真核基因组的组装，有纳米孔就够了
生物通报道 农业生物技术公司KeyGene近日只利用纳米孔测序仪MinION生成的序列，组装了立枯丝核菌（Rhizoctonia solani）的基因组。立枯丝核菌是一种农业害虫，感染一些重要的经济作物，包括玉米、水稻和大豆。 在BioRxiv网站的预印本上，KeyGene的Martin de Vos及其同事介绍了他们的读长优化方法，这使得他们能够生成高度连续的组装，比之前利用短读长测序方法获得的组装要长得多。不过他们也指出，基于纳米孔的组装有着较高的错误率。尽管如此，研究人员认为，这仍是一种高性价比的方法。 在这项研究中，研究人员利用大小选择，从立枯丝核菌的样品中筛掉小的DNA片段，只留下高分子量的DNA。他们从中生成了三个长插入片段的纳米孔文库：两个是用随机剪切的DNA制备的，片段的平均长度分别为12.5 kb和18.8 kb，而第三个则来自完整的基因组DNA。 之后，研究人员利用Oxford Nanopore的M......阅读全文
真核基因组的组装，有纳米孔就够了
生物通报道 农业生物技术公司KeyGene近日只利用纳米孔测序仪MinION生成的序列，组装了立枯丝核菌（Rhizoctonia solani）的基因组。立枯丝核菌是一种农业害虫，感染一些重要的经济作物，包括玉米、水稻和大豆。 在BioRxiv网站的预印本上，KeyGene的Martin de
“蔬菜作物重要性状的遗传和表观遗传研讨会”在沪举办
由中科院上海生科院植生生态所和中-荷植物分子育种联合实验室共同承办的“蔬菜作物重要性状的遗传和表观遗传研讨会”于10月25日在上海举行，来自科研机构、商业企业及政府部门的30余位蔬菜产业相关的来宾出席了此次研讨会。 会议由报告会与圆桌会议两个部分组成。报告会由西北农林科技大学的巩振辉教授主
我国学者成功完成小麦A基因组的测序和精细图谱绘制
小麦是全球最重要的粮食作物，养活了世界上40%的人口，提供了人类所需热能和蛋白质的20%。我国是世界上小麦生产和消费大国，常年种植面积为2,400万公顷左右，年产量近1.3亿吨。生产上广泛种植的普通小麦是一个经两次自然杂交而形成异源六倍体，含有A、B和D三个亚基因组，其基因组大（约17 Gb，是
DNA分子标记技术研究进展（一）
遗传标记在遗传学的建立和发展过程中有着举足轻重的作用，随着遗传学的进一步发展和分子生物学的异军突起，遗传标记先后相应地经历了形态标记、细胞学标记、生化标记和DNA分子标记四个发展阶段。前三种标记都是以基因表达的结果为基础的，是对基因的间接反映；而DNA分子标记则是DNA水平遗传变异的直接反映，它具有
31项与免疫学有关的分子生物学实验技术（二）
十二、大肠杆菌感受态细胞（E.coli DH5α）制备E.coli DH5α制备主要操作步骤：1）挑取受体菌（DH5或DH10B）的单菌落于LB培养基中37℃摇床培养过夜（约16小时）；2）取1ml过夜培养物转接于100ml LB培养基中，在37℃摇床上剧烈振荡培养约2.5-3小时（250-30
盘点：31项与免疫学有关的分子生物学实验技术
现代分子生物学和免疫学的进展加深了我们对许多疾病的了解，并且导致了免疫新策略的产生，免疫学检测方法可分为体液免疫和细胞免疫测定。本文盘点了与免疫学有关的分子生物学实验技术汇总。 一、GST pull-down实验 GST是指谷胱甘肽巯基转移酶，GST pull-down实验是一个行之有效的验
基因测序领域之成果、政策大盘点
1. 利用CRISPR/Cas9进行NGS建库和细菌克隆。 (NGS建库新方法)Cas9本质上是一种核酸酶，虽然科学家发现Cas9在真核细胞的基因靶向和编辑中具有重要作用，但是新的研究也在将Cas9用于体外和微生物细胞中来剪切DNA。3月份，加州大学旧金山分校(UCSF)Joe DeRisi领导