卢煜明教授PNAS发布第二代无创胎儿基因组分析结果
今年9月,堪称“中国诺贝尔”的未来科学大奖揭晓。香港中文大学李嘉诚健康科学研究所的卢煜明(Dennis Ming Yuk Lo)教授因发现可以从母亲血液中提取到胎儿DNA,而获得高达100万美元的生命科学大奖奖金。作为无创DNA产前检测的奠基人,卢教授早在1997年就发现了孕妇外周血中存在游离的胎儿DNA,并发展出了一套新技术来准确分析和度量母亲血浆内的胎儿DNA,也因此当选英国皇家学会院士,2013年当选美国国家科学院外籍院士。其研究组近期发表了题为“Second generation noninvasive fetal genome analysis reveals de novo mutations, single-base parental inheritance, and preferred DNA ends ”的文章,通过针对母体血浆DNA进行全基因组测序,探索了第二代无创性胎儿全基因组分析方法的限制与改良。这一研究......阅读全文
首张非洲人全基因组图谱问世
据《自然》杂志报道,2月6日,美国加州Illumina生物技术公司宣布,他们首次对一位非洲男子进行了完整的基因组测序。 在此之前,科学家已经对两位白人男性(James Watson和Craig Venter)和一位中国男性进行了全基因组测序,但从未对非洲人进行研究。因此,这位匿名的尼日利亚约鲁巴人男
全基因组测序揭示蒙古族遗传结构
内蒙古民族大学生命科学学院白海花团队对175名蒙古人进行了全基因组测序,从而揭示了蒙古族的遗传结构。11月6日,相关成果发表于《自然—遗传学》。 历史上,蒙古族的统治疆域曾北至俄罗斯的西伯利亚,南至中国南海,东北至黑龙江,西南至缅甸泰国境内,蒙古族民众也因此四散各地。不过,对于蒙古族人如何影响
全基因组重测序的生物信息分析内容
1.数据量产出总碱基数量、Totally mapped reads、Uniquely mapped reads统计,测序深度分析。2.一致性序列组装与参考基因组序列(Reference genome sequence)的比对分析,利用贝叶斯统计模型检测出每个碱基位点的最大可能性基因型,并组装出该个体
全基因组甲基化定量检测技术LUMA
LUMA介绍 基因组DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的变化被认为是正常和病理细胞过程中的重要的事件,有助于正常发育和分化以及癌症和其他疾病。在此,我们介绍一种新的方法评估全基因组DNA甲基化,称为荧光甲基化检测(Luminometric Methyl
15000年前“农民”全基因组数据出炉
英国《自然·通讯》杂志近日发表的一项遗传学报告中,德国科学家公布了生活在15000年前的安纳托利亚“农民”的首个全基因组数据。该研究结果有助于认识欧亚大陆的农业起源。图片来源于网络 农业在公元前10000年至9000年左右起源于亚洲西南部的新月沃土(Fertile Crescent),随后传
Nature发布大型全基因组RNA分析研究
由来自宾夕法尼亚州立大学的化学家和植物生物学家领导的一个研究小组开发出了一种分子技术,将有助于科学团体以从前不可能达到的规模,来分析在基因表达调控中起重要作用的分子。 科学家们开发出了一种方法,能够更精确预测在活细胞内核糖核酸分子(RNAs)的折叠情况,由此阐明植物以及其他的活体生物对环境
我国科学家完成柞蚕全基因组测序
由辽宁省蚕业科学研究所牵头,辽宁省农科院大连生物技术研究所、吉林省蚕业科学研究院、沈阳农业大学生物科学技术学院、河南省蚕业科学研究院、黑龙江省蚕业研究所组成的柞蚕基因组研究联合攻关项目组(简称柞蚕项目组)与深圳华大基因科技服务有限公司(简称华大科技)携手,经过两年的不懈努力,日前完成了柞蚕全基因
单细胞全基因组扩增技术大比武
2013年,权威技术期刊《Nature Methods》将年度技术授予了单细胞测序。正如社论中所说,每个细胞都是独一无二的--它占据了独特的空间位置,它的复制基因组中携带了独特的错误。然而,过去以细胞群体为对象的研究只获得了平均值,而忽略了异质性。目前多种新型分析技术,如NGS,都是为细胞群
全基因组测序揭示蒙古族遗传结构
内蒙古民族大学生命科学学院白海花团队对175名蒙古人进行了全基因组测序,从而揭示了蒙古族的遗传结构。11月6日,相关成果发表于《自然—遗传学》。 历史上,蒙古族的统治疆域曾北至俄罗斯的西伯利亚,南至中国南海,东北至黑龙江,西南至缅甸泰国境内,蒙古族民众也因此四散各地。不过,对于蒙古族人如何影响其他
从全血中纯化基因组-DNA-实验方法
用于从全血(10 ml) 中分离基因组 DNA 的 Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒建立在一个四步程序基础上的。纯化程序的第一步包括血红细胞的裂解、可溶部分的弃除,随后是白细胞及其细胞核的裂解。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒乙醇异丙醇RNA 酶 A
10万英国病人将接受全基因组测序
英国将对10万名癌症及其他罕见疾病患者进行全基因组测序。 随着基因技术的突飞猛进,英国首相于12月10日宣布了一项雄心勃勃的计划,为10万名患有癌症和罕见疾病的英国病人进行全基因组测序。尽管许多国家都宣称正在以治疗和护理病人的名义解码其公民的脱氧核糖核酸(DNA),但这项新的计划却
从全血中纯化基因组-DNA-实验方法
试剂、试剂盒 乙醇异丙醇RNA 酶 A全血仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳离心管Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂乙醇,70%,室温异丙醇, 室温RNA 酶 A将 RNA 酶 A 溶解于 DNA 再水合液中至终浓度为 4 mg/ml, 煮沸 10min 以去
基因是否表达:cfDNA全基因组测序可揭晓
《Nature Genetics》杂志上的研究表明,血循环游离DNA(cfDNA)可提供线索来预测基因的表达。 全基因组测序就能知道基因是否表达 基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中的遗传信息经过转录和翻译,最后转变成具有生物活性的蛋白质分子的
国内首次!玉米全基因组选择育种新突破
14日,记者从四川农业大学获悉,该校玉米研究所兰海教授团队利用全基因组选择技术构建了西南玉米区域新的杂优模式,并运用该技术在国内首次选育出玉米新品种。相关成果近日发表在《植物科学前沿》上。 兰海介绍,该团队利用360份代表性自交系随机构建了2077个杂交组合,对产量相关性状进行了精准鉴定,并利
全基因组测序解读重要甲基化机制
DNA看起来只是AGTC四种碱基的简单排列,可一旦它与组蛋白包装形成染色质,情况就复杂得多了。组蛋白主要有四种,分别是H2A、H2B、H3和H4。这些组蛋白要么令DNA盘绕起来保持沉默,要么将DNA解开允许基因表达。组蛋白上的化学修饰(如甲基化),能够影响它对基因的控制。 H3K4me3是
RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止?
近日,南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化(polyadenylation)的转录本在
自闭症谱系障碍家庭全基因组测序
近日,国际生物学顶尖期刊nature medicine在线刊登了加拿大科学家的一项最新研究成果,他们通过对85个有两个自闭症谱系障碍(ASD)孩子的四成员家庭和170个患有ASD的个体进行了全基因组测序,发现在ASD疾病中存在大量遗传异质性。根据他们的实验结果,在研究和临床中应用全基因组测序诠释
全基因组甲基化定量检测技术LUMA
LUMA介绍基因组DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的变化被认为是正常和病理细胞过程中的重要的事件,有助于正常发育和分化以及癌症和其他疾病。在此,我们介绍一种新的方法评估全基因组DNA甲基化,称为荧光甲基化检测(Luminometric Methylat
科研论文|Sikun-2000全基因组测序性能卓越
上海交通大学联合思昆生物在国际期刊Scientific Reports发表了题为“Comparative assessment of the Sikun 2000 sequencing platform for whole genome sequencing”的研究成果。研究成果表明Sikun 20
关于全基因组测序的基本信息介绍
全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是最早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列,对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部(DOE)与美国国家卫生研究院(NIH),分别在1986年与1987年加入人类基
2023未来科学大奖周在香港开幕
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510303.shtm10月14日,由未来科学大奖与香港科学院共同主办的2023未来科学大奖周在香港科学园开幕。这是未来科学大奖周首次在香港举办。香港特区行政长官李家超在开幕典礼上以视频形式致辞表示,很高
多位专家指导:如何提取和研究血液DNA,RNA与蛋白
血液是唯一与所有器官都有接触的组织,携带着有关机体的大量宝贵信息。在理论上,检测血液携带的 DNA、RNA、囊泡和细胞残骸可以帮助人们诊断和监控各种疾病。 产前基因筛查是血液检测的一个重要应用,通过分析孕妇血液中的胎儿DNA来鉴定染色体异常(比如唐氏综合症)。此外,越来越多的研究者开始关注血液
MIT:2015十大突破技术——液体活检入选
近日,MIT Technology Review杂志发布了2015年度十大突破技术( Breakthrough Technologies 2015)的榜单。其中与生命科学密切相关的液体活检、大脑类器官(Brain Organoids)、DNA互联网等技术光荣上榜。 液体活检:快速、简便的癌症血
基因组所参与的人类全基因组关联分析合作研究获重要进展
与血小板数量相关的GWAS SNP与222 kb 以外的JAK2基因相关联 日前,中科院北京基因组研究所重大疾病基因组与个体化医疗实验室“百人计划”方向东研究员项目组助理研究员渠鸿竹博士等参与开展的国际合作研究“人类疾病全基因组关联分析研究”获得重大进展。相关研究成果Systema
香港基因组计划细节公布!将进行两万人全基因组测序
基因大数据是精准医学的基础,全世界已经启动了众多大规模基因组学计划,朝着精准医疗的目标迈进。根据香港特区政府食物及卫生局本周提交的一份文件,作为香港基因组计划(Hong Kong Genome Project,HKGP)的一部分,香港计划对20,000名参与者进行基因组测序和分析。相关文件将于下
研究人员完成枣和酸枣单倍型基因组组装
近日,西北农林科技大学林学院红枣团队黄建研究员课题组以我国制干枣主栽品种‘骏枣’和著名“秦药”代表清涧酸枣为研究材料,整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多种先进测序技术以及多种组装策略完成了枣和酸枣T2T gap-free和T2T gap-free单倍型基因组的组
日本研究人员首次成功绘制日本人基因组图谱
据日本共同社报道,日本理化学研究所基因组医科学研究中心日前通过新一代DNA测序仪成功绘制出首份日本人基因组图谱。该成果10月24日发表在美国《自然—遗传学》杂志网络版上。 DNA一共有4种碱基排列组合,人类大约有30亿对碱基对。新一代测序仪可将DNA进行极其精细的切片,对大量切片同时
研究人员成功测序蒙特莫朗西酸樱桃基因组
密歇根州的酸樱桃产量在全美名列前茅,密歇根州立大学的一个研究小组启动了一个项目,旨在确定与酸樱桃树晚开有关的基因,以满足不断变化的气候的需要。他们首先将晚开的樱桃树的DNA序列与一个相关物种--桃子的基因组测序进行了比较。他们首先将开花迟缓的酸樱桃树的DNA序列与它们的亲戚桃子的基因组序列进行比较。
安捷伦授予临床基因组研究人员Peter-Robinson“思想领袖奖”
分析测试百科网讯 2016年11月29日,安捷伦科技宣布将安捷伦思想领袖奖授予给Peter Robinson, M.D., MSC,以表彰其对临床基因组学和计算生物学的贡献。在今年早些时候,中国中医科学院中药研究所所长陈士林(详见本网报道:中药研究所所长陈士林获得“安捷伦思想领袖奖”)和癌症研究
卢晓春:永远向前
编者按:从陕西临潼骊山脚下的风王沟,到繁华首都的国家会议中心,再到蓝色多瑙河畔维也纳的联合国全球卫星导航系统委员会(ICG),中国科学院大学(以下简称“国科大”)博士生导师、中国科学院国家授时中心副主任卢晓春研究员的旅程映射出一条不平凡的蜕变轨迹。这不仅是她个人成长的缩影,也是中国科学院国家授时中心