Nature:风险!微生物组可能泄露个人隐私

研究人员发现,通过寄居人体的微生物集成DNA,能够特异性地识别出个人的身份,这就产生了个人隐私问题。 这项发现刊登于5月11日的《美国国家科学院期刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences)上。文章指出,在一项匿名试验研究中,通过寄生于人体的微生物(即其微生物组),很有可能识别出个人身份,从而泄露某人的健康状况、饮食以及种族等细节信息。无独有偶,4月29日发表于《基因组研究》(Genome Research)的一项研究也声称,在由NIH维护的公开性微生物组DNA数据中,也含有具备潜在辨识性的人类DNA。 当然,两篇论文均未依据微生物组的信息披露出受试者的姓名——估计目前这么做也会很困难——但他们有提出,这种具有引导性的微生物组研究应该得到备案。 来自马萨诸塞州波斯顿哈佛陈曾熙公共卫生学院(Harvard T. H. Chan School of Public H......阅读全文

国际微生物大数据联合研究中心在京挂牌

  近日,国家“863”计划“微生物数字化信息系统集成关键技术研发”项目推进会在京举行。其间,由中科院微生物所、中科院上海生命科学研究院、上海生物信息技术研究中心等单位组成的国际微生物大数据联合研究中心挂牌。  随着信息技术的发展,我国微生物大数据研究步入世界前列。据主持“微生物数字化信息系统集成关

人类肠道微生物基因集-为研究提供精准数据支持

  7月7日,由华南理工大学生物科学与工程学院博士研究生李俊桦为第一作者,与深圳华大基因研究院、丹麦哥本哈根大学等单位共同合作完成的《人肠道微生物组参考基因集》研究成果在《自然—生物技术》上发表。这是“华工—华大”基因组科学创新班学子在国际顶级学术期刊上以第一作者身份发表的第二篇文章。  据介绍,人

微生物所发表中国微生物组数据平台

  10月26日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar

世界微生物数据中心落户微生物所

  在近日召开的第12届国际菌种保藏大会上,经过大会专家委员会评审并经世界菌种保藏联合会理事会审议通过,中国科学院微生物研究所在众多的竞争者中脱颖而出,成为世界微生物数据中心(World Data Center for Microorganisms, WDCM)新的主持单位。   W

微生物领域数据库及其分析系统建设研究取得进展

中国科学院计算机网络信息中心大数据技术与应用发展部与中科院微生物研究所等,在微生物领域数据库及其分析系统建设方面取得新进展,提出了一种利用语义网技术构建知识图谱的方法,可将冠状病毒相关的毒株、基因组、蛋白序列、蛋白结构、抗体、文献和ZL等多源异构数据映射至资源描述框架(RDF),并构建了基于语义网框

全球首个冰川微生物数据库

青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外,它是全球最大的冰川分布区,现有冰川2万条以上,面积超过2万平方公里,也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器,封存了不同历史时期的微生物。 现在,中国科学家构建的

我国微生物大数据平台建设获进展

  近日,中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心团队题为World Data Centre for Microorganisms: an information infrastructure to explore and utilize preserved microbia

首个国际ISO微生物数据标准正式发布

  微生物资源是国家的重要战略资源,微生物数据资源则是微生物资源共享和开发的关键环节,数据资源的丰富性、准确性和共享水平,决定着微生物学领域研究和应用的综合能力。  2020年11月9日,国际标准化组织生物技术委员会(ISO/TC 276)正式发布微生物资源中心数据管理和数据发布标准(ISO 217

研究构建绵羊和山羊肠道高质量微生物基因组数据库

近日,西北农林科技大学羊遗传改良与生物育种团队携手国内外多家科研机构,在绵羊和山羊肠道微生物基因组数据库构建及肠道粘蛋白和多糖代谢功能菌种挖掘方面取得进展,研究成果发表在Microbiome上。研究团队在全国范围内的32个羊场收集了来自21个绵羊和山羊品种共计320个肠道样本,分别构建了包含1.6亿

北京大数据研究院成立拟推动数据研究成果转化

  8月27日,国内首个整合了政府、大学和市场三方面资源的大数据研究机构——北京大数据研究院今天在北京大学揭牌。北京大数据研究院是在北京市委市政府的支持与指导下,由中关村管委会、海淀区政府、北京大学、北京工业大学四方共同支持中科院院士、北京大学教授鄂维南牵头筹建。目标是吸引国际一流大数据研究人员来京

呼吁数据共享!数据烂手里,何谈研究话语权?

  导 读  在大气、海洋、冰川等需要国际合作的研究领域,中国普遍缺乏拿得出手的高质量数据。问题出在了哪里?  “我们国家在数据方面基本没有话语权。”  在谈到IPCC报告里鲜有来自中国的数据时,A学者不无感慨地告诉《知识分子》。这位要求匿名的研究者举例说,在2013年第五次IPCC报告中,为决策者

大数据研究推翻常规认识

  近年来,科学创新日渐进入"大数据"时代,各种高通量的分析手段以及各类"组学"的发展,使得我们对生命科学的基本原理以及与人类健康有关的疾病发生机制方面有了更加深入的认识。针对最近一段时间以来科学家们利用"大数据"的手段产生的科学进展,我们进行简要的盘点,希望大家能够喜欢。  1. Nat Gene

全球最大的海洋微生物组数据库建立

  9月4日,《自然》在线发表中外科学家的合作成果,该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者,助理研究员刘琨为文章共同第一作者。  微生物已在生物制造、生物医药、生物农业、环境治理等

全球最大的海洋微生物组数据库建立

9月4日,《自然》在线发表中外科学家的合作成果,该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者,助理研究员刘琨为文章共同第一作者。该成果在《自然》报道   山东大学供图微生物已在生物制造、

全球最大数字微生物数据库建成

  来自爱尔兰、法国和意大利的科学家携手,成功构建了全球最大的数字微生物库——“阿波罗”(APOLLO)。“阿波罗”囊括了247092个计算模型,其中包含迄今为止最全面的人体微生物组计算模型,有望增进科学家对人体微生物组及其对健康影响的理解。相关论文发表于最新一期《细胞系统》杂志。  研究团队重点关

全球微生物组大数据搜索引擎上线

  日前,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心正式发布首个微生物组大数据搜索引擎——MSE(Microbiome Search Engine; http://mse.single-cell.cn),使得以整个微生物组为分析单元的智能搜索和大数据挖掘成为现实。   微生物组,又称“菌群”。

大数据时代:海量数据为科学研究带来重大机遇

  “大数据的概念听上去和云计算一样,有些‘高大上’,但是大数据绝不是一个空泛的口号,事实上它不仅改变了人们的生存面貌,更为科学研究带来重大的机遇。”中国科学院遥感与数字地球所研究员郭华东说。  依托海量的数据状态和云级别的数据处理能力,大数据以其Volume(大量)、Velocity(高速)、Va

科学家研究认为:大数据时代“小数据”仍有未来

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504106.shtm大数据时代,“小数据”有未来吗?武汉纺织大学数理科学学院江健教授团队与美国密歇根州立大学Guo-wei Wei教授团队共同研究认为:“有!”相关研究成果日前在线发表在国际期刊《化学评论

聚焦微生物研究(系列二)

活菌 PCR 是一项崭新的技术,能够选择性地扩增存活细胞的 DNA。这使得研究人员能够快速、可靠地区分存活和死亡细胞,而不再依赖耗时的培养方法进行判断。传统 PCR 法的缺陷传统 PCR 法的一个主要缺点就是无法分辨存活和死亡的微生物。这会导致误导性结果的生成,例如高估污染水平。此外仅对于存活微生物

聚焦微生物研究(系列三)

BLU-V Viability PMA Kit、BLU-V 系统和 BLU-V Incubation Box(孵育盒)共同组成了 BLU-V 产品套装。它们组合在一起,为您提供了一个开始活菌 PCR 应用的简化工作流程。BLU-V Viability PMA KitBLU-V Viability P

聚焦微生物研究(系列一)

适用于您微生物学应用的活菌 PCR 技术对存活微生物实施快速、敏感和特异性检测是许多微生物学研究和质控对照领域的基本需求。real-time PCR 等基于 DNA的扩增技术能够提供所需的速度和特异性。活菌 PCR 是微生物学研究的新一代技术,它将细胞的存活信息与 PCR 类检测法的速度和

世界微生物数据中心与泰国国家微生物资源保藏中心合作

  9月11日至15日,世界微生物数据中心(World Data Center for Microorganisms,简称WDCM)主任、中科院微生物研究所信息中心主任马俊才研究员赴泰国国家基因工程及生物技术中心(National Center for Genetic Enginee

遥感数据智能重构研究获进展

近日,中国科学院南海海洋研究所研究员唐世林团队与自然资源部南海预报减灾中心正高级工程师杨超宇合作,在遥感数据智能重构研究方面取得新进展,实现了南海多源遥感高分辨率海表叶绿素逐日产品的精准重构。相关成果发表于《地球系统科学数据》(Earth System Science Data)。 OI-SwinU

“大数据”助力人类疾病研究

  近年来,科学家们依托“大数据”在改善人类健康、助力人类疾病研究上取得了重大进展,本文中,小编就对近期相关研究成果进行整理,分享给大家!  图片来源:CC0 Public Domain  【1】Front Immunol:大数据帮助设计更好的流感疫苗  doi:10.3389/fimmu.2019

癌症学研究公布最新数据集

  据英国《自然》杂志10月17日在线发表的一项癌症研究,美国俄勒冈健康与科学大学公布了一个数据集,揭示了此前未发现的、急性髓性白血病(AML)患者的特定突变与药物敏感性之间的关联。这些发现将增进对急性髓性白血病的生物学和临床方面的理解。  急性髓性白血病是一种非常多样化的疾病,目前已在患者中观察到

药品研究色谱数据工作站及色谱数据管理要求

  本文规定了药品注册申报研究工作采用的色谱数据工作站的基本要求和色谱数据的管理要求。同时,为保证色谱数据的完整性和可靠性,色谱数据工作站需建立信息安全管理体系。  1、色谱数据工作站基本要求  色谱数据工作站获得的色谱数据应当可靠、安全、完整、可溯源。  鼓励采用经规范和系统验证的色谱数据工作站进

药品研究色谱数据工作站及色谱数据管理要求

1、色谱数据工作站基本要求      色谱数据工作站获得的色谱数据应当可靠、安全、完整、可溯源。      鼓励采用经规范和系统验证的色谱数据工作站进行研究工作。      色谱数据工作站验证可由工作站制造商进行,注册申请人依据工作站制造商的评估和验证报告对工作站获得色谱数据的完整性、可靠性、安全性

微生物所举办第二届世界微生物数据中心研讨会

  6月7日至8日,在中科院国际合作局和中科院生物局的支持下,由世界微生物数据中心(WDCM)、世界菌种保藏中心联合会(WFCC)、联合国教科文组织(UNESCO)、中科院应用微生物研究网络(RNAM)、中科院微生物研究所、国际科技数据委员会(CODATA)、亚洲微生物资源保藏和可持

中科院应用微生物研究网络农业微生物研究中心启动会召开

  近日,中国科学院应用微生物研究网络农业微生物研究中心启动会暨学术研讨会在武汉召开。本次会议由农业微生物研究中心依托单位中国科学院武汉病毒研究所主办。上海交通大学邓子新院士,中科院生物局副局长苏荣辉,生物局工业生物技术处处长邢雪荣、副处长刘斌,应用微生物研究网络总中心主任

扬州环保局公布上半年微生物监测数据

  昨天,我市环保局环境监测中心站公布了我市上半年度主要河流、重点湖泊、城市饮用水源地和市区空气微生物监测工作,并编制完成《2015年上半年扬州市生物监测报告》(下简称《报告》)。记者昨天了解到,我市上半年空气微生物轻微污染,主要由于湿度较大,今年霉菌总数比去年增加6.5倍。   最新发布   上半