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华大基因发表宏基因组测序新成果

人类消化道中居住着大量的微生物,它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用。许多人类疾病都与微生物组失衡有关,但揭示其中的因果关系并不容易。 2014年七月,华南理工大学、华大基因、哥本哈根大学等单位在Nature biotechnology发布了人肠道微生物组参考基因集。研究人员构建了一个高质量、近乎完整的人类肠道微生物基因集数据库,有助于进一步认识肠道菌群与人体生理机能的功能性互作。(更多详细信息参见:人类肠道微生物最高质量参考基因集数据库问世) 现在,华大基因、Paris-Saclay大学和Copenhagen大学的研究人员通过宏基因组测序构建了猪肠道微生物组参考基因集。这一重要成果发表在九月十九日的Nature Microbiology杂志上,文章通讯作者是华大基因的王俊(Jun Wang)、Karsten Kristiansen和Paris-Saclay大学......阅读全文

天然替抗品 促生有益菌

  饲用抗生素的过度使用带来细菌耐药性和超级细菌问题,严重威胁公众健康。伴随着越来越多的国家和地区加入“限抗”和“禁抗”的队伍,寻找和开发“安全、有效、可控、成本低”的天然替抗产品是目前全球研究的热点。  近日,中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所研究员樊伟团队联合湖南农业大学教授曾建国团队、中国

揭开肠道微生物诸多秘密的NCS重磅研究

  最近几年关于肠道微生物的研究越来越火热,日益深入的研究也逐渐揭开了肠道微生物的诸多秘密,越来越多的研究发现肠道微生物与人类健康密切相关。本文中小编为大家盘点了近期关于肠道微生物与健康相关的NCS重磅研究,分享给大家。  【1】Cell:震惊!肿瘤微生物组竟能决定癌症患者的生死  DOI:10.1

华大基因构建全球首个小鼠肠道微生物参考基因集

  2015年9月28日,中国深圳—深圳华大基因研究院、哥本哈根大学等研究机构共同构建了全球首个小鼠肠道微生物参考基因集,为以小鼠为基础的人类疾病模型研究提供有益参考。最新研究成果今日在线发表于《自然生物技术》。  人类的肠道中居住着种类繁多,数量惊人的微生物,而在这些微生物中,细菌的比例高达90%

华大基因Cell子刊发表宏基因组测序新成果

  人类消化道中居住着大量的微生物,它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了重要的作用。许多人类疾病都与微生物组失衡有关。  微生物组研究过去主要依赖16S rDNA基因测序。随着测序成本的直线下降,针对整个菌群的宏基因组测序越来越受到青睐。目前,双胞胎

人体肠道细菌基因组集研究成果

2019年2月5日上午,深圳华大团队在国际知名学术期刊自然旗下子刊自然生物技术上发表了关于人体肠道细菌基因组集(Culturable GenomeReference, CGR)研究成果。该研究提供了1500多条高质量的人体肠道细菌基因组,为肠道微生物组研究提供了大量全新的参考基因组数据,同时

人类肠道微生物基因集 为研究提供精准数据支持

  7月7日,由华南理工大学生物科学与工程学院博士研究生李俊桦为第一作者,与深圳华大基因研究院、丹麦哥本哈根大学等单位共同合作完成的《人肠道微生物组参考基因集》研究成果在《自然—生物技术》上发表。这是“华工—华大”基因组科学创新班学子在国际顶级学术期刊上以第一作者身份发表的第二篇文章。  据介绍,人

中国科研人员构建最优质人肠道微生物参考基因集

  7月7日,由华南理工大学生物科学与工程学院博士研究生李俊桦为第一作者,与深圳华大基因研究院、丹麦哥本哈根大学等单位共同合作完成的《人肠道微生物组参考基因集》研究成果在《自然—生物技术》上发表。这是“华工—华大”基因组科学创新班学子在国际顶级学术期刊上以第一作者身份发表的第二篇文章。  据介绍,人

中国微生物组研究期待新突破

在这个广袤的世界上,存在无数各种各样的微生物,但我们对微生物了解很少,甚至不知道在我们周围有什么样的微生物。世界上所有的哺乳动物和鸟类,几乎已经全部被认知,而我们认知的微生物还不到1%。要知道,我们每个人体内都有大量微生物,一个100斤重的人,体内大约有1.5斤的微生物,它们在我们体内发挥着什么作用

全球40家创新公司竞逐国内微生物组产业走向应用爆发期

  2016年,美国克利夫兰医学中心预言《2017十大医疗创新科技》,其中利用微生物组预防、诊断和治疗疾病领域高居榜首,这表明全球已掀起微生物研究的新热潮且取得瞩目成绩,同时在市场潜力与应用前景方面,微生物组学将焕发无限生机。   我们知道,所有机体包括人在内都与微生物是共生体,人体身上有超过1

土壤动物肠道中砷转化微生物及其代谢方面获进展

  砷是一种广泛分布且毒性较强的环境污染物,随着社会经济的快速发展,大量砷制剂通过工业排放、畜牧养殖及农业生产等途径进入农田土壤系统,不仅对土壤作物生长发育产生不良影响,甚至通过食物链对人和动物的健康构成威胁。蚯蚓是土壤生态系统中一个极其重要的生物多样性储存库,经常被用做评价土壤健康水平和质量的生物

微生物检测:NGS和质谱为行业变革带来契机

微生物检测主要用于辅助诊断,百亿级市场市场空间,潜力很大你可能知道,“抗生素滥用”在中国很普遍。改变这个现状就要靠微生物检测。2011年卫生部颁布了史上最苛刻的《抗菌药物临床管理办法》,把微生物检测的地位提到了前所未有的高度。微生物检测属于IVD的一个细分领域,是对感染性疾病的病原体或代谢物进行检测

乳酸菌研究进入基因与分子生物时代

  继2007年中国食品科学技术学会在上海成功举办第四届亚洲乳酸菌研讨会后,2009年7月1—3日,由新加坡国立大学(NUS)与新加坡微生物与生化协会(SSMB)主办的第五届亚洲乳酸菌研讨会在美丽的狮城——新加坡举行。来自新加坡、中国、荷兰、瑞典、芬兰等20个国家及中国台湾地区的共319位业界代表出

中国最高引用100篇文章出炉 最高引用6091次的竟然是这篇

  对于中国引用量最高的100篇文章,一直不是很清楚。iNature花了数月时间,仔细的整理了中国学者发表的引用量最高的100篇文章。我们发现:  【1】对于这100篇文章而言,平均引用量是2142次,其中最高引用量是赫捷发表的CA文章,引用量达到了6091次,最少的为1496次;  【2】100篇

国际人类微生物组联盟启动

经过近3年的酝酿和筹备,以解析人类共生微生物与健康关系为目标的国际人类微生物组联盟(IHMC)近日在德国海德堡宣布成立。来自美国国立卫生研究院(NIH)、欧盟委员会,以及中国、日本等9个国家的科学家出席成立大会并交流了各自的计划和进展。 基因与环境相互作用决定人体健康,目前大量的研究都集中在分析人

引发哮喘的原因是什么?

  哮喘是肺部的一种慢性炎症性疾病,主要症状是气器官受阻,导致患者难以呼吸。西方社会中哮喘更为普遍,并且通常在童年时期发生。然而,导致它的原因又是什么呢?  鉴于哮喘在西方社会中的发病率是全球发生率的五倍,这表明生活方式对该疾病的发生起着重要作用。由于通常在儿童时期发展,许多研究试图以发生或未发生哮

春节来了!让科学家告诉你如何做一个健康的吃货!

  马上就要过年了,吃货的春天又将来临,想必大家都已经准备好了上好的食材,时刻准备着磨刀嚯嚯向猪羊。或与家人团圆欢聚,或与朋友把酒言欢,或畅谈发小一吐不快,或智斗姑姨险避相亲,但是都逃不开一个字儿:吃!那么问题就来了:怎么海吃海喝才能不长肉呢?我们来看看达尔文怎么说:物竞天择,适者生存!这是什么意思

Nature子刊:新测序技术揭示细菌多样性

  斯坦福大学的研究人员首次将一种新测序技术用于人类肠道微生物组,揭示了惊人的细菌多样性。这项研究发表在十二月十四日的Nature Biotechnology杂志上。  “这些细菌在遗传学上比我们想象的更加多样化,”文章资深作者Michael Snyder教授说。人类个体之间只有千分之一的基因组序列

Nature Methods发布宏基因组测序新工具

  微生物几乎是无所不在的,它们对生态环境和人体健康起到了不容忽视的作用。然而人们对微生物的了解还相当匮乏,因为许多微生物是无法在实验室中培养的。宏基因组学是了解这些微生物的重要途径,但宏基因组测序并不是一件容易的事儿,就像是把许多拼图拆散混在一起,然后在毫无参考的情况下拼接。  最近Nature

如何测人体最大微生态库?下一代测序来帮忙

  在人体中最大的微生态库是生活在人体消化道微生物复合群落组成的肠道菌群,别看人体肠道所占体积不大,但是人体肠道内寄生着10万亿个细菌,它们能影响体重和消化能力、抵御感染和自体免疫疾病的患病风险,还能控制人体对癌症治疗药物的反应。  人体肠道的正常微生物,如双歧杆菌,乳酸杆菌等能合成多种人体生长发育

科学家开发新的宏基因组分析工具

  对环境样品(如海水、医院表面和人类肠道)直接进行微生物测序,已经阐明了我们世界中存在的大量微生物。然而,一个微生物物种可能存在遗传多样性,而在宏基因组分析中往往捕获不到这种多样性。最近在《Genome Research》发表的一项研究中,科学家们开发了一种新的工具,来检测细菌物种内的遗传差异,并

多亏“双胞胎” 科学家找到研究肠道菌群好路子

  首个双胞胎群体的肠道微生物宏基因组鸟枪法测序研究项目成果表明,人体自身遗传背景及外部环境对肠道菌群的组成、功能和代谢有重要影响。12月21日,由华大基因研究院、深圳国家基因库、澳门科技大学和伦敦国王学院等机构组成的研究团队取得的最新成果发表于《细胞系统》。  肠道菌群在人体健康和疾病中扮演着极其

方法速递--肠道菌群代谢物的检测及意义

  上海交通大学附属第六人民医院转化医学中心贾伟教授团队目前在肠道菌群代谢物检测方面工作取得了新进展,开发了一种基于气相色谱-飞行时间质谱联用技术(GC-TOF/MS)的高通量绝对定量检测150种重要肠道菌群代谢物的微生物代谢组学分析方法,能够在15分钟内实现对血清、尿液、粪便或者细菌(如大肠杆菌)

方法速递--肠道菌群代谢物的检测及意义

  上海交通大学附属第六人民医院转化医学中心贾伟教授团队目前在肠道菌群代谢物检测方面工作取得了新进展,开发了一种基于气相色谱-飞行时间质谱联用技术(GC-TOF/MS)的高通量绝对定量检测150种重要肠道菌群代谢物的微生物代谢组学分析方法,能够在15分钟内实现对血清、尿液、粪便或者细菌(如大肠杆菌)

方法速递:肠道菌群代谢物的检测及意义

上海交通大学附属第六人民医院转化医学中心贾伟教授团队目前在肠道菌群代谢物检测方面工作取得了新进展,开发了一种基于气相色谱-飞行时间质谱联用技术(GC-TOF/MS)的高通量绝对定量检测150种重要肠道菌群代谢物的微生物代谢组学分析方法,能够在15分钟内实现对血清、尿液、粪便或者细菌(如大肠杆菌)等样

盘点食品界中渐渐崛起的基因测序

  2015年可谓是基因测序的元年,自精准医疗概念提出以来,基因测序在我国曾几度被央视报道。随着人类基因组计划的完成,基因测序技术不断提高,价格也不断降低,人类完成各种基因组测序成为了可能。无论在医疗行业还是在农业等领域,基因测序技术均大放光彩,殊不知,近年来基因测序在食品行业也渐渐崛起。本文综述了

基因梦工厂里那些年轻人:没上大学就做研究

  世界总会让年轻人占领。   曾经和乔布斯一起演讲的小天才Thomas Suarez今年还在读初中,现在他在名叫MakerBot的机器人创业公司研究3D打印机。而出生于1997年的邹奇奇,8岁出版了12万字故事集《飞扬的手指》轰动美国,2013年登上TED时她已有“女权主义者”标签和赢得诺贝

赵立平撰文谈肠道菌群与慢性病的关系

  6月17日出版的《自然》(Nature)杂志,在NEWS and VIEWS栏目刊登了上海交通大学教授的文章。  应该刊编辑部的邀请,针对《自然》和《科学》杂志最近发表的有关人体元基因组的论文,赵教授评价了这些论文在理解肠道菌群与慢性病的关系的意义。文章指出,下一阶段人体元基因组学研究

7月5日《科学》杂志精选

  英研究揭示得到土地终极价值策略   一项新的研究强调,通过考虑土地的多种用途——并不只是那些像农业生产这种会产生眼前利益的用途——我们赖以生存的土地最终会产出更多的价值。组成我们多种生态系统景观的树木、土壤、平原和水路会产生让社会受益的范围广泛的服务,其中包括温室气体的封存、防洪、开放式获取的

7月5日Science杂志精选

封面故事:埃平森林的农田鸟瞰图景   英国全国范围的研究揭示了得到土地终极价值的策略   一项新的研究强调,通过考虑土地的多种用途——并不只是那些像农业生产这种会产生眼前利益的用途——我们赖以生存的土地最终会产出更多的价值。组成我们多种生态系统景观的树木、土壤、平原和水路会产生让社会受益的范围广

华大参与:复杂宏基因组数据的新分析法

  当前分析宏基因组数据的大多数方法,都依赖于与参考基因组的对比,但是许多环境中的微生物多样性远远超过了参考数据库所覆盖的范围。将复杂的宏基因组数据从头划分为特定的生物学实体(如特定的菌株或病毒),在很大程度上仍然是一个未解决的问题。  在2014年7月6日的《Nature Biotechnolog