如何研究lncRNA？三位科学家现身说法
人生如戏，相信长链非编码RNA（lncRNA）也体会到了。之前一直遭冷遇，如今却是万人迷。其实，人类及其他哺乳动物的基因组转录了数万条lncRNA。根据GenCode数据库中最新版本的数据，人类基因组中包含16,000条lncRNA，产生了近28,000条转录本。再加上其他数据库的数据，目前已知的lncRNA超过40,000条。 这些类似mRNA的转录本在各种基因调控水平和胚胎发育等生物学过程中发挥作用。越来越多的证据也表明，异常表达的lncRNA在多种疾病状态中发挥重要作用，如癌症。这些RNA尽管在十几年前就已经发现，但只有少数分子的功能得到鉴定。 德克萨斯大学西南医学中心的药理学教授David Corey表示：“你必须从检测非编码转录本开始。”他的研究方向是将lncRNA作为药物靶点。“我对这些数据库不感冒，因为可能存在错误。他们可能检测到你的细胞系中不存在的RNA或很少量的RNA。” 若并非全基因组范围内的检测，......阅读全文
长链非编码RNA测序服务助力揭开lncRNA神秘面纱
2012年12月18日，华大基因科技服务有限公司(简称“华大科技”)在国内推出长链非编码RNA测序(lncRNA-Seq)服务。该技术突破了常规研究方法效率低、研究范围受限的瓶颈，可一次性获得样本中几乎全部的lncRNA序列，不仅可以对已知lncRNA进行定量分析，还可对 novel lnc
全转录组测序的“一箭三雕”：circRNA，lncRNA，mRNA
1. 文章主题：环状RNA通过靶向miRNA调控的信号传导促进结直肠癌的转移发表期刊：Journal of pathology影响因子：5.942发表时间：201906实验方法：全转录组测序实验样本：结直肠癌组织肝转移是结直肠癌（CRC）患者的主要死亡原因。作者使用全转录组测序在CRC肝转移的小鼠模
lncRNA启动子DNA甲基化/羟甲基化测序分析
技术优势：● 专注非编码RNA领域，完善的lncRNA启动子分析流程● 可与lncRNA表达谱芯片联合应用，实现平台间无缝对接● 可视化数据展示，提供paper级结果图表● 优化的IP实验方法，可信赖的检测平台及数据结果 介绍： 人类基因组中仅有约2%的DNA序列最
lncRNA启动子DNA甲基化/羟甲基化测序分析综述
技术优势： ● 专注非编码RNA领域，完善的lncRNA启动子分析流程 ● 可与lncRNA表达谱芯片联合应用，实现平台间无缝对接 ● 可视化数据展示，提供paper级结果图表 ● 优化的IP实验方法，可信赖的检测平台及数据结果 介绍： 人类基因组中仅有
调控免疫的lncRNA
当过度活化或脱靶时，免疫系统中正常对抗感染的一些细胞会转而攻击个体自身的组织。这一过程会推动作为自身免疫性疾病组成部分的炎症。现在，来自纽约大学Langone医学中心的一项新研究揭示出了抑制这些机制的一种新方法，有可能会影响未来的药物设计。相关论文 发布在12月16日的《自然》（Natur
lncRNA研究策略与技术
研究背景：长链非编码RNA(long noncoding RNA，lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA分子，长度在200 bp以上，起初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能；近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构，可以与蛋白、DNA和RNA相互作用，参与多种生物学过程的调控
lncRNA功能机制研究（一）
文章导读LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA，在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合，并在转录或转录后水平调控基因表达，而且lncRNA也可以作为诱饵，吸附miRNA，调节miRNA调控的靶基因表达。但是，目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能
lncRNA功能机制研究（二）
实验路线（1）LINC00346调控胃癌发展的上游机制结果：转录因子KLF5和MYC可与LINC00346启动子结合，并增强其表达a. 转录因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析；b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的转录因子
又传喜讯云序客户一次测序两项成果影响因子合计10分！
感恩有你，一路同行，新年快乐！ 感恩有你，一路同行！2019年伊始，云序生物携全体员工对一直以来关心和支持公司发展的广大新老客户致以最诚挚的问候！一元复始，万象更新！转眼间我们迎来了2019年，站在新时代新的历史起点，回望刚刚过去的2018年，不断创新收获硕果丰盈；展望2019，任重道远却
揭示Y染色体上LncRNA－TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移
前列腺癌（Prostate cancer，PCa）作为男性发病率第二的癌症，严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控，且目前缺乏相关机制方面的深入研究，治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展，使研究PCa相关分子标志物基因和作用机制成为可能。目前，已有报道指出许多明星Ln
外泌体LncRNA帮助免疫细胞“叛变”乳腺癌恶化新机制！
文章导读： 外泌体是细胞间传递信号的媒介，直径在30-200nm，表面具有磷脂双分子层，内部具有丰富内含物的小囊泡，其内含物包括miRNA，环状RNA，LncRNA和mRNA等。以不久前发表于Nature Cell Biology（影响因子：19）的文章为例，看一看外泌体中LncRNA的功
eLife：lncRNA调控癌症关键基因
Salk研究所的科学家们发现，一种长非编码RNA(lncRNA)是癌症发展过程中的一个关键基因开关。这项研究于四月二十九日发表在eLife杂志上，为相关癌症的治疗提供了一条新的途径。 研究人员将这种lncRNA命名为PACER(p50-associated COX-2 extragenic
lncRNA的概念及形成过程
lncRNA，即Long non-coding RNA，你可以把它理解为不表达蛋白的mRNA。它的很多特征与mRNA很类似。比如，它与mRNA一样有启动子、有polyA尾巴、有不同剪接、有动态表达水平。除了不表达蛋白这一点以外，仅从核苷酸水平上来看，可以说它与mRNA并无实质分别。所以对于设计PC
lncRNA表达与RNA的延伸
LncRNA的火热研究已经有几年的时间了，关于lncRNA总归是有说不完的话题。目前对lncRNA的基础分析都已形成了一定的模式。然后，今年来lncRNA的相关文章依然如雨后春笋。 长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RN
如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的网站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC数据库等。今天，小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。 一．根据LncRNA来源数据库，进入相应链接。 1. Genebank：https://www.ncb
如何快速查找LncRNA序列？
查找LncRNA序列的网站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC数据库等。今天，小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。一．根据LncRNA来源数据库，进入相应链接。 Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov
lncRNA助力叶酸研究新成果
LncRNA研究发表的成果五花八门，然而借助于lncRNA芯片，挖掘其中的高通量数据，发表5分影响因子的文章，还是可行的。本研究是以叶酸处理肥胖模型为基础，让我们来看看到底怎么样就可以在《Cellular Physiology and Biochemistry》（IF=5.104）上发表。研究背
lncRNA甲基化如何研究？
lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能，这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能轻松的变废为宝，竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章，你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化，作为最新的国自然热点受到
首次揭示Y染色体上LncRNA－TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖...
首次揭示Y染色体上LncRNA TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移文章导读前列腺癌（Prostate cancer，PCa）作为男性发病率第二的癌症，严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控，且目前缺乏相关机制方面的深入研究，治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展，
lncRNA在农业领域的研究成果
miRNA的好Homie，非编码RNA界的NewStar --没想到在农业上大展身手啦 你没看错！不是标题党。说到miRNA的好Homie，非编码RNA界的NewStar，想必聪明博学的你就已经猜到了是lncRNA。今天大阅哥要给大家挖一挖lncRNA在农业上的研究进展。为了写这篇主题
外泌体LncRNA帮助免疫细胞“叛变”——乳腺癌恶化新机制－1
文章导读：外泌体是细胞间传递信号的媒介，直径在30-200nm，表面具有磷脂双分子层，内部具有丰富内含物的小囊泡，其内含物包括miRNA，环状RNA，LncRNA和mRNA等。以不久前发表于Nature Cell Biology（影响因子：19）的文章为例，看一看外泌体中LncRNA的功能机制是如何
外泌体LncRNA帮助免疫细胞“叛变”乳腺癌恶化新机制
外泌体是细胞间传递信号的媒介，直径在30-200nm，表面具有磷脂双分子层，内部具有丰富内含物的小囊泡，其内含物包括miRNA，环状RNA，LncRNA和mRNA等。以不久前发表于Nature Cell Biology（影响因子：19）的文章为例，看一看外泌体中LncRNA的功能机制是如何研究的。
lncRNA在农业领域的研究成果（一）
miRNA的好Homie，非编码RNA界的NewStar --没想到在农业上大展身手啦 你没看错！不是标题党。说到miRNA的好Homie，非编码RNA界的NewStar，想必聪明博学的你就已经猜到了是lncRNA。今天大阅哥要给大家挖一挖lncRNA在农业上的研究进展。为了写这篇主题，大阅哥呕心沥
一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...2
（二）云序客户m6A RNA甲基化修饰表达谱，一次测序两篇文章疾病：胃癌样品：胃癌组织vs癌旁组织（6 vs 6）研究方法：m6A-MeRIP-Seq，RNA-seq4. m6A修饰对其修饰基因在胃癌中的异常表达及预后的潜在影响发表杂志：Frontiers in Genetics影响因子：3.258
昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星
m6A RNA甲基化是当前在LncRNA，环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星，到底有多火？摆出数据告诉你！ 2019年才过去一半还不到，已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域，不仅文章数量多，高分文章也有许多。据统计，仅2019年上半年就发表了多篇Nature，Cell
不得了，大牛告诉你lncRNA甲基化如何研究
lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能，这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能轻松的变废为宝，竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章，你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。 RNA甲基化，作为最新的国
Nature子刊：非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破
近日，匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归（Elastic Net regression）的机器学习模型，从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱（long noncoding RNAs, lncRNAs）与265种抗癌药物敏感性数据中，挖掘出了27
Nature重要发现：调控免疫的lncRNA
当过度活化或脱靶时，免疫系统中正常对抗感染的一些细胞会转而攻击个体自身的组织。这一过 程会推动作为自身免疫性疾病组成部分的炎症。现在，来自纽约大学Langone医学中心的一项新研究揭示出了抑制这些机制的一种新方法，有可能会影响未来 的药物设计。相关论文发布在12月16日的《自然》（Nature）
LncRNA芯片应用于胃癌研究
研究背景 在全世界分范围内，每年因肝癌死亡的病例超过50万人，是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中，随着影像学的进步以及健康体检的普及，越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺，外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确
国际知名学者综述：LncRNA分类
美国St. Laurent Institute的Philipp Kapranov教授，是基因组学与系统生物学领域具有重要国际影响的专家，长期从事系统生物学和基因组功能方面的研究，其发现人类基因组能够产生大量的有功能作用的非编码RNA，在概念层次上重新定义了“基因”，这一发现被Science选为最