GenomeBiology：食物会影响DNA序列
牛津大学的研究人员在两种寄生虫中检测到了食物组分造成的DNA序列差异。他们在Genome Biology杂志上发表文章指出，食物能够影响生物的基因序列。 “生物从食物中获取原料构建自己的DNA。我们认为，食物组分可能应该能够改变生物的DNA。我们也许可以预测素食者熊猫与肉食者北极熊之间的基因差异，” 牛津大学的Dr Steven Kelly说。 为了测试这个理论，研究人员选择两种寄生虫作为模式生物，一种真核生物寄生虫（Kinetoplastida）和一种细菌寄生虫（Mollicutes）。这些寄生虫有共同的祖先，但它们感染不同的宿主，食物也大不相同。“我们发现，寄生虫食物中不同水平的氮造成了它们的DNA改变。具体来说，与摄取高氮高蛋白食物的寄生虫相比，摄取低氮高糖食物的寄生虫DNA使用更少的氮，”Kelly表示。 这些结果揭示了过去人们不曾发现的细胞代谢与进化之间的关系。研究表明，生物对不同食物的适应会影响它们的DNA......阅读全文
Genome－Biology：食物会影响DNA序列
牛津大学的研究人员在两种寄生虫中检测到了食物组分造成的DNA序列差异。他们在Genome Biology杂志上发表文章指出，食物能够影响生物的基因序列。 “生物从食物中获取原料构建自己的DNA。我们认为，食物组分可能应该能够改变生物的DNA。我们也许可以预测素食者熊猫与肉食者北极熊之间的基因差
吃什么就是什么？对，食物会影响你的DNA序列
牛津大学的研究人员在两种寄生虫中检测到了食物组分造成的DNA序列差异。他们在Genome Biology杂志上发表文章指出，食物能够影响生物的基因序列。 “生物从食物中获取原料构建自己的DNA。我们认为，食物组分可能应该能够改变生物的DNA。我们也许可以预测素食者熊猫与肉食者北极熊之间的基因差
Genome－Biology：新技术90分钟完成全基因组序列分析
美国国家儿童医院（Nationwide Children's Hospital）的研发人员最近在Genome Biology上发布了一个自主开发的分析软件，表示这个软件使寻找全基因组致病变异从几周缩短到按几十个小时。 第一个人类基因组测序完成耗时大约13年，耗费30亿美元，而现在技术测序技术的
Genome－Biology发文介绍RNA印记法
生物学家们逐渐意识到，RNA不只是DNA和蛋白之间的过渡产物，它对调节基因的表达有重要作用。深入研究RNA调控，能够帮助科学家们进一步理解相关疾病。 宾夕法尼亚大学的科学家们开发了分析RNA调控的新方法，这一方法能够有效获得RNA与RNA结合蛋白(RBP)互作的所有位点。这一发表在Geno
Genome－Biology：为CRISPR选择最佳向导
细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争，为此它们演化出了多种防御机制，CRISPR-Cas9 适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合，可以在引导RNA的指引下，靶标并切割入侵者的遗传物质。 2012年研究者们利用这一特点，将CRISPR系统发展成了强大
Genome－Biology：大豆重要性状遗传网络解析
不同复杂性状间的耦合是分子设计育种的关键科学问题。作物的产量、品质等大都是多基因控制的复杂性状，由于受到一因多效和遗传连锁累赘的影响，使某些性状在不同材料和育种后代中协同变化，呈现耦合性相关。解析复杂性状间耦合的遗传调控网络，明确关键调控单元，对分子设计育种具有重要意义。大豆原产中国，是人类和动
Genome－Biology发布菜豆基因组测序结果
菜豆（Phaseolus），是世界上最古老的作物之一。几千年前，它与玉米和木薯一起，在美国被驯养，成为世界性的主要主食。根据联合国粮食和农业组织（FAO）的研究显示，普通菜豆是最重要的粮食豆类，占世界食用豆类食品的50%，在超过5亿人的饮食中显得尤为重要。这种作物种植在拉丁美洲、非洲、中东、中国
Genome－Biology：RNAseq需要多长的读长？
随着新一代测序（NGS）的读长在不断增长，研究人员也开始纠结：到底多长的读长才合适？双端测序是不是优于单端测序？近日，康奈尔大学维尔医学院的研究人员在《Genome Biology》杂志上发表文章，认为对于差异表达分析而言，读长并非越长越好。不过，双端测序和长的读长无疑能改善剪接的检测。 最初
973首席科学家发表《Genome－Biology》文章
来自西南大学蚕学与系统生物学研究所的研究人员利用家蚕全基因组芯片分析家蚕多种组织基因表达特征，这一研究成果公布在国际生物学权威期刊《Genome Biology》网络版上。 领导这一研究的是夏庆友教授，现任教育部“长江学者”特聘教授，“973”项目首席科学家 原文检索：Genome Biolog
Genome－Biol：DNA破裂或会重新调节癌症基因的控制机制
理解介导癌症基因组中广泛DNA损伤的机制一直以来都是癌症研究人员非常感兴趣的研究领域，近日，一项刊登在国际杂志Genome Biology上的研究报告中，来自贝勒医学院等机构的科学家们通过研究发现，基因组结构的变异或许能作为人类癌症中DNA甲基化改变（基因控制的一种形式）的一种特殊机制。 文章
Genome－Biology：普通小麦精细表观组图谱绘制成功
7月15日，Genome Biology期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组与南京农业大学张文利研究组等合作完成的研究论文。该工作生成并绘制普通小麦精细的表观组图谱，以此为基础针对性开发整合计算流程对全基因组顺式调控元件进行了系统的挖掘与鉴定，并初步探索
《Genome－Biology》：上海交大参与发表强迫症研究成果
报道： 在2014年3月份的《基因组生物学》(Genome Biology)发表的一项研究中，美国哈佛-麻省理工博德研究所(The Broad Institute of MIT and Harvard)、麻省理工学院、上海交通大学、明尼苏达大学和康奈尔大学等研究结构的研究人员，采用全基因
苏州大学Genome－Biology：聚焦基因组中的新基因
来自苏州大学、芝加哥大学的研究人员在新研究中，调查了人类和小鼠基因组中新基因驱动基因间相互作用（GGI）网络的速度及模式。这项研究发布在近期的《基因组生物学》（Genome Biology）杂志上。 苏州大学的沈百荣（Bairong Shen）教授及芝加哥大学遗传与进化系终身教授龙漫远(Man
这样加工食物，会破坏食物DNA，被吸收后会增加癌症风险
民以食为天，饮食直接影响着人类的健康。良好合理的健康饮食习惯是保健的一个重要方面，可使身体健康地生长、发育。不良的饮食习惯则会导致人体正常的生理功能紊乱而感染疾病。食物的烹饪方法与健康息息相关。我们知道，吃烧烤和油炸食品会增加多种健康问题的风险。选择合适的烹饪方法可以最大程度地保留食物的营养成分和口
《Genome－Research》：根据基因组序列预测MRSA毒性
微生物毒力一直是一个复杂的多因素表型，与病原体的进化轨迹有着复杂的关联。毒性，破坏宿主细胞膜和粘附的能力，粘附到人体组织的能力，是许多细菌病原体的主要毒力因子，包括金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。 金黄色葡萄球菌是临床上常见的毒性较强的细菌，自从上世纪40
惊人发现：食物会影响我们的基因？
科学家们最近发现，我们的大多数基因都会受到食物的影响。这项引人注目的研究发表在Nature旗下新期刊Nature Microbiology上。 细胞行为是由基因活性决定的，而基因活性受到表观遗传学开关的调控。此前有研究表明，基因调控还存在另一个层面，那就是代谢网络。代谢是维持细胞的生化反应，主
Genome－Biol：突破！科学家提出“人如其食”的遗传证据
日前，一项刊登在国际杂志Genome Biology上的研究报告中，来自牛津大学的研究人员通过研究发现，有机体的饮食方式能够影响机体基因的DNA序列；文章中研究者通过对两种寄生虫进行研究发现，其机体中DNA序列的差异或许归因于食物的组成成分。 研究者Steven Kelly表示，有机体会利用从
Genome－Biology：胰腺癌肝转移的分子特征研究新进展
近日，中国科学院上海营养与健康研究所研究员李虹、李亦学研究组，与上海交通大学附属仁济医院主任医师孙勇伟、研究员薛婧、主任医师王理伟及研究员张志刚团队合作的研究成果，以Integrated genomic and transcriptomic analysis reveals unique cha
水生所举办Water－Biology－and－Security期刊影响力发布会
“水生所主办的《Water Biology and Security》（简称WBS）获得首个影响因子5.1！”6月22日， “Water Biology and Security期刊影响力发布会”在中国科学院水生生物研究所举行。发布会由水生所党委书记、研究员解绶启主持。WBS主编桂建芳院士、副主编缪
DNA微序列技术
· Protocols for Making Drosophila Arrays (Stanford U.)Detailed protocol for making arrays including PCR Amplification of cDNAs for Printing,
DNA－序列分析技术
试剂、试剂盒 琼脂糖TE 水饱和酚无水乙醇70％乙醇TEMED测序酶溴化乙锭仪器、耗材 电泳仪离心管离心机冰浴箱恒温板DNA 测序仪
DNA－序列分析技术
DNA序列分析技术可用于：（1）分析物种的遗传多样性；（2）鉴定新的物种；（3）用于比较基因组学。实验方法原理本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDe
DNA序列测定技术
DNA序列测定技术序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam－Gilbert DNA化学降解法测序策略目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等（1977）提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭，但这两种方法都是同样生成互相独立的若干
DNA－序列分析技术
实验方法原理 本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDeoy TM Terminator
DNA序列测定技术
DNA序列测定技术序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam－Gilbert DNA化学降解法测序策略 目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等（1977）提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭，但这两种方法都是同样生成互相独立的
Genome－Biology：上海交大解析阿司匹林的抗结直肠癌机制
癌症化学预防指利用天然或合成的化学物质来阻止、逆转、减缓癌症的发生发展过程。虽然阿司匹林的化学预防效果已经被广泛研究，但人们还不完全清楚细胞组分在其中起到的作用，比如长非编码RNA（lncRNA）。lncRNA是长达两百个核苷酸以上的转录本，绝大多数位于细胞核内。 上海交大医学院的研究团队发现
Genome－Biology：联合鉴定肺癌筛查与临床预后生物标志物
肺癌是最常见的癌症类型，并且表现出复杂的发病机理和高度异质性，遗传因素是导致肺癌发生的风险之一，但目前其机制尚不清楚，研究发现13q12.12中的SNP rs753955（A> G）与中国人群中的肺癌发生风险高度相关。 2019年5月24日，南京医科大学孙玉洁、沈洪斌，昆明医科大学宋鑫等人在Ge
Nat－Commun：父母会影响儿童对食物的选择
当儿童在决定吃什么的时候，他们会推测母亲会希望他们吃什么这一点。根据一篇发表在《自然-通讯》上的论文，研究人员指出了儿童在做食物相关的选择时大脑中会激活的特定区域。 虽然已经有研究表明儿童期的食物选择可以建立起终身的与健康相关的行为模式，但是儿童的决策行为包括食物选择背后的神经机制仍不太清楚。
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA序列测定2
目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等（1977）提出的酶法（双脱氧链终止法）和Maxam（1977）提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭，但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸，每组核苷酸都有共同的起点，却随机终止于一种（或多种）特定的残基，形成一系列以某一特定核苷酸
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA序列测定3
2．利用末端转移酶和α-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下，末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端，如果作为底物的核苷酸经过修饰（如ddNTP），则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段，亦存在DNA的两侧均被标记问题，可通过上述同