Nature子刊解决科研难题从微生物组中挖出真正的“金矿”
我们今天使用的绝大多数抗生素都是以细菌生产的天然分子为基础。随着抗生素抗性问题的日益突出,人们亟需寻找更多新的抗生素。然而,让细菌生产新抗生素并不容易,绝大多数细菌并不能在实验室里生长,生产抗生素分子的基因大多也不会启动。 Rockefeller大学的研究人员找到了解决这些问题的方法。他们在细菌基因组中鉴定生产抗菌化合物的基因,然后自己合成这些化合物。不需要培养细菌就可以发现新的潜在抗生素。 Sean Brady及其同事用特殊软件在公开数据库中扫描人体共生菌的基因组,搜索可能生产抗生素的基因簇,并预测其产物的化学结构。他们一共鉴定了57个潜在的基因簇,最终通过多肽固相合成法制造了25个不同的化合物。他们对这些化合物的抗菌效果进行测试,成功确定了两个亲缘关系很近的抗生素,humimycin A和humimycin B。这两种抗生素都是在红球菌(Rhodococcus)中发现的,这种细菌在实验室培养的时候从未生产过类似物质。......阅读全文
抗生素干扰婴儿肠道微生物组
在我们的肠道里,生活着许多微生物群落,它们在调控机体代谢和免疫防御功能上起着关键作用。这些微生物群落的集合被称为肠道微生物组。美国《科学转化医学》杂志6月15日发表的研究结果显示,使用抗生素会降低婴儿肠道微生物组的多样性和稳定性。 在世界大部分地区,对患病婴幼儿用抗生素治疗已成常规做法,美国孩
断奶、抗生素都会影响孩子的微生物组
我们肠道中的共生菌能够与正常细胞过程相互作用,生产人体所必需的物质(比如氨基酸)。理解肠道菌对代谢、免疫和行为的影响,一直是科学家们的研究热点。 本期《Cell Host & Microbe》推出了“The Host-Microbiota Balance”特刊,通过一系列文章探讨了宿主与共生菌
数百微生物基因组草图绘成-全新抗生素或由此产生
英国《自然》杂志14日在线发表的一项微生物学最新成果,美国科学家团队绘制完成数百个非培养且未被研究过的微生物基因组草图,并鉴定出了一千多个生物合成基因簇。研究表明,土壤中的细菌极有可能代表了一种有待开发的新型抗生素,以及其他药用化合物的来源。图片来源于网络 细菌在与抗生素的博弈中,已经变得越
微生物如何产生抗生素?
微生物产生抗生素的过程是一种复杂的生物合成机制,涉及到多种生物学和化学过程。以下是产生抗生素的关键步骤: 应激反应:研究表明,微生物在面临生存威胁,如食物短缺或其他环境压力时,会触发一系列的生化反应,这些反应促使微生物开始合成抗生素。这种应激状态通常会导致微生物进入一种高度调控的代谢状态。
微生物所发表中国微生物组数据平台
10月26日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
深海微生物来源抗生素研究获突破
近日,中科院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室鞠建华团队在深海微生物来源的抗生素A201A研究领域获突破。相关研究在美国《国家科学院院刊》发表。 研究人员对A201A糖基结构单元的生物合成和后修饰过程进行了剖析,发现并阐明了一个新颖的l-半乳糖吡喃—呋喃型变位酶MtdL。Mtd
Cell:微生物组的确影响免疫
麻省总医院MGH、Broad研究所与荷兰的两家医学研究中心在Cell杂志上发表了人类功能基因组计划(HFGP)的重要研究成果。他们通过三项研究揭示了基因、微生物组和环境对免疫应答的影响。 人类消化道中居住着大量的微生物,它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等
国际人类微生物组联盟启动
经过近3年的酝酿和筹备,以解析人类共生微生物与健康关系为目标的国际人类微生物组联盟(IHMC)近日在德国海德堡宣布成立。来自美国国立卫生研究院(NIH)、欧盟委员会,以及中国、日本等9个国家的科学家出席成立大会并交流了各自的计划和进展。 基因与环境相互作用决定人体健康,目前大量的研究都集中在分析人
Cell:微生物组的确影响免疫
麻省总医院MGH、Broad研究所与荷兰的两家医学研究中心在Cell杂志上发表了人类功能基因组计划(HFGP)的重要研究成果。他们通过三项研究揭示了基因、微生物组和环境对免疫应答的影响。人类消化道中居住着大量的微生物,它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起
Nature聚焦微生物组的家
人体内充满了微小的微生物,这些成百上千的细菌物种被统称为微生物组(microbiome),人们认为它们有助于人体的健康与生存。胃肠道,尤其是结肠是最高密度和最高多样性细菌物种的家园。然而由于食物和流体的通过,这一系统不断发生变化,这些生物体是如何能够存留于其中并旺盛生长的呢? 由加州理工大
Nature:揭秘地球微生物组计划
地球微生物组计划(Earth Microbiome Project)的目标是尽可能多地对地球微生物群落进行取样,以便促进人们对微生物及其与包括植物、动物和人类在内的环境之间的关系的理解。这一任务需要来自世界各地的科学家的帮助。到目前为止,这一计划已覆盖了从北极到南极的七大洲和43个国家,而且有超
抗生素、微生物污染成水环境新挑战
随着全球抗生素使用量持续增加,各种新研发的化学品进入生态环境循环中,给传统的污水处理和中水回用、自来水处理系统提出新挑战。在30日于南京闭幕的第15届国际水协会(IWA)水与污水前沿技术大会(LET)上,抗生素、微生物等水体新型污染物引起了各国与会专家的关注。图片来源于网络 水处理成抗生素耐药
抗生素破坏土壤微生物研究取得进展
土壤动物数量众多,种类丰富,在土壤生态系统中扮演着关键的作用。另一方面,肠道微生物对宿主的健康具有重要作用,土壤动物肠道微生物是土壤微生物组的重要组成部分,但是人们对土壤动物肠道微生物的认识却十分缺乏。随着人类活动的加剧,大量污染物和抗生素进入了土壤生态系统,他们对土壤动物的影响已经引起了大家广
微生物“暗物质”中分离出高效抗生素
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/507017.shtm
微生物“暗物质”中分离出高效抗生素
一种从细菌中分离出来的新型强效抗生素似乎能够对抗有害细菌,甚至是具有多重耐药性的“超级细菌”。这种名为Clovibactin的抗生素能以一种不寻常的方式杀死细菌,使细菌更难对其产生耐药性。荷兰乌得勒支大学、德国波恩大学、德国感染研究中心、美国东北大学和诺沃生物制药公司的联合团队22日在《细胞》杂志上
抗生素、微生物污染成水环境新挑战
随着全球抗生素使用量持续增加,各种新研发的化学品进入生态环境循环中,给传统的污水处理和中水回用、自来水处理系统提出新挑战。在30日于南京闭幕的第15届国际水协会(IWA)水与污水前沿技术大会(LET)上,抗生素、微生物等水体新型污染物引起了各国与会专家的关注。 水处理成抗生素耐药性传播潜在途
怎么看懂微生物报告合理使用抗生素?
1、药敏试验报告S、I、R的涵义S (敏感)是指对抗菌药物敏感,细菌能被药物推荐剂量在感染部位通常可达到的抗菌药物浓度所抑制。即使用常规剂量时的平均血浓度超过MIC 5倍以上,用常规剂量通常有效。 I (中介)指抗菌药物MIC 接近于和组织中通常可达到的水平,而抗药治疗的反应率可能低于敏感菌
后微生物组时代-首次发现人体特有的病毒组
我们人体中的病毒会影响微生物群体的结构和行为,但是关于身体许多区域的噬菌体,也就是感染细菌的病毒,科学家们所知甚少。近期一组研究人员发现,在膀胱中整合进细菌基因组的是噬菌体要比细菌本身多得多,这项出乎人意料的研究发现公布在1月29日的the Journal of Bacteriology杂志上。
用于微生物组研究的人造肠道
微生物存在于人体、植物、土壤、海洋等各种环境中,这些微生物群落的集合被称为微生物组。近年来,微生物组研究成为一个热门,去年10月份,Science和Nature两大期刊同时发文,倡议开展浩大的微生物组研究,以理解和利用微生物组——栖息在多种多样生态系统(如人类肠道和海洋)的微生物群落,来改善人类
微生物组研究:关乎人类的未来
当人类第一次认识到微生物的存在时,并不知道这种个头微小的生命体是地球生态系统的基石、关系人类健康的重要因素——它不仅将极大地帮助人类克服当今所面临的生存挑战,还能提供人类未来生存之道。如今,人类基因组的神秘面纱已渐渐揭开,微生物组又成为各国生命科学竞争的焦点,纷纷启动微生物组研究计划。科学家们呼吁,
微生物组研究:关乎人类的未来
当人类第一次认识到微生物的存在时,并不知道这种个头微小的生命体是地球生态系统的基石、关系人类健康的重要因素——它不仅将极大地帮助人类克服当今所面临的生存挑战,还能提供人类未来生存之道。如今,人类基因组的神秘面纱已渐渐揭开,微生物组又成为各国生命科学竞争的焦点,纷纷启动微生物组研究计划。科学家们呼吁,
中国微生物组计划:机遇与挑战
微生物组是指一个特定环境或者生态系统中全部微生物及其遗传信息,包括其细胞群体和数量、全部遗传物质(基因组),它界定了涵盖微生物群及其全部遗传与生理功能,其内涵包括了微生物与其环境和宿主的相互作用。微生物组学是一个崭新的学科,微生物组研究取得的成果,必将为国家经济社会发展、人类生活质量改善提供源源
人类微生物组影响健康机制揭秘
英国《自然》杂志8月31日发表的一篇生物学论文称,美国科学家发现,肠道菌群会产生名为N-酰基酰胺的小型有机复合物,它们与受体相互作用,参与人体生理的包括免疫等各方面活动,而这正是人类微生物组影响生理健康的背后机制。 科学家已经意识到,人类基因组并不能完全解释人类疾病与健康的关键问题,因为人类对
肠道微生物组进展一览
本期为大家带来的是肠道微生物相关领域的研究进展,希望读者朋友们能够喜欢。 1. Nutrition Reviews:饮食对肠道菌群的影响 DOI: 10.1093/nutrit/nuz106 根据乔治华盛顿大学(GW)和美国国家标准研究院(National Institute of Sta
美推出国家微生物组计划
美国政府日前发起一项新的努力,研究在人体和整个生态系统中茁壮成长的数量巨大且大部分不可见的微生物组,旨在推进对微生物世界的认知,从而在卫生保健、食品生产和环境恢复等领域有所应用。 白宫发表的一份声明指出,多年来,美国政府一直在微生物组领域投资,且近年来力度不断增加。2014财年的联邦投资是20
中国微生物组研究期待新突破
在这个广袤的世界上,存在无数各种各样的微生物,但我们对微生物了解很少,甚至不知道在我们周围有什么样的微生物。世界上所有的哺乳动物和鸟类,几乎已经全部被认知,而我们认知的微生物还不到1%。要知道,我们每个人体内都有大量微生物,一个100斤重的人,体内大约有1.5斤的微生物,它们在我们体内发挥着什么作用
Nature:皮肤微生物组与免疫应答
皮肤是机体和环境接触的主要界面,也是无数微生物的家园,这些微生物组成的复杂生态系统被称为皮肤微生物组。 美国国立过敏与传染病研究所(NIAID)领衔的研究团队,在一月五日的Nature杂志上发表文章指出,皮肤微生物组能够显著影响机体的免疫力。 皮肤上共生的微生物群体有着很高的多样性,这个群体
肠道细胞利用microRNAs控制微生物组
生物学前沿之一就是谈论操纵我们的肠道微生物组(microbiome)。这听起来像一个大胆的想法,但它看起来像是我们可能一直就在修改我们的微生物组,甚至都没有意识到这一点。一篇新的来自美国哈佛大学医学院的Howard Weiner、Shirong Liu及其研究团队的论文提示着
Nat-Commun:微生物组的可靠“时钟”
尽管人类微生物组在过去几年中受到了人们的广泛关注,但一直以来难以观察其在各种刺激下随时间变化的情况。最常见的分析方法是从粪便样本中提取细菌,然后对它们的基因组进行测序,但是这种方法会丢失肠道中细菌的位置和时间等关键信息。 如今,来自哈佛大学的研究人员创建的一种新工具提供了解决此问题的方法,他们
单细胞拉曼结合靶向宏基因组揭示土壤活性抗生素耐药组
抗生素耐药性(AMR)在人类、环境和动植物间的传播,加剧全球“One Health”的负担。土壤是“One Health”的关键环节之一,所携带的抗生素耐药性可通过食物链等方式转移至人类而带来健康威胁。土壤中栖息着地球上最丰富多样的微生物,其中活性耐药菌在驱动土壤耐药性传播中具有关键作用。然而,