任兵教授Nature发表表观遗传学新成果
母型-合子型转变(MZT)对于新个体形成是必不可少的。虽然早期胚胎发育的基因表达和DNA甲基化分析已经取得了不少进展，但人们对MZT过程依然知之甚少。奥斯陆大学和加州大学的研究团队最近在Nature杂志上发表文章，揭示了组蛋白H3K4me3对小鼠卵母细胞MZT的调节作用。文章通讯作者是加州大学的任兵（Bing Ren）教授、奥斯陆大学的Arne Klungland和John Arne Dahl。 动态的组蛋白修饰可能在MZT中起到了重要作用。不过，测定小量细胞的组蛋白修饰图谱还比较困难。目前的检测反应一次可以处理500个细胞的染色质，但起始步骤需要一万个细胞，不然就得使用专业的微流体设备。 任兵教授及其同事为此开发了微尺度的染色质免疫沉淀测序（μChIP–seq）。他们用这种方法分析小鼠的不成熟卵母细胞、MII期卵母细胞、2-细胞胚胎和8-细胞胚胎，获得了组蛋白甲基化H3K4me3和组蛋白乙酰化H3K27ac的全基因组图......阅读全文
早期胚胎发育中的单胚胎细胞基因表达（一）
Single-embryo Gene Expression for Early Embryo DevelopmentMylene Yao, M.D. Assistant ProfessorDept. of Obstetrics and Gynecology Stanford UniversityMy
早期胚胎发育中的单胚胎细胞基因表达（二）
“We picked 42 genes to validate on the BioMark system,” Dr. Yao said. “We picked them to represent different functional categories.”“We used the F
任兵教授Nature发表表观遗传学新成果
母型-合子型转变(MZT)对于新个体形成是必不可少的。虽然早期胚胎发育的基因表达和DNA甲基化分析已经取得了不少进展，但人们对MZT过程依然知之甚少。奥斯陆大学和加州大学的研究团队最近在Nature杂志上发表文章，揭示了组蛋白H3K4me3对小鼠卵母细胞MZT的调节作用。文章通讯作者是加州大学的
任兵教授利用CRISPR发现新型增强子
人类基因组只有不到2%编码蛋白质，因此解析非编码DNA的功能是一个很大的挑战。科学家们已经通过分析DNA甲基化、染色质修饰、核酸酶敏感性、转录因子结合，在人类基因组中预测了数百万个调控序列，但只有少数序列在天然条件下得到证实。 加州大学的研究团队为此开发了基于CRISPR/Cas9的高通量筛选
单细胞基因表达分析解密血液早期发育调控网络
近日，著名国际期刊nature biotechnology发表了英国科学家的一项最新研究成果，他们应用单细胞基因表达分析与计算方法描述了血液发育的转录调控网络。这项研究为分析器官发育的调控网络提供了一种可行的方法。 研究人员指出，重建调控器官发育的分子途经受限于缺少对胚胎祖细胞进行研究的方法，
任兵教授Cell－Res:开发新的ChIPseq分析远程染色质相互作用
生物通报道：近日，加州大学圣地亚哥分校任兵教授带领的研究小组，在国际知名学术期刊《Cell Research》以Letter to the Editor的形式，在线发表了题为“Mapping of long-range chromatin interactions by proximity li
《细胞》：人类原始生殖细胞研究获重要成果
封面设计源于中国古代象征生殖的图腾——玄武，寓意哺乳动物通过有性生殖（蛇与龟）来维持完整的生命周期（圆环），而中心处的生殖细胞（红色）则在遗传信息的世代沿袭中起着非常关键的作用 人类生殖细胞系（精子、卵细胞及原始生殖细胞）、囊胚以及着床后胚胎体细胞的DNA甲基化水平示意图 父本印迹基因
惊人发现！胚胎基因表达也要“听妈妈的话”
一项最新研究发现，爪蟾胚胎在发育早期并不能完全控制基因的开启和关闭，但它们的母亲可以通过卵细胞内一些特殊蛋白控制胚胎内基因表达。来自荷兰奈梅亨大学的生物学家在国际学术期刊Nature Communication上发表了这一结果。 爪蟾胚胎不仅从母亲那里得到一半的遗传信息，还得到了如何"使用"D
动物所发现DNA甲基化调控胚胎左右不对称发育
DNA甲基化是常见的表观遗传修饰形式，通常发生在CpG位点中的胞嘧啶，由DNA甲基转移酶所催化，将胞嘧啶（C）转变为5-甲基胞嘧啶（5mC）。DNA甲基化在基因转录调控、染色体结构稳定性、基因印记、X染色体失活等方面发挥作用。脊椎动物早期胚胎全基因组DNA甲基化图谱研究提示DNA甲基化可能在胚胎发育
动物所发现DNA甲基化调控胚胎左右不对称发育
DNA甲基化是常见的表观遗传修饰形式，通常发生在CpG位点中的胞嘧啶，由DNA甲基转移酶所催化，将胞嘧啶（C）转变为5-甲基胞嘧啶（5mC）。DNA甲基化在基因转录调控、染色体结构稳定性、基因印记、X染色体失活等方面发挥作用。脊椎动物早期胚胎全基因组DNA甲基化图谱研究提示DNA甲基化可能在胚胎
科学家揭示克隆胚胎发育异常表观遗传机制
同济大学教授高绍荣和张勇课题组通过对不同发育命运体细胞克隆胚胎进行全基因组DNA甲基化分析，揭示了异常的DNA再甲基化是导致克隆胚胎着床后发育异常的关键因素。该研究近日发表于《细胞—干细胞》。 虽然体细胞克隆在多种动物上已获得成功，但克隆胚胎中DNA甲基化的重编程过程及其对克隆效率的影响在很大
科学家揭示克隆胚胎发育异常表观遗传机制
同济大学教授高绍荣和张勇课题组通过对不同发育命运体细胞克隆胚胎进行全基因组DNA甲基化分析，揭示了异常的DNA再甲基化是导致克隆胚胎着床后发育异常的关键因素。该研究近日发表于《细胞—干细胞》。 虽然体细胞克隆在多种动物上已获得成功，但克隆胚胎中DNA甲基化的重编程过程及其对克隆效率的影响在很大
徐国良院士Nature发表表观遗传学重要成果
表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性，而且这种修饰会受到环境因素的影响。DNA甲基转移酶（DNMT）介导的胞嘧啶甲基化是哺乳动物基因组最常见的一种表观遗传学修饰，在基因组印记、X染色体失活等重要过程中起到了关键性作用。TET家族的双加氧酶能够逐步氧化5-甲基胞嘧啶，由此实现
《Nature》发文阐述人类围着床期胚胎发育分子调控规律
2019年8月22日，北京大学第三医院乔杰课题组和汤富酬课题组合作，在国际权威学术期刊《自然》（Nature，IF：43.07）在线发表研究成果“Reconstituting the transcriptome and DNA methylome landscapes of human impl
Nature发表：－阐述人类围着床期胚胎发育分子调控规律
2019年8月22日，北京大学第三医院乔杰课题组和汤富酬课题组合作，在国际权威学术期刊《自然》（Nature，IF：43.07）在线发表研究成果“Reconstituting the transcriptome and DNA methylome landscapes of human imp
昆明理工大学谭韬、季维智在Cell－Research发表研究文章
2月24日， 国际知名期刊Cell Research（细胞研究，影响因子14.8）以 昆明理工大学灵长类转化医学研究院为第一及通讯作者单位在线发表了灵长类转化医学研究院谭韬和季维智课题组、中国农科院深圳农业基因组研究所高飞课题组，以及同济大学孙毅课题组合作完成的研究论文“De novo DNA
Science专题：大脑的基因表达，发育与疾病
生命是个神秘的个体，它由无法计量的细胞组成。生物学家的工作在于袪魅，发现无知，再解决无知。脑部的神经分布最密集，因此与之有关的疾病更是难以解决的问题。 12月14日的Science公布了PsychENCODE项目的最新成果，阐释有神经精神疾病罹患风险的脑部构造。 神经精神疾病有着十分复杂的
北京大学Nature发布重要甲基化景观图
来自北京大学、教育部辅助生殖重点实验室、哈佛大学等机构的研究人员，绘制出了人类早期胚胎全基因组水平的DNA甲基化景观图谱，提出了有别于以往小鼠研究结果的一些新见解。这些研究结果发表在7月23日的《自然》（Nature）杂志上。 北京大学第三医院的乔杰(Jie Qiao)教授以及汤富酬(Fuch
猪克隆胚胎发育关键候选基因被找到
近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物基因工程与种质创新团队研究发现与猪体细胞克隆胚胎初次分裂时间相关的关键候选基因，为提高猪克隆胚胎的发育效率、解析体细胞克隆机制提供了理论基础。相关研究成果在线发表在《基因》上。 该团队研究员牟玉莲介绍，猪体细胞克隆技术是目前唯一可以通过体细胞遗传物质
暨南大学报道－造血干细胞发育单细胞lncRNA动态表达图谱
来自暨南大学基础医学院兰雨课题组、中国医学科学院基础医学研究所余佳课题组、军事医学科学院附属医院（现为解放军总医院第五医学中心）刘兵课题组合作发表研究论文“Combined Single-Cell Profiling of lncRNAs and Functional Screening Re
任兵教授PNAS发表重要测序技术
高等生物的细胞核负责储存基因组DNA，这些DNA环绕着组蛋白形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质，使DNA受到良好的保护。染色质结构对于DNA转录、复制和修复非常关键，决定着基因的表达和细胞的生理状态。人们通常使用核酸酶MNase和DNase I进行染色质结构分析，但在某
DNA甲基化研究方法的回顾与评价
摘要： DNA甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分，在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用，是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入，各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类：基因组整体水平的甲
DNA甲基化研究方法的回顾与评价(图)
摘要： DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分，在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用，是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入，各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类：整体水平的甲
徐国良院士Nature发文，破解胚胎发育背后的秘密
徐国良院士（图片来源：上海交通大学新闻网） 10月19日，Nature杂志在线发表了题为“TET-mediated DNA demethylation controls gastrulation by regulating Lefty–Nodal signalling”的论文，第一次在体内证明了D
胚胎干细胞“全能”秘密揭晓
瑞士科学家在最新一期《自然·细胞生物学》杂志上发表论文称，他们发现了胚胎干细胞保持“全能”的秘密：一种被称为“Pramel7”的蛋白质能阻止其内遗传物质甲基化，使它能发育成任何类型的细胞。 胚胎干细胞被认为是一种“全能”细胞，可以分化成所有类型的细胞，而成人干细胞和实验室培养的人工胚胎干细胞都
《自然·细胞生物学》：胚胎干细胞保持“全能”的秘密
近期瑞士科学家在最新一期《自然·细胞生物学》杂志上发表论文称，他们发现了胚胎干细胞保持“全能”的秘密：一种被称为“Pramel7”的蛋白质能阻止其内遗传物质甲基化，使它能发育成任何类型的细胞。 胚胎干细胞被认为是一种“全能”细胞，可以分化成所有类型的细胞，而成人干细胞和实验室培养的人工胚胎干细
天然胚胎干细胞“全能”秘密揭晓，“Pramel7”蛋白能阻止
瑞士科学家在最新一期《自然·细胞生物学》发表论文称，他们发现了天然胚胎干细胞保持“全能”的秘密：一种被称为“Pramel7”的蛋白质能阻止其内遗传物质甲基化，使其能发育成任何类型的细胞。 天然胚胎干细胞被认为是一种“全能”细胞，可以分化成所有类型的细胞，而成人干细胞和实验室培养的人工胚胎干
任兵教授Nature重要成果：首张小鼠功能基因组图谱
通常被称之为“生命之书”的人类基因组非常地难于阅读。在没有充分了解其语法和句法的情况下，基因组中29亿的腺嘌呤与胸腺嘧啶、鸟嘌呤和胞嘧啶碱基对为了解人类的基础遗传学提供了有限的认识。 在发表于7月1日《自然》(Nature)杂志上的一篇论文中，来自德维格癌症研究所和加州大学圣地亚哥医学院的
Cell－Res重点论文：单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
Cell－Res重点论文：单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日，北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研