基本原理是DNA 的复制反应体系中需要存在DNA 聚合酶、DNA 模板、寡核苷酸引物和dNTP,引物和模板退火形成双链后,DNA 聚合酶在引物的引导下在模板链上沿3’→5’的方向移动,dNTP 按照碱

基因组所开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT

  中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员,带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT(Parallel Alignment and back-Translation)”。该研究成果发表在Biochemical and Biop

基因组序列草图的概念

中文名称基因组序列草图英文名称draft genome sequence定  义已测定序列占到90%以上、测序精度在1%的基因组序列图。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

解析现代月季基因组序列

科学家研究现代月季基因。图片来源:monticelloshop.org 近日,法国农业科学研究院、里昂大学、法国国家科学研究中心的研究人员解密了现代月季的基因组序列。现代月季拥有独特的颜色与香味,广受称赞,这项研究帮助人们从分子角度了解这背后的基因和代谢流程。4月30日,相关论文在线刊登于《自然

DNA-前导序列的结构特点

前导序列是结构基因中编码区之前的一段序列,这部分序列能被转录,但不被翻译,在mRNA是从5′端起至结构基因第一编码子开始点(通常 AUG)为止,在蛋白质合成过程中不被翻译。

DNA-下游序列的结构特点

中文名称下游序列英文名称downstream sequence定  义DNA或RNA分子中,相对于某一序列的3′方向的序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),总论(二级学科)

细胞化学基础端粒DNA序列

端粒DNA 序列(telomere DNA sequence,TEL)端粒的功能是与端粒酶结合,完成染色体末端复制。端粒酶以其自身的RNA 为模板,在染色体端部添加上端粒的重复序列。作为模板的RNA 比较短,含有1.5 个端粒重复单元。端粒结构还能防止染色体融合及降解。端粒是保护DNA分子中的基因的

首次测定玉米蛇基因组序列

  在现有的5000种哺乳动物中,有超过100种已经进行了基因组测序,但是,只有9种爬行动物(在10000个物种当中)的基因组对科学界来说是可用的。最近,瑞士日内瓦大学(UNIGE)的一个研究小组,构建了一个大的数据库,其中就包括一种爬行动物——玉米蛇的新基因组测序,这种蛇越来越多地被用来了解爬行动

概述酿酒酵母的基因组序列

  1996年6月,在国际互联网的公共数据库中公布了酿酒酵母的完整基因组顺序,它被称为遗传学上的里程碑。因为首先,这是人们第一次获得真核生物基因组的完整核苷酸序列;其次,这是人们第一次获得一种易于操作的实验生物系统的完整基因组。 [10]  在酿酒酵母测序计划开始之前,人们通过传统的遗传学方法已确定

端粒DNA-序列的基本信息

端粒DNA 序列(telomere DNA sequence,TEL)端粒的功能是与端粒酶结合,完成染色体末端复制。端粒酶以其自身的RNA 为模板,在染色体端部添加上端粒的重复序列。作为模板的RNA 比较短,含有1.5 个端粒重复单元。端粒结构还能防止染色体融合及降解。 端粒是保护DNA分子中的基因

DNA序列测定的技术和策略

目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱

DNA序列多态性的定义

中文名称DNA序列多态性英文名称DNA sequence polymorphism定  义同一物种的不同基因组DNA等位序列之间的差异。包括长度多态、限制性酶切位点多态及单核苷酸多态等。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

T载体克隆的DNA序列分析

实验目的: 了解常规DNA序列分析技术(Sanger双脱氧法)的原理及操作步骤。 实验原理: 在分子生物学研究中,DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger等(1977)发明的双脱氧链末端终止法和Maxam和Gilbert(1977)发明的化学

DNA保守序列的结构特点

保守序列(Conserved Sequence):指在进化过程中基本保持不变的 DNA 分子中的一个核苷酸片段或者蛋白质中的氨基酸片段。

Genome-Biology:食物会影响DNA序列

  牛津大学的研究人员在两种寄生虫中检测到了食物组分造成的DNA序列差异。他们在Genome Biology杂志上发表文章指出,食物能够影响生物的基因序列。  “生物从食物中获取原料构建自己的DNA。我们认为,食物组分可能应该能够改变生物的DNA。我们也许可以预测素食者熊猫与肉食者北极熊之间的基因差

DNA共有序列的结构特点

共有序列(consensus sequence) 决定启动序列的转录活性大小。各种原核启动序列特定区域内(通常在转录起始点上游-10及-35区域)存在共有序列(consensus sequence)