华大基因参与破译虎尾海马全基因组
2016年12月15日，由中国科学院南海海洋研究所、德国康斯坦茨大学、华大基因和新加坡A*STAR研究院共同组成的研究小组，联合破译了虎尾海马（Hippocampus comes）的全基因组，有关研究成果以封面文章的形式发表在Nature杂志上。 海马隶属于海龙科。与其他硬骨鱼不同，海马呈现高度特殊的形态，例如头部前方具有管状长嘴，无腹鳍和尾鳍，尾端卷曲，全身覆盖硬骨骼，没有鳞片等。另一个特殊的点在于其雄性育儿及性别角色逆转，即雌性海马将卵子放入雄性海马的育儿袋中，雄性海马通过育儿袋孵化胚胎直到分娩。 为了探索海马特殊的形态及繁殖方式背后的遗传基础，研究小组针对虎尾海马进行全基因组测序并与其他辐鳍鱼进行比较分析。 研究发现，在已测定全基因组的硬骨鱼中，海马的进化速率是最快的。虽然有关机制还不太清楚，但是较高的进化速率会促进具有新功能及更高效蛋白的海马的出现，这些进化可能与其特殊的体型有关。另外，和斑马鱼等其他硬骨鱼相比......阅读全文
Nature子刊：斑马鱼帮助挽救重症淋巴病男孩
在丹尼尔10岁时，他有望成为一名足球运动员，那时他能够在25分钟里跑出5公里的距离。两年后，他的腿突然开始肿胀，出现呼吸困难的症状。医院诊断丹尼尔心脏周围有淋巴积液，并且淋巴液还在继续渗漏。丹尼尔的双腿和腹部像是海绵一样肿胀。他的肺部充满了积液以至于只能靠着氧气罐勉强维持生命。在接受了一种西罗莫
斑马鱼模型有助研发关节炎新疗法
你相信么，鱼也会患上关节炎！美国南加州大学研究人员领导的一项研究发现，地球上早期出现的硬骨鱼很容易患上关节炎。研究人员表示，对鱼类关节炎患病机制的研究，或许会加速人类关节炎预防和治疗手段的研究进程。 长有四肢的骨脊椎动物，如人类，都是从肉鳍类鱼进化而来。在生物进化过程中，为更适应生存环境，陆
科学家揭示斑马鱼大脑空间信息表达机制
中国科学院上海微系统与信息技术研究所研究员李孟与德国马克斯普朗克学会生物控制论研究所合作，证实了在斑马鱼幼鱼端脑中存在编码空间的神经元，表明斑马鱼可作为研究空间信息在全脑尺度表达及处理的全新模式动物，为开发类脑空间计算及类脑导航提供了理论基础和生物机理支持。相关研究发表于《自然》。当来到一座陌生的城
海马基因组及环境适应进化机制获揭示
记者从中国科学院南海海洋研究所获悉，由该所研究员林强课题组主导，联合德国康斯坦茨大学、新加坡国家科技局和华大基因等共同揭示了海马在海洋近岸和岛礁栖息过程中的体型特化和繁殖适应性进化特征。相关研究12月15日以封面文章的形式发表在《自然》杂志上。 林强团队在国际上率先完成了海马的全基因组研究，揭
斑马鱼——CRISPR高通量基因功能研究新平台
近日，来自美国NIH的研究人员进行了一项研究，他们利用CRISPR-CAS9技术靶向斑马鱼特定DNA序列进行基因功能探索和人类治病基因的发现研究，相关研究成果在线发表在国际学术期刊genome research。 在这项研究中，研究人员发现利用基因编辑技术CRISPR-CAS9进行斑马鱼基因靶
2020年我国将绘成斑马鱼全脑介观图谱
“到2020年完成有20万个神经元的斑马鱼全脑介观图谱的绘制。”5月2日，香山科学会议召开“全脑介观神经联接图谱”国际合作计划特别会议，中国科学院外籍院士、中国科学院神经科学研究所所长蒲慕明介绍，中国科学家将从模式动物斑马鱼入手从全脑尺度上解读脑工作原理，利用期间形成的脑科学研究技术，进一步于
斑马鱼雌二醇elisa试剂盒几点操作步骤
斑马鱼雌二醇（E2）elisa试剂盒操作步骤1.标准品的稀释：本试剂盒提供原倍标准品一支，用户可按照下列图表在小试管中进行稀释。80 pmol/L5号标准品150μl的原倍标准品加入150μl标准品稀释液40 pmol/L4号标准品150μl的5号标准品加入150μl标准品稀释液20 pmol/L3
深受科学家的热爱斑马鱼基因编辑技术介绍
斑马鱼又叫蓝条鱼，因为其体表有暗蓝色和银色的类似于斑马一样的条纹而命名。斑马鱼属于鲤科鱼类，同属鲤科的还有我们十分熟悉的鲤鱼、鲫鱼等。斑马鱼的体型较小，成鱼体长约4-6厘米，而且成鱼常年产卵且产卵量大，可达300-1000粒，还是体外受精并发育，因此十分适合进行实验室的大规模养殖与筛选。
斑马鱼胚胎细胞的培养——成纤维细胞饲养层
实验方法原理通过用链酶蛋白酶除去绒毛膜、用添加成分的 FGF 培养液培养细胞和采用不同的胰蛋白酶消化筛选成纤维细胞，用原肠胚期斑马龟的胚胎成纤维细胞制备饲养层 [ Sun et al., 1995a ]。实验材料链酶蛋白酶E用D-PBSA配制1%胰蛋白酶和1mmol L EDTA受精后8h的胚胎FB
应用模式动物斑马鱼开展农药环境毒理的研究（二）
图1图1为96h之后福美锌（ziram）引起的斑马鱼胚胎的死亡率和发育障碍情况。其中A为受精24,48,72和96h胚胎的累计死亡率；B为受精72和96h胚胎的累计孵化率；C为受精48,72和96h胚胎20s内的心跳；D为受精48,72和96h胚胎的脊索畸变率。从图1可以看出：1、斑马鱼受精96h时
组织靶向性胚胎嵌合体—斑马鱼囊胚细胞移植
真核生物的基因调控比原核生物复杂得多。这是因为这两类生物在三个不同水平上存在着重大的差别：①在遗传物质的分子水平上，真核细胞基因组的DNA含量和基因的总数都远高于原核生物，而且 DNA不是染色体中的唯一成分，DNA和蛋白质以及少量的RNA构成以核小体为基本单位的染色质；②在细胞水平上，真核细胞的染色
应用模式动物斑马鱼开展农药环境毒理的研究（一）
在未涉及正文分析介绍及阐述之前，首先给大家分享一个关于斑马鱼研究的框架图：从框架图可以看出，该研究的目的及主要思路是：评估福美锌（ziram）对斑马鱼发育的影响，主要从形态学、行为、生理学和分子四大方面来进行探讨。毋庸置疑，这也是今天将与大家分享的一篇使用Noldus（诺达思）的DanioVisio
斑马鱼行为变化及免疫调节研究新进展
近日，中国水产科学研究院淡水渔业研究中心生物技术研究室基因中心以斑马鱼为研究对象，在锌离子污染环境下，对斑马鱼行为变化、免疫调节等方面开展研究，并取得新进展。 研究团队评估了雄性斑马鱼（Danio Rerio）在1.0或1.5ppm（mg/L）氯化锌暴露6周后的行为和生理变化。锌暴露导致雄性斑
通过研究斑马鱼来揭示视网膜生物钟活性
昼夜节律和视网膜生物钟人类以及许多其他动物体，睡眠-清醒循环以及其他的生物节律过程是由内源性振荡器-生物钟所调节的。生物钟受一系列基因控制，这些基因的表达因是否有光照所微调，从而使得每日的生物节律适应于日夜循环交替。在哺乳动物的大脑中，生物钟母钟（主要的控制因子）位于下丘脑视交叉上核。然而它并非每日
扫描电镜揭秘斑马鱼与血栓研究的关系（二）
科普时间 上：纤维蛋白包裹红细胞与血小板形成血栓示意图；下：血管内壁血栓扫描电镜图为了建立研究凝血酶生成与纤维蛋白形成之间的关系，Schurgers 等人通过飞纳台式扫描电子显微镜对斑马鱼和人类凝血块与其中血纤维蛋白超微网状结构进行可视化分析与对比。 图 A 与图 B 分别为不同倍数下的斑马鱼与
斑马鱼雌二醇elisa试剂盒几点操作步骤
斑马鱼雌二醇（E2）elisa试剂盒操作步骤1.标准品的稀释：本试剂盒提供原倍标准品一支，用户可按照下列图表在小试管中进行稀释。80 pmol/L5号标准品150μl的原倍标准品加入150μl标准品稀释液40 pmol/L4号标准品150μl的5号标准品加入150μl标准品稀释液20 pmol/L3
扫描电镜揭秘斑马鱼与血栓研究的关系（一）
血液是身体里"流动的长河"，如果生命的长河被血栓堵塞，能想象后果会有多么严重吗？ 目前，我国因血栓性疾病导致的死亡人数已占全球因血栓性疾病导致的死亡人数的 51% ，远超过肿瘤、传染性疾病、呼吸系统疾病等。因不易察觉，血栓被称为最隐蔽的杀手。斑马鱼（zebrafish），因其全身布满多条深蓝色条纹似
斑马鱼帮助解码钙缺乏和结肠癌的关联
钙缺乏会引起异常的结肠生长，增加结肠癌风险，但是对于其中的机制还知之甚少。一个小的、透明的鱼胚胎和一连串的惊喜，带领科学家们更深入地了解低钙和结肠癌之间的复杂联系。 密歇根大学的研究人员通过研究斑马鱼胚胎皮肤，解码了能够导致钙缺乏人群中肿瘤和结肠癌的结肠细胞异常生长背后的细胞信息。他们也在
斑马鱼的基因敲除定制（Cas9KO）法介绍
利用 CRISPR/Cas9 技术，针对靶基因序列设计 sgRNA， 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂，在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中，靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中，最终导致靶基因无法正常转录翻译，达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRIS
Blood：斑马鱼造血干细胞发育新的调控机制
人和动物的血液形成是一个有序而复杂的动态过程，造血干细胞的发生、分化与成熟受多种调控因子的精细调控。造血干细胞的发育和分化缺陷可引起多种疾病，包括贫血、免疫异常以及白血病等。近年来国外一个课题组应用全外显子组测序技术，发现一些剪接因子基因突变与骨髓增生异常综合征(MDS)以及继发性急性髓系白血病
斑马鱼帮助发现致命性心肌病治疗药物
最近，研究人员利用斑马鱼模型，确定了一种药物化合物，似乎能逆转致心律失常性心肌病（ACM），这种遗传性疾病，是年轻人猝死的主要原因。由贝斯以色列女执事医疗中心（BIDMC）和布莱根妇女医院的研究人员带领的这项研究，为这种危险疾病的新疗法开发，提供了关键的第一步，而目前这种疾病还没有预防性的治疗方
斑马鱼的基因敲除定制（Cas9KO）法介绍
利用 CRISPR/Cas9 技术，针对靶基因序列设计 sgRNA， 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂，在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中，靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中，最终导致靶基因无法正常转录翻译，达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRISPR
胚胎和成年斑马鱼眼情的组织学准备
INTRODUCTIONThis protocol describes the histological preparation of embryonic and adult zebrafish eyes. The methods described here can be easily adapt
国内外大型药企追捧斑马鱼新药筛选平台
可别小看这几厘米长的小不点，斑马鱼基因与人类基因同源性高达85%，信号传导通路基本相似。这意味着在其身上做药物实验所得到的结果在多数情况下也适用于人体。“比如癫痫、关节炎、脂肪肝、癌症等常见人类疾病模型，都可以通过斑马鱼进行新药筛选。”据环特生物科技有限公司负责人介绍，目前斑马鱼可以承
新发现：斑马鱼脑内有游离的淋巴细胞
清除有害物质、扫荡毒害细胞的废物，大脑有自己的内在程序，这些程序也能为中风和痴呆等疾病提供保护措施。 澳大利亚昆士兰大学（UQ）的科学家们通过研究热带淡水斑马鱼（拥有着许多与人相同的细胞和器官），发现了一种新型的大脑“清道夫”淋巴细胞——脑膜壁淋巴管内皮细胞（meningeal mural l
深受科学家的热爱斑马鱼基因编辑技术介绍
斑马鱼又叫蓝条鱼，因为其体表有暗蓝色和银色的类似于斑马一样的条纹而命名。斑马鱼属于鲤科鱼类，同属鲤科的还有我们十分熟悉的鲤鱼、鲫鱼等。斑马鱼的体型较小，成鱼体长约4-6厘米，而且成鱼常年产卵且产卵量大，可达300-1000粒，还是体外受精并发育，因此十分适合进行实验室的大规模养殖与筛选。
Nat－Commun：斑马鱼研究发现脊椎损伤修复新机制
最近，研究者们以斑马鱼为研究对象，发现了神经纤维再生的关键分子，这一发现将为神经损伤患者的治疗提供了新的线索。具体地，这一发现将为脊神经损伤后大脑与肌肉之间连接的重建提供帮助。 对于人与其它哺乳动物来说，脊神经的损伤会导致永久性的瘫痪，然而，斑马鱼在脊神经损伤之后的几周之内就能够恢复正常的运动
Micro－CT在斑马鱼为模型的骨骼研究上的应用
Micro CT在斑马鱼为模型的骨骼研究上的应用
追记青年科学家刘廷析：“科研痴”情迷斑马鱼
今年7月16日，中科院上海生命科学研究院、上海交通大学医学院健康科学研究所研究员刘廷析因病去世，年仅44岁。他依依不舍的是他的学生、心爱的妻子、年幼的孩子，还有未竟的事业和5万条斑马鱼。 病逝前，刘廷析一米八的个儿，瘦得只剩下40多公斤，他躺在病榻上，仍然不忘鼓励学生们勇攀科学高峰。
MSHOT体视荧光显微镜应用于斑马鱼观察
斑马鱼体型小，易于养殖，体外受精和发育，且早期胚胎透明，易于观察及操作，受精后24小时主要的组织器官原基已形成，是理想的实验动物。MSHOT明美体视荧光显微镜应用于斑马鱼观察。斑马鱼胚胎可以靠被动扩散供氧生存相当长时间，因而具有心血管发育缺陷的胚胎能够在早期发育中存活。这些优点使斑马鱼成为研究脊椎动