良好的开端:破译非编码突变!
12月14日,《Science》杂志报道,一项针对将近2000个家庭的全基因组测序研究显示,自闭症患者基因组的“启动子”区发生了突变,首次在全基因组分析背景下,揭示了人类基因组中非编码突变的作用。 大多数自闭症等疾病的测序研究都集中在基因组的编码区,因为人们认为编码基因是构建蛋白质的“食谱”。但是,超过98%的人类基因组由基因以外的物质组成。“如果它们没有用,我们不可能让它们留在基因组中,”这项研究的领导人之一、加州大学旧金山研究所的Stephan Sanders说。 在诸如自闭症等疾病中定位非编码区的作用比定位基因的作用要困难得多,既是因为数据量大,又因为非编码区域功能理解不充分。具有意义的是,新研究从2000个家庭的数据噪音中提取了有用信号。 Sanders课题组调查了自闭症家族数据库Simons Simplex收藏中1920个“四重奏”(自闭症儿童、未受影响的父母和未受影响的兄弟姐妹)。研究发现,在基因组的启动子......阅读全文
智力障碍相关非编码基因突变发现
科技日报北京6月6日电 (记者张梦然)新一期《自然·医学》发表的一项大规模遗传学研究结果显示,相比目前已知的其他任何非性别相关基因,RNU4-2基因的罕见突变,可能是更多临床诊断智力障碍病例的一个促进因素。新发现有望促进对特定神经发育疾病的诊断和治疗。智力障碍是一种神经发育疾病,其特征为智力功能以及
非编码区的作用
非编码区虽然不能编码蛋白质,但对于遗传信息表达是不可缺少的。在它上面有调控遗传信息表达的核苷酸序列,是有遗传效应的。比如RNA聚合酶结合位点。非编码区对目的基因是不可缺少的。非编码区上有与RNA聚合酶的结合位点,具有调控作用。基因非编码区的碱基的插入、缺失和替代也属于基因突变事件,尽管大多数的研究是
非编码区的定义
基因是由成千上万个核苷酸对组成。组成基因的核苷酸序列可以分为不同区段。在基因表达的过程中,不同区段所起的作用不同。能够转录为相应信使RNA,进而指导蛋白质合成(也就是能编码蛋白质)的区段叫做编码区。不能编码蛋白质的区段叫做非编码区。非编码区位于编码区前后,同属于一个基因,控制基因的表达和强弱 。
Cell惊人发现:谁说非编码RNA不编码?
来自德克萨斯大学西南医学中心的Eric Olson和同事们在分析梳理肌肉特异性的长链非编码RNAs(lncRNAs)以了解它们的功能时,发现了一种在骨骼肌中特异性表达的lncRNA。尽管这一RNA以往被归类为是非编码RNA,它的序列中包含的一小段却看上去好像一个编码区域。这一研究发现发布在《细胞
自闭症或因父亲基因突变-非编码区DNA结构变体潜藏祸端
《科学》杂志官网近日消息称,一项探索非编码DNA的新研究发现,调节基因活性区域的改变也可能导致自闭症,令人惊讶的是,这些变化倾向于从非自闭症的父亲那里继承而来。 过去十年中,研究人员已经发现了数百种可能影响大脑发育,从而增加自闭症风险的基因变异,但这些变异主要来自直接编码蛋白质的DNA中。此外
非编码序列的定义
中文名称非编码序列英文名称non-coding sequence定 义基因中不具有编码功能的序列。如真核生物基因的内含子、启动子等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
非编码序列的概念
中文名称非编码序列英文名称non-coding sequence定 义基因中不具有编码功能的序列。如真核生物基因的内含子、启动子等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
简述非编码RNA的成熟
多数生物体中的非编码基因(ncRNA)被转录为需要进一步加工的前体。核糖体RNA(rRNA)通常被转录为含有一个或多个rRNA的前体rRNA,前体rRNA后来在特定位点被大约150种不同的snoRNA切割和修饰。转移RNA(tRNA)的5'和3'端序列分别被RNase P和tRN
长非编码RNA与肺癌转移
我们体内的大多数DNA(约80%)并没有编码蛋白,不过它们会转录为RNA。这些非编码的RNA分子负责在细胞中实现多种功能。microRNA等小RNA已经被研究得很多了,近年来人们又发现了一类长非编码RNA,这些RNA拥有两百个以上的核苷酸。 长非编码RNA对细胞周期、细胞生长和细胞死亡等细
《自然》:研究揭示mRNA非编码功能
由1962年诺贝尔生理学或医学奖获得者英国科学家克里克和美国科学家沃森提出的分子生物学中心法则认为,遗传信息是从DNA(脱氧核糖核酸)传递给mRNA(信使核糖核酸),再从mRNA传递给功能蛋白质,由此来完成遗传信息的转录和翻译过程的。 根据这一中心法则,mRNA似乎只有唯一的功
Nature解析癌症与非编码RNA
人类基因组可生成1万多种长链非编码RNA(lncRNA) 分子,但人们至今却只知道其中几十种转录物的功能。在发表在8月14日《自然》(Nature)杂志上的一篇新研究中,来自加州大学的杨柳青(Liuqing Yang,音译)等研究人员揭示,两种lncRNAs结合并控制了雄激素受体的功能。
细胞化学词汇非编码小RNA
中文名称:非编码小RNA英文名称:small non-messenger RNA;snmRNA定 义:细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科:生物化学
良好的开端:破译非编码突变!
12月14日,《Science》杂志报道,一项针对将近2000个家庭的全基因组测序研究显示,自闭症患者基因组的“启动子”区发生了突变,首次在全基因组分析背景下,揭示了人类基因组中非编码突变的作用。 大多数自闭症等疾病的测序研究都集中在基因组的编码区,因为人们认为编码基因是构建蛋白质的“食谱”。
Nature重要发现:独特的非编码RNA
我们的皮肤表皮是由许多不同细胞类型构成的混合体,每种细胞类型都有非常明确的职责。这样复杂的组织,其生成或分化在细胞水平上需要进行大量的协调,这一过程发生故障可以导致灾难性的后果。现在,来自斯坦福大学医学院的研究人员确定了这一分化过程的一个主要调控因子。研究成果发表在12月2日的《自然》(Natu
非编码小RNA的结构和功能
中文名称非编码小RNA英文名称small non-messenger RNA;snmRNA定 义细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科生物化学与分子生
长链非编码RNA调控肿瘤生长
人类基因组能够产生10000多种长链非编码RNA(lncRNA),但是至今为止,人们只知道几十种lncRNA分子的功能。 加州大学圣地亚哥分校的Liuqing Yang等人发表在Nature上的一项研究成果表明,两种lncRNAs可以与雄激素受体结合并控制其功能。雄激素受体是一种转录因
长链非编码-RNA(lncRNA)研究策略
长链非编码 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子,它们不编码蛋白,位于细胞核或胞质内,具有保守的二级结构。研究显示,lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能,它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作
关于长非编码核糖核酸研究
10月6日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员陈玲玲在《自然-方法》(Nature Methods)上,发表了题为Towards higher-resolution and in vivo understanding of lncRNA biogenesis
长链非编码-RNA-测序案例分析
背景:人类寿命的延长伴随着神经退行性疾病的发病几率的增加,因而价格不贵的血液诊断的发展迫在眉睫。通过 RNA-seq 分析血液细胞的转录本是发现新的生物标志物的非常高效的途径。 目的:利用 Illumina 测序平台对帕金森病人白血球中 lncRNAs 进行分析,探讨其对 mRNA 选择性剪接的
非编码小RNA的基本信息
中文名称非编码小RNA英文名称small non-messenger RNA;snmRNA定 义细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科生物化学与分子生
非编码RNA的功能引发国际研究热潮
由1962年诺贝尔生理学或医学奖获得者英国科学家克里克和美国科学家沃森提出的分子生物学中心法则认为,遗传信息是从DNA(脱氧核糖核酸)传递给mRNA(信使核糖核酸),再从mRNA传递给功能蛋白质,由此来完成遗传信息的转录和翻译过程的。 根据这一中心法则,mRNA似乎只有唯一的
非编码RNA为癌症研究提供新思路
澳大利亚纽卡斯尔大学和中国科技大学等机构合作完成的两项最新研究表明,非编码RNA(核糖核酸)在癌症治疗方面存在巨大潜力,有助于开发出新型的癌症靶向治疗方法。 非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA。长期以来,全球各地开展的癌症研究主要针对能编码蛋白质的基因,这些基因只占人类基因组的2%。 发表
如何揭开长非编码RNA的神秘面纱
长非编码RNA(lncRNA)长达两百个核苷酸以上的转录本,但并不编码任何蛋白质。尽管如此,长非编码RNA在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,说明lncRNA的调控具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA(也称lincRNA)位于细胞核,它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠,
深入研究非编码RNA的新工具
最近,加拿大多伦多大学Donnelly中心的一个研究小组,开发出了一种方法,可使科学家们能够深入探索“ncRNAs在人类细胞内做了什么”。 这项研究发表在5月19日的《Molecular Cell》杂志,同一天,来自新加坡基因组研究所的Yue Wan研究组与斯坦福大学的Howard Chang
带你走进神秘的长链非编码RNA
长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平。lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。然而,近年来的研究
中国科大发现新型非编码RNA
最近,中国科学技术大学单革教授实验室在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)发表研究性论文,报导了其实验室发现的一类新型非编码RNA以及此类非编码RNA的功能和功能机理。 非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起
可以促进癌细胞生长的非编码RNA
国际著名学术期刊《美国国家科学院院刊》发表西奈山伊坎医学院教授Benjamin Greenbaum的一篇研究文章。研究人员在癌细胞中发现了一组可以激发免疫反应的非编码RNA分子,它们具有与病原体相似的一些特征。由于这些分子在癌细胞中表达并扩增,它们造成的免疫反应有可能影响癌细胞的生长。 研究
Science首次证实全新基因的非编码来源
在过去的几年里,科学家们已逐渐认识到基因组中本来是非编码的区域,确实有可能形成新基因。事实上,相关物种基因组的比较也甚至指出,这种从头形成基因的方式也许是一种普遍模式。 来自加州大学戴维斯分校的研究人员近期发现了在6种果蝇株系中全部或部分表达的142个转录子,对应于果蝇参考基因组(refe
长链非编码RNA:-从科研到临床
长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子;根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA;它具有多种作用机制,比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结构
出人意料的非编码RNA调控
为了将六英尺多的DNA塞进细胞核里,细胞将基因组紧紧缠绕在组蛋白核心上形成核小体,并最终将其包装成紧密的染色质。DNA转录的时候需要打开核小体,而胚胎干细胞的染色质重塑复合体esBAF可以做到这一点。它不仅会打开需要转录的DNA,还暴露了促进转录的启动子和增强子。 基因组测序研究最近显示,增强