中国农业科学院NatureGenetics发表测序新成果

来自中国农业科学院、荷兰瓦赫宁根大学和研究中心、南京农业大学等机构的研究人员证实,在芜菁(Brassica rapa)和甘蓝(Brassica oleracea)中亚基因组平行选择与形态多样化和作物驯化有关联。这一研究发现发布在8月15日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。 中国农业科学院的王晓武(Xiaowu Wang)研究员、武剑(Jian Wu)副研究员及荷兰瓦格宁根大学Guusje Bonnema博士是这篇论文的共同通讯作者。王晓武研究员现主要从事芸薹属和瓜类作物基因组学、芸薹属作物代谢组学研究、雄性不育功能基因组学、基于高 通量测序的分子标记开发与分子育种等研究。武剑副研究员则主要从事十字花科植物矿质营养含量的基因克隆和遗传分析,芸薹属作物基因组学研究,芸薹属作物代谢组学研究,基于高通量测序的分子标记开发与分子育种等研究。 2014年,中国农科院蔬菜花卉研究所王晓武团队和美国科学院院士迈克......阅读全文

超高通量基因测序仪首发!真迈生物在新区创新启航

  10月15日,真迈生物南京公司启用揭牌仪式暨新品发布会在新区生物医药谷举行。中国科学院院士陈润生,市委常委、江北新区党工委书记陆卫东,江苏省药品监督管理局副局长陈和平,南京市科学技术局局长赵成军,江北新区党工委委员、管委会副主任王伟、陈文斌,真迈生物董事长颜钦出席活动。  真迈生物成立于2012

410万-这家疾控中心采购一台高通量基因测序仪

 项目概况 上海市长宁区疾病预防控制中心(上海市长宁区卫生健康监督所)高通量自动化基因测序仪公开招标项目 招标项目的潜在投标人应在上海市政府采购网获取招标文件,并于2025年06月11日 10:00(北京时间)前递交投标文件。一、项目基本情况项目编号:310105000250312191210-05

昆明植物所揭示竹类植物生活史转变和物种多样化遗传机制

多倍化或称基因组加倍是植物演化史上的永恒主题,广泛发生于被子植物(有花植物)的各个演化阶段,特别是在与重要地史和气候事件相关的演化节点上,并伴随着整个被子植物和诸多大科大属的兴起。然而,在亚基因组水平上,关于多倍化如何促进植物适应性演化以及物种多样性形成的认识仍然不足。现有研究集中在新近(五百万年内

全球首张榨菜高质量基因组图谱问世

   9月6日,《自然-遗传》(Nature Genetics)杂志在线发表了浙江大学农业与生物技术学院园艺系教授张明方团队的最新研究成果,课题组通过高通量测序技术,绘制了世界上第一张榨菜全基因组图谱,并从基因组选择与进化层面解答了榨菜“家乡味”的成因,这一进展将对芥菜类蔬菜作物的改良产生重要意义。

全基因组连锁分析和高通量测序结合寻找疾病相关基因-1

在寻找疾病相关基因的研究中,使用基因芯片对家系进行连锁分析,将基因定位于少数几个区域中,接着进行外显子组测序或全基因组重测序寻找候选区域中的遗传变异,是一个准确高效的研究方案。本文列举了上海交通大学医学院附属新华医院皮肤科李明老师团队的两项研究,均使用了上述方法成功找到了疾病相关的基因变异位点。该研

全基因组连锁分析和高通量测序结合寻找疾病相关基因-2

图1.2. 全基因组连锁分析结果。最高LOD值为3.01。接下来,研究使用了Agilent SureSelect平台对其中一例患者进行了外显子测序,测序深度为100X,但并没有发现功能相关变异。于是作者又进行了全基因组重测序,测序平台为Illumina Hiseq XTen,测序深度为平均每

华大智造宣布超高通量基因测序仪落地南澳基因组学中心

2023年4月27日,华大智造宣布超高通量基因测序仪DNBSEQ-T7落地南澳基因组学中心(SAGC),该中心将基于DNBSEQ-T7测序平台开展各项科学研究,助力全面推动澳大利亚基因组学研究发展和成果转化。  南澳基因组学中心成立于2020年7月,是国际领先的基因组学中心之一,致力于支持整个澳洲及

【Nature子刊】农科院、华大基因联手完成甘蓝测序

  中国农业科学院油料作物研究所、中国农业科学院蔬菜花卉研究所、华大基因等多家研究机构的科学家们近日完成了对甘蓝基因组的测序,并将这种作物的基因组草图发表在五月二十三日的Nature Communications杂志上。文章的通讯作者是油料作物研究所的研究员刘胜毅(Shengyi Liu)

Nature-Genetics-|-中国农大等单位合作通过泛基因组分析揭示苹果属(Malus)的进化与多样性

  近日,Nature Genetics在线发表中国农业大学等团队合作的题为“Pan-genome analysis reveals the evolution and diversity of Malus”的研究论文,该论文首次对30个苹果属物种(涵盖二倍体与多倍体)进行高质量基因组测序与组装,构

高通量测序的技术应用的介绍

  测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novosequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测

关于高通量测序的内容简介

  高通量测序已经成为一种常规的实验技术,不过最近新一代测序技术的显著优势,比如大规模平行信号(MPSS, Brenner et al.2000)和焦磷酸测序法(也称454测序; Margulies et al.2005, Langaee and ronaghi2005)已经使测序技术发生了彻底的变

关于高通量测序的技术应用介绍

  测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novo sequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重

高通量测序技术应用发展现状

  根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以下几种:大规模平行签名测序(MassivelyParallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony Sequencing)、454焦磷酸测序(454 pyrosequencing)、Illumina

高通量测序-锁定病原体“命门”

  病原体能使人类群体性致病甚至致死,为追本溯源,找到变异基因作为有效靶点,科学家们在迎战埃博拉病毒的过程中取得突破。  《科学》杂志的历史上,刊载过一篇沉重的学术文章。2014年一篇关于通过基因组学手段监测埃博拉病毒的起源和传播的论文,在刊登时已有6名研究人员因感染埃博拉而死亡。  “对埃博拉病毒

遗传病家系的高通量测序

摘要 高通量测序技术的出现与普及,为遗传病的研究带来了前所未有的机会。它提高了遗传病致病基因克隆和鉴定的效率,使人类对自身基因功能的认识大大加速。本文对遗传病家系的高通量测序分析提出一些注意事项,希望有助于相关的研究。 前言 我国是一个多民族的人口大国,也是遗传病家系资源比较丰富的国家之一。遗传病家

高通量测序--锁定病原体“命门”

《科学》杂志的历史上,刊载过一篇沉重的学术文章。2014年一篇关于通过基因组学手段监测埃博拉病毒的起源和传播的论文,在刊登时已有6名研究人员因感染埃博拉而死亡。“对埃博拉病毒的研究和控制是高通量测序技术(二代测序技术)全面应用的首次‘实战’。”日前,在由中国医学科学院、北京协和医学院主办的第

llumina高通量测序平台的应用(二)

3、可逆化学阻断技术测序        利用边合成边测序(Sequencing by synthesis)的原理,加入改造过的DNA聚合酶和带有4种荧光标记的dNTP。这些核苷酸是“可逆终止子”,因为3’羟基末端带有可化学切割的部分,每个循环它只容许掺入单个碱基。去除其他多余的dNTP后,用激光扫描

llumina高通量测序平台的应用(一)

Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收购了

华北理工大学对现代榴莲基因组研究取得新突破

  从华北理工大学获悉:该大学王希胤课题组对现代榴莲基因组研究取得新突破。近日,《Plant Physiology》在线发表了王希胤课题组题为“Recursive paleohexaploidization shaped the durian genome”的研究论文。课题组对榴莲基因组进行了重新分

华北理工大学对现代榴莲基因组研究取得新突破

   记者11月14日从华北理工大学获悉:该大学王希胤课题组对现代榴莲基因组研究取得新突破。近日,《Plant Physiology》在线发表了王希胤课题组题为“Recursive paleohexaploidization shaped the durian genome”的研究论文。课题组对榴莲

甲基化的基因组直接测序法

  基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理,并以连接介导的PCR来放大信号强度,然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解,故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解

英将推广基因测序开展个性化医疗

  英国卫生部7月5日说,国家医疗服务系统将推广一项基因测序计划,优先为癌症、罕见病和传染病患者进行基因测序,以更好地提供有针对性的治疗方案。   英国卫生大臣杰里米·亨特5日说,这一项目将由卫生部下属机构“英格兰基因组学”负责实施,该机构将与英国研究机构、高校和医院签订合同,由该机构为

研究揭示多倍体植物二型花柱调控机制

  花部形态多样性在被子植物进化与物种分化中具有核心作用。异型花柱(二型或三型)具有提高植物传粉精确度、降低雌雄干扰、促进异花传粉等重要生态功能。全基因组复制或多倍化,对被子植物繁育系统和形态演化具有重要影响。然而,以往对异型花柱分子调控机制的研究都局限于二倍体,对于多倍体植物异型花柱的发生和演化还

基因测序

基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,可以说基因测序技术,是下一个改变世界的技术

基因测序

第1代测序技术——荧光标记的Sanger法 在第一台全自动测序仪出现之前,使用最为广泛的测序方法就是 Sanger 在 20 世纪 70 年代中期发明的末端终止法测序技术。 Sanger 也因此获得 1980年的诺贝尔化学奖。 他的发明第一次为科研人员开启了深入研究生命遗传密码的大门。G1.1   

全外显子测序和高通量测序一样吗

能否简述下全外显子测序和普通的基因测试、全基因组测序有什么不同...全外显子组测序,是指利用序列捕获技术将只占基因组1%的外显子进行高通量测序,从而检测出约85%的致病突变,测序深度更高,数据更有效,变异检测更准确。全基因组测序,是利用高通量测序平台对一种生物的基因组中的全部基因进行测序,可以同时

高通量基因点样仪

  高通量基因点样仪是一种用于基础医学领域的医学科研仪器,于2016年11月17日启用。  技术指标  1.X 轴移动速度:50-250mm/s;Y 轴移动速度:100mm/s;Z 轴移动速度:100mm/s;X,Y,Z轴移动精度:± 0.2mm;划线头定位精度:± 0.2mm。2.划头最小间距:

低深度高通量全基因组测序在产前诊断中的意义

  胎儿染色体核型分析常被用于高危妊娠的产前检查中,随着技术的发展,染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)在产前诊断中的应用也逐步推进,并成为检测高危妊娠中显微和亚显微水平染色体结构变异的一线技术。高深度全基因组测序(whole genome se

1132.2万!浙江大学采购高通量基因测序仪、LCMS/MS等

  分析测试百科网讯 近日,浙江大学高通量基因测序仪、液相色谱串联三重四级杆质谱仪项目公开招标,此次采购预算金额1132.2万元(人民币)。招标详情如下:  项目名称:浙江大学高通量基因测序仪、液相色谱串联三重四级杆质谱仪项目  项目编号:ZUPC-GK-HW-2019033  投标截止时间:201

荧光定量PCR及高通量测序方法研究抗生素抗性基因

  抗生素自发明以来被广泛使用,曾经被认为是可以治愈任何细菌感染的灵丹妙药。然而,由于多种因素的影响,21世纪以来细菌抗生素抗性(耐药性)问题日益突出,导致抗菌药物治疗失效时有发生,因此抗生素抗性基因被认定为新兴污染物。细菌抗生素抗性虽然是环境中的自然现象,但随着环境中抗生素、重金属和杀菌剂等浓度升