又一国产高分数据库，堪称lncRNA神器
之前我们介绍了好用的CRN数据库，可以在线分析差异表达lncRNA并绘制与差异mRNA联系的网络图。那么有没有能直接出lncRNA与预后相关的生存曲线图的工具呢？答案当然是有的！这次我们就一起来看一下这个数据库！ lnCAR数据库（https://lncar.renlab.org/）是由中山大学的学者开发，相关文章（PMID: 30786995）于2019年4月发表在Cancer Research杂志（2019IF=9.727）上，截至2021-02-02该文章已引用6次（数据来源：PubMed ）。 从标题我就能知道该数据库的数据来源是芯片，这也意味着该数据库做出的图可以直接和TCGA、oncomine等数据库相互印证。下图展示了lnCAR数据库所使用到的所有资源信息及其链接。 目前，lnCAR数据库收集整理了来自GEO数据库中的10种肿瘤（膀胱癌、乳腺癌癌、宫颈癌、结肠癌、食管癌、胃癌、肝癌、肺癌、卵巢癌和前列腺癌......阅读全文
《自然》：知名数据库中超34万篇论文涉嫌造假
说起PubMed，很多小伙伴都非常熟悉，这应该算是国内最常用的生物医学相关SCI文献检索数据库，实验室的小白们一开始用的基本都是它。最近，Nature的一篇报道文章称，就是这样一个广受好评的文献检索集大成者，被一款名为Papermill Alarm的软件工具查出，至少有1%的论文可能出自论文工厂。1
利用生物指标数据库开展大气污染研究的相关学术论文
利用生物指标数据库开展大气污染研究的相关学术论文：《基于大鼠呼出气监测大气污染的研究》 ：发表于《环境科学与技术》期刊。该研究将大鼠打造为大气污染“监测器”，通过监测大鼠呼出气中的生物标志物的变化，可反演空气污染程度，从而判断对人类健康的影响22。《苔藓植物在大气污染监测中的最新应用进展》 ：发表于
重要化学数据库近千个晶体结构可能来自论文工厂
英国剑桥晶体学数据中心（CCDC）收录的近千个晶体结构的数据条目可能是论文工厂的产物，机构已将其标记为可疑条目，并对其进行审查。CCDC 是化学家寻求晶体结构信息的一个必查资源库，存放了结晶学领域许多期刊论文的数据，记录了 100 多万个晶体结构。今年 4 月，预印本平台 Research Squa
破解困局:－中国应建立国家级数据库应对优秀论文外流
“中国最重要的学术成果中有95%以上不在国内发表，我们借助国外同行把它发表出来，同时，国家每年还要花很多外汇把这个成果买回来用于支撑我们的科研教育。”上海书展还未开幕，一场围绕中国学术出版 “走出去”展开的高端论坛于8月13日下午开讲。国家新闻出版广电总局副局长邬书林在论坛上点出的中国学术出
期刊数据库更新
图片来源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评，认为其扭曲了学术出版。近日，美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告（JCR）数据库的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数，除以其两年间发表的文章数量，
期刊数据库更新
图片来源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评，认为其扭曲了学术出版。近日，美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告（JCR）数据库的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数，除以其两年间发表
GenBank数据库概述（四）
NCBI站点地图---其他基因组数据介绍：1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 ：把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起，包括序列，图谱，和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序：小鼠基因组计划的测序进展，HTG序列contigs（可以用大小和染色体号来浏览）由
核酸数据库的概念
中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定 义DNA、RNA序列的资料库，主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性，如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），方法与技术（二级
GenBank数据库概述（三）
结构： 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB：分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook
GenBank数据库概述（一）
1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库，一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合（UniGene），人类基因组基因图
GenBank数据库概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述，下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1，国际标准组织（ISO）数据表示格式，下载
汉语语言产生数据库发表
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517976.shtm
QP2010农药数据库
Shimadzu气质联用的多种农药库 QP2010农药数据库
美国更新食品掺假数据库
9月5日食品安全新闻网消息，美国药典委员会（USP）更新了食品掺假数据库（FFD2.0）。食品掺假数据库主要为行业、监管部门以及消费者预防和应对食品掺假事件发生提供技术支持。最新的FFD2.0涵盖了科研文献、媒体信息、食品监管记录、司法裁决记录中涉及食品掺假事件的各种信息。新版食品掺假数据库将于
生命科学常用数据库
The NationalCenter for Biotechnology Information. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/National Center for GenomeResources.http://www.ncgr.org/ncgr/ncgr.html T
全球危险病毒数据库上线
一个供研究人员共享危险病毒基因组的新数据库，有望解决许多阻碍现有方法的问题。但前提是，必须说服研究人员使用它。据《自然》报道，这一名为Pathoplexus的数据库于上个月启动，数据库背后的科学家团队希望有更多研究人员分享已知和新出现的对公共卫生具有重要意义的基因序列。澳大利亚悉尼大学病毒学家Edw
拉曼光谱免费数据库
拉曼数据库在物质鉴定和化学分析方面具有重要的作用。关于拉曼数据，我们一般会关注两个峰的位置，分别是D峰和G峰。D峰和G-峰均是C原子晶体的 Raman特征峰，分别在1350cm-1和 1580 cm-1附近，D峰反应的是晶格的碳缺陷，G峰反应的是材料的碳化程度。I(D) / I(G) 是 D峰和G峰
发表论文的捷径？线粒体测序论文太多
David Roy Smith是来自加拿大韦仕敦大学的一位生物学助理教授，近期他在The Scientist杂志上发文，指出目前涌现了太多线粒体基因组测序论文，2014年GenBank中新增的线粒体基因组序列信息多达上千条，这几乎比上一年激增了15%。 Smith指出，很少有人会质疑这些线粒体
“敦煌遗书数据库”建成投用
3月10日，在十四届全国人大二次会议甘肃代表团开放团组活动上，敦煌研究院党委委员、保护研究部副部长汪万福代表介绍，该院“流失海外敦煌文物数字化复原项目”迈出实质步伐，“敦煌遗书数据库”业已建成投用。 汪万福说，敦煌研究院还组建了甘肃省敦煌文物保护研究中心，建成国内首座文物保护领域多场耦合实验室
英国启动细胞产品试验数据库
英国细胞治疗产品行业现在拥有了一个数据库，该数据库囊括了该国所有正在进行之中的临床试验项目。建立这个数据库的目的是要扩大研究合作，将更多的早期试验推进到后期开发阶段。 囊括21个研究项目 这个数据库包括21个细胞治疗研究项目，由英国细胞疗法中心(CTC)发起，并得到了英国技术战略委员
siRNA数据库与设计工具
siRNA DatabaseSearchable database of Silencer ™ Validated and Pre-designed siRNAs to >34,000 human, mouse, and rat targets. All siRNAs in the database
生命科学国外重要数据库
EMBL数据库结构EMBL数据库的基本单位也是序列条目，包括核甘酸碱基排列顺序和注释两部分。序列条目由字段组成，每个字段由标识字起始，后面为该字段的具体说明。有些字段又分若干次子字段，以次标识字或特性表说明符开始，最后以双斜杠“//”作本序列条目结束标记。条目的关键字包括ID（序列名称），DE（序列
北京正在建罕见病数据库
今日，2014第三届中国罕见病高峰论坛在京举办。北京医学会罕见病分会副主任王琳在论坛中透露，北京正在建立罕见病病例登记系统和病人数据库，尝试单病种追踪调研和罕见病诊治地图的设置。 王琳介绍，中国目前所应用的罕见病相关数据都是基于欧盟、美国等地所提供的资料。“而国内到现在也没有对本国进行过罕见病
国内首个向量数据库标准发布
11月15日，中国信通院联合腾讯云计算（北京）有限责任公司、中移（苏州）软件技术有限公司等多家企业共同编制的、国内首个向量数据库标准正式发布，将为我国向量数据库研发、测试及选型提供重要参考，推动我国人工智能产业高质量发展。 向量数据能够从多个维度记录事物特征，是人工智能时代的基础数据形式。人工
盐湖资源环境信息数据库建成
日前，中国科学院青海盐湖研究所在科技部基础专项、中科院“百人计划”等项目的支持下，立足柴达木盆地盐湖资源优势，历时6年建成的盐湖资源与环境科学基础数据共享数据库正式通过科技部验收。这标志着目前我国数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统正式建成，并对基于科学数据的盐湖资源合理利用、长远决策
植物生物学研究数据库
实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
青年长江学者论文“404”－学位论文都删了
在南京大学社会学院网站上，这位教授的个人成果页面目前只张贴着英文论著目录，没有任何中文论文。这对一位本土的人文社科学者来说，是非常少见的情形。梁莹的一些论文与别人论文存在大面积雷同 但梁莹事实上著述颇丰，仅所能查到的，以她为第一或第二作者的中文文献就超过了120篇。 不过在过去几年里，她的这
中南大学启用论文“测谎仪”－论文答辩先测谎
“我听说去年有一个前辈，被系统查出了有抄袭，暂停了毕业程序。”昨日(3月29日)，中南大学文学院2011届研究生毕业生小田连连感叹：“这个对研究生震慑很大。” 这套引起震慑的反剽窃软件，正式名称是“学位论文学术不端行为检测系统”，学生们习惯称其为“测谎仪”。最初的传闻里，它功能强大，
副教授抄袭论文被解聘：“论文崇拜”何时破
网帖举报副教授抄袭论文 近日，一则举报遵义师范学院副教授赵某抄袭论文的帖子，在网上引发关注。帖子作者称这名副教授抄袭自己的本科毕业论文并被发表在《遵义师范学院学报》上。 有网友指出，赵某2013年2月以前的职称是讲师，在抄袭论文发表后不久，被聘为遵义师范学院副教授。 针对网帖的质疑，遵义
青年长江学者论文“404”－学位论文都删了
在南京大学社会学院网站上，这位教授的个人成果页面目前只张贴着英文论著目录，没有任何中文论文。这对一位本土的人文社科学者来说，是非常少见的情形。 但梁莹事实上著述颇丰，仅中国青年报记者所能查到的，以她为第一或第二作者的中文文献就超过了120篇。 不过在过去几年里，她的这些学术成果陆续被从网上