2013值得关注的技术：微生物组功能研究
《Nature Methods》杂志将2012年度技术授予了定向蛋白质组学(targeted proteomics)。同时，杂志还介绍了2013年值得关注的技术，包括纳米孔测序仪(Disruptive nanopores)、微生物组功能研究(Probing microbiome function)、近红外探针(Near-infrared probes)、干细胞体外微环境(In vitro niches)等等。 大约几年前，人们开始争相对直接取自环境的微生物进行大规模测序。随着每个栖息地的宏基因组序列蜂拥而至，微生物生态学的新阵地在哪里?《Nature Methods》杂志认为，分子图谱分析技术与DNA测序互补，有望带我们深入了解看不见的生物群落的功能。 微生物的大规模测序在这两年相当热门，目前已有多项成果发表。今年6月，Nature、Science和Cell三大顶级期刊都公布了人类微生物组计划的最......阅读全文
宏基因组及宏转录组测序揭示极端环境微生物的生态学作用
中山大学与千年基因合作应用宏基因组及宏转录组测序对极端环境酸性矿山废水（Acid mine drainage, AMD）中的微生物群落进行研究，相关成果于11月7日发表于The ISME Journal杂志。 本研究是继2012年11月发表于The ISME Journal杂志的微生物群落多样
DGGE技术在微生物生态学中的应用
在自然界中存在大量丰富的微生物资源，但目前被人们所培养利用的仅仅占1%～10%，还有大量的微生物没有被人们所了解和利用。随着基因组学在生物技术领域的不断发展，微生物基因组学的研究凭借基因组研究(TIGR)所利用鸟枪法成功地对流感嗜血菌(Haem ophilus influenzae)的全基因组序列的
DGGE技术在微生物生态学中的应用
在自然界中存在大量丰富的微生物资源，但目前被人们所培养利用的仅仅占1%～10%，还有大量的微生物没有被人们所了解和利用。随着基因组学在生物技术领域的不断发展，微生物基因组学的研究凭借基因组研究(TIGR)所利用鸟枪法成功地对流感嗜血菌(Haem ophilus influenzae)的全基因组序
土壤动物肠道微生物的生态学功能取得进展
蚯蚓是土壤中主要的大型土壤动物，它们对于土壤中碳素的稳定、矿化以及氮素的周转等方面有重要的贡献。但是此前，大多的研究都停留在土壤物本身，而忽略了土壤动物肠道微生物在其宿主发挥这些生态学功能过程中的作用。土壤动物的肠道是土壤微生物另一重要的“栖息地”，是一个天然可移动的厌氧环境，为厌氧微生物的生长
人体微生物组可能已经处于生态学上的危险区！
我们如今生活的世界与我们的祖先当时生活的世界发生了很大的改变。随着我们进入了新的地理纪元-“人类世”，在世界上留下了很多足迹。我们如今面临的问题也越来越多，包括全球气候变暖，冰川融化以及生物多样性的减少。 不过另外一个问题却常常被忽视：我们体内的微生物种群数量也在大幅下降。 如果我们体内的微
迄今最久微生物基因组草图出炉
英国《自然》杂志日前在线发表的一项演化学研究报告，近乎完整地构建出了一种口腔细菌的基因组，这个有48000年历史的微生物的基因组，是迄今为止历史最悠久的微生物基因组草图，研究同时揭示了尼安德特人的饮食结构。 尼安德特人的DNA序列和现代人类的DNA序列非常相似。他们是现代欧洲人祖先的近亲，从1
第四届土壤微生物生态学研讨会召开
5月5日，由中科院城市环境研究所和中科院生态环境研究中心共同承办的“第四届土壤微生物生态学研讨会”在厦门召开。来自美国、比利时、荷兰等国家及北京、石家庄、南京、长沙、广州、厦门等地的40余位科学家参加了会议。 会议邀请了美国科学院院士James Tiedje教授，根特大学To
宏基因组如何指导微生物分离培养
近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所奶产品质量与风险评估科技创新团队受邀撰写综述文章，阐述了宏基因组指导未培养微生物分离培养的机遇与挑战，系统总结了基于宏基因组分离培养未培养微生物的方法。相关综述文章发表在《微生物》（Microbiome）。 随着宏基因组测序技
单分子测序改善微生物基因组组装
美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员近日在《Genome Biology》上发表文章，介绍了SMRT技术在微生物基因组组装上的应用。他们认为，单分子测序数据能降低测序费用，并带来更多完整的基因组，改善微生物基因组数据库的质量。 随着测序费用的不断下降，测序项目的数量也在不断上升。G
宏基因组如何指导微生物分离培养
近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所奶产品质量与风险评估科技创新团队受邀撰写综述文章，阐述了宏基因组指导未培养微生物分离培养的机遇与挑战，系统总结了基于宏基因组分离培养未培养微生物的方法。相关综述文章发表在《微生物》（Microbiome）。 随着宏基因组测序技
中科院最新文章解析人类母乳微生物菌群
母乳是婴儿最健康、理想的营养来源, 也是人类进化和文明最重要的特征之一. 最新的宏基因组学研究表明母乳含有高达数百种细菌, 而且包括一些常见的病原菌. 母乳微生物菌群是人类与微生物协同进化相互适应的产物, 而“微生物群落-宿主”生态系统的动态平衡则应是保持健康母乳的基础. 然而, 迄今为止, 从
揭示火灾生态学：不同环境条件下微生物群落响应
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/515778.shtm
揭示火灾生态学：不同环境条件下微生物群落响应
中国科学院华南植物园研究员李跃林团队在国家自然科学基金项目的资助下，研究揭示了森林火灾与灾后不同管理方式下土壤微生物群落中细菌与真菌反应差异。近日，相关成果发表于《环境管理杂志》。 野火对森林生态系统具有重大且持久的影响，而火灾后的不同管理方式可以改变森林恢复方向。土壤微生物对环境变化极为敏感
华大基因完成肠道微生物基因组关联分析
从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征，这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日，国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期
全球微生物模式基因组测序计划获进展
近日，《核酸研究》（Nucleic AcidsResearch）在线发表了国家微生物科学数据中心（中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心）关于全球模式微生物基因组数据库gcType的论文。gcType是由我国牵头的全球模式微生物基因组测序计划的重要成果。 模式菌株（t
纳米二次离子质谱技术在－微生物生态学研究中的应用
纳米二次离子质谱技术(NanoSIMS)在 微生物生态学研究中的应用氮(N)、碳(C)、硫(S)等生命元素的生物地球化学循环过程主要由微生物所驱动。 耦合分析自然环境中 微生物遗传多样性与其代谢多样性是当今微生物生态学研究的难点和热点。 自然环境中的微生物多样性极 为丰富,每吨土壤中的微生物类
2013值得关注的技术：微生物组功能研究
《Nature Methods》杂志将2012年度技术授予了定向蛋白质组学(targeted proteomics)。同时，杂志还介绍了2013年值得关注的技术，包括纳米孔测序仪(Disruptive nanopores)、微生物组功能研究(Probing microbiome func
华大基因参与全球最大微生物基因组研究项目
华大基因3月22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目EarthMicrobiomeProject(简称“EMP”)，将负责EMP亚洲地区所有样本的收集和鉴定，并对整个项目提供DNA提取、扩增、建库、宏基因组测序，以及研发生物信息学分析流程所需的计算资源。 EMP将对来自全球的20万个样本进
口腔、肠道微生物菌群元基因组关联分析
2015年7月28日，北京协和医院和华大基因等机构的研究人员共同合作完成了类风湿关节炎（RA）口腔和肠道微生物元基因组研究。本项研究揭示口腔和肠道微生物菌群异常是RA病理生理和疾控的重要环节，并且为元基因组学辅助的RA个性化诊疗方案提供基础。研究成果于今日发表在《自然医学》杂志。 RA是一种致
微生物所等发表植物基因组编辑研究综述
序列特异性核酸酶使得基因组编辑成为可能，快速推动了基础和应用生物学的发展。CRISPR-Cas9系统自出现以来，作为可转化植物的基因组编辑工具已得到广泛应用。CRISPR-Cas9对基因组靶位点进行定向切割，造成DNA双链断裂。DNA双链断裂主要通过两种高度保守的机制进行修复，即非同源末端连接(
研究人员构建人类阴道微生物基因组库
6月21日，深圳市宝安中医院（集团）副院长黄链莎、转化医学中心助理研究员孙文与大连医科大学副教授鄢秋龙等课题组的最新合作成果发表于《自然—微生物学》。人类女性阴道是一个包括细菌、真菌和病毒在内的复杂微生态系统，各微生物之间是相互制约、相互作用、相互依赖、对立统一的关系，其间的平衡关乎女性生殖健康及胎
宏基因组学：查明微生物身份新手段
背景 《美国医学会杂志》(JAMA)近期刊发了一篇题为《利用不需培养的宏基因组学测序技术研究产志贺毒素大肠杆菌O104∶H4暴发株》的研究论文，引起了学界和社会的广泛关注。这篇论文中应用了一种称为“宏基因组学”的技术方法，不通过培养，直接从病人样品中检测分析其携带的病原微生物，甚至可以
“万种微生物基因组计划”在深圳启动
由深圳华大基因研究院联合中国微生物领域顶尖研究机构、院校和企业组成的“万种微生物基因计划”，八月一日在深圳启动。 据悉，该计划是深圳华大基因研究院在“国际千人基因组计划”后启动的又一重大基因组计划，目前该计划的地位为亚洲第一、世界第三。 该计划预计在三年内完成一万种微生物物种全基因组
微生物宏基因组测序可以解释地球氮循环？
微生物（细菌和古细等）是全球生物地球化学循环的重要驱动者。阐明微生物生物地理分布及其驱动过程对于预测环境变化将如何影响生物地球化学循环非常重要。以往微生物生物地理学的研究常常聚焦在物种的层面。然而，越来越多的研究表明，由于微生物群落固有的功能冗余性，微生物群落的功能变化通常与其物种组成变化是解耦
溴化乙锭的生态学数据
对是水稍微有危害的不要让未稀释或大量的产品接触地下水、水道或者污水系统，若无政府许可，勿将材料排入周围环境。
乙烯的生态学数据
1、生物降解性好氧生物降解性：24~672h厌氧生物降解性：96~2688h2、非生物降解性空气中光氧化半衰期（h）：6.2~56h3、其他有害作用该物质对环境有危害，对鱼类应给予特别注意。还应特别注意对地表水、土壤、大气和饮用水的污染。
草酸的生态学数据
该物质对环境可能有危害，对水体应给予特别注意。该品具有强烈刺激性和强烈腐蚀性。其粉尘或浓溶液可导致皮肤、眼或黏膜的严重损害。具有较强毒性和腐蚀性。草酸对人的最低致死量为71mg/kg，对成年人的致死量为15～30g。人若口服5g草酸即发生胃肠道炎、虚脱、抽搐和休克等症状甚至死亡。吸入草酸蒸气发生慢性
生态学词汇遗传距离
中文名称：遗传距离外文名称：genetic distance类 别：生物学定 义：遗传距离指不同的种群或种之间的基因差异的程度，并且以某种数值进行度量。通常由基因频率的某个函数所确定。常用遗传系统树加以表达。②位于同一条染色体上两个基因座间发生交换和重组的机会，两个基因座距离越近
分子生态学词汇杂交
中文名称：杂交外文名称：hybrid 定 义：一品系与另一品系之间的交合学科类别：遗传学实验方法：通过不同的基因型的个体之间的交配取得双亲基因重新组合解 释：1. 交游混杂。 宋 陆游 《读苏叔党汝州北山杂诗次其韵》之九：“闭门勿杂交，一经万事足。”2. 男女杂乱性交。人类
丙酮的生态学数据
1、生态毒性LC50：4740~6330mg/L（96h）（虹鳟鱼）；10mg/L（48h）（水蚤）；2100mg/L（48h）（卤虫）LD50：5000mg/L（24h）（金鱼）EC50：8600mg/L（5min）（发光菌，Microtox毒性测试）；10mg/L（48h）（水蚤）2、生物降解性