中科大最新Nature子刊发现lncRNA新功能

来自中科大的消息,中国科学技术大学教授单革课题组发现并命名了一个长链非编码RNA――5S-OT,并发现在灵长类中,5S-OT RNA获取了调控多个基因可变剪切的新功能。该研究成果发表在10月3日出版的《自然-结构和分子生物学》上。论文的共同第一作者为课题组的博士生胡珊珊和硕士生王小林。从酵母到人类的各种真核细胞中,基因组DNA上的信息主要是由RNA聚合酶II及RNA聚合酶III读取并转录产生相应的RNA。这些RNA按照其是否会作为蛋白质翻译的模板,可以分为编码RNA(mRNA,即信使RNA)和非编码RNA。非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起着调控作用的RNA分子。而mRNA往往以大的pre-mRNA前体方式产生并随后进行剪切,产生能真正作为翻译蛋白质的mRNA模板。研究人员发现,在高级灵长类和人类当中,5S-OT RNA获取了调控多个基因可变剪切的新功能。在高级灵长类和人类中,5S-OT中插入了一个反义Alu序列,并因......阅读全文

基因表达的机制

转录转录过程由RNA聚合酶(RNAP)进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”(产生RNA转录物的模板)和“编码链”(含有转录本序列的DN

AI揭示影响人脑发育基因组突变

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494310.shtm 科技日报北京2月21日电 (记者张梦然)美国研究人员使用人工智能(AI)模型揭示了可能影响人类认知进化的基因组突变。这项人类基因组学的开创性研究可能会促进发现复杂脑部疾病的新疗法

Nature里程碑式成果:“垃圾”DNA的起源

  来自宾州大学的研究人员取得了一项里程碑式的研究新发现:他们发现了转录起始的精确位点,从而为解析基因组“暗物质”的起源迈出了重要的一步。这一研究成果公布在9月18日的《Nature》杂志上,这将有助于分析复杂疾病特征所在的确切位置。   所谓基因组“暗物质”,其实就是基因组中的非编码RNA——不

脱氧核糖核酸的生理功能

在基因组中,遗传信息存储在称为基因的DNA序列中,这个遗传信息的传递由互补的含氮碱基序列的存在得到保证。事实上,在转录过程中,遗传信息可以很容易地被转录到互补的RNA链中(mRNA)。mRNA通过翻译合成蛋白质。或者,细胞可以通过称为DNA复制的过程简单地复制遗传信息。基因组结构真核生物基因组DNA

脱氧核糖核酸的生物功能

在基因组中,遗传信息存储在称为基因的DNA序列中,这个遗传信息的传递由互补的含氮碱基序列的存在得到保证。事实上,在转录过程中,遗传信息可以很容易地被转录到互补的RNA链中(mRNA)。mRNA通过翻译合成蛋白质。或者,细胞可以通过称为DNA复制的过程简单地复制遗传信息。基因组结构真核生物基因组DNA

脱氧核糖核酸的生理功能

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脱氧核糖核酸的生物功能

在基因组中,遗传信息存储在称为基因的DNA序列中,这个遗传信息的传递由互补的含氮碱基序列的存在得到保证。事实上,在转录过程中,遗传信息可以很容易地被转录到互补的RNA链中(mRNA)。mRNA通过翻译合成蛋白质。或者,细胞可以通过称为DNA复制的过程简单地复制遗传信息。基因组结构真核生物基因组DNA

脱氧核糖核酸的生物功能

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脱氧核糖核酸的生物功能

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细胞化学基础脱氧核糖核酸生物功能

在基因组中,遗传信息存储在称为基因的DNA序列中,这个遗传信息的传递由互补的含氮碱基序列的存在得到保证。事实上,在转录过程中,遗传信息可以很容易地被转录到互补的RNA链中(mRNA)。mRNA通过翻译合成蛋白质。或者,细胞可以通过称为DNA复制的过程简单地复制遗传信息。基因组结构真核生物基因组DNA

我国发现一类新型长非编码RNA-基因组“暗物质”不断“正名”

  国际著名学术期刊Molecular Cell近日在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新进展。该研究发现,一类新型长非编码RNA,或与小胖威利综合征的发生发展密切相关。  人类基因组中存在大量被称为基因组“暗物质”的非编码序列,包括基因

浙大揭示新冠病毒RNA非编码区域与宿主蛋白质互作网络

  近日,浙江大学生命科学研究院冯新华、蒋超、任艾明、杨兵实验室在美国微生物协会(American Society for Microbiology)旗下的期刊mSystems杂志上合作发表了题为“High-sensitivity profiling of SARS-CoV-2 noncoding

中国科技大学Nature子刊聚焦环状RNA

  来自中国科技大学、华中师范大学等处的研究人员报告称,他们鉴别出了一类与RNA聚合酶Ⅱ相关的环状RNA(circRNAs),将之命名为外显子-内含子circRNAs(EIciRNAs)。并证实这些EIciRNAs调控了细胞核中的转录。这些研究成果在线发表在2月9日的《自然结构与分子生物学

长非编码RNA与肺癌转移

  我们体内的大多数DNA(约80%)并没有编码蛋白,不过它们会转录为RNA。这些非编码的RNA分子负责在细胞中实现多种功能。microRNA等小RNA已经被研究得很多了,近年来人们又发现了一类长非编码RNA,这些RNA拥有两百个以上的核苷酸。   长非编码RNA对细胞周期、细胞生长和细胞死亡等细

Nature解析癌症与非编码RNA

  人类基因组可生成1万多种长链非编码RNA(lncRNA) 分子,但人们至今却只知道其中几十种转录物的功能。在发表在8月14日《自然》(Nature)杂志上的一篇新研究中,来自加州大学的杨柳青(Liuqing Yang,音译)等研究人员揭示,两种lncRNAs结合并控制了雄激素受体的功能。

《自然》:研究揭示mRNA非编码功能

  由1962年诺贝尔生理学或医学奖获得者英国科学家克里克和美国科学家沃森提出的分子生物学中心法则认为,遗传信息是从DNA(脱氧核糖核酸)传递给mRNA(信使核糖核酸),再从mRNA传递给功能蛋白质,由此来完成遗传信息的转录和翻译过程的。  根据这一中心法则,mRNA似乎只有唯一的功

良好的开端:破译非编码突变!

  12月14日,《Science》杂志报道,一项针对将近2000个家庭的全基因组测序研究显示,自闭症患者基因组的“启动子”区发生了突变,首次在全基因组分析背景下,揭示了人类基因组中非编码突变的作用。  大多数自闭症等疾病的测序研究都集中在基因组的编码区,因为人们认为编码基因是构建蛋白质的“食谱”。

细胞化学词汇非编码小RNA

中文名称:非编码小RNA英文名称:small non-messenger RNA;snmRNA定  义:细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科:生物化学

修正基因组法有效提高非模式生物蛋白质组鉴定的新策略

  随着高通量测序技术的不断崛起,全基因组测序也逐步普及。越来越多的物种基因组予以公布。目前,主要有两种获得研究物种参考基因组的策略:de novo 基因组拼接和基于mapping算法的基因组序列修正,mapping是指将所有测序读段通过序列比对定位到参考基因组上。De novo 基因组拼接是利用短

关于组蛋白基因的研究进展介绍

  人体蛋白质编码基因数量最早估计有10万个左右,人类基因组计划将其数量减少到了2万个左右,而最新研究再次将这一数量减少到了1.9万。研究负责人、西班牙国立癌症研究中心的Alfonso Valencia说,几年前无人会想到,如此少的基因会创造出人类这样如此复杂的物体。  研究人员说,人类和灵长类动物

雪貂基因组测序加深人类疾病研究

   近日,一个国际研究团队进行了雪貂基因组测序,他们认为这将巩固雪貂作为研究人类呼吸道疾病如流感和囊性纤维化的生物模型。   研究人员检查了雪貂感染大范围流感病毒后基因随着时间推移的不同表达,通过研究囊性纤维化雪貂模型反映了人类疾病的发展。   基因分析中心的合著人Federica Di Palm

-牛津大学校刊:人类蛋白质编码基因数量降至1.9万

  7月10日消息,据Science Daily报道,人体蛋白质的编码基因数量最早估计有10万个左右,人类基因组计划将其数量减少到了2万个左右。而最新研究再次将这一数量减少到了1.9万。  研究负责人、西班牙国立癌症研究中心的Alfonso Valencia说,几年前无人会想到,如此少的基因会创造出

长链非编码RNAs介导的表观遗传调控基础

  近日,中国科学院昆明动物研究所李家立、胡新天和郑永唐课题组与中国科学技术大学生命科学学院汪香婷课题组、武汉生命之美生物科技公司合作,揭示了长链非编码RNAs在灵长类大脑发育和老化过程中表达动态变化和作用。该研究成果以Annotation and cluster analysis of spati

利用LCMS/MS等方法-发现线粒体基因组编码蛋白质的新模式

图 线粒体编码基因CYTB的双重翻译模式  在国家自然科学基金项目(批准号:92254301、92357302、32025010)等资助下,中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国研究员团队在线粒体基因组编码研究方面取得进展,研究成果以“线粒体基因CYTB编码的新蛋白质CYTB-187AA调控哺乳动

正粘病毒化学组成及其功能(一)

流感病毒由68%~70%的蛋白质、1%~2%的核糖核酸(RNA)、20%~25%脂质和5%~8%的糖组成。病毒蛋白质含有5种多肽,即血凝素、神经氨酸酶、基质蛋白、核蛋白和多聚酶。  (1) 正粘病毒基因组组成 〖HT5SS〗流感病毒的基因组是由8个分节段的单链、负股RNA组成,其中4、6号两个节段

陈玲玲,杨力受邀Cell子刊发表综述:核重复序列

  2月10日,上海生化细胞所陈玲玲研究员与上海生科院(健康院)计算生物学所杨力研究员受邀在《Trends Cell Biol》发表了题为“ALUternative Regulation for Gene Expression.”的综述论文,系统总结了灵长类(包括人)基因组中特异的Alu短散在核重复

乙肝病毒基因组的结构特点和功能介绍

  乙肝病毒(HBV)的基因组DNA结构很奇特,是一环状的部分双螺旋结构,长约3.2kb。其中的2/3为双螺旋结构,1/3为单链,这就是说,DNA中的两条链不等长。长链的5'端与3'端无共价连接,而是与一种蛋白质共价相连。长链的5'端以250-300对碱基互补结合。长链为负链

在非结核分枝杆菌的基因组中,糖分解途径相关酶编码基因有哪些?

  非结核分枝杆菌(Non-tuberculous mycobacteria,简称NTM)是一类广泛存在于环境中的细菌,其中一些种类可以引起人类和动物的感染。在非结核分枝杆菌的基因组中,糖分解途径相关酶编码基因主要包括以下几种:  糖酵解途径(Glycolysis):这是细胞获取能量的主要途径。非结

黄病毒属长链非编码亚基因组RNA的溶液结构研究中新进展

  9月10日,生命学院方显杨课题组和军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所秦成峰课题组合作,在《欧洲分子生物学报道》(EMBO Reports)上发表了题为“黄病毒属长链非编码亚基因组RNA在溶液中具有伸展的三维结构并具有柔性”(Long non-coding subgenomic flavi

丙型肝炎病毒的基因结构

  HCV-RNA约有9500-10000bp组成,5′和3′非编码区(NCR)分别有319-341 bp,和27-55 bp,含有几个顺向和反向重复序列,可能与基因复制有关。在5′非编码区下游紧接一可读框(ORF),其中基因组排列顺序为5'-C-E1-E2-p7-NS2-NS3-NS4-N