中科院Cell子刊发表lncRNA新发现

生物通报道:长非编码RNA(lncRNA)是一些长度超过二百个核苷酸的RNA分子,来自于基因组的非编码区域。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段特异性表达。研究者们普遍认为lncRNA具有重要的生物学意义,但对它们的具体功能还知之甚少。 中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所的研究团队最近鉴定了一种源自多顺反子转录本的lncRNA。他们在Molecular Cell杂志上发表文章指出,一种不寻常的加工机制会生成能隔离多个RNA结合蛋白的SPA LncRNA。这项研究的通讯作者是中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所的陈玲玲(Ling-Ling Chen)研究员。 研究显示,SPA LncRNA具有5′snoRNA帽子和3′多聚腺苷酸化。这种LncRNA的加工不仅与新生mRNA 3′加工有关,还涉及XRN2修剪与Pol II延伸的动态竞争。研究人员发现,位于15q11 -q......阅读全文

中科院Cell子刊解析非编码RNA

  来自中科院、福建农林大学等机构的研究人员在新研究中证实,一种叫做NRAV的长链非编码RNA(lncRNA)通过抑制干扰素刺激基因转录调控了抗病毒反应。这一研究发现发表在11月12日的《Cell, Host & Microbe》杂志上。  中科院微生物研究所的陈吉龙(Ji-Long Chen)研究

北京大学最新学术论文介绍LncRNADisease

  来自北京大学的研究人员在世界上首次创建并发布了长非编码RNA疾病数据库(lncRNA and disease database, LncRNADisease),这一数据库收录了160多种和长非编码RNA有关的疾病,并集成了一个生物信息学工具用以预测新的人类长非编码RNA和疾病的关系。这一研究

长链非编码RNA测序服务助力揭开lncRNA神秘面纱

  2012年12月18日,华大基因科技服务有限公司(简称“华大科技”)在国内推出长链非编码RNA测序(lncRNA-Seq)服务。该技术突破了常规研究方法效率低、研究范围受限的瓶颈,可一次性获得样本中几乎全部的lncRNA序列,不仅可以对已知lncRNA进行定量分析,还可对 novel lnc

lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程

   自然杀伤(NK)细胞是一类先天性免疫淋巴细胞,与体外病毒感染和免疫调节有关。但是,lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术,分析了NK细胞中lncRNA表达模式,发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中,lnc-CD

lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程

   自然杀伤(NK)细胞是一类先天性免疫淋巴细胞,与体外病毒感染和免疫调节有关。但是,lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术,分析了NK细胞中lncRNA表达模式,发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中,lnc-CD

又一国产高分数据库,堪称lncRNA神器

  之前我们介绍了好用的CRN数据库,可以在线分析差异表达lncRNA并绘制与差异mRNA联系的网络图。那么有没有能直接出lncRNA与预后相关的生存曲线图的工具呢?答案当然是有的!这次我们就一起来看一下这个数据库!  lnCAR数据库(https://lncar.renlab.org/)是由中山大

外泌体lncRNA介导的淋巴转移机制的揭秘(一)

文章导读外泌体是指包含多种RNA(环状RNA、miRNA、LncRNA和mRNA等)和蛋白质的盘状囊泡(30-200nm)。几乎所有类型的细胞均可分泌外泌体,且外泌体天然存在于各种体液中,包括血液、唾液、尿液、脑脊液和乳汁等。外泌体被视为特异性分泌的膜泡,能够参与细胞间通讯。目前,有关外泌体分泌、摄

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析(一)

近日,南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果,以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinogenesis by epigenetically silencing EphB3 throu

外泌体lncRNA介导的淋巴转移机制的揭秘(二)

(5)外泌体LNMAT2上调PROX1的表达有研究报道,PROX1通过调节内皮细胞的分化和转移,对淋巴管系统发育至关重要。因此作者通过qPCR和WB实验发现,HLECs中上调LNMAT2能够促进PROX1的表达;为了探究LNMAT2调控PROX1表达的分子机制,作者进行核质分离PCR,发现LNMAT

lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程

   自然杀伤(NK)细胞是一类先天性免疫淋巴细胞,与体外病毒感染和免疫调节有关。但是,lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术,分析了NK细胞中lncRNA表达模式,发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中,lnc-CD

lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程

   自然杀伤(NK)细胞是一类先天性免疫淋巴细胞,与体外病毒感染和免疫调节有关。但是,lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术,分析了NK细胞中lncRNA表达模式,发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中,lnc-CD

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析(二)

2. GC细胞中FOXD2-AS1富集高的患者预后较差在芯片数据GSE51575基础上,以正常组织作为对照,来评估FOXD2-AS1的诊断效果。ROC曲线下面积为0.919(95%置信区间[CI] 0.809-0.976; P < 0.0001);特异性和敏感性分别为0.885和0.885。

全转录组测序的“一箭三雕”:circRNA,lncRNA,mRNA

1. 文章主题:环状RNA通过靶向miRNA调控的信号传导促进结直肠癌的转移发表期刊:Journal of pathology影响因子:5.942发表时间:201906实验方法:全转录组测序实验样本:结直肠癌组织肝转移是结直肠癌(CRC)患者的主要死亡原因。作者使用全转录组测序在CRC肝转移的小鼠模

lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程

自然杀伤(NK)细胞是一类先天性免疫淋巴细胞,与体外病毒感染和免疫调节有关。但是,lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术,分析了NK细胞中lncRNA表达模式,发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中,lnc-CD56,

不得了,大牛告诉你lncRNA甲基化如何研究

  lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。   RNA甲基化,作为最新的国

广州生物院阐明lncRNA通过表观遗传抑制重编程的发生

  体细胞重编程为干细胞是一个非常复杂的过程,其中必需克服众多障碍,才能到达终点,成为真正的干细胞。长链非编码RNA作为这一过程中的促进因素已经被报道,但是作为障碍物的角色却未曾被发现,中国科学院广州生物医药与健康研究院西班牙裔研究员米格尔·埃斯特班(Miguel A. Esteban )实验室的科

昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星

  m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你!   2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nature,Cell

Diabetologia最新发表应用Arraystar-LncRNA芯片研究Ⅰ型糖尿病

  瑞士洛桑大学Romano Regazzi教授长期从事糖尿病的基础研究,在糖尿病发病机制研究方面做了很多重要工作。近期,Romano教授课题组应用美国Arraystar公司的Arraystar Mouse LncRNA芯片,发现了受到细胞因子调控并在Ⅰ型糖尿病发病过程中起到重要调控功能的长链非编码

前列腺癌的治疗也许可从这种lncRNA下手

  在美国,前列腺癌是男性最常见的恶性肿瘤。这种癌症通常受激素影响,依赖雄激素受体信号。近日,研究人员发现了一种与雄激素受体信号通路相关的长链非编码RNA(lncRNA),有望作为药物靶点。  由密歇根大学领导的研究团队采用转录组分析方法,揭开可能在前列腺癌中起作用的lncRNA。他们在《Natur

Nature子刊:Arraystar-lncRNA芯片应用于乳腺癌研究

   德克萨斯大学安德森癌症中心的华人学者杨柳青博士主要从事肿瘤转移及信号传导方面的基础研究。近期,杨柳青博士应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了乳腺癌组织的长链非编码RNA(lncRNA)表达情况,并且发现部分lncRNA可以直接和脂质(磷脂酰肌醇三磷酸PIP3、卵磷脂PC等)发

如何研究lncRNA?三位科学家现身说法

  人生如戏,相信长链非编码RNA(lncRNA)也体会到了。之前一直遭冷遇,如今却是万人迷。其实,人类及其他哺乳动物的基因组转录了数万条lncRNA。根据GenCode数据库中最新版本的数据,人类基因组中包含16,000条lncRNA,产生了近28,000条转录本。再加上其他数据库的数据,目前已知

Nature子刊:揭示lncRNA在EMT过程中发挥的作用

   西班牙塞利维亚大学教授José A Pintor-Toro长期从事生物化学与细胞生物学研究, 近期,其实验室利用Arraystar LncRNA芯片研究发现了在TGF-β诱导的上皮-间质细胞转化(EMT)过程早期起直接调控作用的lncRNA分子—lnc-Spry1,TGF-β诱导直接引起lnc

增加lncRNA-SNHG12水平有望治疗动脉粥样硬化

  在一项新的研究中,来自美国哈佛医学院、布莱根妇女医院、达纳法伯癌症研究所、中国中南大学、加拿大多伦多大学、意大利乌尔比诺大学和瑞士洛桑联邦高等理工学院的研究人员通过研究基因组中的“垃圾DNA”取得了一项潜在激动人心的新发现。人类基因组中大约75%的区域不会编码蛋白,之前一度被视为垃圾DNA。但是

昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星

m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你!   2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nat

昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星

  m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你!   2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nature,Cell

原发性干燥综合征(pSS)相关的lncRNA表达模式研究

  研究背景   原发性干燥综合征(pSS)是一种由于外分泌腺紊乱引起的自身免疫性疾病,最典型的临床表现为口眼由于唾液腺和泪腺原因而导致的异常干燥。LncRNA是目前转录组学研究的热点,但是,lncRNA是否与pSS的发病有关,目前还没有相关报道,来自上海第九人民医院的研究人员,通过唾液腺中lnc

原发性干燥综合征(pSS)相关的lncRNA表达模式研究

研究背景原发性干燥综合征(pSS)是一种由于外分泌腺紊乱引起的自身免疫性疾病,最典型的临床表现为口眼由于唾液腺和泪腺原因而导致的异常干燥。LncRNA是目前转录组学研究的热点,但是,lncRNA是否与pSS的发病有关,目前还没有相关报道,来自上海第九人民医院的研究人员,通过唾液腺中lncRNA的表达

首次以通讯单位在Nature-Metabolism发文-揭示lncRNA的调控机制

  lncRNA属于一类没有编码蛋白能力的RNA,在过去几年中受到了相当多的关注,并已成为生物调节的重要参与者。许多lncRNA越来越多地涉及控制重要基因的功能和调节细胞的命运。此外,lncRNA正在成为细胞增殖和细胞凋亡的关键调节因子,这与癌症的发生有关。  越来越多地使用高通量研究表明,lncR

Nature医学揭示抗癌新途径

  VIB-KU Leuven的研究人员发现,非编码RNA NEAT1对于高度分裂的癌细胞非常重要。靶标NEAT1将能更有效的杀死癌细胞。这一重要发现发表在七月五日的Nature Medicine杂志上。  NEAT1参与了细胞核亚结构paraspeckle的形成。虽然paraspeckle在进化过

上海生科院首次揭示一条新lncRNA调控MYC转录的新机制

  3月25日,国际学术期刊《细胞研究》(Cell Research)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组的最新研究论文Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-ran