Nature子刊解决科研难题从微生物组中挖出真正的“金矿”

我们今天使用的绝大多数抗生素都是以细菌生产的天然分子为基础。随着抗生素抗性问题的日益突出,人们亟需寻找更多新的抗生素。然而,让细菌生产新抗生素并不容易,绝大多数细菌并不能在实验室里生长,生产抗生素分子的基因大多也不会启动。 Rockefeller大学的研究人员找到了解决这些问题的方法。他们在细菌基因组中鉴定生产抗菌化合物的基因,然后自己合成这些化合物。不需要培养细菌就可以发现新的潜在抗生素。 Sean Brady及其同事用特殊软件在公开数据库中扫描人体共生菌的基因组,搜索可能生产抗生素的基因簇,并预测其产物的化学结构。他们一共鉴定了57个潜在的基因簇,最终通过多肽固相合成法制造了25个不同的化合物。他们对这些化合物的抗菌效果进行测试,成功确定了两个亲缘关系很近的抗生素,humimycin A和humimycin B。这两种抗生素都是在红球菌(Rhodococcus)中发现的,这种细菌在实验室培养的时候从未生产过类似物质。......阅读全文

微生物污染的排除实验——抗生素除菌法

实验方法原理细胞培养中用抗生素是杀灭微生物的主要手段;但迄今尚无对抗支原体特效抗生素。各种抗生素性的性质不同,联合应用比单用效果好;一般在已发生微生物污染后,再使用抗生素,常难以根除.预防性应用比污染后使用更好。有时抗生素仅对细菌有抑制作用,而无杀灭效应;反复使用抗生索还能使微生物产生抗药性,且对细

果树微生物组研究获新进展

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500474.shtm

全球未培养微生物培养组计划启动

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511761.shtm

The-Scientist:肺部微生物组决定你的健康

  近年来,肺部微生物组对呼吸道健康的重要性逐渐受到了科学家们的重视。The Scientist杂志特别撰文介绍了这一领域的最新进展。  如果将人类的消化系统看作是从口腔延伸至胃和肠道的一条河流,那么肺就是河流旁的湖泊,常常被湍急的水流波及,密歇根大学的Gary Huffnagle说。Huffnag

肠道微生物组与儿童行为问题有关

  一项新的研究表明,有行为问题的孩子的肠道微生物组可能有不同的成分,父母在差异的明显程度方面起着重要作用,值得重视。  肠道微生物很重要  肠道微生物组中至少有400种细菌,数万亿种微生物生活在消化道中,这意味着肠道中细菌的数量比体内所有细胞都要多。肠道中的微生物执行重要功能,包括合成维生素、抵御

Nature惊人发现:谁可媲美微生物组

Nature惊人发现:谁可媲美微生物组   来自纽约大学Langone医学中心的微生物学家说,他们获得了第一个强有力的证据证实,天然存在于肠道中的病毒(他们将其称作为“病毒组”(virome))像居住在肠道中、构成“微生物组”(microbiome)的细菌一样发挥了维持健康以及对抗

迄今最久微生物基因组草图出炉

  英国《自然》杂志日前在线发表的一项演化学研究报告,近乎完整地构建出了一种口腔细菌的基因组,这个有48000年历史的微生物的基因组,是迄今为止历史最悠久的微生物基因组草图,研究同时揭示了尼安德特人的饮食结构。  尼安德特人的DNA序列和现代人类的DNA序列非常相似。他们是现代欧洲人祖先的近亲,从1

质疑:肥胖真的与微生物组有关么?

  我们体内生活着不计其数的微生物,它们组成的生态系统就是微生物组。近几年人们发现微生物组对人体健康有着重要的影响,微生物组研究因此受到了极大的重视,甚至被称为是人体的“第二基因组”。  研究者们普遍认为微生物组参与了许多重要的生理活动,比如消化食物、合成营养物质和抵御疾病。包括肥胖在内的许多人类疾

微生物组影响免疫反应复杂化

这项研究今天发表在Journal of Clinical Investigation该研究还表明,这种抗微生物免疫反应可以由免疫细胞对之前与细菌接触的记忆触发,这进一步复杂化了身体接受救命新器官的能力。“以前,我们认为人类器官移植比受保护的实验室动物更不容易被接受的原因是,人类可以在器官细胞上产生交

免疫球蛋白-影响肠道微生物组

  IgA(免疫球蛋白A)是最丰富的黏膜抗体,动物模型实验表明它可以强化肠道屏障,防止危险细菌破坏宿主。然而,缺乏特异性IgA的人通常只有轻微的症状。法国巴黎免疫与疾病研究中心珍妮·法德拉等科学家,比较了健康个体与缺乏IgA个体的粪便微生物组,发现在缺乏IgA的不同患者中,不同属的细菌占不同的主导地

北京生科院提出微生物组解析新技术

  1月23日,国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组学实验室赵方庆团队题为MetaSort untangles metagenome assembly by reducing microbial community

生殖健康方向微生物组研究进展

  近年来,微生物组学的研究提升了关于身体各部位共生微生物的认识。中国科学院北京生命科学研究院研究员赵方庆团队发现微生物组学或进一步拓展对女性生理和生殖健康方面的认识,并有助于提升治疗水平。  作为人体最主要的菌库之一,阴道菌群及其对女性生理和生殖健康的作用显而易见。作为“生命摇篮”的宫腔像一个黑箱

Gastroenterology:微生物组与肠癌发生的关系

  最近,根据来自George Washington大学研究者们在《Gastroenterology》杂志上发表的一项新研究,患有结肠癌的患者体内的一种蛋白突变体阻断了调节细胞增殖和扩张的信号通路,从而增加了促进结肠癌发展的肠道微生物种群,这最终导致肠癌恶化的后果。这些发现表明了微生物组中细菌与结肠

光催化耦合微生物同步降解抗生素及机理分析

  近期,中国科学院城市环境研究所城市污染物转化重点实验室在光催化耦合微生物同步降解抗生素及机理分析方面取得新进展。在已有研究的基础上,对反应体系进行优化设计,在降低光催化材料投加量的情况下,构建了具有快速、高效降解氧四环素(oxytetracycline,OTC)的耦合体系。相关研究成果以Ligh

2025蛋白质组学大会之微生物蛋白质组学

2025年10月14日下午,聚焦于微生物蛋白质组学领域的专题分会场在广州白云国际会议中心107会议室正式拉开帷幕。会议由王恒樑、马庆伟、刘小云、李乐园四位教授召集,现场由刘小云、Paola Roncada教授主持。来自意大利卡坦扎罗“大希腊”大学、比利时根特大学、复旦大学、西湖大学、国家蛋白质科学中

Nature:营养不良破坏你的微生物组

  人类的肠道菌群建立于幼儿时期,这些微生物对于儿童的健康有着重要的影响。日前科学家们在孟加拉一个贫民区,对健康和严重营养不良的儿童进行了研究。研究人员在这些儿童出生后两年中,跟踪分析了他们的肠道菌群,发现营养不良会破坏微生物组的健康发展。就算通过膳食治疗改善营养不良的症状,也不能恢复这样的破坏。这

Nature:风险!微生物组可能泄露个人隐私

  研究人员发现,通过寄居人体的微生物集成DNA,能够特异性地识别出个人的身份,这就产生了个人隐私问题。  这项发现刊登于5月11日的《美国国家科学院期刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences)上。文章指出,在一项匿名试验研究中,通过寄生于

人类微生物组计划公布首份研究报告

  为了进一步了解我们与在我们的身体上或身体内生活的多种细菌之间的关系,美国国立卫生研究院正在对所有这些微生物基因组进行测序。他们研发了对在自然环境中的微生物进行大规模基因组测序的标准化方法,他们目标之一是为至少900种人体寄居的细菌制作出参照基因组序列。研究论文发表于5月21日

2013值得关注的技术:微生物组功能研究

  《Nature Methods》杂志将2012年度技术授予了定向蛋白质组学(targeted proteomics)。同时,杂志还介绍了2013年值得关注的技术,包括纳米孔测序仪(Disruptive nanopores)、微生物组功能研究(Probing microbiome func

Cell封面文章:微生物组研究的理想模型

  近年来,科学家们逐渐意识到人类微生物组会对人体健康产生重要的影响,微生物研究受到了越来越多的重视。微生物群落成员的多样性、丰度和相互关系,对整个群体有着决定性的影响。由于缺乏一个可控的研究体系,微生物群落的研究一直步履维艰。  不过本期Cell杂志的封面文章告诉我们,奶酪皮作为一个可控的实验体系

今日视点:美国为何启动“国家微生物组计划”

   美国白宫13日宣布启动“国家微生物组计划”,这是奥巴马政府继脑计划、精确医学、抗癌“登月”之后推出的又一个重大国家科研计划。小小的微生物,为何能成为美国的国家级大型科研计划?美国政府将如何实施这个计划?最终的目标又是什么?  启动资金超5亿美元  微生物存在于人体、植物、土壤、海洋等各种环境中

Nature:营养不良破坏你的微生物组

  人类的肠道菌群建立于幼儿时期,这些微生物对于儿童的健康有着重要的影响。日前科学家们在孟加拉一个贫民区,对健康和严重营养不良的儿童进行了研究。研究人员在这些儿童出生后两年中,跟踪分析了他们的肠道菌群,发现营养不良会破坏微生物组的健康发展。就算通过膳食治疗改善营养不良的症状,也不能恢复这样的破坏。这

环境和生活方式塑造肠道微生物组

科技日报讯 (实习记者张佳欣)人类肠道中的细菌与多种疾病有关,但有哪些细菌是健康的,哪些是由疾病或药物造成的?科学家迄今尚不十分清楚。荷兰格罗宁根大学傅静远教授团队与合作者在4月13日的《自然》杂志上发表最新研究,系统地揭示了环境和遗传因素与人类肠道微生物组之间的关联,这将促进微生物组靶向治疗的未来

邓子新:透视美国“国家微生物组计划”

作者近影  2016年5月13日,美国科学技术政策办公室与相关政府机构和私人基金会共同颁布了一项新的美国微生物组计划。该计划的目标是:通过对各种不同环境中微生物生态系统的综合研究,深入揭示微生物组的行为规律,促进对健康微生物组功能的保护和恢复。这个计划首次把微生物研究提高到国家战略地位,强

颠覆传统观点-胎盘具有独特微生物组

  一项最新研究表明,在健康孕妇的胎盘中,生活着小型却多样化的细菌群落,这颠覆了传统的观点——胎儿生长在一个无菌的环境里。  这些细菌大多是“有益细菌”,生活在每个人体内。但是,这项研究也暗示,这种微生物菌落的组成,可能在早产中起一定作用。  本研究首席研究员、休斯顿贝勒医学院的Kjersti Aa

青岛能源所提出“微生物组影响指数”

  微生物组是微生物在自然界的存在形式,与人体、空气、土壤与海洋的健康息息相关。因此,微生物组科学与产业已经成为国际科技合作与竞争的“战略高地”。然而,大数据挖掘工具的匮乏,阻碍着微生物组研究从“数据分析”向“数据科学”的跨越。2010年,来自43个国家的500多名研究人员联合启动了“地球微生物组计

Nature:风险!微生物组可能泄露个人隐私

   源自人类粪便的细菌DNA可作为“肠道纹”(gut print)来识别个人身份。  通过寄居某人体内的微生物DNA可识别出此人的身份。  研究人员发现,通过寄居人体的微生物集成DNA,能够特异性地识别出个人的身份,这就产生了个人隐私问题。  这项发现刊登于5月11日的《美国国家科学院期刊》(Pr

Nat-Commun:利用CRISPR技术改造微生物组

  最近,来自Western大学的研究人员开发了一种将DNA编辑工具CRISPR-Cas9应用于改造实验室微生物的新方法,从而提供了一种有效地对特定细菌发起针对性攻击的方法。  今天发表在《Nature Communications》杂志上的这项研究开辟了使用CRISPR改变人体微生物组组成的可能性

Science公布家庭微生物组计划的最新成果

  美国能源部Argonne国家实验室和芝加哥大学的科学家们,通过家庭微生物组计划(Home Microbiome Project),对家庭成员和居住环境中的微生物群体进行了详细的分析。该计划的最新成果发表在本期的Science杂志上。  这项研究揭示了人类和微生物之间的复杂相互作用,进一步展现了微

研究揭示人类胎儿肺脏微生物组结构

  子宫中胎儿的肺和胎盘-怀孕后仅11周就已经显示出细菌微生物组特征,这表明细菌可能在出生前很早就定居在肺部。这项首次发现加深了微生物或微生物产物如何在出生前到达这些器官以及它们在正常的肺和免疫系统发育中起什么作用的谜团。  由阿拉巴马大学伯明翰分校研究员Charitharth Vivek Lal领