任兵教授Nature重要成果:首张小鼠功能基因组图谱
通常被称之为“生命之书”的人类基因组非常地难于阅读。在没有充分了解其语法和句法的情况下,基因组中29亿的腺嘌呤与胸腺嘧啶、鸟嘌呤和胞嘧啶碱基对为了解人类的基础遗传学提供了有限的认识。 在发表于7月1日《自然》(Nature)杂志上的一篇论文中,来自德维格癌症研究所和加州大学圣地亚哥医学院的研究人员进一步打开了这本书籍,首次绘制了小鼠基因组很大一部分功能性序列的图谱。小鼠是当前在生物医学研究中应用最广泛的哺乳动物模型生物体。 领导这一研究的是加州大学圣地亚哥分校德维格癌症研究所基因调控实验室主任任兵(Bing Ren)教授,其早年毕业于中国科技大学,主要从事哺乳动物细胞基因调控网络分析及细胞表观遗传学调控机制的研究。在Science, Nature, Cell等国际知名杂志上发表论文数十篇。 任兵博士说:“我们知道人类基因组的精确字母已有十多年,但却未必知道这些碱基如何生成了有意义的词汇、段落或生命。......阅读全文
哺乳动物中制备基因组DNA实验
实验材料 动物组织试剂、试剂盒 PBS乙酸铵乙醇酚氯仿异戊醇TE仪器、耗材 离心机摇床研钵实验步骤 1. 切下组织并立即剪成小块,置于液氮中冻结。 2. 将200 mg~1 g 的组织用预冷的研钵和研杵研碎,或用锤子将其捣为细粉末,每100 mg 组织用1. 2 ml 消化缓冲液悬浮。 3.
哺乳动物中制备基因组DNA实验
制备DNA 实验材料 动物组织 试剂、试剂盒
哺乳动物“共同祖先”基因组重建完成
从鸭嘴兽到蓝鲸,每一种现代哺乳动物都是生活在大约1.8亿年前的“共同祖先”的后裔。人们对“共同祖先”知之甚少,现在,一个国际研究小组通过计算重建了其基因组。该成果将发表在《美国国家科学院院刊》上,对理解哺乳动物的进化和保护工作具有重要意义。 研究人员利用了来自32个活物种的高质量基因组序列,这
植物和哺乳动物线粒体基因组的差异
植物细胞植物细胞的线粒体基因组的大小差别很大,最小的为100kb左右,大部分由非编码的DNA序列组成,且有许多短的同源序列,同源序列之间的DNA重组会产生较小的亚基因组环状DNA,与完整的“主”基因组共存于细胞内,因此植物线粒体基因组的研究更为困难。哺乳动物哺乳动物的线粒体基因DNA没有内含子,几乎
哺乳动物中制备基因组DNA实验——制备DNA
在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素,以保证DNA的完整性,为后续的实验打下基础。一般真核细胞基因组DNA有107-9bp,可以从新鲜组织、培养细胞或低温保存的组织细胞中提取,常是采用在EDTA以及SDS等试剂存在下用蛋白酶K消化细胞,随后用酚抽提而实现的。实验材料动物组织试剂、
哺乳动物基因组三维结构首次确定
英国医学研究理事会网站日前报道称,英国科学家从单个细胞中确定出完整保存的哺乳动物基因组的首个3D结构,显示了细胞核内所有染色体中的DNA是如何复杂地折叠在一起的。该项研究成果发表在近日出版的《自然》杂志上。 很多人对于呈现“X”形状的染色体十分熟悉,但事实上,染色体仅在细胞分裂时呈现这种形态。
哺乳动物基因组三维结构首次确定
英国医学研究理事会网站日前报道称,英国科学家从单个细胞中确定出完整保存的哺乳动物基因组的首个3D结构,显示了细胞核内所有染色体中的DNA是如何复杂地折叠在一起的。该项研究成果发表在近日出版的《自然》杂志上。 很多人对于呈现“X”形状的染色体十分熟悉,但事实上,染色体仅在细胞分裂时呈现这种形态。
线粒体基因组的植物细胞和哺乳动物相关介绍
植物细胞 植物细胞的线粒体基因组的大小差别很大,最小的为100kb左右,大部分由非编码的DNA序列组成,且有许多短的同源序列,同源序列之间的DNA重组会产生较小的亚基因组环状DNA,与完整的“主”基因组共存于细胞内,因此植物线粒体基因组的研究更为困难。 哺乳动物 哺乳动物的线粒体基因DNA
迄今最大哺乳动物基因组库为进化提供新见解
当21世纪初,小鼠、人类、大鼠和黑猩猩的完整基因组首次发表后,遗传学家通过比较基因序列为了解哺乳动物进化打开了大门。为什么一些哺乳动物嗅觉特别灵敏?为什么有些哺乳动物要冬眠?为什么一些哺乳动物的大脑发更大?20年后的今天,由美国麻省理工学院、哈佛大学等单位的科学家牵头的大型国际研究项目——“Zoon
哺乳动物调控DNA复制起始以维持基因组稳定性的机理
DNA是主要的遗传物质,也是中心法则的源头。DNA代谢包括DNA复制、转录及DNA修复等。其中,DNA复制保证了遗传信息精确完整地传递,而转录则是细胞身份维持和功能调控的关键。DNA复制发生在整个染色质上,而转录则只发生在染色质上的转录区。如果这两个关键的细胞过程碰撞,犹如独木桥上狮虎相遇,会发
基因组所重复序列与哺乳动物内含子扩张关系研究获进展
近日,在中国科学院北京基因组研究所副所长、基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员和“百人计划”雷红星研究员的指导下,基因组所王大鹏博士、博士研究生苏尧等科研人员在哺乳动物基因组内含子扩张与基因功能关系研究,以及突变和自然选择在基因组进化中的作用研究中取得新进展。相关学术论文在Ev
多种养殖哺乳动物携带的病毒基因组遗传多样性被解码
复旦大学公共卫生学院教授粟硕团队与中国科学院微生物研究所研究员毕玉海等合作者,揭示了多种哺乳动物宏基因组数据中的病毒基因组组成、生态学特征与潜在跨物种传播风险,为构建“人-动物-环境”一体化、多维度新发传染病预测预警体系奠定了重要数据基础。9月4日,相关研究发表于《自然》。21世纪以来,人类多次经历
研究揭示宿主基因组趋同是地下哺乳动物适应穴居生活的趋同演化基础
趋同演化是指亲缘关系较远的物种在相似环境或生活方式下,独立演化出相似的表型或特征。地下哺乳动物独立演化出多种适应性表型和特征,以应对极端地下环境带来的低氧、黑暗等挑战,是研究特殊环境适应性演化与趋同演化的理想模型。目前,地下哺乳动物的适应性演化和趋同演化机制的研究集中在基因组层面,而转录组和肠道
哺乳动物-DNA-的快速分离
根据本方案制备的哺乳动物 DNA 约 20~50 kb,适于作 PCR 反应的模板。DNA 产量在 0.5 到 3.0 μg/mg 组织之间变化,或者是 5~15 μg/300μl 全血。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理根据本方案制备的哺乳动物 DNA 约 20~50 k
哺乳动物可通过肠道吸氧
近日,美国辛辛那提儿童医院研究人员证明,通过直肠提供氧气或含氧液体,能够帮助小鼠等实验动物在低氧条件下存活。研究人员认为,该方法可能提供一个挽救呼吸衰竭的危重患者的新范式。相关研究结果发表于5月14日《医学》。 未参与该研究的美国科罗拉多大学胃肠病学家Sean Colgan表示:“这看起来
哺乳动物组织的匀浆实验
实验方法原理 对于细胞内蛋白的纯化和特性分析,重要的是选择一种有效的方法来破碎细胞或组织,使蛋白迅速地从胞内相对隔离的空间中释放到缓冲液中,而该缓冲液应对所研究的蛋白的生物活性没有影响。广泛使用的破碎软组织的方法之一是匀浆。蛋白酶从其他的细胞区隔中释放出来的风险很小。可以通过在匀浆缓冲液中加人蛋白酶
哺乳动物-DNA-的快速分离
实验方法原理 根据本方案制备的哺乳动物 DNA 约 20~50 kb,适于作 PCR 反应的模板。DNA 产量在 0.5 到 3.0 μg/mg 组织之间变化,或者是 5~15 μg/300μl 全血。实验材料 无 DNase 的 RNase蛋白酶 K哺乳动物组织或全血试剂、试剂盒 细胞裂解缓冲液乙
航运激增威胁北极哺乳动物
研究人员希望,他们的发现将促成破坏性更小的航线。图片来源:PNAS 对于鲸和北极熊来说,融化的海冰绝不仅仅意味着简单的栖息地丧失。一项最新研究表明,开放水域季节变长导致的北极航运量剧增,可能使在北极栖息的众多海洋哺乳动物处于危险境地。 随着夏季海冰覆盖量减少,诸如西北航道等航线在较温
哺乳动物组织的匀浆实验
基本方案 附加方案:从组织匀浆液中去除黏蛋白 实验方法原理 对于细胞内蛋白的纯化和特性分析,重要的是选择一种有效的方法来破碎细胞或组织,使蛋白迅速地
哺乳动物-DNA-的快速分离
实验方法原理 根据本方案制备的哺乳动物 DNA 约 20~50 kb,适于作 PCR 反应的模板。DNA 产量在 0.5 到 3.0 μg/mg 组织之间变化,或者是 5~15 μg/300μl 全血。
哺乳动物“计算时间”机制被发现
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/4/521258.shtm
哺乳动物精核的制备实验
实验材料哺乳动物组织培养细胞(如 HeLa 细胞)试剂、试剂盒PBS裂解缓冲液缓冲液 B仪器、耗材带有 B 型研磨棒的杜恩斯匀浆器光学显微镜实验步骤1. 培养并收获 3L 1×106 细胞/ml 的哺乳动物组织培养的细胞(如 HeLa), 用 1L PBS清洗两次。2. 用 20 倍于沉淀体积(40
早期哺乳动物牙、耳如何演化?
中新网北京4月4日电 (记者 孙自法)在从爬行动物到哺乳动物的进化过程中,有两个最为重要的形态和功能变化,表现在牙齿从简单到复杂以增加食物的摄取能力、下颌头骨关节变为中耳听骨组合以提高听觉效力,二者如何演化备受学界关注。中国科学院古脊椎动物与古人类研究所(古脊椎所)发布消息说,该所毛方园研究员、张驰
哺乳动物细胞的生物特征
哺乳动物是全身被毛,运动快速,恒温,胎生和哺乳的脊椎动物.它是脊椎动物中躯体结构,功能和行为最复杂的一个高等动物类群.鸟类和哺乳类都是从爬行动物起源的,它们分别以不同的方式适应陆栖生活所遇到的许多基本矛盾(陆地上快速运动,防止体内水分蒸发,完善的神经系统和繁殖方式),并在新陈代谢水平全面提高的基
Nature子刊:首个哺乳动物“手机”
来自苏黎世联邦理工学院的研究人员确实地构建出了一种“手机”:他们以这种方式对哺乳动物细胞进行了重编程,使得细胞能够通过化学信号给彼此“打电话”。 打电话是一个相互交流信息的过程:A给B打电话,两者就B应该做的事情达成一致意见。一旦这样做了,B方就会给A方去电话让他或她知道。A不再回复B电话
哺乳动物RNAi技术-Mammalian-RNA-Interference
Mammalian RNA InterferenceThomas TuschlLaboratory for RNA Molecular BiologyThe Rockefeller University, New York Excerpted from RNAi: A Guide To Gene S
哺乳动物精核的制备实验
实验方法原理 实验材料 哺乳动物组织培养细胞(如 HeLa 细胞)试剂、试剂盒 PBS裂解缓冲液缓冲液 B仪器、耗材 带有 B 型研磨棒的杜恩斯匀浆器光学显微镜实验步骤 1. 培养并收获 3L 1×106 细胞/ml 的哺乳动物组织培养的细胞(如 HeLa), 用 1L PBS清洗两次。2. 用 2
揭秘早期哺乳动物的发育过程
由于小鼠的易实验性和强遗传性,其一直是生物医学研究中使用广泛的动物模型。但是,胚胎学研究发现,小鼠早期发育的许多方面与其他哺乳动物不同,从而使有关人类发育的推论复杂化。英国剑桥大学等研究团队合作构建了兔发育的形态学和分子图谱。该研究成果于近日发表在《Nature Cell Biology》,题为
基因代谢速度决定哺乳动物进化
通常认为人类和黑猩猩之间仅有1%~2%的基因差异,但事实上,区分人类和黑猩猩的基因比科学家预料的要多。一项新的研究表明,把人类和近亲——黑猩猩区分开的是人类获得新基因、抛弃旧基因的速率。 人类比黑猩猩和其他哺乳动物基因代谢速度快。(图片提供:《科学》杂志网站) 人类和黑猩猩这两个物种
揭秘:哺乳动物大脑的空间编码
大脑经常被比作一台电脑,它的硬件由组装在复杂回路中的神经元组成;它的软件是管理神经元行为的大量编码。但有时,即使大脑的硬件似乎不足以完成任务,它也会表现得异常出色。例如,尽管大脑的空间感知回路似乎适合代表更小的区域,但是人类和其他哺乳动物如何设法在大规模环境中导航的,这一直是个谜。 在一项新的